2016 Fiscal Year Annual Research Report
Establishment of a new method for functional analysis of cis-regulatory modules using CRISPRi
| Project/Area Number |
26650087
|
|---|
| Research Institution | Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University |
|---|
Principal Investigator |
安岡 有理 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (70724954)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
|
| Keywords | ゲノム編集 / 発生 / シス制御領域 / 転写制御関連因子 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
ツメガエル胚に対してmRNAを顕微注入する代わりに、dCas9およびCas9タンパク質を各種gRNAとともに顕微注入し、ルシフェラーゼレポーター解析によってその効果を検討した。その結果、Cas9タンパク質を注入した場合はレポーターの発現が阻害されたものの、dCas9タンパク質では阻害されなかった。この結果は、Cas9タンパク質によってレポーターDNAが切断されればレポーターの発現量が下がるものの、dCas9タンパク質が結合するだけでは、内在の転写制御タンパク質によって押し出され、阻害効果をもたらさないことを意味している。したがって、dCas9を用いたシス制御領域の機能解析実験は、少なくともツメガエル胚では有効な手段となりえないことが示された。
|
-
[Journal Article] Foxh1 Occupies cis-Regulatory Modules Prior to Dynamic Transcription Factor Interactions Controlling the Mesendoderm Gene Program.2017
Author(s)
Rebekah M. Charney, Elmira Forouzmand, Jin Sun Cho, Jessica Cheung, Kitt D. Paraiso, Yuuri Yasuoka, Shuji Takahashi, Masanori Taira, Ira L. Blitz, Xiaohui Xie, and Ken W.Y. Cho.
-
Journal Title
Developmental Cell
Volume: 40
Pages: 595-607
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
-
-
-
-
-
