2014 Fiscal Year Research-status Report
ヒメミカヅキモの性決定遺伝子から迫る、ストレプトファイツ植物の性決定
| Project/Area Number |
26650147
|
|---|
| Research Institution | Japan Women's University |
|---|
Principal Investigator |
関本 弘之 日本女子大学, 理学部, 教授 (20281652)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
|
| Keywords | ミカヅキモ / ストレプトファイツ / 性決定 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、CpMinus1遺伝子の発現レベルを変動させた形質転換体の状態をRNAseqにより解析することで、性決定に対する貢献を評価すること、もう一つの未知性決定遺伝子であるCpMinus2を発見することを目的としている。
本年度は、ヒメミカヅキモのヘテロ株のゲノム解読を進めるため、＋型、－型両性のゲノムについて、PacBioを用いて、ゲノム配列を決定した。しかし、現時点で、IlluminaのデータとPacBioのデータの両方を使用できるハイブリットアセンブラーの開発がされておらず、以前としてscaffoldサイズは小さいままとなった。しかしながら、－型細胞特異的なContigを、CpMinus1以外に１つ見いだしており、全長クローニングを行いつつ、CpMinus2となりうるかを今後検討する。
CpMinus1については、cDNAをHSP70遺伝子プロモーターの下流で強制発現するようなコンストラクトを作製し、＋株に導入し6株の形質転換体を得ている。そのうち、2株は＋株と混合することで顕著に接合反応が進行し、－型との混合ではほとんど接合子を形成せず、あたかも－型細胞のような表現型を示したものの、残りの株では完全に性表現の転換は起こらなかった。遺伝子発現に用いたプロモーターが不適切であることが考えられてため、－型細胞のゲノム配列からCpMinus1遺伝子のプロモーターを含む領域を増幅し、新たな遺伝子導入用コンストラクトを作製した。
CpMinus1を導入することで、あたかも＋型細胞のように振る舞うようになった１株を用いて、比較transcriptomeのためのデータを取得した。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
ゲノム解読については、相変わらずscaffold長がなかなか長くならず難航しているが、そんな中でもCpMinus2遺伝子候補を見いだすことには成功した。また、CpMinus1を導入した株について、比較Transcriptome解析を進めており、データ解析の準備まで進んでいる。全体としては、順調に推移していると思われる。
|
| Strategy for Future Research Activity |
ゲノム解読については、PAC BioデータとIlluminaデータのハイブリットアセンブラーの開発を待つことになるが、CpMinus2遺伝子候補については、全長クローニングを行い、構造と機能を解析する。
雌雄異株のオーストラリアシャジクモについて、株の状態がやや悪かったため、研究を中断していたが、新たに接合子から子孫株を単離し、比較RNAseqを行う。
CpMinus1を導入することで、あたかも＋型細胞のように振る舞うようになった１株の比較transcriptome解析を進める。
|
| Causes of Carryover |
ハイブリッドアセンブラーの開発が進んでいないこともあり、scaffold長がなかなか長くならず、CpMinus2遺伝子候補を見いだすことには成功したものの、さらなる解析には着手出来ずにいる。また、雌雄異株のオーストラリアシャジクモについて、株の状態がやや悪かったため、比較RNAseqに進めなかったことも一因である。そのため、当初予定した費用を次年度以降に使用することとした。
|
| Expenditure Plan for Carryover Budget |
CpMinus2遺伝子候補の全長クローニングと機能解析、オーストラリアシャジクモの比較RNAseq解析などに用いる。
|
-
[Journal Article] A Receptor-like kinase, related with cell wall sensor of higher plants, is required for sexual reproduction in the unicellular charophycean alga, Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex2015
Author(s)
1. Hirano, N., Marukawa, Y., Abe, J., Hashiba, S., Ichikawa, M., Tanabe, Y., Ito, M., Nishii, I., Tsuchikane, Y., Sekimoto, H.
-
Journal Title
Plant Cell Physiol.
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
-
-
-
-
-
-
-
-
