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2015 Fiscal Year Annual Research Report

出芽酵母における多様性創出ゲノム工学技術の開発

Research Project

Project/Area Number 26660066
Research InstitutionSojo University

Principal Investigator

原島 俊  崇城大学, 生物生命学部, 教授 (70116086)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 杉山 峰崇  大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (80379130)
笹野 佑  大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (90640194)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywords酵母 / ゲノム工学 / 染色体工学 / ゲノムの再編成工学 / ゲノム育種
Outline of Annual Research Achievements

申請者らは、酵母を材料として、それまでいずれの生物でも開発されていなかった染色体任意部位のワンステップ分断技術、任意領域の削除技術、重複技術等々、多様なゲノム工学技術を開発し、それらの技術が実際に「ゲノム機能の解明や育種」に応用できることを20報近い論文によって示してきた。しかし、従来の技術は、一度の形質転換で、染色体一カ所の分断、あるいは一領域の削除、重複しかできず、同時性と迅速性の観点からは満足のいくものではなかった。そこで、本研究では、染色体の分断技術に、近年勃興してきたゲノム編集技術CRISPR/Casを取り入れ、従来不可能であった染色体の複数部位の同時分断を可能とする、スループットの高い革新的なゲノム工学技術を確立することを目的とした。
昨年度までに、同じ染色体上の2カ所、また異なる染色体上の2カ所の同時分断に成功していたので、本年度は、同時3箇所分断、さらに同時4カ所分断に挑戦した。その結果、まず、異なる染色体における3箇所同時分断に成功した。これより1回の形質転換で、3つの天然の染色体を6つの人工染色体にすることが可能となった(3本→6本)。ついで、同一染色体における3箇所同時分断にも成功した。この結果、1回の形質転換で、1本の天然染色体を4つの人工染色体にすることが可能となった(1本→4本)。さらに、異なる染色体上の4箇所の部位の同時分断に成功した。これより、1回の形質転換で、4つの天然染色体を8本の人工染色体にすることができるようになった(4本→8本)。これらの結果は、ゲノムの再編成技術によりゲノムの多様性を創出するために必要な、多数の人工染色体の創出を、これまでより飛躍的に短い時間(おおよそ5週間が1週間程度)で達成することができることを意味しており、染色体分断に要する多大な時間や労力を大幅に削減することが出来ることとなった。

  • Research Products

    (20 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Improved stress resistance and ethanol production by segmental haploidization of the diploid genome in Saccharomyces cerevisiae.2016

    • Author(s)
      Kaboli S, Miyamoto T, Sunada K, Sasano Y, Sugiyama M, Harashima S.
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 121 Pages: 638-644

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2015.10.012.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Core regulatory components of the PHO pathway are conserved in the methylotrophic yeast Hansenula polymorpha2016

    • Author(s)
      Zhou Y, Yuikawa N, Nakatsuka H, Maekawa H, Harashima S, Nakanishi Y, Kaneko Y.
    • Journal Title

      Current Genetics

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Overexpression of ESBP6 improves lactic acid resistance and production in Saccharomyces cerevisiae.2016

    • Author(s)
      Sugiyama M, Akase SP, Nakanishi R, Kaneko Y, Harashima S
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2016.03.010.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide construction of a series of designed segmental aneuploids in Saccharomyces cerevisiae.2015

    • Author(s)
      Natesuntorn W, Iwami K, Matsubara Y, Sasano Y, Sugiyama M, Kaneko Y, Harashima S.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 5 Pages: 12510-12527

    • DOI

      10.1038/srep12510.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Nuclear localization domains of GATA activator Gln3 are required for transcription of target genes through dephosphorylation in Saccharomyces cerevisiae.2015

    • Author(s)
      Numamoto M, Tagami S, Ueda Y, Imabeppu Y, Sasano Y, Sugiyama M, Maekawa H, Harashima S.
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 120 Pages: 121-127

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2014.12.017.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Type 2C protein phosphatase Ptc6 participates in activation of the Slt2-mediated cell wall integrity pathway in Saccharomyces cerevisiae.2015

    • Author(s)
      Sharmin D, Sasano Y, Sugiyama M, Harashima S.
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 119 Pages: 392-398

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2014.09.013.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Stabilization of mini-chromosome segregation during mitotic growth by overexpression of YCR041W and its application to chromosome engineering in Saccharomyces cerevisiae.2015

    • Author(s)
      Sasano Y, Yamagishi K, Tanikawa M, Nakazawa T, Sugiyama M, Kaneko Y, Harashima S.
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 119 Pages: 526-531

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2014.10.006

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 出芽酵母プロテインホスファターゼのゲノムサイエンス2016

    • Author(s)
      原島 俊
    • Organizer
      日本プロテインホスファターゼ研究会 2015 学術集会
    • Place of Presentation
      基礎生物学研究所(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2016-01-29 – 2016-01-30
    • Invited
  • [Presentation] Genome engineering : perspective and challenges for synthetic biotechnology in yeast2015

    • Author(s)
      Harashima S
    • Organizer
      The 27th Annual Meeting of the Thai Society for Biotechnology and International Conference
    • Place of Presentation
      マンダリンホテル(バンコク、タイ)
    • Year and Date
      2015-11-17 – 2015-11-19
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Improvement of thermotolerance of Saccharomyces cerevisiae for bioethanol production by genome shuffling2015

    • Author(s)
      Minetaka Sugiyama, Junyuan Wu, Yu Sasano, Yoshinobu Kaneko, Chuenchit Boonchird, Satoshi Harashima
    • Organizer
      The 27th Annual Meeting of the Thai Society for Biotechnology and International Conference
    • Place of Presentation
      マンダリンホテル(バンコク、タイ)
    • Year and Date
      2015-11-17 – 2015-11-19
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ゲノムシャフリングによるキシロース発酵性酵母Spathaspora passalidarum の高温耐性化2015

    • Author(s)
      笹野 佑、林 真帆、藤原悠人、杉山峰崇、原島 俊
    • Organizer
      第67回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      城山観光ホテル(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2015-10-26 – 2015-10-28
  • [Presentation] Bacillus thuringiensis A297株が生産する2種類の抗菌タンパク質2015

    • Author(s)
      浴野圭輔、高橋亮太、斉藤浩之、三田光章、岡 拓二、原島 俊、水城英一
    • Organizer
      第67回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      城山観光ホテル(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2015-10-26 – 2015-10-28
  • [Presentation] バイオエタノール生産のためのゲノムシャフリングによる高温耐性酵母の開発2015

    • Author(s)
      杉山峰崇、呉 俊元、笹野 佑、金子嘉信、原島 俊
    • Organizer
      第67回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      城山観光ホテル(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2015-10-26 – 2015-10-28
  • [Presentation] Improved thermotolerance od Saccharomyces cerevisiae for bioethanol production by genome shuffling2015

    • Author(s)
      Minetaka Sugiyama、 Junyuan Wum Yu Sasano、Satoshi Harashima
    • Organizer
      The 32nd International Specialized Symposium on Yeast
    • Place of Presentation
      Perugia Congress Center(Perugia、イタリア)
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-17
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] CRISPR-PCS: An efficient and versatile chromosome splitting technology in yeast2015

    • Author(s)
      Yu Sasano, Koki Nagasawa, Saeed Kaboli, Minetaka Sugiyama, Satoshi Harashima
    • Organizer
      The 27th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology
    • Place of Presentation
      Conference Hall(Levico Terme、イタリア)
    • Year and Date
      2015-09-06 – 2015-09-12
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] CRISPR-PCS:多様な染色体操作が可能な染色体工学技術2015

    • Author(s)
      Yu Sasano、Koki Nagasawa、Saeed Kaboli、Minetaka Sugiyama、Satoshi Hiroshima
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第48回研究報告会
    • Place of Presentation
      広島大学(広島県東広島市)
    • Year and Date
      2015-08-31 – 2015-09-02
  • [Presentation] バイオエタノール生産のためのゲノムシャフリングによる高温耐性酵母の開発2015

    • Author(s)
      杉山峰崇、呉 俊元、笹野 佑、金子嘉信、原島 俊
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第48回研究報告会
    • Place of Presentation
      広島大学(広島県東広島市)
    • Year and Date
      2015-08-31 – 2015-09-02
  • [Presentation] 高温耐性酵母 Hansenula polymorpha による乳酸生産2015

    • Author(s)
      加藤謙斗、笹野 佑、金子嘉信、原島 俊、杉山峰崇
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第48回研究報告会
    • Place of Presentation
      広島大学(広島県東広島市)
    • Year and Date
      2015-08-31 – 2015-09-02
  • [Book] Mechanism of Yeast Adaptation to Weak Organic Acid Stress : In Stress Biology of Yeasts and Fungi (ed by H. Takagi and H. Kitagaki)2015

    • Author(s)
      M. Sugiyama、 Y. Sasano、 S. Harashima
    • Total Pages
      218 ページ(107 -121)
    • Publisher
      Springer
  • [Remarks] 崇城大学 生物生命学部 応用微生物工学科 原島研究室ホームページ

    • URL

      http://rsrch.ofc.sojo-u.ac.jp/sjuhp/KgApp?kyoinId=ymemgkoyggy

URL: 

Published: 2017-01-06  

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