2014 Fiscal Year Research-status Report
包括的ゲノムスキャンニングによる小児がんと先天奇形症候群の新規治療戦略の開発
| Project/Area Number |
26670493
|
|---|
| Research Institution | The University of Tokyo |
|---|
Principal Investigator |
滝田 順子 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (00359621)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
|
| Keywords | Ewing肉腫 / 自閉症 / 次世代シークエンサー / エクソーム解析 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
悪性腫瘍と先天性発達障害に関する共通の分子機構を解明するために、本年度は、自閉症にEwing肉腫を合併した例のエクソーム解析を行った。Ewing肉腫は、主として小児や若年性の骨・軟部組織に発生する小円形細胞肉腫であり、分子生物学的にはEWS-FLI1などEWS-ETS融合遺伝子が特徴的な遺伝子異常であることが知られている。解析症例は11歳男児(症例1)。乳幼児期より言葉の遅れ指摘され、自閉症と診断されていた。11歳時に左上腕骨にEwing肉腫を発症し、外科治療と化学療法を施行され、寛解に達した。本症例の腫瘍組織と末梢血よりDNAを抽出し、SureSelectを用いてエクソーム解析を行った。対照として、正常児に発症したEwing肉腫2例も同時に解析した(症例2,3)。変異候補はSangerシークエンスを行い、複数の体細胞変異を検出した。症例1では、悪性黒色腫で検出されたがん抑制遺伝子、体細胞変異を見出した。Grmline変異として、神経の分化に関与する遺伝子の変異と神経系で強く発現する転写因子の変異を検出した。対照の症例2では、p53の体細胞変異が確認されたが、もう1例では、有意な体細胞変異は見出されなかった。以上の結果より、Ewing肉腫と自閉症には、神経系の分化や転写に関与する遺伝子異常が発症に関与している可能性が示唆された。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本年度は、Ewing肉腫を合併した例のエクソーム解析を行った。解析した症例に関しては、十分なデータ量が収集できた。
|
| Strategy for Future Research Activity |
次世代シークエンサーによるエクソーム解析． 引き続き全試料の全エクソンのリシーケンスの完了を目指す。家族歴が濃厚な遺伝性疾患については罹患患者とともに解析可能な非罹患家系メンバーが同時に解析される。
SNPアレイによるゲノムコピー数の解析． エクソーム解析により原因遺伝子が同定されなかった試料に関して、ゲノムの大きな欠失や増幅などの異常を想定して、Affymetrix社GeneChip500Kアレイ(CNAG/AsCNAR解析アルゴリズム)を用いて、網羅的ゲノムコピー数の解析を行う。
網羅的エピゲノム解析． 白血病や骨髄異形成症候群ではエピジェネティックな修飾と発がんの直接的な関連性が示され、新たな治療戦略の標的として注目されている。またPrader-Willi症候群やAngelman症候群など発達障害を伴う一部の先天異常症でもメチル化との関連性が明らかとなった。そこで、本年度は発達障害と腫瘍の発症に関与するエピジェネティックな修飾の網羅的解析を行う。
標的遺伝子の同定と遺伝子性状の解析． 解析した試料におけるゲノム異常の共通領域内に存在する有用な遺伝子(群)につき、real-time PCRを用いて発現解析を行う。またHeterodyplex mobility assay法、直接塩基配列決定法による変異解析およびコロニーアッセイなどにより、腫瘍化との関連性のさらなる検証を行い、標的遺伝子の同定を試みる。
|
Research Products
(77 results)
-
[Journal Article] Aggressive transformation of anaplastic large cell lymphoma with increased number of ALK-translocated chromosomes.2015
Author(s)
Hoshino A, Nomura K, Hamashima T, Isobe T, Seki M, Hiwatari M, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Ogawa S, Takita J, Kanegane H.
-
Journal Title
Int J Hematol.
Volume: 101
Pages: 198-202
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] Allogeneic haematopoietic stem cell transplantation for infant acute lymphoblastic leukaemia with KMT2A (MLL) rearrangements: a retrospective study from the paediatric acute lymphoblastic leukaemia working group of the Japan Society for Haematopoietic Cell Transplantation.2015
Author(s)
Kato M, Hasegawa D, Koh K, Kato K, Takita J, Inagaki J, Yabe H, Goto H, Adachi S, Hayakawa A, Takeshita Y, Sawada A, Atsuta Y, Kato K.
-
Journal Title
Br J Haematol.
Volume: 168
Pages: 564-70
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] Early use of allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for infants with MLL gene-rearrangement-positive acute lymphoblastic leukemia.2015
Author(s)
Koh K, Tomizawa D, Moriya Saito A, Watanabe T, Miyamura T, Hirayama M, Takahashi Y, Ogawa A, Kato K, Sugita K, Sato T, Deguchi T, Hayashi Y, Takita J, Takeshita Y, Tsurusawa M, Horibe K, Mizutani S, Ishii E.
-
Journal Title
Leukemia.
Volume: 29
Pages: 290-6
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] Identification of a homozygous JAK3 V674A mutation caused by acquired uniparental disomy in a relapsed early T-cell precursor ALL patient.2015
Author(s)
Kawashima-Goto S, Imamura T, Seki M, Kato M, Yoshida K, Sugimoto A, Kaneda D, Fujiki A, Miyachi M, Nakatani T, Osone S, Ishida H, Taki T, Takita J, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Ogawa S, Hosoi H.
-
Journal Title
Int J Hematol.
Volume: 101
Pages: 411-6
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
[Journal Article] Upregulation of MAPK negative feedback regulators and RET in mutant ALK neuroblastoma: implications for targeted treatment.2015
Author(s)
Lambertz I, Kumps C, Claeys S, Lindner S, Beckers A, Janssens E, Carter DR, Cazes A, Cheung BB, De Mariano M, De Bondt A, De Brouwer S, Delattre O, Gibbons J, Janoueix-Lerosey I, Laureys G, Liang C, Marshall GM, Porcu M, Takita J et al.
-
Journal Title
Clin Cancer Res.
Volume: e pub ahead of print
Pages: -
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
[Journal Article] Systemic lupus erythematosus complicated with liver cirrhosis in a patient with Papillon-Lefèvre syndrome.2014
Author(s)
Yasudo H, Ando T, Takeuchi M, Nakano H, Itonaga T, Takehara H, Isojima T, Miura K, Harita Y, Takita J, Oka A.
-
Journal Title
Lupus.
Volume: 23
Pages: 1523-7
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
-
-
[Journal Article] Flotillin-1 regulates oncogenic signaling in neuroblastoma cells by regulating ALK membrane association.2014
Author(s)
Tomiyama A, Uekita T, Kamata R, Sasaki K, Takita J, Ohira M, Nakagawara A, Kitanaka C, Mori K, Yamaguchi H, Sakai R.
-
Journal Title
Cancer Res.
Volume: 74
Pages: 3790-801
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
[Journal Article] Biallelic DICER1 mutations in sporadic pleuropulmonary blastoma.2014
Author(s)
Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Shimamura T, Sato Y, Nishimura R, Okuno Y, Chiba K, Tanaka H, Kato K, Kato M, Hanada R, Nomura Y, Park MJ, Ishida T, Oka A, Igarashi T, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J.
-
Journal Title
Cancer Res.
Volume: 74
Pages: 2742-9
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
[Journal Article] Genome-wide approach to identify second gene targets for malignant rhabdoid tumors using high-density oligonucleotide microarrays.2014
Author(s)
Takita J, Chen Y, Kato M, Ohki K, Sato Y, Ohta S, Sugita K, Nishimura R, Hoshino N, Seki M, Sanada M, Oka A, Hayashi Y, Ogaw S.
-
Journal Title
Cancer Sci.
Volume: 105
Pages: 258-64
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
[Journal Article] 高用量シクロフォスファミドによるHLA一致同胞間骨髄幹細胞移植後に致死的心毒性をきたした一例2014
Author(s)
渡邉 健太郎, 加藤 元博, 田中 淳, 中井 まりえ, 関 正史, 林 泰佑, 塩澤 亮輔, 樋渡 光輝, 吉田 健一, 小川 誠司, 松坂 恵介, 深山 正久, 滝田 順子, 岡 明．
-
Journal Title
日本造血細胞移植学会雑誌
Volume: 3
Pages: 120-3
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
-
-
[Presentation] Whole Exome and Transcriptome Analyses in Pediatric T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia.2014
Author(s)
Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Kato M, Hanada R, Miyano S, ide Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
Organizer
56th Annual Meeting of American Society of Hematology
Place of Presentation
San Francisco, U.S.A.
Year and Date
2014-12-06 – 2014-12-09
-
-
[Presentation] Integrated analysis of clonal evolution in hepatoblastoma with familial adenomatous polyposis.2014
Author(s)
Hoshino N, Seki M, Yoshida K, Kato M, Sato Y, Kasahara M, Nakazawa A, Miyano S, Hayashi Y, Oka A, Iwanaka T, Takita J
Organizer
第56回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
岡山コンベンションセンター
Year and Date
2014-11-28 – 2014-11-30
-
[Presentation] Landscape of genomic alteration of pediatric germ cell tumors.2014
Author(s)
Shiozawa R, Seki M, Hoshino N, Yoshida K, Yoshida M, Uryu K, Hiwatari M, Kato M, Ogawa S, Oka A, Takita J
Organizer
第56回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
岡山コンベンションセンター
Year and Date
2014-11-28 – 2014-11-30
-
[Presentation] Integrated genetic and epigenetic analysis defines novel molecular clusters in rhabdomyosarcoma.2014
Author(s)
Seki M, Nishimura R, Yoshida K, Shimamura T, Shiraishi Y, Sato Y, Hoshino N, Nagae G, Okuno Y, Hosoi H, Tanaka Y, Okita H, Taguchi T, Hanada R, Oka A, Miyano S, Aburatani H, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
Organizer
第56回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
岡山コンベンションセンター
Year and Date
2014-11-28 – 2014-11-30
-
[Presentation] The role of epigenetic dysregulation in neuroblastoma.2014
Author(s)
Hoshino N, Seki M, Yoshida K, Kato M, Nishimura R, Sato Y, Miyano S, Nagae G, Hayashi Y, Oka A, Aburatani H, Iwanaka T, Ogawa S, Takita J
Organizer
第56回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
岡山コンベンションセンター
Year and Date
2014-11-28 – 2014-11-30
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
[Presentation] Integrative genome analysis of T cell acute lymphoblastic leukemia with subsequent development of Langerhans cell histocytosis.2014
Author(s)
Seki M, Kat M, Ohyama R, Yoshida K, Sato Y, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Arakawa Y, Kishimot H, Sanada M, Miyano S, Oka A, Hanada R, Ogawa S, Koh K, Takita J
Organizer
第76回日本血液学会学術集会
Place of Presentation
大阪国際会議場
Year and Date
2014-10-31 – 2014-11-02
-
[Presentation] Genome-wide Epigenetic and copy number analyses in Rhabdomyosarcoma.2014
Author(s)
Seki M, Shimamura T, Yoshida K, Sato Y, Nishimura R, Kato M, Nagae G, Oka A, Miyano S, Aburatani H, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
Organizer
46th Congress of the International Society of Paediatric Oncology
Place of Presentation
Toronto, Canada
Year and Date
2014-10-22 – 2014-10-25
-
[Presentation] Genome-wide approach to identify gene targets of pancreatoblastoma.2014
Author(s)
Isobe T, Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Sato Y, Kato M, Hama A, Tanaka Y, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Oka A, Takita J
Organizer
46th Congress of the International Society of Paediatric Oncology
Place of Presentation
Toronto, Canada
Year and Date
2014-10-22 – 2014-10-25
-
[Presentation] Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for infants with acute lymphoblastic leukemia: A retrospective study from the pediatric all working group of the JSHCT.2014
Author(s)
Kato M, Hasegawa D, Koh K, Inagaki J, Kato K, Goto H, Takita J, Yabe H, Sawada A, Atsuta Y, Kato K
Organizer
46th Congress of the International Society of Paediatric Oncology
Place of Presentation
Toronto, Canada
Year and Date
2014-10-22 – 2014-10-25
-
-
-
-
-
-
-
-
-
[Presentation] Genome-Wide Methylation Analysis in Neuroblastoma.2014
Author(s)
Seki M, Kato M, Ohyam R, Yoshida K, Sato Y, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Arakaw Y, Kishimoto H, Sanada M, Miyano S, Oka A, Hanada R, Ogawa S, Koh K, Takit J
Organizer
Advances in Neuroblastoma Research 2014
Place of Presentation
Cologne, Germany
Year and Date
2014-05-13 – 2014-05-16
-
-
[Presentation] Genetic Landscapes of Childhood T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia.2014
Author(s)
Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Kato M, Hiwatari M, Sanada M, Hanada R, Miyano S, Oka A, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
Organizer
Pediatric Academic Societies and Aisan Society for Pediatric Research 2014
Place of Presentation
Vancouver, Canada
Year and Date
2014-05-03 – 2014-05-06
-
[Presentation] Genome-wide analysis of T cell acute lymphoblastic leukemia with subsequent development of Langerhans cell histocytosis.2014
Author(s)
Seki M, Kato M, Oyama R, Yoshida K, Sato Y, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Arakawa Y, Kishimoto H, Miyano S, Oka A, Hanada R, Ogawa S, Koh K, Takita J
Organizer
9th Biennial Childhood Leukemia Symposium
Place of Presentation
Prague, Check Republic
Year and Date
2014-04-28 – 2014-04-29
-
-
-
-
-
[Presentation] The Genetic landscape of neuroblastoma.2014
Author(s)
Uryu K, Nishimura R, Yoshida K, Seki M, Kato M, Oka A, Hayashi Y, Tajiri T, Nakagawara A, Ogawa S, Takita J
Organizer
The 11th Asian Society for Pediatric Research
Place of Presentation
グランキューブ大阪
Year and Date
2014-04-15 – 2014-04-18
-
[Presentation] Integrated genetic and epigenetic analysis in rhabdomyosarcoma.2014
Author(s)
Seki M, Yoshida K, Hosoi H, Tanaka Y, Okita H, Hanada R, Igarashi T, Oka A, Hayahshi Y, Ogawa S, Takita J
Organizer
The 11th Asian Society for Pediatric Research
Place of Presentation
グランキューブ大阪
Year and Date
2014-04-15 – 2014-04-18
-
[Presentation] Genetic alterations in ATM pathway related genes in neuroblastoma.2014
Author(s)
Yoshida M, Kato M, Uryu K, Hoshino N, Seki M, Hiwatari M, Yoshida K, Oka A, Ogawa S, Hayashi Y, Takita J
Organizer
The 11th Asian Society for Pediatric Research
Place of Presentation
グランキューブ大阪
Year and Date
2014-04-15 – 2014-04-18
-
[Presentation] Clonal evolution and pathology in hepatoblastoma with familial adenomatous polyposis.2014
Author(s)
Hoshino N, Seki M, Yoshida K, Kato M, Sato Y, Nakagawa A, Miyano S, Iwanaka T, Oka A, Ogawa S, Takita J
Organizer
The 11th Asian Society for Pediatric Research
Place of Presentation
グランキューブ大阪
Year and Date
2014-04-15 – 2014-04-18
-
-
-
-
-
-
-
