2015 Fiscal Year Research-status Report
依存性薬物感受性・依存症脆弱性個人差におけるゲノムワイドコピー数多型・変異解析
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26860360
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| Research Institution | Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science |
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Principal Investigator |
西澤 大輔 公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, 主席研究員 (80450584)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 薬物依存 / 薬物感受性 / 薬物感受性・依存症脆弱性個人差の遺伝要因 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
当該年度においては、対象サンプルの収集及びアレル情報を考慮しない形でのレアバリアントとしてのCNV（コピー数変異）データに対するオピオイド感受性との関連解析を行った。
サンプル収集に関しては、研究代表者の所属研究室で以前より収集されていた、下顎形成外科手術時にオピオイド鎮痛薬を投与された15-60歳の患者の（術中鎮痛としてレミフェンタニルが用いられた）サンプルが引き続き収集され、当該年度末までに合計約320例以上となった。
また、CNV解析においては、まず、ゲノム解析用のGenomeStudioを用いて、下顎形成外科手術時にオピオイド鎮痛薬を投与された15-60歳の患者の（術中鎮痛としてフェンタニルが用いられた）355サンプルの全ゲノムジェノタイピングデータを対象として、Call frequency ≧ 0.95、及びCluster sep ≧ 0.1等の条件を満たす一塩基多型（SNP）を対象とし、CNV解析に特化したcnvPartition、及びPLINK Input Report Plug-in等の特殊なソフトウェアを利用して、ゲノム上においてCNV領域の検出を行った。その結果、同定されたのはコピー数が0、1、2、3、4、の領域についてそれぞれ合計399、431、8796、1150、67、の個数であった。これらの領域に対して、オピオイド感受性の指標としての術後24時間のオピオイド鎮痛薬投与量との関連解析を行ったところ、多数の領域がP<0.05の検定結果となり、有意な関連が示されたが、多重検定補正を行った場合にも有意な関連を示す領域は無かった。なお、最も強い関連を示したものは、5番染色体におけるCHSY3及びHINT1の遺伝子領域間のCNVであった（[CNV保有者における対数変換後表現型値] = 3.213、[CNV非保有者における対数変換後表現型値] = 1.126；[最低P値] = 0.004）。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当該年度の研究において、サンプル収集はほぼ予定通り進行し、アレル情報を考慮しない形でのレアバリアントとしてのCNVデータのみが対象ではあったものの、オピオイド感受性との関連解析を行うことができたため。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は、当該年度までの研究において行っていたサンプル収集を引き続き行う。
また、下顎形成外科手術時にオピオイド鎮痛薬を投与された15-60歳の患者のサンプル中のオピオイド高感受性またはオピオイド低感受性であることが示唆されるサンプルに関する全ゲノムジェノタイピングデータを用い、オピオイド感受性に関連するCNVを同定する。さらに、アレル情報を考慮する形でのcommonバリアントとしてのCNVデータに対するオピオイド感受性との関連解析（個別多型・ハプロタイプ等）を行う。比較的頻度の高いCNVに対しては、commonな一塩基多型などの場合と同様に、鎮痛薬・疼痛感受性の指標となる臨床データを用いて関連解析を行う。これらの解析において有意な関連が見出されたCNVに関しては、文献検索及びリアルタイム定量PCR（qPCR）による追加解析等を含めた詳細な検討を行い、最有力候補構造多型・変異（最もcausativeと考えられるCNV及びその遺伝子）を同定する。
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| Causes of Carryover |
基本的には当初の研究期間内に全額を使用すべく計画的に執行したが、年度末近くになっても実験が引き続いており、本年度達成できなかった実験及び解析を次年度に行うこととなった。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
物品費（実験用試薬及びプラスチック製品等）、旅費（研究成果発表目的の国内外旅費及び研究打合せ目的の出張費等）、その他等（印刷費及び研究成果発表費用（論文校閲・別刷費用）等）に対して使用予定である。
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[Journal Article] Genome-wide association study identifies candidate loci associated with postoperative fentanyl requirements after laparoscopic-assisted colectomy2016
Author(s)
Mieda T*, Nishizawa D*, Nakagawa H, Tsujita M, Imanishi H, Terao K, Yoshikawa H, Itoh K, Amano K, Tashiro J, Ishii T, Ariyama J, Yamaguchi S, Kasai S, Hasegawa J, Ikeda K, Kitamura A, Hayashida M (*: These authors contributed equally to this study.)
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Journal Title
Pharmacogenomics
Volume: 17
Pages: 133-145
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Association between the rs1465040 single-nucleotide polymorphism close to the transient receptor potential subfamily C member 3 (TRPC3) gene and postoperative analgesic requirements2015
Author(s)
Aoki Y*, Nishizawa D*, Hasegawa J, Kasai S, Yoshida K, Koukita Y, Ichinohe T, Nagashima M, Katoh R, Satoh Y, Tagami M, Hayashida M, Fukuda K, Ikeda K (*: These authors contributed equally to this study.)
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Journal Title
J Pharmacol Sci
Volume: 127
Pages: 391-393
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] ゲノムワイド及び追加関連解析によるニコチン依存関連遺伝子多型の同定2015
Author(s)
西澤大輔, 笠井慎也, 長谷川準子, 佐藤直美, 谷岡書彦, 長島誠, 氏家寛, 橋本亮太, 田中雅嗣, 椙村春彦, 池田和隆
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Journal Title
日本神経精神薬理学雑誌
Volume: 35
Pages: 45-46
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[Presentation] Association between the rs1465040 single-nucleotide polymorphism close to the transient receptor potential subfamily C member 3 (TRPC3) gene and postoperative analgesic requirements2015
Author(s)
Aoki Y, Nishizawa D, Hasegawa J, Kasai S, Yoshida K, Koukita Y, Ichinohe T, Nagashima M, Katoh R, Satoh Y, Tagami M, Hayashida M, Fukuda K, Ikeda K
Organizer
4th Congress of Asian College of Neuropsychopharmacology
Place of Presentation
Taipei, Taiwan
Year and Date
2015-11-20
Int'l Joint Research
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[Presentation] Association between KCNJ6 (GIRK2) gene polymorphism rs2835859 and postoperative analgesia, pain sensitivity, and nicotine dependence2015
Author(s)
Nishizawa D, Fukuda K, Kasai S, Ogai Y, Hasegawa J, Sato N, Yamada H, Tanioka F, Sugimura H, Hayashida M, Ikeda K
Organizer
4th Congress of Asian College of Neuropsychopharmacology
Place of Presentation
Taipei, Taiwan
Year and Date
2015-11-20
Int'l Joint Research
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[Presentation] Association between KCNJ6 (GIRK2) gene polymorphism rs2835859 and postoperative analgesia, pain sensitivity, and nicotine dependence2015
Author(s)
Nishizawa D, Fukuda K, Kasai S, Ogai Y, Hasegawa J, Sato N, Yamada H, Tanioka F, Sugimura H, Hayashida M, Ikeda K
Organizer
The American Society of Human Genetics 65th Annual Meeting
Place of Presentation
Baltimore, USA
Year and Date
2015-10-08
Int'l Joint Research
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