2017 Fiscal Year Annual Research Report
Genome-wide association analyses of copy number variations in sensitivity to addictive substances and vulnerability to dependence
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26860360
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Research Institution | Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science |
Principal Investigator |
西澤 大輔 公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, 主席研究員 (80450584)
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Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2018-03-31
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Keywords | 薬物依存 / 薬物感受性 / 薬物感受性・依存症脆弱性個人差の遺伝要因 |
Outline of Annual Research Achievements |
当該年度においては、対象サンプルの収集及びアレル情報を考慮しない形でのレアバリアントとしてのCNV(コピー数変異)データに対するオピオイド感受性との関連解析を行った。 サンプル収集に関しては、下顎形成外科手術時にオピオイド鎮痛薬を投与された15-60歳の患者のサンプルが引き続き収集され、当該年度末までに合計約410例程度となった。 また、CNV解析においては、前年度と同様に、ゲノム解析用のGenomeStudioを用いて、対象患者355サンプルの全ゲノムジェノタイピングデータを対象として、Call frequency ≧ 0.95、及びCluster sep ≧ 0.1等の条件を満たす一塩基多型(SNP)を対象とし、CNV解析に特化したcnvPartition、及びPLINK Input Report Plug-in等の特殊なソフトウェアを利用して、ゲノム上においてCNV領域の検出を行った。その結果、同定されたのはコピー数が0、1、2、3、4、の領域についてそれぞれ合計399、431、8796、1150、67、の個数であった。また、オピオイド感受性の指標として、術中及び術後24時間のオピオイド鎮痛薬投与量及びフェンタニル量に換算されたジクロフェナクの投与量の合計となる術中術後鎮痛薬総量を計算し、検出されたCNV領域との関連解析を行ったところ、多数の領域がP<0.05の検定結果となり、有意な関連が示されたが、多重検定補正を行った場合にも有意な関連を示す領域は無かった。なお、最も強い関連を示したものは、5番染色体におけるCHSY3、HINT1、LYRM7、CDC42SE2、RAPGEF6、FNIP1、及びACSL6等の複数の遺伝子領域上または領域間のCNVであった([CNV保有者における対数変換後表現型平均値] = 3.602~3.906、[CNV非保有者における対数変換後表現型平均値] = 2.148~2.152;[最低P値] = 0.00009999)。
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[Journal Article] Genome-wide scan identifies candidate loci related to remifentanil requirements during laparoscopic-assisted colectomy2018
Author(s)
Nishizawa D, Mieda T, Tsujita M, Nakagawa H, Yamaguchi S, Kasai S, Hasegawa J, Fukuda K, Kitamura A, Hayashida M, Ikeda K
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Journal Title
Pharmacogenomics
Volume: 19(2)
Pages: 113-127
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Paclitaxel-induced sensory peripheral neuropathy is associated with an ABCB1 single nucleotide polymorphism and older age in Japanese2017
Author(s)
Tanabe Y, Shimizu C, Hamada A, Hashimoto K, Ikeda K, Nishizawa D, Hasegawa J, Shimomura A, Ozaki Y, Tamura N, Yamamoto H, Yunokawa M, Yonemori K, Takano T, Kawabata H, Tamura K, Fujiwara Y
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Journal Title
Cancer Chemother Pharmacol
Volume: 79(6)
Pages: 1179-1186
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] ゲノムワイド関連解析 (GWAS) による腹腔鏡補助下大腸切除術後フェンタニル必要量に影響する遺伝子多型の同定2017
Author(s)
西澤大輔, 三枝勉, 辻田美紀, 天野功二郎, 田代浄, 石井利昌, 山口茂樹, 笠井慎也, 長谷川準子, 池田和隆, 北村晶, 林田眞和
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Journal Title
日本神経精神薬理学雑誌
Volume: 37(2)
Pages: 53-54
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[Presentation] ゲノムワイド関連解析(GWAS)による腹腔鏡補助下大腸切除術中レミフェンタニル投与速度に寄与する遺伝子多型の同定2018
Author(s)
西澤大輔, 三枝勉, 辻田美紀, 中川秀之, 山口茂樹, 笠井慎也, 長谷川準子, 福田謙一, 北村晶, 林田眞和, 池田和隆
Organizer
平成29年度新学術領域研究 学術研究支援基盤形成【先端モデル動物支援プラットフォーム】成果発表会
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[Presentation] ゲノムワイド関連解析(GWAS)による慢性疼痛感受性遺伝子多型の同定2017
Author(s)
西澤大輔, 有田英子, 花岡一雄, 矢島直, 井関雅子, 加藤実, 小川節郎, 平沼彩子, 笠井慎也, 長谷川準子, 林田眞和, 池田和隆
Organizer
日本人類遺伝学会第62回大会
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[Presentation] Genome-wide association study identifies candidate loci associated with intraoperative remifentanil requirements during laparoscopic-assisted colectomy2017
Author(s)
Nishizawa D, Mieda T, Tsujita M, Nakagawa H, Yamaguchi S, Kasai S, Hasegawa J, Fukuda K, Kitamura A, Hayashida M, Ikeda K
Organizer
The American Society of Human Genetics 67th Annual Meeting
Int'l Joint Research
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[Presentation] Associations between polymorphisms close to the cAMP responsive element binding protein 1 (CREB1) gene and the activating transcription factor 2 (ATF2) gene and fentanyl sensitivity2017
Author(s)
Aoki Y, Nishizawa D, Yoshida K, Hasegawa J, Kasai S, Takahashi K, Koukita Y, Ichinohe T, Hayashida M, Fukuda K, Ikeda K
Organizer
5th Congress of Asian College of Neuropsychopharmacology (AsCNP 2017)
Int'l Joint Research
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