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2015 Fiscal Year Annual Research Report

卵巣がん関連遺伝子の網羅的メタボローム解析

Research Project

Project/Area Number 26861324
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

山口 建  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20378772)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywords明細胞癌 / SWI/SNF複合体
Outline of Annual Research Achievements

代謝に関わる遺伝子を検索するために、代謝異常を示す卵巣明細胞癌において、どのような遺伝子変異やコピー数異常があるかを検討するために明細胞癌39検体を用いてエクソームシークエンス解析を行った。遺伝子変異解析では426遺伝子に変異を認め、62%にARID1A遺伝子、51%にPIK3CA遺伝子、10%にKRAS遺伝子、ARID1B遺伝子変異をそれぞれ認めた。コピー数異常解析では、染色体8qの増幅を64%、20qの増幅を54%、17qの増幅を46%、19pの増幅を41%に認めた。染色体8qにはMYC遺伝子、17qにはERBB2、HNF1B、STAT3遺伝子がある。また、欠失はSMARCA4遺伝子がある19pは41%に、RB1遺伝子がある13qは28%に認めた。遺伝子変異とコピー数異常を統合すると、85%にSWI/SNF複合体に属する因子に、82%にKRAS/PI3Kシグナルに、75%にMYC/RBシグナルに異常を認めた。
次にSWI/SNF複合体に着目して解析した。免疫組織染色では卵巣明細胞癌の46.3%にARID1A遺伝子がコードするBAF250a発現の消失を認めた。SWI/SNF複合体全体で見ると、7.8%は1因子のみ、23.2%は複数因子に発現消失を認めたSWI/SNF複合体発現の消失因子多いと有意に進行期が多く、複合体の発現消失は累積的に無病生存期間、全生存期間ともに予後不良であった。多変量解析では病期と、SWI/SNF複合体の発現消失が独立予後予測因子となった。コピー数異常解析では、SWI/SNF複合体の発現消失がない症例は、発現消失のある症例と比較してコピー数異常がより強かった。以上の結果は、卵巣明細胞癌には、SWI/SNF複合体の発現が消失した予後不良の群と、SWI/SNF複合体の発現がありコピー数異常が多い予後良好群との2つの亜型が存在することを示唆している。

  • Research Products

    (11 results)

All 2016 2015

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Prediction of taxane and platinum sensitivity in ovarian cancer based on gene expression profiles.2016

    • Author(s)
      Murakami R, Matsumura N, Brown JB, Wang Z, Yamaguchi K, Abiko K, Yoshioka Y, Hamanishi J, Baba T, Koshiyama M, Mandai M, Yamada R, Konishi I.
    • Journal Title

      Gynecol Oncol.

      Volume: 141 Pages: 49-56

    • DOI

      10.1016/j.ygyno.2016.02.027.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Establishment of a Novel Histopathological Classification of High-Grade Serous Ovarian Carcinoma Correlated with Prognostically Distinct Gene Expression Subtypes.2016

    • Author(s)
      Murakami R, Matsumura N, Mandai M, Yoshihara K, Tanabe H, Nakai H, Yamanoi K, Abiko K, Yoshioka Y, Hamanishi J, Yamaguchi K, Baba T, Koshiyama M, Enomoto T, Okamoto A, Murphy SK, Mori S, Mikami Y, Minamiguchi S, Konishi I.
    • Journal Title

      Am J Pathol.

      Volume: 186 Pages: 1103-13

    • DOI

      10.1016/j.ajpath.2015.12.029. Epub 2016 Mar 15.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Clinical efficacy of neoadjuvant chemotherapy with irinotecan (CPT-11) and nedaplatin followed by radical hysterectomy for locally advanced cervical cancer.2016

    • Author(s)
      bou-Taleb HA, Koshiyama M, Matsumura N, Baba T, Yamaguchi K, Hamanishi J, Abiko K, Yamanoi K, Murakami R, Horikawa N, Taha AA, Kitamura S, Konishi I.
    • Journal Title

      J Int Med Res

      Volume: 44 Pages: 346-56

    • DOI

      10.1177/0300060515591858.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The BMP signaling pathway leads to enhanced proliferation in serous ovarian cancer-A potential therapeutic target.2016

    • Author(s)
      Peng J, Yoshioka Y, Mandai M, Matsumura N, Baba T, Yamaguchi K, Hamanishi J, Kharma B, Murakami R, Abiko K, Murphy SK, Konishi I.
    • Journal Title

      Mol Carcinog.

      Volume: 55 Pages: 335-45

    • DOI

      10.1002/mc.22283.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chemotherapy Induces Programmed Cell Death-Ligand 1 Overexpression via the Nuclear Factor-κB to Foster an Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Ovarian Cancer.2015

    • Author(s)
      Peng J, Hamanishi J, Matsumura N, Abiko K, Murat K, Baba T, Yamaguchi K, Horikawa N, Hosoe Y, Murphy SK, Konishi I, Mandai M.
    • Journal Title

      Cancer Res.

      Volume: 75 Pages: 5034-45

    • DOI

      10.1158/0008-5472.CAN-14-3098.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic profile predicts the efficacy of neoadjuvant chemotherapy for cervical cancer patients.2015

    • Author(s)
      Horikawa N, Baba T, Matsumura N, Murakami R, Abiko K, Hamanishi J, Yamaguchi K, Koshiyama M, Yoshioka Y, Konishi I.
    • Journal Title

      BMC Cancer.

      Volume: 19 Pages: 739

    • DOI

      10.1186/s12885-015-1703-1.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Safety and Antitumor Activity of Anti-PD-1 Antibody, Nivolumab, in Patients With Platinum-Resistant Ovarian Cancer.2015

    • Author(s)
      Hamanishi J, Mandai M, Ikeda T, Minami M, Kawaguchi A, Murayama T, Kanai M, Mori Y, Matsumoto S, Chikuma S, Matsumura N, Abiko K, Baba T, Yamaguchi K, Ueda A, Hosoe Y, Morita S, Yokode M, Shimizu A, Honjo T, Konishi I.
    • Journal Title

      J Clin Oncol.

      Volume: 33 Pages: 4015-22

    • DOI

      10.1200/JCO.2015.62.3397.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Metabolic alterations caused by HNF1β expression in ovarian clear cell carcinoma contribute to cell survival.2015

    • Author(s)
      Amano Y, Mandai M, Yamaguchi K, Matsumura N, Kharma B, Baba T, Abiko K, Hamanishi J, Yoshioka Y, Konishi I.
    • Journal Title

      Oncotarget.

      Volume: 22 Pages: 26002-17

    • DOI

      10.18632/oncotarget.4692.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] IFN-γ from lymphocytes induces PD-L1 expression and promotes progression of ovarian cancer.2015

    • Author(s)
      Abiko K, Matsumura N, Hamanishi J, Horikawa N, Murakami R, Yamaguchi K, Yoshioka Y, Baba T, Konishi I, Mandai M.
    • Journal Title

      Br J Cancer.

      Volume: 28 Pages: 1501-9

    • DOI

      10.1038/bjc.2015.101.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Genomic Alterations of Ovarian Clear Cell Carcinoma2015

    • Author(s)
      Noriomi Matsumura
    • Organizer
      The 57th meeting of the Japan Society of Gynecologic Oncology
    • Place of Presentation
      アイーナ岩手県民情報センター(盛岡市)
    • Year and Date
      2015-08-07 – 2015-08-09
    • Invited
  • [Presentation] 卵巣明細胞癌におけるSWI/SNF複合体の網羅的遺伝子変異解析2015

    • Author(s)
      山口 建
    • Organizer
      67回日本産科婦人科学会学術講演会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2015-04-09 – 2015-04-12

URL: 

Published: 2017-01-06  

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