2015 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
26861324
|
Research Institution | Kyoto University |
Principal Investigator |
山口 建 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20378772)
|
Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
|
Keywords | 明細胞癌 / SWI/SNF複合体 |
Outline of Annual Research Achievements |
代謝に関わる遺伝子を検索するために、代謝異常を示す卵巣明細胞癌において、どのような遺伝子変異やコピー数異常があるかを検討するために明細胞癌39検体を用いてエクソームシークエンス解析を行った。遺伝子変異解析では426遺伝子に変異を認め、62%にARID1A遺伝子、51%にPIK3CA遺伝子、10%にKRAS遺伝子、ARID1B遺伝子変異をそれぞれ認めた。コピー数異常解析では、染色体8qの増幅を64%、20qの増幅を54%、17qの増幅を46%、19pの増幅を41%に認めた。染色体8qにはMYC遺伝子、17qにはERBB2、HNF1B、STAT3遺伝子がある。また、欠失はSMARCA4遺伝子がある19pは41%に、RB1遺伝子がある13qは28%に認めた。遺伝子変異とコピー数異常を統合すると、85%にSWI/SNF複合体に属する因子に、82%にKRAS/PI3Kシグナルに、75%にMYC/RBシグナルに異常を認めた。 次にSWI/SNF複合体に着目して解析した。免疫組織染色では卵巣明細胞癌の46.3%にARID1A遺伝子がコードするBAF250a発現の消失を認めた。SWI/SNF複合体全体で見ると、7.8%は1因子のみ、23.2%は複数因子に発現消失を認めたSWI/SNF複合体発現の消失因子多いと有意に進行期が多く、複合体の発現消失は累積的に無病生存期間、全生存期間ともに予後不良であった。多変量解析では病期と、SWI/SNF複合体の発現消失が独立予後予測因子となった。コピー数異常解析では、SWI/SNF複合体の発現消失がない症例は、発現消失のある症例と比較してコピー数異常がより強かった。以上の結果は、卵巣明細胞癌には、SWI/SNF複合体の発現が消失した予後不良の群と、SWI/SNF複合体の発現がありコピー数異常が多い予後良好群との2つの亜型が存在することを示唆している。
|
Research Products
(11 results)
-
[Journal Article] Prediction of taxane and platinum sensitivity in ovarian cancer based on gene expression profiles.2016
Author(s)
Murakami R, Matsumura N, Brown JB, Wang Z, Yamaguchi K, Abiko K, Yoshioka Y, Hamanishi J, Baba T, Koshiyama M, Mandai M, Yamada R, Konishi I.
-
Journal Title
Gynecol Oncol.
Volume: 141
Pages: 49-56
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Establishment of a Novel Histopathological Classification of High-Grade Serous Ovarian Carcinoma Correlated with Prognostically Distinct Gene Expression Subtypes.2016
Author(s)
Murakami R, Matsumura N, Mandai M, Yoshihara K, Tanabe H, Nakai H, Yamanoi K, Abiko K, Yoshioka Y, Hamanishi J, Yamaguchi K, Baba T, Koshiyama M, Enomoto T, Okamoto A, Murphy SK, Mori S, Mikami Y, Minamiguchi S, Konishi I.
-
Journal Title
Am J Pathol.
Volume: 186
Pages: 1103-13
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Clinical efficacy of neoadjuvant chemotherapy with irinotecan (CPT-11) and nedaplatin followed by radical hysterectomy for locally advanced cervical cancer.2016
Author(s)
bou-Taleb HA, Koshiyama M, Matsumura N, Baba T, Yamaguchi K, Hamanishi J, Abiko K, Yamanoi K, Murakami R, Horikawa N, Taha AA, Kitamura S, Konishi I.
-
Journal Title
J Int Med Res
Volume: 44
Pages: 346-56
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] The BMP signaling pathway leads to enhanced proliferation in serous ovarian cancer-A potential therapeutic target.2016
Author(s)
Peng J, Yoshioka Y, Mandai M, Matsumura N, Baba T, Yamaguchi K, Hamanishi J, Kharma B, Murakami R, Abiko K, Murphy SK, Konishi I.
-
Journal Title
Mol Carcinog.
Volume: 55
Pages: 335-45
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Chemotherapy Induces Programmed Cell Death-Ligand 1 Overexpression via the Nuclear Factor-κB to Foster an Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Ovarian Cancer.2015
Author(s)
Peng J, Hamanishi J, Matsumura N, Abiko K, Murat K, Baba T, Yamaguchi K, Horikawa N, Hosoe Y, Murphy SK, Konishi I, Mandai M.
-
Journal Title
Cancer Res.
Volume: 75
Pages: 5034-45
DOI
Peer Reviewed
-
-
[Journal Article] Safety and Antitumor Activity of Anti-PD-1 Antibody, Nivolumab, in Patients With Platinum-Resistant Ovarian Cancer.2015
Author(s)
Hamanishi J, Mandai M, Ikeda T, Minami M, Kawaguchi A, Murayama T, Kanai M, Mori Y, Matsumoto S, Chikuma S, Matsumura N, Abiko K, Baba T, Yamaguchi K, Ueda A, Hosoe Y, Morita S, Yokode M, Shimizu A, Honjo T, Konishi I.
-
Journal Title
J Clin Oncol.
Volume: 33
Pages: 4015-22
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-