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2015 Fiscal Year Annual Research Report

Paused iPSCを用いたiPS細胞誘導機構の解析

Research Project

Project/Area Number 26870074
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

西村 健  筑波大学, 医学医療系, 助教 (80500610)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
KeywordsKlf4 / iPS細胞 / Tcl1
Outline of Annual Research Achievements

前年度に、paused iPS細胞の全ゲノム遺伝子発現解析を元に明らかにした、Klf4量依存的にiPS細胞誘導時に発現が上昇してくる遺伝子の中で、実際に多能性獲得に重要な遺伝子の同定を試みた。まず、我々が明らかにしたKlf4量依存的に発現誘導される遺伝子群の中で、他の研究グループによって明らかにされている、iPS細胞誘導後期に発現が誘導されてくる遺伝子群(Polo JM et al. (2009) Cell)と共通で、かつES細胞においてKlf4がプロモーター領域に結合している遺伝子(Chen X et al. (2008) Cell)を抽出した。抽出された8遺伝子を、各々レトロウイルスベクターを用いてpaused iPS細胞で過剰発現させたところ、Tcl1とFoxh1遺伝子を過剰発現させるとpaused iPS細胞の多能性が向上することを明らかにした。その後、Tcl1機能の阻害剤等を用いた実験により、Tcl1はiPS細胞誘導時にKlf4量依存的に発現が誘導され、複数の代謝経路の機能調節を行うことによって、多能性獲得に寄与しているということを明らかにした。
また、前年度に作製した、Flag-tag付きKlf4を発現するpaused iPS細胞誘導用ベクターSeVdp(fKg-OSM)を用いて、paused iPS細胞内におけるKlf4等の結合をChIP assayで解析した結果、Klf4のプロモーター領域への結合量に相関して、いくつかのヒストン修飾等が変化していることを明らかにした。以上の結果から、iPS細胞誘導時にKlf4は、量依存的にTcl1等の多能性獲得関連遺伝子のプロモーター領域に結合し、ヒストン修飾の変換等を介してそれらの遺伝子の発現を制御しているということを明らかにした。

  • Research Products

    (10 results)

All 2016 2015

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Generation of cleidocranial dysplasia-specific human induced pluripotent stem cells in completely serum-, feeder-, and integration-free culture.2016

    • Author(s)
      Yamasaki S, Hamada A, Akagi E, Nakatao H, Ohtaka M, Nishimura K, Nakanishi M, Toratani S, Okamoto T
    • Journal Title

      In Vitro Cell. Dev. Biol.-Animal

      Volume: 52 Pages: 252-264

    • DOI

      10.1007/s11626-015-9968-x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic variability overrides the impact of parental cell-type and determines iPSCs differentiation potential2016

    • Author(s)
      Kyttala A, Moraghebi R, Valensisi C, Kettunen J, Andrus C, Pasumarthy KK, Nakanishi M, Nishimura K, Ohtaka M, Weltner J, Handel BV, Parkkonen O, Sinisalo J, Jalanko A, Hawkins RD, Woods NB, Otonkoski T, Trokovic R
    • Journal Title

      Stem Cell Reports

      Volume: 6 Pages: 200-212

    • DOI

      10.1016/j.stemcr.2015.12.009

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Functional neurons generated from T cell-derived iPSCs for neurological disease modeling2016

    • Author(s)
      Matsumoto T, Fujimori K, Andoh-Noda T, Ando T, Kuzumaki N, Toyoshima M, Tada H, Imaizumi K, Ishikawa M, Yamaguchi R, Isoda M, Zhou Z, Sato S, Kobayashi T, Ohtaka M, Nishimura K, Kurosawa H, Yoshikawa T, Takahashi T, Nakanishi M, Ohyama M, Hattori N, Akamatsu W, Okano H
    • Journal Title

      Stem Cell Reports

      Volume: 6 Pages: 422-435

    • DOI

      10.1016/j.stemcr.2016.01.010

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Klf4遺伝子発現調節によるiPS細胞誘導中間体の作製2015

    • Author(s)
      西村健、久武幸司
    • Journal Title

      医学のあゆみ

      Volume: 255 Pages: 173-174

  • [Journal Article] Interspecific in vitro assay for chimera-forming ability of human pluripotent stem cells.2015

    • Author(s)
      Masaki H, Kato-Itho M, Umino A, Sato H, Hamanaka S, Kobayashi T, Yamaguchi T, Nishimura K, Ohtaka M, Nakanishi M, Nakauchi H
    • Journal Title

      Development

      Volume: 142 Pages: 3222-3230

    • DOI

      10.1242/dev.124016

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Safeguard System for Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Rejuvenated T Cell Therapy.2015

    • Author(s)
      Ando M, Nishimura T, Yamazaki S, Yamaguchi T, Kawana-Tachikawa A, Hayama T, Nakauchi Y, Ando J, Ota Y, Takahashi S, Nishimura K, Ohtaka M, Nakanishi M, Miles JJ, Burrows SR, Brenner MK, Nakauchi H
    • Journal Title

      Stem Cell Reports

      Volume: 5 Pages: 597-608

    • DOI

      10.1016/j.stemcr.2015.07.011

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] An assessment of the effects of ectopic gp91phox expression in XCGD iPSC-derived neutrophils.2015

    • Author(s)
      Lin HT, Masaki H, Yamaguchi T, Wada T, Yachie A, Nishimura K, Ohtaka M, Nakanishi M, Nakauchi H, Otsu M
    • Journal Title

      Mol. Ther. Methods Clin. Dev.

      Volume: 2 Pages: 15046

    • DOI

      10.1038/mtm.2015.46

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Molecular mechanism of KLF4-dose dependent induction of pluripotency during iPSC production2016

    • Author(s)
      K. Nishimura, N.F. Liliani, E. Shiomitsu, M. Ohtaka, A. Fukuda, M. Nakanishi, K. Hisatake
    • Organizer
      CiRA/ISSCR International Symposium
    • Place of Presentation
      京都大学百周年時計台記念館
    • Year and Date
      2016-03-22 – 2016-03-24
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Application of novel RNA vector to stem cell engineering2015

    • Author(s)
      Ken Nishimura
    • Organizer
      Gene-editing, transgenics & stem cells: Frontiers in medical and molecular therapeutics Workshop
    • Place of Presentation
      Dublin, Ireland
    • Year and Date
      2015-09-07 – 2015-09-09
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Manipulation of KLF4 expression generates iPSCs paused at successive stages of reprogramming2015

    • Author(s)
      K. Nishimura, E. Shiomitsu, N.F. Liliani, T. Kato, C. Chen, M. Ohtaka, A. Fukuda, M. Nakanishi, K. Hisatake
    • Organizer
      International Society of Stem Cell Research 13th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Stockholm, Sweden
    • Year and Date
      2015-06-24 – 2015-06-27
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2017-01-06  

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