末梢血cell free DNAを用いた網羅的・定量的遺伝子変異解析の探索研究

2014 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 26870509
• Research Institution: Wakayama Medical University
• Principal Investigator: 赤松 弘朗 和歌山県立医科大学, 医学部, 助教 (10646582)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2016-03-31
• Keywords: Liquid Biopsyに関する研究

Outline of Annual Research Achievements

肺癌を対象として、末梢血採取からDNA抽出・定量・保管に至るまでのプラットフォームを前向き臨床研究として整備し、まずは呼吸器内科を中心として症例集積を開始している。現在21例の症例登録が済んだところであり、今後も継続予定である。次世代シークエンサーを用いた解析については組織検体の集積も待って、今年度中の解析が可能な状況である。探索的研究としての高感度PCR法（Digital PCR法）については、これまでmultiplex検出系の確立がされていなかったため、EGFR遺伝子変異（exon19del、exon20 T790M、exon21 L858R）についてそれぞれのプローブ作成・条件検討を行った。前者については、genomic DNAを用いた検討でmultiplex検出系における十分な精度が示され、結果を2014年の肺癌学会総会で報告した（渡邊、赤松、洪、山本ら、肺癌学会 2014）。その後、臨床検体を用いた検討に移った。同一症例におけるduplex・multiplex検出系での一致率が100％と、精度が十分であることを報告した（Akamatsu, Watanabe, Koh, Yamamotoら、米国癌学会2015）。
臨床情報との統合については2014年1月から呼吸器内科におけるデータベース作成を開始しており、今後遺伝子変異解析結果と併せて報告する予定である。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

年度前半で前向き臨床研究としての体制整備（採血からDNA抽出・保管までの体制や臨床データベースの確立）に時間を要したものの、その後は症例集積が比較的順調に進んでいる。一方で同時期に多くの臨床試験・治験が並行して開始となった事から、これらの症例については本研究への参加が制限された事が予想外の事項であった。

Strategy for Future Research Activity

本年は臨床検体の集積に注力すると同時に、次世代シークエンサーでの解析を進めていく。また、digital PCRを用いたmultiplex検出系についても同様に症例集積と解析を進めていく（2015年日本癌学会で報告予定）。臨床情報との統合については、当科データベースが稼働して長期フォローアップのデータが一部で得られると思われるので、その際に解析することを計画している。

Causes of Carryover

臨床研究体制の整備と高感度PCR法を用いたmutiplex検出系の確立に時間を要したため、次世代シークエンサーを用いた解析が十分に進まなかったことから次年度使用額が生じた。

Expenditure Plan for Carryover Budget

次年度は臨床検体の集積を進め、次世代シークエンサー・高感度PCR法を用いた研究を推進していくため、次年度使用額を充てる事ができる。また、multiplex検出系の構築については論文作成を計画しており、こちらについても次年度使用額を充てることを予定している。

Research Products

• [Journal Article] Disease flare after gefitinib discontinuation. (2015)
  • Author(s): Akamatsu H, Ono A, Shukuya T, Tsuya A, Nakamura Y, Kenmotsu H, Naito T, Murakami H, Endo M, Nakajima T, Yamamoto N
  • Journal Title: Respir Investig Volume: 53 Pages: 68-72
  • DOI: 10.1016
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Comparison of platinum combination re-challenge therapy and docetaxel monotherapy in non-small cell lung cancer patients previously treated with platinum-based chemoradiotherapy. (2015)
  • Author(s): Imai H, Kaira K, Mori K, Ono A, Akamatsu H, Taira T, Yoshino R, Kenmotsu H, Saitoh J, Harada H, Naito T, Murakami H, Tomizawa Y, Matsuura M, Saito R, Nakajima T, Yamada M, Takahashi T.
  • Journal Title: Springerplus Volume: 4 Pages: 152
  • DOI: 10.1186
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] The efficacy of amrubicin on central nervous system metastases originating from small-cell lung cancer: a case series of eight patients. (2015)
  • Author(s): Miura S, Kaira K, Kaira R, Akamatsu H, Ono A, Shukuya T, Tsuya A, Nakamura Y, Kenmotsu H, Naito T, Murakami H, Takahashi T, Endo M, Yamamoto N.
  • Journal Title: Invest New Drugs. Volume: epub ahead of print Pages: epub
  • DOI: epub ahead of print
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Progression-free survival, post-progression survival, and tumor response as surrogate markers for overall survival in patients with extensive small cell lung cancer. (2015)
  • Author(s): Imai H, Mori K, Wakuda K, Ono A, Akamatsu H, Shukuya T, Taira T, Kenmotsu H, Naito T, Kaira K, Murakami H, Endo M, Nakajima T, Yamamoto N, Takahashi T.
  • Journal Title: Ann Thorac Med. Volume: 10 Pages: 61-65
  • DOI: epub ahead of print
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Prognostic impact of cancer cachexia in patients with advanced non-small cell lung cancer. (2015)
  • Author(s): Kimura M, Naito T, Kenmotsu H, Taira T, Wakuda K, Oyakawa T, Hisamatsu Y, Tokito T, Imai H, Akamatsu H, Ono A, Kaira K, Murakami H, Endo M, Mori K, Takahashi T, Yamamoto N.
  • Journal Title: Support Care Cancer Volume: 23 Pages: epub
  • DOI: 10.1007
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Multiplexed molecular profiling of lung cancer using pleural effusion (2014)
  • Author(s): Akamatsu H, Koh Y, Kenmotsu H, Naito T, Serizawa M, Kimura M, Mori K, Imai H, Ono A, Shukuya T, Taira T, Murakami H, Ohde Y, Endo M, Nakajima T, Takahashi T, Yamamoto N
  • Journal Title: J Thorac Oncol Volume: 9 Pages: 1048-1052
  • DOI: 10.1097
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] The effect of gefitinib in patients with postoperative recurrent non-small cell lung cancer harboring mutations of the epidermal growth factor receptor. (2014)
  • Author(s): Ko R, Kenmotsu H, Hisamatsu Y, Akamatsu H, Omori S, Nakashima K, Oyakawa T, Wakuda K, Shukuya T, Ono A, Imai H, Taira T, Naito T, Murakami H, Mori K, Endo M, Ohde Y, Takahashi K, Takahashi T.
  • Journal Title: Int J Clin Oncol Volume: epub ahead of print Pages: epub
  • DOI: epub ahead of print
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Identification of actionable mutations in malignant pleural mesothelioma. (2014)
  • Author(s): Shukuya T, Serizawa M, Watanabe M, Akamatsu H, Abe M, Imai H, Tokito T, Ono A, Taira T, Kenmotsu H, Naito T, Murakami H, Takahashi T, Endo M, Ohde Y, Nakajima T, Yamamoto N, Koh Y.
  • Journal Title: Lung Cancer Volume: 86 Pages: 35-40
  • DOI: 10.1016
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Individual-level data on the relationships of progression-free survival and post-progression survival with overall survival in patients with advanced non-squamous non-small cell lung cancer patients who received second-line chemotherapy. (2014)
  • Author(s): Imai H, Mori K, Ono A, Akamatsu H, Taira T, Kenmotsu H, Naito T, Kaira K, Murakami H, Endo M, Nakajima T, Takahashi T.
  • Journal Title: Med Oncol Volume: 31 Pages: 88
  • DOI: 10.1007
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Changes in forced expiratory volume in 1 second over time in patients with controlled asthma at baseline. (2014)
  • Author(s): Matsunaga K, Ichikawa T, Oka A, Morishita Y, Kanai K, Hiramatsu M, Akamatsu H, Kawabata H, Kikuchi T, Akamatsu K, Hirano T, Kou Y, Nakanishi M, Minakata Y, Yamamoto N.
  • Journal Title: Respir Med Volume: 108 Pages: 976-982
  • DOI: 10.1016
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Toxicity and efficacy of chemotherapy for non-small cell lung cancer with cavitary lesions. (2014)
  • Author(s): Tokito T, Shukuya T, Akamatsu H, Ono A, Taira T, Kenmotsu H, Naito T, Murakami H, Takahashi T, Endo M, Mori K, Yamamoto N.
  • Journal Title: Respir Investig Volume: 52 Pages: epub
  • DOI: 10.1016
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Assessment of mutational profile of Japanese lung adenocarcinoma patients by multitarget assays: a prospective, single-institute study. (2014)
  • Author(s): Serizawa M, Koh Y, Kenmotsu H, Isaka M, Murakami H, Akamatsu H, Mori K, Abe M, Hayashi I, Taira T, Maniwa T, Takahashi T, Endo M, Nakajima T, Ohde Y, Yamamoto N.
  • Journal Title: Cancer Volume: 15 Pages: 1471-81
  • DOI: 10.1002
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Comparison of cisplatin plus pemetrexed and cisplatin plus gemcitabine for the treatment of malignant pleural mesothelioma in Japanese patients. (2014)
  • Author(s): Shukuya T, Takahashi T, Imai H, Tokito T, Ono A, Akamatsu H, Taira T, Kenmotsu H, Naito T, Murakami H, Endo M, Yamamoto N.
  • Journal Title: Respir Investig Volume: 52 Pages: 101-106
  • DOI: 10.1016
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] Ongoing early phase trials using liquid biopsy (2015)
  • Author(s): Hiroaki Akamatsu
  • Organizer: The 4th Japan-Taiwan Oncology Phase I Trial Conference
  • Place of Presentation: International Conference Center of National Taiwan University Hospital
  • Year and Date: 2015-04-26
  • Invited
• [Presentation] Establishment of multiplexed ultra-sensitive detection of epidermal growth factor receptor mutations using picodroplet digital PCR (2015)
  • Author(s): Hiroaki Akamatsu, Yasuhiro Koh, Masaru Watanabe, Takashi Kikuchi, Masanori Nakanishi, Kazuto Matsunaga, Nobuyuki Yamamoto.
  • Organizer: American Association of Cancer Research Annual Meeting 2015
  • Place of Presentation: Pennsylvania Convention Center
  • Year and Date: 2015-04-23
• [Presentation] Droplet Digital PCR を用いた EGFR 遺伝子変異のマルチプレックス検出 (2014)
  • Author(s): 渡辺 勝、洪 泰浩、赤松 弘朗、菊池 崇史、松永 和人、山本 信之
  • Organizer: 日本肺癌学会総会
  • Place of Presentation: 京都国際会館
  • Year and Date: 2014-11-15
• [Presentation] Significance ofconsolidation chemotherapyin unresectable, locally advanced non-small cell lung cancer. (2014)
  • Author(s): Hiroaki Akamatsu
  • Organizer: 日本臨床腫瘍学会総会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場
  • Year and Date: 2014-07-17
  • Invited
• [Book] 呼吸器疾患診療最新ガイドライン (2014)
  • Author(s): 菊池崇史, 赤松弘朗, 山本信之
  • Total Pages: 342-349
  • Publisher: 総合医学社
• [Book] がん薬物療法の作用機序 殺細胞性抗悪性腫瘍薬 白金製剤･アルキル化薬･抗がん性抗生物質 (2014)
  • Author(s): 赤松弘朗, 山本信之
  • Total Pages: 124-126
  • Publisher: 日本臨床社
• [Book] Ⅲ期非小細胞肺癌の化学放射線療法. (2014)
  • Author(s): 赤松弘朗, 山本信之
  • Total Pages: 84-87
  • Publisher: へるす出版
• [Book] EBMの手法による肺癌診療ガイドライン2014年版 (2014)
  • Author(s): 赤松弘朗, 山本信之
  • Total Pages: 70-80
  • Publisher: 金原出版
• [Book] 現在進行中の大規模無作為化比較試験 (2014)
  • Author(s): 赤松弘朗, 山本信之
  • Total Pages: 360-364
  • Publisher: 南山堂
• [Book] 腫瘍病理鑑別診断アトラス 肺癌 (2014)
  • Author(s): 赤松弘朗, 山本信之
  • Total Pages: 261-265
  • Publisher: 文光堂