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2015 Fiscal Year Annual Research Report

ユビキチン酵素標的を網羅的に探索する革新的技術基盤の確立

Publicly Offered Research

Project AreaNew aspect of the ubiquitin system : its enormous roles in protein regulation
Project/Area Number 15H01186
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

弓本 佳苗  九州大学, 生体防御医学研究所, 研究員 (30596838)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Keywordsユビキチンリガーゼ / 基質 / CRISPR/Cas9
Outline of Annual Research Achievements

本申請課題ではユビキチンリガーゼ(E3)の基質を生理的にスクリーニングする系を確立することを目的としている。この為、平成27年度は既に判明しているKeap1(E3)-Nrf2(基質)をベンチマークとして系を確立させた。具体的には、内在性のKeap1の5'にFLAGタグを挿入するような組み換え用ベクターを作製した。また、開始コドン付近にguide RNAを設計し、pX330ベクターに組み入れた。両ベクターをHEK293T細胞に導入し、全てのアリルにFLAG tagを挿入してある細胞をクローニングした。また、予備検討より、Keap1の3-boxに変異を導入するとNrf2が蓄積することを確認した。3-boxはKeap1の1st exonに存在するため、先の組み換え用ベクターに変異を導入し、同様にCRISPRベクターと共にHEK293T細胞に導入した。
次にFLAGタグが機能しているかを免疫沈降・免疫ブロットにより確認したところ、Nrf2が上手く免疫沈降できていることを確認した。また、tert-ブチルヒドロキノン(tBHQ)存在・非存在下でLC-MS/MSによりFLAG免疫沈降物を測定したところ、Keap1分解系が停止しているtBHQ処理下でのみNrf2を結合タンパク質として同定できた。以上より、ベンチマークが上手く動くことを確認した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

上述の通り、本年度の目標はおおむね達成できている。

Strategy for Future Research Activity

当初の予定に従い、本年度はこのノックイン系を用いて未知のユビキチンリガーゼ‐基質関係を発見することを目標とする。本システムは特に分子量の大きなユビキチンリガーゼに対して絶大な威力を発揮すると予想される。このため、本年度はまだあまり解析されていないE3であるUBRsに解析対象をしぼる。

  • Research Products

    (2 results)

All 2015

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results)

  • [Journal Article] FBXO21 mediates the ubiquitylation and proteasomal degradation of EID1.2015

    • Author(s)
      Watanabe K., Yumimoto K., Nakayama K. I.
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 20(8) Pages: 667-74

    • DOI

      10.1111/gtc.12260

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] FBXL12-mediated degradation of ALDH3 is essential for trophoblast differentiation during placental development.2015

    • Author(s)
      Nishiyama M., Nita A., Yumimoto K., Nakayama K. I.
    • Journal Title

      Stem Cells

      Volume: 33(11) Pages: 3327-40

    • DOI

      10.1002/stem.2088

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2017-01-06  

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