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2018 Fiscal Year Annual Research Report

花幹細胞の終結過程における遺伝子ネットワークの冗長性と協調性

Publicly Offered Research

Project AreaPrinciples of pluripotent stem cells underlying plant vitality
Project/Area Number 18H04839
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

伊藤 寿朗  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (90517096)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Keywords発現制御 / 幹細胞 / 増殖抑制
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、花において旺盛な幹細胞の増殖活性を自ら停止し、生殖器官を分化させる仕組みを明らかにするために、これまでの単一変異の解析では見落とされていた遺伝子機能を多重変異体の活用により分子遺伝学的に解明することを主目的としている。シロイヌナズナにおいて、独立に花幹細胞を抑制すると考えられている3つの経路を構成する主要因子:AGAMOUS (AG)、SUPERMAN (SUP)の2つの転写因子と、CLAVATA3 (CLV3) ペプチドリガンドの遺伝学的な相互作用についてはすでに論文として報告した(Uemura et al. Plant Reproduction, 2018)。また、花幹細胞の増殖抑制に機能するSUPはポリコム因子CLFと直接結合することで、オーキシン合成を抑制している。本内容を花幹細胞の増殖抑制におけるエピジェネティック機構を介したオーキシン制御の論文としてEMBO Journal(2018)にて発表した。さらにCRCによるクロマチンを介したオーキシン合成酵素の制御機構の論文をNature Communications (2018)にて発表した。ヒストンの脱メチル化酵素によるABAシグナルにおける新規フィードバック系を解明してPlant, Cell & Environment (2019)に発表した。また、関連論文をShort CommunicationsとしてPlant Signaling Behavior(2019)や花幹細胞の増殖抑制機構についてのレビュー(Xu et al., J of Experimental Botany 2019)に発表した。また、細胞自立的に花幹細胞の増殖抑制にかかわる経路の解析を行い、エピジェネティック制御を介した遺伝子ネットワーク機構を解明して論文報告を行った(Sun et al. Plant Cell 2019 in press)。現在、花幹細胞制御因子の多重突然変異体をもちいた分子遺伝学的解析も進めている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

花幹細胞制御におけるKNUとWUSとの関連性については、植物系トップジャーナルであるThe Plant Cell (2019)にて報告した。また、CRCおよびSUPによるエピジェネティック制御を介した花幹細胞の増殖抑制機構は、それぞれNature Communications (2018)およびEMBO Journal(2018)において報告した。さらにcrc sup二重突然変異体の分子遺伝学的な解析に関しても最終的にまとめ上げる段階にある。その他、ABAシグナル系におけるヒストン脱メチル化酵素の働きを明らかにして、Plant, Cell & Environment (2019)にて報告した。

Strategy for Future Research Activity

花幹細胞の増殖抑制に機能する2つの転写因子であるKNUとSUPの二重突然変異体を用いた表現型の解析に併せて、RNA-seqによる発現プロファイル解析を目指す。同時に、変動環境下において、分化マーカー遺伝子の発現および表現型も観察することで、増殖と分化のバランスを保ち、花器官の数を一定に保つための環境頑強性の機能解析を進める。

Remarks

新聞記事など 1.伊藤寿朗、日本経済新聞「花がめしべづくりを開始するためのDNAの折りたたみ構造変化を解明」奈良先端科学技術大学院大学 2018年12月12日
アウトリーチ活動など 1.奈良先端大サイエンス塾 花のABCモデルを平易に解説した。2018年10月13日 2.奈良先端大オープンキャンパス 植物の花の形作りについて。2018年11月11日

  • Research Products

    (22 results)

All 2019 2018

All Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 7 results)

  • [Journal Article] Abscisic acid‐dependent histone demethylation during postgermination growth arrest in Arabidopsis2019

    • Author(s)
      Wu Jinfeng、Ichihashi Yasunori、Suzuki Takamasa、Shibata Arisa、Shirasu Ken、Yamaguchi Nobutoshi、Ito Toshiro
    • Journal Title

      Plant, Cell & Environment

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/pce.13547

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Integration of transcriptional repression and Polycomb-mediated silencing of WUSCHEL in floral meristems2019

    • Author(s)
      Bo Sun, Yingying Zhou, Jie Cai, Erlei Shang, Nobutoshi Yamaguchi, Jun Xiao, Liang-Sheng Looi, Wan-Yi Wee, Xiuying Gao, Doris Wagner, Toshiro Ito.
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1105/tpc.18.00450

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] When to stop: an update on molecular mechanisms of floral meristem termination2019

    • Author(s)
      Yifeng Xu, Nobutoshi Yamaguchi, Eng-Seng Gan, Toshiro Ito
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany

      Volume: 70 Pages: 1711~1718

    • DOI

      10.1093/jxb/erz048

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Histone demethylases control root elongation in response to stress-signaling hormone abscisic acid2019

    • Author(s)
      Jinfeng Wu, Nobutoshi Yamaguchi & Toshiro Ito
    • Journal Title

      Plant Signaling & Behavior

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1080/15592324.2019.1604019

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chromatin-mediated feed-forward auxin biosynthesis in floral meristem determinacy2018

    • Author(s)
      Yamaguchi Nobutoshi、Huang Jiangbo、Tatsumi Yoshitaka、Abe Masato、Sugano Shigeo S.、Kojima Mikiko、Takebayashi Yumiko、Kiba Takatoshi、Yokoyama Ryusuke、Nishitani Kazuhiko、Sakakibara Hitoshi、Ito Toshiro
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 9 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41467-018-07763-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Meristem Termination and Organ Number Control in Early Stage of Arabidopsis Flower Development2018

    • Author(s)
      Xu Yifeng、Ito Toshiro
    • Journal Title

      Journal of Cell Signaling

      Volume: 03 Pages: -

    • DOI

      10.4172/2576-1471.1000186

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In Situ Proximity Ligation Assay to Detect the Interaction Between Plant Transcription Factors and Other Regulatory Proteins2018

    • Author(s)
      Yifeng Xu, Eng-Seng Gan, Toshiro Ito
    • Journal Title

      Plant Transcription Factors.Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)

      Volume: 1830 Pages: 325~335

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-8657-6_19

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Using CRISPR/Cas9 System to Introduce Targeted Mutation in Arabidopsis2018

    • Author(s)
      Ze Hong Lee, Nobutoshi Yamaguchi, Toshiro Ito
    • Journal Title

      Plant Transcription Factors.Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)

      Volume: 1830 Pages: 93~108

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-8657-6_6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RGB-Color Intensiometric Indicators to Visualize Spatiotemporal Dynamics of ATP in Single Cells2018

    • Author(s)
      Arai Satoshi、Kriszt Rokus、Harada Kazuki、Looi Liang-Sheng、Matsuda Shogo、Wongso Devina、Suo Satoshi、Ishiura Shoichi、Tseng Yu-Hua、Raghunath Michael、Ito Toshiro、Tsuboi Takashi、Kitaguchi Tetsuya
    • Journal Title

      Angewandte Chemie

      Volume: 130 Pages: 11039~11044

    • DOI

      10.1002/ange.201804304

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] SUPERMAN regulates floral whorl boundaries through control of auxin biosynthesis2018

    • Author(s)
      Xu Yifeng、Prunet Nathanael、Gan Eng‐Seng、Wang Yanbin、Stewart Darragh、Wellmer Frank、Huang Jiangbo、Yamaguchi Nobutoshi、Tatsumi Yoshitaka、Kojima Mikiko、Kiba Takatoshi、Sakakibara Hitoshi、Jack Thomas P、Meyerowitz Elliot M、Ito Toshiro
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 37 Pages: e97499~e97499

    • DOI

      10.15252/embj.201797499

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Membrane-Bound NAC-Like Transcription Factor OsNTL5 Represses the Flowering in Oryza sativa2018

    • Author(s)
      Guo S, Dai S, Singh PK, Wang H, Wang Y, Tan JLH, Wee W, Ito T
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science, Plant Biotechnology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.3389/fpls.2018.00555

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of floral meristem activity through the interaction of AGAMOUS, SUPERMAN, and CLAVATA3 in Arabidopsis.2018

    • Author(s)
      Uemura, A., Yamaguchi, N., Xu, X., Wee, W., Ichihashi, Y., Suzuki, T., Shibata, A., Shirasu, K., and Ito, T.
    • Journal Title

      Plant Reproduction

      Volume: 31 Pages: 89-105

    • DOI

      10.1007/s00497-017-0315-0

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Multistep termination of floral stem cell activities2019

    • Author(s)
      伊藤 寿朗
    • Organizer
      Japan-Taiwan Plant Biology 2019 (JTPB2019)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Spatio-temporal regulation of floral stem cell activities2018

    • Author(s)
      伊藤 寿朗
    • Organizer
      PSDB 10th Annual National Convention
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Memory and induced forgetting in plants2018

    • Author(s)
      伊藤 寿朗
    • Organizer
      University of the Philippines-Diliman Ateneo de University 大学訪問セミナー
  • [Presentation] 植物における記憶定着と能動的忘却システム2018

    • Author(s)
      伊藤 寿朗
    • Organizer
      さきがけ懇親会
  • [Presentation] Spatio-temporal regulation of floral stem cell activities2018

    • Author(s)
      伊藤 寿朗
    • Organizer
      Henan University大学訪問セミナー
    • Invited
  • [Presentation] Multi-step termination of floral stem cell activities2018

    • Author(s)
      伊藤 寿朗
    • Organizer
      福建農林大学さくらサイエンスプラン
  • [Presentation] Auxin-mediated multistep termination of floral stem cell activities2018

    • Author(s)
      伊藤 寿朗
    • Organizer
      IPMB 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 花幹細胞の時空間的な運命制御2018

    • Author(s)
      伊藤 寿朗
    • Organizer
      京都大学形態統御学分科セミナー
    • Invited
  • [Presentation] Auxin-mediated floral meristem determinacy control2018

    • Author(s)
      伊藤 寿朗
    • Organizer
      25th ICSPR 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Auxin-mediated multistep termination of floral stem cell activities2018

    • Author(s)
      伊藤 寿朗
    • Organizer
      Meristem 2018
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2019-12-27  

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