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2011 Fiscal Year Annual Research Report

Wntシグナル伝達系因子の離合集散を制御するDIXドメインの構造生物学

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrative understanding of biological processes mediated by transient macromolecular complexes; New technology for visualizing physiologically metastable states.
Project/Area Number 22121519
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

樋口 芳樹  兵庫県立大学, 生命理学研究科, 教授 (90183574)

KeywordsX線結晶解析 / 構造機能相関 / 離合集散の生物学 / DIXドメイン / Wntシグナル伝達
Research Abstract

Wingless(Wnt)は分泌性細胞間シグナル伝達タンパク質で,線虫やショウジョウバエからヒトに至るまで生物種を越えて保存されており,細胞の増殖や分化・運動・初期胚発生時の体軸形成や器官形成等の重要な生物学的機能を制御する.Wntの細胞内シグナル伝達機構はAxinやβ-カテニンなど複数のタンパク質複合体により制御されている.本研究ではWntシグナル伝達経路の重要な3種類のタンパク質(Axin,Dishevelled(Dvl),Coiled-coil-DIX1(CCD1))が有するDIXドメインの結晶構造を解明し,それぞれのホモおよびヘテロオリゴマー化の本質を理解することを目的とした.
平成22年度は,CCD1-DIXドメインの結晶解析を行い,結晶中で7個のDIX分子が分子間のβ-ブリッジ相互作用により,らせん状オリゴマーを形成していることを見いだした.また,このらせんは,2本で逆方向の2重らせんを形成していた.平成23年度は,Dvl-DIXの点変異体の結晶解析に成功した.その結果,Dvl-DIXは,2種類の空間群に属する結晶が得られ,その結晶中でDIXドメイン分子は,それぞれ6回および8回のらせんを形成していることを明らかにした.らせんの1巻分のピッチや半径は異なるが,2番目と4番目のβ-ストランドによる分子間相互作用は,すべてのDIXドメインのホモオリゴマーで共通の相互作用様式であることがわかった.しかし,このDvl-DIXも2重らせんを形成するが,CCDl-DIXとは異なり,2本のらせんが,順方向に寄り添ってらせん間相互作用をしていることが明らかになった.

  • Research Products

    (17 results)

All 2012 2011

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] The Three-dimensional Structure of Nylon Hydrolase and the Mechanism of Nylon-6 Hydrolysis2012

    • Author(s)
      S.Negoro, et al
    • Journal Title

      J.Biol.Chem.

      Volume: 287 Pages: 5079-5090

    • DOI

      DOI:10.1074/jbc.M111.321992

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An O-Centered Structure of the Trinuclear Copper Center in the Cys500Ser/Glu506Gln Mutant of CueO and Structural Changes in Low to High X-Ray Dose Conditions2012

    • Author(s)
      H.Komori, et al
    • Journal Title

      Angewandte Chemie

      Volume: 51 Pages: 1861-1864

    • DOI

      DOI:10.1002/anie.201107739

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An O-Centered Structure of the Trinuclear Copper Center in the Cys500Ser/Glu506Gln Mutant of CueO and Structural Changes in Low to High X-Ray Dose Conditions2012

    • Author(s)
      H.Shomura, et al
    • Journal Title

      Protein Science

      Volume: 21 Pages: 707-716

    • DOI

      DOI:10.1002/pro.2058

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular Dynamics Studies on Mutational Structures of a Nylon-6 Byproduct-degrading Enzyme2011

    • Author(s)
      T.Baba, et al
    • Journal Title

      Chem.Phys.Lett.

      Volume: 507 Pages: 157-161

    • DOI

      doi:10.1016/j.cplett.2011.03.046

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallographic Characterization of the DIX Domain of the Wnt Signalling Positive Regulator Ccd12011

    • Author(s)
      S.Terawaki, et al
    • Journal Title

      Acta Crystallgor

      Volume: F67 Pages: 758-761

    • DOI

      doi:10.1107/S1744309111016526

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and Preliminary X-ray Diffraction Analysis of Membrane-bound Respiratory [NiFe] Hydrogenase from Hydrogenovibrio marinus2011

    • Author(s)
      Y.Shomura, et al
    • Journal Title

      Acta Crystallgor

      Volume: 67 Pages: 827-829

    • DOI

      doi:10.1107/S1744309111019804

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and X-ray Diffraction Analysis of Nylon Oligomer Hydrolase (NylC) from Agromyces sp.KY5R2011

    • Author(s)
      K.Yasuhira, et al
    • Journal Title

      Acta Crystallgor

      Volume: 67 Pages: 892-895

    • DOI

      doi:10.1107/S1744309111022858

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of π-Electron Systems in Stabilization of the Oxidized Tetraheme Architecture in Cytochrome c_32011

    • Author(s)
      Y.Takayama, et al
    • Journal Title

      Bull.Chem.Soc.Jpn.

      Volume: 84 Pages: 1096-1101

    • DOI

      doi:10.1246/bcsj.20110039

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural Basis for a [4Fe-3S] Cluster in the Oxygen-tolerant Membrane-bound [NiFe]-hydrogenase2011

    • Author(s)
      Y.Shomura, et al
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 479 Pages: 253-257

    • DOI

      doi:10.1038/nature10504

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 酸素耐性膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析-水素エネルギー利用に向けた基礎科学的研究-2011

    • Author(s)
      樋口芳樹
    • Organizer
      関西サイエンスフォーラム
    • Place of Presentation
      リーガロイヤルNCB(大阪府)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-29
  • [Presentation] ゼータサイザーでタンパク質のオリゴマー化を解析する2011

    • Author(s)
      樋口芳樹
    • Organizer
      日本結晶学会年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-24
  • [Presentation] マルチ銅酸化酵素の構造解析2011

    • Author(s)
      小森博文, 等
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都府)
    • Year and Date
      2011-09-23
  • [Presentation] Structural study of the O_2-tolerant [NiFe] hydrogenase2011

    • Author(s)
      Y.Shomura, et al
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] シトクロムc-552の多量体生成と二量体構造2011

    • Author(s)
      林有吾, 等
    • Organizer
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくばぼ国際会議場(茨城県)
    • Year and Date
      2011-09-14
  • [Presentation] Crystal structure analysis of release factor 32011

    • Author(s)
      K.Kihira, et al
    • Organizer
      XXII Congress and General Assembly of International Union of Crystallography
    • Place of Presentation
      Madrid (Spain)
    • Year and Date
      2011-08-28
  • [Presentation] Primer design for cDNA synthesis based on the crystal structure2011

    • Author(s)
      N.Shibata, Y.Higuchi
    • Organizer
      XXII Congress and General Assembly of International Union of Crystallography
    • Place of Presentation
      Madrid (Spain)
    • Year and Date
      2011-08-27
  • [Presentation] ウマシトクロムcおよび緑膿菌シトクロムc_<551>の多量体形成2011

    • Author(s)
      廣田俊, 等
    • Organizer
      第38回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      茨城大学(茨城県)
    • Year and Date
      2011-06-23

URL: 

Published: 2013-06-26  

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