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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of curvaure variation for understanding tip growth and its tropism

Publicly Offered Research

Project AreaIntrinsic periodicity of cellular systems and its modulation as the driving force behind plant development
Project/Area Number 22H04718
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

佐藤 良勝  名古屋大学, トランスフォーマティブ生命分子研究所, 特任准教授 (30414014)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Keywords先端成長
Outline of Annual Research Achievements

先端成長は、コケ植物やシダ植物では原糸体細胞、被子植物では花粉管や根毛など陸上植物共通に見られる伸長様式であり、先端成長細胞が周期的な速度変化を伴って伸長することは知られている。しかし、これまでの解析のほとんどは、細胞の長さや角度計測という限られた情報のみで伸長速度や屈性が評価されてきた。本研究では、イメージング技術を基盤に、有機合成科学、マイクロデバイス技術、画像解析技術など異分野技術を駆使して従来の先端成長の定量解析に新たなスタンダードを創出し、光や化学物質などの環境刺激による先端成長細胞の屈性を曲率変動の変調として記述し植物環境応答戦略の理解に繋げることを目標とした。
トレニアの花粉管、シロイヌナズナの根毛、ヒメツリガネゴケ原糸体細胞などの先端成長細胞の細胞壁をラベルに関して、独自に開発した近赤外蛍光性細胞壁可視化プローブを用いた観察系を確立した。特に、ヒメツリガネゴケ原糸体細胞では、曲率変動解析に必要な二値化処理に十分なシグナルノイズ比で細胞輪郭を染色されていることが確認でき、明瞭な先端部の曲率変動と曲率極大部の法線ベクトルを得ることに成功した。一方、本研究を進める過程において、先端成長細胞先端部の曲率変動周期性や変調を解析するには、視野内での周期数が不足するという課題も明らかになったため、先端成長細胞の先端部を追尾する動態追尾イメージング系の確立に注力した。その結果、トレニア花粉管の動体追尾は良好に機能するものの、根毛は伸長阻害が見られるケースが多く、ヒメツリガネゴケ原糸体では追尾に失敗するケースが多いことが分かってきた。さらに、先端部が視野内に収まっているものの追尾の正確性が不十分であるものについては、先端部を合わせる画像のアライメント調整を半自動化する解析方法を採用し正確な追尾解析を可能にした。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (12 results)

All 2024 2023

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Plasma membrane damage limits replicative lifespan in yeast and induces premature senescence in human fibroblasts.2024

    • Author(s)
      Kojiro Suda, Yohsuke Moriyama, Nurhanani Razali, Yatzu Chiu, Yumiko Masukagami, Koutarou Nishimura, Hunter Barbee, Hiroshi Takase, Shinju Sugiyama, Yuta Yamazaki, Yoshikatsu Sato, Tetsuya Higashiyama, Yoshikazu Johmura, Makoto Nakanishi & Keiko Kono
    • Journal Title

      Nat Agin

      Volume: 4 Pages: 319-335

    • DOI

      10.1038/s43587-024-00575-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Near-infrared imaging of phytochrome-derived autofluorescence in plant nuclei.2024

    • Author(s)
      Akira Yoshinari, Reika Isoda, Noriyoshi Yagi, Yoshikatsu Sato, Jelmer J. Lindeboom, David W. Ehrhardt, Wolf B. Frommer, Masayoshi Nakamura
    • Journal Title

      Plant J

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/tpj.16699

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Root-knot nematode modulates plant CLE3-CLV1 signaling as a long-distance signal for successful infection.2023

    • Author(s)
      Satoru Nakagami, Michitaka Notaguchi, Tatsuhiko Kondo, Satoru Okamoto, Takanori Ida, Yoshikatsu Sato, Tetsuya Higashiyama, Allen Yi-Lun Tsai, Takashi Ishida, and Shinichiro Sawa
    • Journal Title

      Sci Adv

      Volume: 9 Pages: eadf4803

    • DOI

      10.1126/sciadv.adf4803

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An ABCB transporter regulates anisotropic cell expansion via cuticle deposition in the moss Physcomitrium patens.2023

    • Author(s)
      Liechi Zhang, Yuko Sasaki-Sekimoto, Ken Kosetsu, Tsuyoshi Aoyama, Takashi Murata, Yukiko Kabeya, Yoshikatsu Sato, Shizuka Koshimizu, Mie Shimojima, Hiroyuki Ohta, Mitsuyasu Hasebe, Masaki Ishikawa
    • Journal Title

      New Phytologist

      Volume: 241 Pages: 665-675

    • DOI

      10.1111/nph.19337

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Chemical screening for regulators of intracellular auxin dynamics2024

    • Author(s)
      青山 剛士、南保 正和、栗原 大輔、佐藤 綾人、土屋 雄一朗、佐藤 良勝
    • Organizer
      第65回 日本植物生理学会年会
  • [Presentation] マイクロ流路で顕在化する花粉管の潜在能力2023

    • Author(s)
      佐藤 良勝
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
    • Invited
  • [Presentation] ケージドプローブを用いたオーキシン細胞間移動の可視化2023

    • Author(s)
      青山 剛士、南保 正和、Gwee Eunice、土方 優、佐藤 良勝、土屋 雄一朗
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
  • [Presentation] 葉切片ライブイメージングによるC4植物葉肉葉緑体凝集運動の解析2023

    • Author(s)
      加藤 優太、大井 崇生、佐藤 良勝、谷口 光隆
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
  • [Presentation] 使用している検出器のスペックを知ろう2023

    • Author(s)
      佐藤 良勝
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会 関連集会
    • Invited
  • [Presentation] Observation of chloroplast movement in the C4 plant by live leaf-section imaging.2023

    • Author(s)
      Yuta Kato, Takao Oi, Yoshikatsu Sato, Mitustaka Taniguchi
    • Organizer
      The 20th International Microscopy Congress
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 胚珠にある植物新組織の発見とその新組織を利用した新しい植物種子形成学の黎明2023

    • Author(s)
      劉 暁燕、中島 耕大、伍 小燕、アドヒカリ パラカッシュ バブ、朱 紹威、岡田 健太郎、黒谷 賢一、石田 喬志、中村 匡良、佐藤 良勝、謝 礼洋、黄 陳、何 嘉楽、澤 進一郎、東山 哲也、野田口 理孝、笠原 竜四郎
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
  • [Presentation] 植物成長の自動監視のための深層学習に基づく根の長さ自動測定ツールの開発2023

    • Author(s)
      王 成、鵜飼 優子、林 雄一郎、小田 昌宏、佐藤 良勝、森 健策
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会

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Published: 2024-12-25  

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