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2013 Fiscal Year Annual Research Report

システイン残基ユビキチン化修飾の分子基盤とペルオキシソームタンパク質輸送制御

Publicly Offered Research

Project AreaNew aspect of the ubiquitin system : its enormous roles in protein regulation
Project/Area Number 25112518
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

藤木 幸夫  九州大学, その他部局等, 特任教授 (70261237)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Keywordsペルオキシソーム / ユビキチン化 / タンパク質輸送 / ペルオキシン
Research Abstract

本研究の目的は、新たな「ユビキチンコード」の一つといえる、Pex5pのN末領域に保存されたシステイン残基に対するチオエステル結合を介したモノユビキチン化修飾(Cys-Ub化と略)によるペルオキシソームマトリクスタンパク質輸送の制御機構を解明することである。本年度は、以下のA) およびB) の項目に関する研究成果の概略を記す。
A)Pex5pのCys-Ub化修飾の分子基盤:ペルオキシソーム欠損性CHO変異細胞のペルオキシソーム画分の解析から、3種RINGペルオキシンのうち、Pex10p (Miyataら, Traffic 2012)に加え、 Pex2pとPex12pもPex5pのCys-Ub化に必要であることを見出した。一方、リコンビナントRINGペルオキシンを用いたin vitroユビキチン化アッセイ系においては、Pex10p/Pex12p複合体がPex5pのLys残基をモノUb化する活性を検出したが、Pex5pのCys-Ub化はまだ再構成できていない。
B)Cys-Ub化修飾によるペルオキシソームマトリクスタンパク質輸送の制御機構:In vivoにおけるPex5pのユビキチン化修飾を解析する過程で、1) マトリクスタンパク質輸送に必須なペルオキシソーム膜上におけるPex5pのCys11のモノUb化に加え、2) 内在性Pex5pのLys残基のモノUb化、および3) 一過性に発現させたPex5pがペルオキシソーム非依存的に細胞質においてLys520のモノUb化修飾を受けることを見出した。さらに、Pex5pに対する異なる3種の様式のUb化修飾が、ペルオキシソームマトリクスタンパク質輸送を制御することを明らかにした。これらの成果を国際誌 Jounal of Biological Chemistryに公表した(Okumoto K., Noda H.,and Fujiki Y. J. Biol.Chem.in press, 2014 doi: 10.1074/jbc.M113.527937)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

Pex5pのCys-Ub化の分子機盤の解明のうち、E3についてはRINGペルオキシン3種である確証を得た。E3の使い分けやE2については、引き続きin vitroユビキチン化アッセイ系の確立を目指しつつ解析を行う。一方で、in vivoにおけるPex5pのユビキチン化修飾の解析の過程で、Cys-Ub化以外の2種のLys残基モノUb化を見出し、それぞれのペルオキシソームマトリクスタンパク質輸送における機能を明らかにすることができ、大きな進展が得られた。また、Pex5pのCys-Ub化に影響を及ぼす要因として、いくつかの細胞内環境変化を見出しつつあり、新たな展開が期待できる。

Strategy for Future Research Activity

リコンビナントタンパク質を用いたPex5p Cys-Ub化のin vitro再構成系の確立を引き続き目指しつつ、Pex5pのCys-Ub化に必要なE2の同定を進める。平成26年度研究計画に基づいて、Cys-Ub化Pex5pに結合する因子の検索などを行う。また、RNAi法によるノックダウンやIn vitro Pex5p輸送実験系、In vitro Ub化反応系、およびペルオキシソーム欠損性CHO細胞を用いたin vivoの実験を駆使して、Pex5pのCys-Ub化修飾によるPex5pのシャトリングおよびマトリクスタンパク質輸送の制御機構を解析する。

  • Research Products

    (24 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (14 results) (of which Invited: 3 results) Book (3 results)

  • [Journal Article] Molecular basis for peroxisome biogenesis disorders2014

    • Author(s)
      *Fujiki, Y., Okumoto, K., Mukai, S., and Tamura, S.
    • Journal Title

      In: Brocard, C. and Hartig, A. (eds) Molecular machines involved in peroxisome biogenesis and maintenance, Berlin, Springer-Verlag

      Volume: N/A Pages: in press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular complex coordinating peroxisome morphogenesis in mammalian cells2014

    • Author(s)
      *Fujiki, Y., Itoyama, A., Abe, Y., and Honsho, M.
    • Journal Title

      In: Brocard, C. and Hartig, A. (eds) Molecular machines involved in peroxisome biogenesis and maintenance, Berlin, Springer-Verlag

      Volume: N/A Pages: in press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Very-long-chain polyunsaturated fatty acids accumulate in phosphatidylcholine of fibroblasts from patients with Zellweger syndrome and acyl-CoA oxidase1 deficiency2014

    • Author(s)
      Abe, Y., Honsho, M., Nakanishi, H., Taguchi, R., and *Fujiki, Y.
    • Journal Title

      Biochimica Biophysica Acta- Molecular and Cell Biollogy of Lipids

      Volume: 1841 Pages: 610-619

    • DOI

      10.1016/j.bbalip.2014.01.001.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Distinct modes of ubiquitination of peroxisome-targeting signal type 1 (PTS1)-receptor Pex5p regulate PTS1 protein import2014

    • Author(s)
      Okumoto, K., Noda, H., and *Fujiki, Y.
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 289 Pages: in press

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.527937.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] System to quantify the import of peroxisomal matrix proteins by fluorescence intensity2013

    • Author(s)
      Noguchi, M., Okumoto, K., and *Fujiki, Y.
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 18 Pages: 476-492

    • DOI

      10.1111/gtc.12051.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mff functions with Pex11pbeta and DLP1 in peroxisomal fission2013

    • Author(s)
      Itoyama, A., Michiyuki, S., Honsho, M., Yamamoto, T., Moser, A., Yoshida, Y., and *Fujiki, Y.
    • Journal Title

      Biology Open

      Volume: 2 Pages: 998-1006

    • DOI

      10.1242/bio.20135298.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Topogenesis and homeostasis of fatty acyl-CoA reductase 12013

    • Author(s)
      Honsho, M., Asaoku, S., Fukumoto, K., and *Fujiki, Y.
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 288 Pages: 34588-34598

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.498345.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Biogenesis and assembly of peroxisomal proteins

    • Author(s)
      Yukio Fujiki
    • Organizer
      EMBO conference: Protein transport systems:From Structure to Function (開催期間: April 13-17, 2013)
    • Place of Presentation
      Dubrovnik, Croatia
    • Invited
  • [Presentation] Peroxisome Membrane Biogenesis in Mammals

    • Author(s)
      Yukio Fujiki
    • Organizer
      ASBMB Special Symposia: The Multitasking Endoplasmic Reticulum in Health and Disease (開催期間: May 1-3, 2013)
    • Place of Presentation
      Airlie Center, Warrenton, Va, USA
    • Invited
  • [Presentation] ペルオキシソームタンパク質膜透過装置複合体の同定と膜透過メカニズム

    • Author(s)
      田村 茂彦、矢田裕人、藤木幸夫
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会 (開催期間: 2013年9月11-13日)
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [Presentation] ペルオキシソーム移行シグナル1型(PTS1)レセプターPex5pの新規結合因子、P5BP1の同定

    • Author(s)
      奥本 寛治、白濱友里、藤木幸夫
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [Presentation] エーテルリン脂質プラスマローゲンによるコレステロール生合成の制御

    • Author(s)
      本庄 雅則、藤木幸夫
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [Presentation] ペルオキシソーム形態異常による細胞内リン脂質代謝への影響解析

    • Author(s)
      阿部 雄一、本庄 雅則、石原 直忠、三原 勝芳、Ronald J.A. Wanders、藤木 幸夫
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [Presentation] ヒト乳癌由来MCF-7細胞はプラスマローゲン合成不全細胞である

    • Author(s)
      高橋 公紀、本庄雅則、藤木幸夫
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [Presentation] Direct targeting of membrane proteins to mammalian peroxisomes

    • Author(s)
      Yuqiong Liu, Yuichi Yagita, and Yukio Fujiki
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [Presentation] 哺乳類ペキソファジーにおけるアダプタータンパク質の役割

    • Author(s)
      山下 俊一、藤木幸夫
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [Presentation] Dynamic and functional assembly of the AAA peroxins, Pex1p and Pex6p, and their membrane receptor Pex26p in shuttling of PTS1-receptor Pex5p during peroxisome biogenesis

    • Author(s)
      Yukio Fujiki
    • Organizer
      10th International Conference on AAA+ Proteins From Mechanisms and Disease to Targets (開催期間: September 15-19, 2013)
    • Place of Presentation
      Comundo Conference Center, Neuss, Germany
    • Invited
  • [Presentation] A novel AAA ATPase interacting with Pex7 modulates plasmalogen synthesis

    • Author(s)
      Hajime Niwa, Yasuhiro Miyauchi-Nanri, Masanori Honsho, and Yukio Fujiki
    • Organizer
      10th International Conference on AAA+ Proteins From Mechanisms and Disease to Targets
    • Place of Presentation
      Comundo Conference Center, Neuss, Germany
  • [Presentation] RING peroxin complexes comprising Pex10p and Pex12p ubiquitinate the PTS1 receptor Pex5p and regulate its shuttling between peroxisomes and the cytosol

    • Author(s)
      Kanji Okumoto, Hiromi Noda, and Yukio Fujiki
    • Organizer
      PerFuMe Kick-Off Conference on peroxisome biology (開催期間: December 1-4, 2013)
    • Place of Presentation
      Hampshire Plaza, Groningen, The Netherlands
  • [Presentation] Targeting pathway and signal of a novel peroxisomal tail-anchored proteins PMP55

    • Author(s)
      Yuichi Yagita, Yukio Fujiki
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会 (開催期間:2013年12月3-6日)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
  • [Presentation] Identification of a novel protein interacting with peroxisome targeting signal type 1 (PTS1) receptor, Pex5p

    • Author(s)
      Yuri Shirahama, Kanji Okumoto, and Yukio Fujiki
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
  • [Book] 医学のあゆみ 特集 「生命と脂質: 最新の研究と臨床」 Vol.248, No.13, ペルオキシソームの脂質代謝2014

    • Author(s)
      藤木 幸夫、 本庄 雅則
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      医歯薬出版
  • [Book] 細胞工学 8月号 特集:テイルアンカー型タンパク質の細胞内輸送と膜挿入機構~現代生物学に残された謎の一つがいま解かれる~Overview~2013

    • Author(s)
      藤木 幸夫
    • Total Pages
      3
    • Publisher
      秀潤社
  • [Book] 細胞工学 8月号 特集:テイルアンカー型タンパク質の細胞内輸送と膜挿入機構~テイルアンカー型ペルオキシソームタンパク質の輸送機構2013

    • Author(s)
      八木田 悠一、 藤木 幸夫
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      秀潤社

URL: 

Published: 2015-05-28  

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