2014 Fiscal Year Annual Research Report
パーソナルゲノム解析によるてんかんの分子生物学的発症機序の解明
Publicly Offered Research
Project Area | Personal genome-based initiatives toward understanding bran diseases |
Project/Area Number |
25129708
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Research Institution | Fukuoka University |
Principal Investigator |
廣瀬 伸一 福岡大学, 医学部, 教授 (60248515)
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Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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Keywords | てんかん / 遺伝子変異 / エクソーム / 次世代シークエンサー |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究は永らく不明である小児特発性てんかんの責任遺伝子の多くを網羅的に探索し、てんかんに対して遺伝子プロファイリングからのアプローチを用いて分子病態を解明することを目的とした。てんかん責任遺伝子の同定に次シークエンサーを用いた全エクソーム解析を実施した。はじめに、乳児悪性焦点移動性部分発作(MMPSI)と良性家族性新生児てんかん(BFNE)対象とした。独自の責任遺伝同定パイプラインとコンピュータープログラムを用いることにより責任遺伝子を絞り込んだ。MMPSI では19 のバリアントを絞り込んだ。現在確認をサンガー法で行っており、11 は偽陽性あることを確認して、残り8 個の中より原因遺伝子を確認中である。BFNE では、てんかん発作に係る824 遺伝子中に43 バリアントが存在した。この中であるK+チャネルの遺伝子のバリアントは発端者4 人中2 名共通していた。このチャネルはてんかんと関係すると報告されているKCNQ2、KCNQ3、KCNB1, KCNC1 のK+チャネルと密接な関係があった。このため変異を有する本K+チャネルの機能を解析中である。このほか、夜間前頭葉てんかんの9例に対しエクソームシークエンスを終了した。片麻痺性片頭痛に対しても4例で、PCDH19関連てんかんでは3家系の3トリオでのエクソームシークエンスを実施中である。熱性けいれんでは典型的な熱性けいれんの10家系10名でエクソームシークエンスを実施した。このように症例の集積により、原因遺伝子探索を引き続き行う予定である。
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Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(26 results)
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[Journal Article] Single Nucleotide Variations in CLCN6 Identified in Patients with Benign Partial Epilepsies in Infancy and/or Febrile Seizures.2015
Author(s)
Yamamoto T, Shimojima K, Sangu N, Komoike Y, Ishii A, Abe S, Yamashita S, Imai K, Kubota T, Fukasawa T, Okanishi T, Enoki H, Tanabe T, Saito A, Furukawa T, Shimizu T, Milligan CJ, Petrou S, Heron SE, Dibbens LM, Hirose S, Okumura A.
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Journal Title
PLoS ONE
Volume: 10(3)
Pages: e0118946
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Clinical and genetic features of acute encephalopathy in children taking theophylline.2015
Author(s)
Saitoh M, Shinohara M, Ishii A, Ihara Y, Hirose S, Shiomi M, Kawawaki H, Kubota M, Yamagata T, Miyamoto A, Yamanaka G, Amemiya K, Kikuchi K, Kamei A, Akasaka M, Anzai Y, Mizuguchi M.
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Journal Title
Brain Dev
Volume: 37
Pages: 463-70
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Immediate suppression of seizure clusters by corticosteroids in PCDH19 female epilepsy.2015
Author(s)
Higurashi N, Takahashi Y, Kashimada A, Sugawara Y, Sakuma H, Tomonoh Y, Inoue T, Hoshina M, Satomi R, Ohfu M, Itomi K, Takano K, Kirino T, Hirose S.
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Journal Title
Seizure
Volume: 27
Pages: 1-5
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] The kick-in system: a novel rapid knock-in strategy.2014
Author(s)
Tomonoh Y, Deshimaru M, Araki K, Miyazaki Y, Arasaki T, Tanaka Y, Kitamura H, Mori F, Wakabayashi K, Yamashita S, Saito R, Itoh M, Uchida T, Yamada J, Migita K, Ueno S, Kitaura H, Kakita A, Lossin C, Takano Y, Hirose S.
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Journal Title
PLoS ONE
Volume: 9(2)
Pages: e88549
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Elfn1 recruits presynaptic mGluR7 in trans and its loss results in seizures.2014
Author(s)
Tomioka NH, Yasuda H, Miyamoto H, Hatayama M, Morimura N, Matsumoto Y, Suzuki T, Odagawa M, Odaka YS, Iwayama Y, Won Um J, Ko J, Inoue Y, Kaneko S, Hirose S, Yamada K, Yoshikawa T, Yamakawa K, Aruga J.
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Journal Title
Nat Commun
Volume: 5
Pages: 4501
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Genotype-phenotype correlations in alternating hemiplegia of childhood.2014
Author(s)
Sasaki M, Ishii A, Saito Y, Morisada N, Iijima K, Takada S, Araki A, Tanabe Y, Arai H, Yamashita S, et al 34番目
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Journal Title
Neurology
Volume: 82(6)
Pages: 482-90
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Association of nonsense mutation in GABRG2 with abnormal trafficking of GABAA receptors in severe epilepsy.2014
Author(s)
Ishii A, Kanaumi T, Sohda M, Misumi Y, Zhang B, Kakinuma N, Haga Y, Watanabe K, Takeda S, Okada M, Ueno S, Kaneko S, Takashima S, Hirose S.
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Journal Title
Epilepsy Res
Volume: 108(3)
Pages: 420-32
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Case of Desbuquois dysplasia type 1: potentially lethal skeletal dysplasia.2014
Author(s)
Inoue S, Ishii A, Shirotani G, Tsutsumi M, Ohta E, Nakamura M, Mori T, Inoue T, Nishimura G, Ogawa A, Hirose S.
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Journal Title
Pediatr Int
Volume: 56(4)
Pages: e26-9
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Distinct neurological disorders with ATP1A3 mutations.2014
Author(s)
Heinzen EL, Arzimanoglou A, Brashear A, Clapcote SJ, Gurrieri F, Goldstein DB, Johannesson SH, Mikati MA, Neville B, Nicole S, Ozelius LJ, Poulsen H, Schyns T, Sweadner KJ, van den Maagdenberg A, Vilsen B, for the ATPAWG, (Hirose S, et al, ).
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Journal Title
Lancet Neurol
Volume: 13(5)
Pages: 503-14
DOI
Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Presentation] A recurrent KCNT1 mutation in two sporadic cases with malignant migrating partial seizures in infancy2014
Author(s)
Okumura A, Ishii A, Shioda M, Kidokoro H, Sakauchi, M, Shimada S, Shimizu T, Osawa M, Hirose S, Yamamaoto T.
Organizer
The 16th annual meeting of the infantile seizure society
Place of Presentation
TURKEY
Year and Date
2014-06-22 – 2014-06-27
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[Presentation] A Neonatal Case of Malignant Migrating Partial Seizures in infancy2014
Author(s)
Sato T, Watanabe Y, Watanabe K, Yamashita M, Hashimoto K, Dateki S, Shirakawa T, Nakashima Y, Ihara Y, Ishii A, Hirose S, Moriuchi H
Organizer
The 16th annual meeting of the infantile seizure society
Place of Presentation
TURKEY
Year and Date
2014-06-22 – 2014-06-27
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