2014 Fiscal Year Annual Research Report
悪性神経膠腫の可塑性と悪性転化メカニズムの解明に向けたシステム生物学的アプローチ
Publicly Offered Research
| Project Area | Integrative Systems Understanding of Cancer for Advanced Diagnosis, Therapy and Prevention |
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25134702
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
武笠 晃丈 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (90463869)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 悪性神経膠腫 / オミクス解析 / システム生物学 / 可塑性 / 悪性転化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
昨年度に引き続き、神経膠腫の悪性転化に伴い変化を遂げるオミクスデータの取得とその比較解析を行った。イルミナ社Infinium 450Kアレイによるゲノムワイドなエピゲノム解析や、次世代シークエンサー HiSeqを使用したRNAシークエンス解析による網羅的トランスクリプトーム解析に加え、エクソームシークエンス解析による網羅的遺伝子変異同定や、SNPアレイによる網羅的ゲノム異常の解析を行った。
続いて、これら包括的データの比較統合解析を、バイオインフォマティクスの手法を用いて施行するとともに、公共データベースからTCGA（The Cancer Genome Atlas)の膠芽腫の解析データを取得して、比較解析を行った。悪性転化にともない脱メチル化する領域は、プロモーター以外のゲノム領域に大多数は認めていたものの、このような解析により、悪性転化に伴ってプロモーター領域を中心とした脱メチル化をきたし、これに伴って発現が上昇する遺伝子を複数抽出することが出来た。このような分子につき、定量的RT-PCRによる検討にて遺伝子発現解析の結果の検証を行ったところ、実際に同定した特定の遺伝子においては、プロモーター領域の脱メチル化にともない、遺伝子発現が上昇し、免疫染色においても蛋白レベルでの発現上昇を認めていることを確認することができた。このような分子が、悪性転化した神経膠腫における、良い治療標的となることが期待された。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Evolution of DNA repair defects during malignant progression of low-grade gliomas after temozolomide treatment.2015
Author(s)
van Thuijl HF, Mazor T, Johnson BE, Fouse SD, Aihara K, Hong C, Malmström A, Hallbeck M, Heimans JJ, Kloezeman JJ, Stenmark-Askmalm M, Lamfers ML, Saito N, Aburatani H, Mukasa A, Berger MS, Söderkvist P, Taylor BS, Molinaro AM, Wesseling P, Reijneveld JC, Chang SM, Ylstra B, Costello JF
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Journal Title
Acta Neuropathol.
Volume: 129
Pages: 597-607
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Intracranial Germ Cell Tumor Genome Analysis Consortium (iGCT Consortium). Mutually exclusive mutations of KIT and RAS are associated with KIT mRNA expression and chromosomal instability in primary intracranial pure germinomas.2014
Author(s)
Fukushima S, Otsuka A, Suzuki T, Yanagisawa T, Mishima K, Mukasa A, Saito N, Kumabe T, Kanamori M, Tominaga T, Narita Y, Shibui S, Kato M, Shibata T, Matsutani M, Nishikawa R, Ichimura K
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Journal Title
Acta Neuropathol.
Volume: 127
Pages: 911-925
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] 5-Hydroxymethylcytosine plays a critical role in glioblastomagenesis by recruiting the CHTOP-methylosome complex.2014
Author(s)
Takai H, Masuda K, Sato T, Sakaguchi Y, Suzuki T, Suzuki T, Koyama-Nasu R, Nasu-Nishimura Y, Katou Y, Ogawa H, Morishita Y, Kozuka-Hata H, Oyama M, Todo T, Ino Y, Mukasa A, Saito N, Toyoshima C, Shirahige K, Akiyama T.
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Journal Title
Cell Rep.
Volume: 9
Pages: 48-60
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Frequent H3F3A K27M Mutations in Thalamic Gliomas from Young Adult Patients2014
Author(s)
Mukasa A, Aihara K, Gotoh D, Saito K, Nagae G, Tsuji S, Tatuno K, Yamamoto S, Takayanagi S, Narita Y, Shibui S, Aburatani H, Saito N
Organizer
20th International Conference on Brain Tumor Research and Therapy
Place of Presentation
Truckee (USA)
Year and Date
2014-07-20 – 2014-07-23
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[Presentation] H3F3A K27M Mutations in Thalamic Gliomas from Young Adult Patients2014
Author(s)
Akitake Mukasa, Koki Aihara, Kengo Gotoh, Kuniaki Saito, Genta Nagae, Shingo Tsuji, Kenji Tatuno, Shogo Yamamoto, Shunsaku Takayanagi, Yoshitaka Narita, Soichiro Shibui, Hiroyuki Aburatani, Nobuhito Saito.
Organizer
American Association for Cancer Research(AACR) Annual Meeting
Place of Presentation
San Diego (USA)
Year and Date
2014-04-05 – 2014-04-09
