2015 Fiscal Year Annual Research Report
生細胞内の秩序構造が誘起する蛋白質立体構造の安定性
Publicly Offered Research
| Project Area | Dynamical ordering of biomolecular systems for creation of integrated functions |
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26102538
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| Research Institution | Tokyo Metropolitan University |
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Principal Investigator |
池谷 鉄兵 首都大学東京, 理工学研究科, 助教 (30457840)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | in-cell NMR / NMR立体構造解析 / PCS |
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| Outline of Annual Research Achievements |
蛋白質の細胞内ダイナミクス解析では，TTHA1718とGB1蛋白質について，T1, T2, DESTのモデル解析を行った．解析の結果，細胞内では100msec程度の交換速度で，TTHA1718とGB1蛋白質の数%が細胞内の超巨大分子と相互作用していることが示唆された．特定の相互作用部位の存在は示唆されなかった．現在，人工の分子クラウダーでも同様な解析を行い，細胞内環境のデータとの比較を進めている．
不安定構造を有する蛋白質の細胞内解析では，pH 6.0の通常の緩衝液下でフォールドとアンフォールド構造が1:1で存在することが明らかになっているDrk蛋白質の構造解析を進めている．これまで，アンフォールド状態を持つと知られている蛋白質N末端側のSH3ドメインのみの解析を行ってきたが，本年度は，Drk蛋白質全長の構造解析を行った．全長の解析から，二状態存在する機構の解明と，この蛋白質の本来持つ特性を理解することを目指す．Drk蛋白質全長の試料は，cell freeのシステムを用いることで，大量発現と精製に成功した．3D 3重共鳴スペクトルの測定にも成功し，現在，蛋白質主鎖連鎖帰属の解析を進めている．
大腸菌を用いた蛋白質の立体構造決定では，QME(Quantitative Maximum Entropy)によるNMR信号の再構成，FLYAによる蛋白質側鎖の共鳴信号の自動帰属，ベイズ推定を用いた立体構造計算の３つの新規手法を組み合わせることで，従来よりもはるかに高精度に立体構造が決定できることを示した．
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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