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Development of polarization-dependent fluorescence correlation spectroscopy for initial process analysis of protein aggregation

Research Project

Project/Area Number 16K07312
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Biophysics
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology (2018)
Hokkaido University (2016-2017)

Principal Investigator

Yamamoto Johtaro  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (20585088)

Research Collaborator Kitamura Akira  
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2017: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2016: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Keywords蛍光計測 / 蛍光相関分光法 / タンパク質凝集 / 動態計測 / 拡散 / 並進拡散 / 回転拡散 / タンパク質凝集体 / 偏光蛍光相関分光法 / タンパク質 / 核酸の構造 / 動態 / 凝集性タンパク質
Outline of Final Research Achievements

In this work, we developed a polarization-dependent fluorescence correlation spectroscopy (Pol-FCS), which analyzes translational and rotational diffusion of molecules such as proteins. Size measurement of molecular aggregation using Pol-FCS inside living cells was successfully demonstrated. In addition, we found the Pol-FCS can also estimate orientation of molecules (ordered/disordered) and degree of macromolecular crowding. Thus, the Pol-FCS was a more powerful tool than we expected. In future, we expect the Pol-FCS will be widely used in biology such as the researches about aggregation prone proteins.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、タンパク質分子のランダムな並進移動と回転の速さを解析する計測装置(偏光蛍光相関分光装置、Pol-FCS装置)を用いることで、分子の凝集の程度や凝集している分子の方向の乱雑さを生きた細胞の中でそのまま測定できることを世界で初めて実証しました。アルツハイマー症のようにタンパク質の凝集が関連していると考えられている様々な疾患において、Pol-FCSは疾患の機序や治療法の研究の大きな手助けになります。また近年では、タンパク質をバイオ医薬品として用いられるようになっており、その凝集状態を評価可能なPol-FCSはより安定なバイオ医薬品の開発や品質管理に大きく寄与できると期待できます。

Report

(4 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2018 2017 2016 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (11 results) (of which Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Multipoint fluorescence correlation spectroscopy using spatial light modulator2018

    • Author(s)
      Yamamoto Johtaro、Mikuni Shintaro、Kinjo Masataka
    • Journal Title

      Biomedical Optics Express

      Volume: 9 Issue: 12 Pages: 5881-5881

    • DOI

      10.1364/boe.9.005881

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Relationship Between Homodimeric Glucocorticoid Receptor and Transcriptional Regulation Assessed via an In Vitro Fluorescence Correlation Spectroscopy-Microwell System2018

    • Author(s)
      Oasa Sho、Mikuni Shintaro、Yamamoto Johtaro、Kurosaki Tsumugi、Yamashita Daisuke、Kinjo Masataka
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Issue: 1 Pages: 7488-7488

    • DOI

      10.1038/s41598-018-25393-w

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Two-detector number and brightness analysis reveals spatio-temporal oligomerization of proteins in living cells2018

    • Author(s)
      Ryosuke Fukushima, Johtaro Yamamoto, Hideto Ishikawa, Masataka Kinjo
    • Journal Title

      Methods

      Volume: 印刷中 Pages: 161-171

    • DOI

      10.1016/j.ymeth.2018.03.007

    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Polarization-dependent fluorescence correlation spectroscopy for studying structural properties of proteins in living cell2016

    • Author(s)
      Makoto Oura, Johtaro Yamamoto, Hideto Ishikawa, Shintaro Mikuni, Ryousuke Fukushima, Masataka Kinjo
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 31091-31091

    • DOI

      10.1038/srep31091

    • Related Report
      2016 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 偏光蛍光相関分光法の生物学的応用2018

    • Author(s)
      山本条太郎, 松井亮人, 桃崎哲, 金城政孝
    • Organizer
      第15回バイオオプティクス研究会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 蛍光のゆらぎから何が分かるか2018

    • Author(s)
      山本条太郎
    • Organizer
      第8回光科学異分野横断萌芽研究会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Verification of macromolecule species in intracellular macromolecular crowding condition application to cell cycle study2018

    • Author(s)
      松井亮人, 山本条太郎, 金城政孝
    • Organizer
      第56回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Study of the orientation dependency of fraction of rotational diffusion in Polarization-dependent Fluorescence Correlation Spectroscopy2018

    • Author(s)
      桃崎哲, 山本条太郎, 金城政孝
    • Organizer
      第56回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞周期における細胞内高分子クラウディング状態の解析に向けて2018

    • Author(s)
      松井亮人, 顔総子, 福島綾介, 山本条太郎, 金城政孝
    • Organizer
      平成29年度 北大細胞生物研究集会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 偏光蛍光相関分光法によるタンパク質構造解析に向けて2018

    • Author(s)
      顔総子, 山本条太郎, 金城政孝
    • Organizer
      第3回北大・部局横断シンポジウム
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] Evaluation of molecular crowding based on the rotational and translational diffusion measurement in living cells2017

    • Author(s)
      山本条太郎
    • Organizer
      第55回 日本生物物理学会年会 シンポジウム「高分子混雑が支配する細胞の世界」
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] tudy of the Structural Change in Protein using Polarization-dependent Fluorescence Correlation Spectroscopy2017

    • Author(s)
      顔総子, 山本条太郎, 金城政孝
    • Organizer
      第55回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 偏光蛍光相関分光法による高分子混雑の評価2017

    • Author(s)
      山本条太郎
    • Organizer
      第14回バイオオプティクス研究会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Pol-FCS測定における回転拡散成分振幅の分子配向依存性の検証2017

    • Author(s)
      顔総子、大浦真、山本条太郎、金城政孝
    • Organizer
      2016年度 日本生物物理学会北海道支部例会・第23回ファーマサイエンスフォーラム・北海道大学創薬センター 合同シンポジウムジョイントセッション
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道・札幌市)
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Presentation] 蛍光偏光相関分光法により明らかになった生細胞内での分子混雑と回転拡散の関係2016

    • Author(s)
      大浦真、山本条太郎、松本昴大、グン チェンピン、金城政孝
    • Organizer
      第54回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県・つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25
    • Related Report
      2016 Research-status Report
  • [Remarks] 北海道大学プレスリリース

    • URL

      http://www.hokudai.ac.jp/news/160808_sci_pr.pdf

    • Related Report
      2016 Research-status Report

URL: 

Published: 2016-04-21   Modified: 2020-03-30  

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