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Search for new ergosterol binding amphiphilic compounds

Research Project

Project/Area Number 17K08342
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Natural medicines
Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

Nakashma Takuji  北里大学, 北里生命科学研究所, 特任准教授 (40526216)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松本 厚子  北里大学, 感染制御科学府, 准教授 (20300759)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2019: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2017: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywords放線菌 / 二次代謝産物 / 生物活性物質 / 樹脂(分離剤) / エルゴステロール / ESシリカ / シリカゲル / ジピリマイシン / クロマトグラフィー / シリカゲル樹脂 / 天然物 / 抗真菌活性
Outline of Final Research Achievements

Ergosterol is an essential component for fungal growth. we developed silica-binding ergosterol (ES silica) resin and searched for natural products interacting with ergosterol from actinomycete culture broths. And 24 natural products were deduced as new ones. Dipyrimicins and Dietziamide C, new compounds interacted with ES silica, were discovered from actinomycete culture extracts. Dipyrimicin B possesses a 2,2′-dipyridine core skeleton with amide groups. The amide group in dipyrimicin B could be the primary factor involved in the interaction with ES silica. Dietziamide C is a unique structure that possesses a N,N,N-trimethylpropan-1-aminium at the center of tetramic acid dimer. It was suggested that ES silica interacts with microbial alkaloids.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ジピリマイシンの結果からESシリカとの相互作用は化合物内にあるアミド基が重要であることがわかった。また、既知物質同定の結果から検出できた化合物のうち8割が窒素を含む化合物であった。ESシリカは既存樹脂であるODSやシリカと異なる特徴を示した。天然物の精製分野でESシリカを新規樹脂として提案することができた。
ESシリカは新規樹脂(分離剤)として開発でき、共同研究先である富士シリシア化学と特許を共同出願することができた。ESシリカは富士シリシア化学から販売されたことは社会的意義として大きい。

Report

(4 results)
  • 2019 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2018 Research-status Report
  • 2017 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2020 2019 2018 2017

All Journal Article (1 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Dipyrimicin A and B, microbial compounds isolated from Amycolatopsis sp. K16-01942018

    • Author(s)
      Izuta Shoko、Kosaka Shohei、Kawai Makoto、Miyano Rei、Matsuo Hirotaka、Matsumoto Atsuko、Nonaka Kenichi、Takahashi Yoko、Omura Satoshi、Nakashima Takuji
    • Journal Title

      The Journal of Antibiotics

      Volume: 71 Issue: 5 Pages: 535-537

    • DOI

      10.1038/s41429-018-0028-0

    • Related Report
      2018 Research-status Report 2017 Research-status Report
  • [Presentation] Search for new compounds from actinomycetes using ES silica.2020

    • Author(s)
      1.Nakashima, T., Izuta, S., Kosaka, S., Suda, M., Kanchanasin, P., Suzuki, Y., Miyano1, R., Matsuo1, H., Tanasupawat, S., Takahashi, Y., Omura, S.
    • Organizer
      3rd Natural Product Discovery and Development in the Genomic Era
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 微生物ダークマターが創り出す未知物質の探索2019

    • Author(s)
      中島琢自、松尾洋孝、高橋洋子、大村智
    • Organizer
      2019年度日本生物工学会大会シンポジウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Physicochemical screening による新規物質の探索2019

    • Author(s)
      中島琢自
    • Organizer
      天然物創薬研究会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] エルゴステロール修飾シリカゲルの特徴と新規化合物の探索2019

    • Author(s)
      伊豆田祥子、宮野怜、松本厚子、高橋洋子、大村智、中島 琢自
    • Organizer
      第34回日本放線菌学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] エルゴステロール樹脂を用いた新規物質の探索2018

    • Author(s)
      伊豆田祥子、 高坂尚平、 河合真、 宮野怜、松尾洋孝、 松本厚子、 三浦宏美、 野中健一、 高橋洋子、 大村智、 中島琢自
    • Organizer
      2018年度日本農芸化学会大会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 微生物が作り出す宝物の探し方2018

    • Author(s)
      中島琢自
    • Organizer
      富士シリシア化学株式会社 社内講演会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Physicochemical screening による微生物新規物質の探索2018

    • Author(s)
      中島琢自
    • Organizer
      2019年度日本農芸化学会ランチョンセミナー
    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 微生物の底力 Potential Power of Microorganisms2018

    • Author(s)
      中島琢自
    • Organizer
      天野エンザイム株式会社 社内講演会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Physicochemical screeningによる新規二次代謝産物の探索2018

    • Author(s)
      中島琢自
    • Organizer
      第 62 回日本放線菌学会学術講演会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] Search for new microbial metabolites by physicochemical screening using new resin, ES-silica2018

    • Author(s)
      中島琢自
    • Organizer
      Kitasato Univ. - Mahidol Univ. Joint Symposium, Microbial Natural Products: Discovery of Novel Bioactive Compounds and Biosynthetic Pathways
    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] エルゴステロール樹脂を用いた新規物質の探索2017

    • Author(s)
      伊豆田祥子,宮野怜,松本厚子,三浦宏美,野中健一,高橋洋子,大村智,中島琢自.
    • Organizer
      日本放線菌学会大会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] エルゴステロール樹脂を用いた新規物質の探索2017

    • Author(s)
      伊豆田祥子、 高坂尚平、 河合真、 宮野怜,松尾洋孝、 松本厚子、 三浦宏美、 野中健一、 高橋洋子、 大村智、 中島琢自
    • Organizer
      日本農芸化学会大会
    • Related Report
      2017 Research-status Report

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Published: 2017-04-28   Modified: 2021-02-19  

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