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Molecular mechanisms of environment-dependent germ cell determination in land plants

Research Project

Project/Area Number 19K16166
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

YOSHITAKE YOSHIHIRO  京都大学, 生命科学研究科, 助教 (10839179)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywordsエピジェネティクス / 転写因子 / 生殖細胞 / ゼニゴケ / 進化 / 環境情報 / クロマチン / 環境応答 / 陸上植物 / 生殖細胞形成 / クロマチンリモデリング
Outline of Research at the Start

環境情報を適切に読み取り、配偶子(生殖細胞)を着実に形成することは“種”の確立を可能とし、進化の原動力となった。本研究では、基部陸上植物を用いた解析を通じて、生殖細胞系列分化の転写機構についてクロマチンの動態を含めた全体像を把握することで本質となる知見を抽出し、単に祖先的な植物が有していた生殖細胞系列への分化機構の解明に留まることなく、変動する厳しい地球環境に対して、植物が種の保存のためにいかに「多様性」を獲得し「普遍性」を保持してきたのか、その生存戦略を学ぶ。また、本質的理解がもたらす知見を生殖細胞分化の人為的制御に向けて応用することで育種戦略の立案や産業植物への還元を目指す。

Outline of Final Research Achievements

Germ cell differentiation is a critical for maintaining organisms. Day length is one of the key determinants in plants. In bryophytes, the molecular mechanism of day-length recognition has long been unknown. In this study, we demonstrated that a molecular module homologous to that of Arabidopsis thaliana regulates day-length recognition and comprehensively showed the gene cluster regulated by this molecular module. Furthermore, by comparing the regulatory genes of Arabidopsis and Marchantia, we were able to discover pathways that are conserved across evolution.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、苔類ゼニゴケにおいて日長 (光周性) を感知する分子機構を詳細に解析しこの感知モジュールが制御する遺伝子の進化的な共通性を見出した。単系統群で進化する陸上植物において、コケ植物と被子植物の遺伝的経路 (パスウェイ) の比較解析は、進化的変遷を超えて保存される経路の抽出を可能とし、経路に重み付けを与えることで、光周性経路の基本骨格すなわち本質を見出すことに成功した。生物的意義については今後の解析が待たれるが、栄養状態を適切に保つことが重要であると推察される。また本研究は、コケ植物では困難であった実験技術の障壁を数多く乗り越えており、今後の植物間のパスウェイ解析を円滑に実行可能にした。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Identification of the sex-determining factor in the liverwort Marchantia polymorpha reveals unique evolution of sex chromosomes in a haploid system2021

    • Author(s)
      Miyuki Iwasaki Katsuyuki T. Yamato John L. Bowman Takayuki Kohchi et al
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 31 Issue: 24 Pages: 5522-5532.e7

    • DOI

      10.1016/j.cub.2021.10.023

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Design principles of a minimal auxin response system2020

    • Author(s)
      Kato Hirotaka、Mutte Sumanth K.、Suzuki Hidemasa、Crespo Isidro、Das Shubhajit、Radoeva Tatyana、Fontana Mattia、Yoshitake Yoshihiro、Hainiwa Emi、van den Berg Willy、Lindhoud Simon、Ishizaki Kimitsune、Hohlbein Johannes、Borst Jan Willem、Boer D. Roeland、Nishihama Ryuichi、Kohchi Takayuki、Weijers Dolf
    • Journal Title

      Nature Plants

      Volume: 6 Issue: 5 Pages: 473-482

    • DOI

      10.1038/s41477-020-0662-y

    • Related Report
      2020 Research-status Report 2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] コケ植物の解析から明らかになった陸上植物の環境依存的な有性生殖起動メカニズムの進化2021

    • Author(s)
      吉竹良洋, 山岡尚平, 川村昇吾, 西浜 竜一 ,河内孝之
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] アンチセンス長鎖非翻訳RNA SUFの転写は苔類ゼニゴケの雌性分化の抑制に重要である2021

    • Author(s)
      梶原智明, 宮崎基, 岩崎美雪, 山岡尚平, 吉竹良洋, 安居佑季子, 西浜竜一, 河内孝之
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 陸上植物進化から探る環境依存的な有性生殖プログラムの起動原理2020

    • Author(s)
      吉竹良洋・山岡尚平・西浜竜一・河内孝之
    • Organizer
      日本分子生物学会_年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 陸上植物進化から探る環境依存的な有性生殖プログラムの起動メカニズム2019

    • Author(s)
      吉竹良洋・山岡尚平・西浜竜一・河内孝之
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] MpCDF and MpTPL complex mediates repression of the photoperiodic growth-phase transition in Marchantia polymorpha2019

    • Author(s)
      Yoshihiro Yoshitake, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama and Takayuki Kohchi,
    • Organizer
      日本エピジェネティクス研究会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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