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Radiomics approach to a human disease model of medaka by in vivo MR microscopy

Research Project

Project/Area Number 20H03623
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 52040:Radiological sciences-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Ueno Tomohiro  京都大学, 医学研究科, 助教 (10379034)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 杉本 直三  京都大学, 医学研究科, 教授 (20196752)
麻生 俊彦  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 副チームリーダー (50397543)
木下 政人  京都大学, 農学研究科, 准教授 (60263125)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥18,200,000 (Direct Cost: ¥14,000,000、Indirect Cost: ¥4,200,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2020: ¥11,440,000 (Direct Cost: ¥8,800,000、Indirect Cost: ¥2,640,000)
Keywords磁気共鳴映像法 / 小型魚類 / ヒト疾患モデル / 個体識別 / ラジオミクス
Outline of Research at the Start

磁気共鳴映像法(MRI)などの医用画像を組み合わせ、診断や予後予測の精度の改善を目指すラジオミクスという手法が現在盛んに行われている。これまでに、我々はヒトの病気を発症するメダカのモデルを個体ごとに生きたまま、経時的に高解像度で可視化するMR顕微鏡(in vivo MR顕微鏡)を開発した。本研究では、in vivo MR 顕微鏡の解像度を細胞レベルに高め、ヒト疾患のメダカモデルに対し、ラジオミクスを個体ごとに経時的に行うことを目指す(細胞レベルラジオミクス)。この研究により、非侵襲的に細胞・組織的状態を特定でき、病態解明や治療法の開発に貢献できる。

Outline of Final Research Achievements

This research project was aimed at achieving a higher spatial resolution of in vivo MR microscopy without extending imaging time, and at monitoring an individual human disease model of medaka in a long term, and at investigating a disease process based on time-series analyses of correlations between extracted image parameters using a radiomics approach. The higher spatial resolution in in vivo MR microscopy was achieved by modifying the current MR microscope to a multi-channel system and introducing a compressed sensing approach. In addition, we established a non-invasive individual identification method based on dark spot patterns on the head of medaka. Moreover, multiple parameter analyses of a cancer suppressor gene p53 knock-out model medaka indicated a disease progression mechanism starting from kidneys.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

In vivo MR顕微鏡は、ヒト疾患モデルメダカを生きたまま、経時的に個体ごとに可視化できる。そのため、遅発性の疾患などで個体ごとに発症や進行が異なっても、その個体差を考慮した解析が可能である。さらに、確立した個体識別法を用いて飼育環境を維持し、環境変化や侵襲的識別方の影響を排除することで、疾患の個体差をより抑制できる。加えて、高解像度化により、より詳細な病態解析が可能となった。また、経時的可視化による個体追跡は、動物愛護の観点からも重要である。さらに、がん抑制遺伝子p53変異メダカの解析で示唆された結果は、脊椎動物で様々な役割を担うp53に関わる医療技術や治療への貢献が期待される。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2023 2022 2021 2020 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Individual identification of inbred medaka based on characteristic melanophore spot patterns on the head2023

    • Author(s)
      Hajime Morizumi, Naomi Sugimoto, Tomohiro Ueno
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 659-659

    • DOI

      10.1038/s41598-023-27386-w

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] MR顕微鏡のin vivoイメージング開発と2021

    • Author(s)
      上野智弘、森泉元、山田正翔
    • Journal Title

      アグリバイオ

      Volume: 62 Pages: 560-564

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] MR顕微鏡 in vivoイメージング開発と小型魚類疾患モデルへの応用2021

    • Author(s)
      上野智弘、森泉元、山田正翔
    • Journal Title

      細胞

      Volume: 53 Pages: 47-50

    • NAID

      40022470683

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Distribution pattern of dark spots on the head of medaka for individual identification over time2022

    • Author(s)
      Hajime Morizumi, Naomi Sugimoto, Tomohiro Ueno
    • Organizer
      17th International Zebrafish Conference
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Individual identification of medaka using a distribution pattern of dark spots on the head2022

    • Author(s)
      Hajime Morizumi, Naomi Sugimoto, Tomohiro Ueno
    • Organizer
      28th Japanese Medaka and Zebrafish Meeting
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] MR頭微鏡を用いたヒト疾患メダカモデルのin vivo撮像での圧縮センシングによる高解像度化の検討2022

    • Author(s)
      清水樹、杉本直三、上野智弘
    • Organizer
      第50回日本磁気共鳴医学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] in vivo MR顕微鏡の開発とメダカヒト疾患モデルへの応用2020

    • Author(s)
      上野智弘、森泉元
    • Organizer
      第14回NIBBバイオイメージングフォーラム
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] 遺伝子・環境が同じメダカを頭の斑点で識別―均質な実験動物のバイオメトリクス―

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2023-01-20-2

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Remarks] Connecting the dots

    • URL

      https://www.eurekalert.org/news-releases/982963

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Remarks] Connecting the dots

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/en/research-news/2023-03-17

    • Related Report
      2022 Annual Research Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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