Functional and structural analyses of the archaeal L-proline dehydrogenase complexes

• Project/Area Number: 21780099
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Applied biochemistry
• Research Institution: Saga University
• Principal Investigator: KAWAKAMI Ryushi Saga University, 総合分析実験センター, 助教 (90380120)
• Project Period (FY): 2009 – 2010
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2010)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2010: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2009: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
• Keywords: 酵素化学 / 構造生物学 / 生化学 / 超好熱アーキア / L-プロリン脱水素酵素複合体 / 鉄イオウクラスター / Thermococcus profundus / Pyrococcus horikoshii

Research Abstract

Two different types of ProDHs (α_4β_4 and αβγδ type) were distributed in the hyperthermophilic archaea. Functional and structural characteristics of both ProDHs were studied. Structure determination at high resolution of α_4β_4-type ProDH which the ICS was not broken, and mutational analysis of intersubunit disulfide bond in α subunit of α_4β_4-type ProDH were performed. Screening of crystallization condition of αβγδ type ProDH was also performed by preparing the ISC mutant enzymes. And the enzymatic properties of β subunits of both types of ProDHs were analyzed.

Research Products

• [Presentation] 超好熱アーキアのL-プロリン脱水素酵素サブユニットの機能解析 (2011)
  • Author(s): 川上竜巳、野口千明、東麻梨江、櫻庭春彦、大島敏久
  • Place of Presentation: 京都女子大学・京都(発表会は中止)
  • Year and Date: 2011-03-26
• [Presentation] 超好熱アーキア由来L-プロリン脱水素酵素サブユニットの機能解析 (2011)
  • Author(s): 川上竜巳
  • Organizer: 日本農芸化学会2011大会
  • Place of Presentation: 京都女子大学(発表会は中止)
  • Year and Date: 2011-03-26
• [Presentation] 超好熱アーキアのL-プロリン脱水素酵素サブユニットの比較解析 (2010)
  • Author(s): 野口千明、東麻梨江、櫻庭春彦、大島敏久、川上竜巳
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド・兵庫
  • Year and Date: 2010-12-10
• [Presentation] 超好熱アーキアPyrococcus horikoshiiのα_4β_4型色素依存性L-プロリン脱水素酵素複合体のシステイン残基の役割 (2010)
  • Author(s): 川上竜巳、櫻庭春彦、大島敏久
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド・兵庫
  • Year and Date: 2010-12-10
• [Presentation] 超好熱アーキアPyrococcus horikoshiiのα4β4型色素依存性L-プロリン脱水素酵素複合体のシステイン残基の役割 (2010)
  • Author(s): 川上竜巳
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド
  • Year and Date: 2010-12-10
• [Presentation] 超好熱アーキアのL-プロリン脱水素酵素サブユニットの比較解析 (2010)
  • Author(s): 野日千明(川上竜巳)
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド
  • Year and Date: 2010-12-10
• [Presentation] 超好熱アーキアのL-プロリン脱水素酵素サブユニットの機能解析 (2010)
  • Author(s): 野口千明、東麻梨江、櫻庭春彦、大島敏久、川上竜巳
  • Organizer: 日本農芸化学会西日本支部大会
  • Place of Presentation: 崇城大学・熊本
  • Year and Date: 2010-09-18
• [Presentation] 超好熱アーキアのL-プロリン脱水素酵素サブユニットの機能解析 (2010)
  • Author(s): 野日千明(川上竜巳)
  • Organizer: 日本農芸化学会西日本支部大会
  • Place of Presentation: 崇城大学
  • Year and Date: 2010-09-18
• [Presentation] 超好熱アーキア由来色素依存性L-プロリン脱水素酵素複合体のL-プロリン脱水素酵素サブユニットの機能解析 (2009)
  • Author(s): 東麻梨江、川上竜巳
  • Organizer: 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
  • Place of Presentation: 唐津シーサイドホテル・佐賀
  • Year and Date: 2009-09-10
• [Presentation] 超好熱アーキア由来色素依存性L-プロリン脱水素酵素複合体のL-プロリン脱水素酵素サブユニットの機能解析 (2009)
  • Author(s): 東麻梨江(川上竜巳)
  • Organizer: 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
  • Place of Presentation: 唐津シーサイドホテル
  • Year and Date: 2009-09-10