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Novel cell system developed by chemistry

Research Project

Project/Area Number 21K19052
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 37:Biomolecular chemistry and related fields
Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

MINAKAWA Noriaki  徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(薬学域), 教授 (40209820)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小暮 健太朗  徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(薬学域), 教授 (70262540)
田良島 典子  徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(薬学域), 准教授 (90755183)
Project Period (FY) 2021-07-09 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Keywords核酸化学 / 合成生物学 / 4'-チオ核酸 / 人工細胞 / 人工核酸 / セントラルドグマ / 合成セントラルドグマ
Outline of Research at the Start

本研究では、4’-チオ核酸 (4’-チオDNAと4’-チオRNA) を遺伝情報に持つ新しい人工細胞に細胞本来の機能を持たせた新しい細胞システムを構築する。その実現にむけて、①合成セントラルドグマ内包人工細胞の最適化、②最適化した人工細胞が、標的とした細胞に遊走・融合する機能を付与するために膜表面への機能性ドメインの提示、③機能化した人工細胞による新しい細胞システムの作動検証を行う。
これが達成できれば、標的とする細胞だけに効率的にタンパク質を輸送する (発現させる) ための技術革新を創出できる。

Outline of Final Research Achievements

In this research project, we aimed to create a new artificial cell system containing a synthetic central dogma composed of 4'-thionucleic acid.
As a result, we were able to confirm the progress of transcription and translation from 4'-thio DNA to protein via 4'-thioRNA in a one-pot, when rSG DNA (with 4'-thioguanosine substituted for the guanosine residue in the sequence) as a template and 4'-thiocytidine 5'-triphosphate (rSCTP) were used. Furthermore, we confirmed that this series of reactions occurred in artificial cells prepared by the thin film hydration method with 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DOPC).

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

「DNAに保存された遺伝情報はRNAへと転写され、タンパク質へと翻訳される」というセントラルドグマの概念は、全ての細胞の生命活動の根幹を成す。では、DNAやRNAは、セントラルドグマに基づく遺伝情報の保存と伝搬を担う唯一の物質なのであろうか。もし違うとすれば、DNAやRNAの代替えとなる物質を化学の力で創造出来ないだろうか。
本研究課題では、その解を求めることに挑戦し、4'-チオ核酸がその代替物質となることを証明した。この研究成果は、合成生物学の研究分野の広がりに大きな影響を与えると考えられる。

Report

(2 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • Research Products

    (23 results)

All 2023 2022

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Rewriting the Central Dogma with Synthetic Genetic Polymers2022

    • Author(s)
      Saito-Tarashima Noriko、Murai Akiho、Minakawa Noriaki
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 70 Issue: 5 Pages: 310-315

    • DOI

      10.1248/cpb.c21-00960

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • Year and Date
      2022-05-01
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  • [Journal Article] Synthesis and Anti-dengue Virus Activity of 5-Ethynylimidazole-4-carboxamide (EICA) Nucleotide Prodrugs2022

    • Author(s)
      Nakamura Motoki、Uemura Kentaro、Saito-Tarashima Noriko、Sato Akihiko、Orba Yasuko、Sawa Hirofumi、Matsuda Akira、Maenaka Katsumi、Minakawa Noriaki
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 70 Issue: 3 Pages: 220-225

    • DOI

      10.1248/cpb.c21-01038

    • NAID

      130008165548

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • Year and Date
      2022-03-01
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Cas9-mediated DNA cleavage guided by enzymatically prepared 4′-thio-modified RNA2022

    • Author(s)
      Saito-Tarashima Noriko、Ueno Mana、Murai Akiho、Matsuo Ayako、Minakawa Noriaki
    • Journal Title

      Organic Biomolecular Chemistry

      Volume: 20 Issue: 26 Pages: 5245-5248

    • DOI

      10.1039/d2ob00742h

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    • Author(s)
      Motani Kou、Saito-Tarashima Noriko、Nishino Kohei、Yamauchi Shunya、Minakawa Noriaki、Kosako Hidetaka
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 41 Issue: 12 Pages: 111868-111868

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111868

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      坂上祐貴、田良島典子、南川典昭
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      第61回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
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  • [Presentation] 4’-チオBNA/LNAヌクレオシドの合成研究2022

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      白木優也、前田璃音、宮澤俊輝、田良島典子、吉村祐一、南川典昭
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      第61回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
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    • Author(s)
      村井あきほ、田良島典子、南川典昭
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      第61回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
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  • [Presentation] 2’-置換-N4-ヒドロキシシチジン (NHC) 誘導体の合成および新型コロナウイルス (SARS-CoV-2) に対する活性評価2022

    • Author(s)
      上田直也、田良島典子、南川典昭
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      第61回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
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      川西香菜子、田良島典子、南川典昭
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  • [Presentation] 糖部フラノース環4’位に硫黄原子を有するcyclic dinucleotide (CDN) analogsの創薬化学研究2022

    • Author(s)
      近藤明希、木下真緒、田良島典子、南川典昭
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      第61回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Synthesis and physical/enzymatic behaviors of the DNA oligomer possessing an ambiguous base, 5-aminoimidazole-4-carboxamide.2022

    • Author(s)
      Nogi Y., Saito-Tarashima N., Minakawa N.
    • Organizer
      The 49th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry / The 6th Annual Meeting of Japan Society of Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2022)
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Synthesis and evaluation of the DNA oligomer possessing 5-aminoimidazole-4-carboxamide (Z)-base.2022

    • Author(s)
      Nogi Y., Saito-Tarashima N., Minakawa N.
    • Organizer
      15h International Symposium on Nanomedicine (ISNM2022)
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  • [Presentation] Synthesis of the membrane-permeable 2’,3’-cGAMP type CDN analog.2022

    • Author(s)
      Kashiwabara Y., Yamauchi S., Saito-Tarashima N., Minakawa N.
    • Organizer
      15h International Symposium on Nanomedicine (ISNM2022)
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    • Int'l Joint Research
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    • Author(s)
      Yamauchi S., Saito-Tarashima N., Motani K., Kosako H., Minakawa N.
    • Organizer
      15h International Symposium on Nanomedicine (ISNM2022)
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Synthesis and enzymatic recognition of ZTP.2022

    • Author(s)
      Murai A., Saito-Tarashima N., Minakawa N.
    • Organizer
      15h International Symposium on Nanomedicine (ISNM2022)
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  • [Presentation] Chemical challenge to the central dogma with 4’-thionucleotides.2022

    • Author(s)
      Saito-Tarashima N., Minakawa N.
    • Organizer
      15h International Symposium on Nanomedicine (ISNM2022)
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2021-07-13   Modified: 2024-01-30  

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