化学修飾を含むmRNA配列設計の基盤技術

• Project/Area Number: 24H00737
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Medium-sized Section 62:Applied informatics and related fields
• Research Institution: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等) (2026); The University of Tokyo (2024-2025)
• Principal Investigator: 浅井 潔 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任研究員 (30356357)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 佐藤 健吾 東京科学大学, 生命理工学院, 教授 (20365472) ; 上田 宏生 千葉大学, 健康疾患オミクスセンター, 特任准教授 (70821916) ; 阿部 洋 名古屋大学, 理学研究科, 教授 (80415067)
• Project Period (FY): 2024-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2026)
• Budget Amount: ¥47,970,000 (Direct Cost: ¥36,900,000、Indirect Cost: ¥11,070,000); Fiscal Year 2026: ¥11,310,000 (Direct Cost: ¥8,700,000、Indirect Cost: ¥2,610,000); Fiscal Year 2025: ¥12,870,000 (Direct Cost: ¥9,900,000、Indirect Cost: ¥2,970,000); Fiscal Year 2024: ¥14,170,000 (Direct Cost: ¥10,900,000、Indirect Cost: ¥3,270,000)
• Keywords: RNA修飾塩基 / 配列設計 / 翻訳効率 / mRNA

Outline of Research at the Start

mRNAの翻訳量・安定性を最適化するための配列設計は、mRNAの工学・医学応用に重要な課題である。しかしながら、mRNA配列の設計自由度を最大限に活かした配列設計は実現していない。また、RNAの修飾はその構造・機能に影響を与えることが知られているが、mRNAの修飾と翻訳量との関係は、未だ解明が不十分である。本研究では、化学修飾を含むmRNAを合成して翻訳量・安定性を測定し、シークエンサによるRNA修飾検出技術を用いた情報解析によって、化学修飾を含むmRNAの性能予測技術と、深層生成モデル用いたmRNAの設計技術の開発を行う。