生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク

• 研究領域: 生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御
• 研究課題/領域番号: 23116001
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 深水 昭吉 筑波大学, 生命環境系, 教授 (60199172)
• 連携研究者: 五十嵐 和彦 東北大学, 医学系研究科, 教授 (00250738) ; 中尾 光善 熊本大学, 発生医学研究所, 教授 (00217663) ; 菅澤 薫 神戸大学, バイオシグナル研究センター, 教授 (70202124) ; 本橋 ほづみ 東北大学, 加齢医学研究所, 教授 (00282351) ; 矢作 直也 筑波大学, 医学医療系, 准教授 (60420246) ; 清水 敏之 東京大学, 薬学系研究科, 教授 (30273858)
• 研究協力者: 佐々木 裕之 ; 米田 悦啓 ; 春日 雅人
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 41,106千円 (直接経費: 31,620千円、間接経費: 9,486千円); 2015年度: 8,307千円 (直接経費: 6,390千円、間接経費: 1,917千円); 2014年度: 6,669千円 (直接経費: 5,130千円、間接経費: 1,539千円); 2013年度: 9,750千円 (直接経費: 7,500千円、間接経費: 2,250千円); 2012年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円); 2011年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円)
• キーワード: 転写 / 代謝 / 生命素子 / 翻訳後修飾 / クロマチン / エピジェネティクス / hub metabolite / エネルギー代謝 / 転写環境

研究成果の概要

本新学術領域研究は、転写環境の形成とエネルギー代謝シグナル間のクロストークを解明することを研究の目的とした。総括班では、領域班会議において、研究進捗状況の発表に加えて「Collaboration Proposal Meeting」を行い、研究者間の技術交流や共同研究を推進した。また、若手研究者や大学院生を主体としたワークショップや、全国で計５８回にわたって行われた「転写代謝セミナー」の開催を支援した。さらにホームページでの情報発信に加え、市民公開講座の主催や、新聞、テレビなどのメディアを通して、研究成果を国民に広く公表した。

研究成果

• [雑誌論文] Pterosin B has multiple targets in gluconeogenic programs, including coenzyme Q in RORα-SRC2 signaling. (2016)
  • 著者名/発表者名: Itoh, Y., Fuchino, H., Sanosaka, M., Kako, K., Hada, K., Fukamizu, A., Takemori, H., Kawahara, N.
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 巻: 473 号: 2 ページ: 415-420
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.03.016
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Novel helical assembly in arginine methyltransferase 8 (2016)
  • 著者名/発表者名: Toma-Fukai S, Kim JD, Park KE, Kuwabara N, Shimizu N, Krayukhina E, Uchiyama S, Fukamizu A, Shimizu T
  • 雑誌名: Journal of Molecular Biology 巻: 428 号: 6 ページ: 1197-1208
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2016.02.007
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] PRMT8 as a phospholipase regulates Purkinje cell dendritic arborization and motor coordination. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kim, J.D., Park, K.E., Ishida, J., Kako, K., Hamada, J., Kani, S., Takeuchi, M., Namiki, K., Fukui, H., Fukuhara, S., Hibi, M,. Kobayashi, M., Kanaho, Y., Kasuya, Y., Mochizuki, N., Fukamizu, A.
  • 雑誌名: Sci. Adv. 巻: 1 号: 11
  • DOI: 10.1126/sciadv.1500615
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] H3K4/H3K9me3 Bivalent Chromatin Domains Targeted by Lineage-Specific DNA Methylation Pauses Adipocyte Differentiation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Matsumura, Y., Nakaki, R., Inagaki, T., Yoshida, A., Kano, Y., Kimura, H., Tanaka, T., Tsutsumi, S., Nakao, M., Doi, T., Fukami, K., Osborne, TF., Kodama, T., Aburatani, H., Sakai, J.
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 60 号: 4 ページ: 584-596
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2015.10.025
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [学会発表] 寿命を動かす代謝の仕組み (2016)
  • 著者名/発表者名: 深水 昭吉
  • 学会等名: 第39回日本基礎老化学会大会
  • 発表場所: 神奈川県伊勢原市 伊勢原市民文化会館
  • 年月日: 2016-05-27
  • 招待講演
• [学会発表] S-アデノシルメチオニン（SAM）の地産地消機構とその意義 (2016)
  • 著者名/発表者名: 五十嵐 和彦
  • 学会等名: 日本薬学会第136年会
  • 発表場所: 神奈川県横浜市 パシフィコ横浜
  • 年月日: 2016-03-28
  • 招待講演
• [学会発表] Moonlighting of a modification enzyme: arginine methylation (2016)
  • 著者名/発表者名: Fukamizu, A.
  • 学会等名: International Symposium on Transcription and Metabolism
  • 発表場所: 東京都文京区 東京大学薬学部講堂
  • 年月日: 2016-02-17
  • 国際学会
• [学会発表] アルギニンメチル化酵素の特性解析 - PRMT1 とPRMT8 - (2016)
  • 著者名/発表者名: 深水 昭吉
  • 学会等名: 第33回染色体ワークショップ・第14回核ダイナミクス研究会合同開催
  • 発表場所: 宮城県宮城郡 松島一の坊
  • 年月日: 2016-01-12
• [学会発表] メチル化細胞生物学：小さな修飾、大きな作用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 深水 昭吉
  • 学会等名: Advans研究会2015
  • 発表場所: 東京都千代田区 ホテルグランドパレス
  • 年月日: 2015-12-13
  • 招待講演
• [学会発表] 代謝調節と遺伝子発現に関する研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 深水 昭吉
  • 学会等名: CVMW2015
  • 発表場所: 兵庫県神戸市 神戸国際会議場
  • 年月日: 2015-12-11
  • 招待講演
• [学会発表] 細胞外環境への細胞内代謝の適応におけるリジン脱メチル化酵素LSD1の役割 (2015)
  • 著者名/発表者名: 坂元顕久、日野信次朗、長岡克弥、阿南浩太郎、高瀬隆太、中尾光善
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会
  • 発表場所: 兵庫県神戸市 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2015-12-03
• [学会発表] 摂食・絶食サイクルの転写調節機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢作直也、武内謙憲、西真貴子、志鎌明人、戸谷直樹、沢田義一、村山友樹、和田亘
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 兵庫県神戸市 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2015-12-03
• [学会発表] メチル化の医科学 小さな修飾、大きな作用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 深水 昭吉
  • 学会等名: 遺伝情報・高次神経機能障害研究センター 共催セミナー
  • 発表場所: 京都府京田辺市 同志社大学生命医科学部 医新館
  • 年月日: 2015-11-25
  • 招待講演
• [学会発表] Cytoprotection and metabolic reprogramming governed by KEAP1-NRF2 system. (2015)
  • 著者名/発表者名: Motohashi, H.
  • 学会等名: The 46th International Symposium of The Princess Takamatsu Cancer Research Fund.
  • 発表場所: 東京都千代田区 Palace Hotel, Tokyo.
  • 年月日: 2015-11-17
  • 国際学会
• [学会発表] hPRMT8の結晶-溶液構造相関解析をもとにした機能解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 藤間祥子、Kim, JD.、Park, KE.、清水伸隆、桑原直之、Krayukhina, E.、内山進、深水昭吉、清水敏之
  • 学会等名: 日本結晶学会年会
  • 発表場所: 大阪府堺市 大阪府立大学中百舌鳥キャンパス、103講義室
  • 年月日: 2015-10-18
• [学会発表] Molecular mechanism that stimulates repair of UV-induced photolesions and prevents skin cancer. (2015)
  • 著者名/発表者名: Sugasawa, K.
  • 学会等名: 第74回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 愛知県名古屋市 名古屋国際会議場
  • 年月日: 2015-10-09
• [学会発表] 降圧薬応答性アミンの同定と代謝：モデルマウスを用いた検証 (2015)
  • 著者名/発表者名: 深水 昭吉
  • 学会等名: 第19回活性アミンに関するワークショップ
  • 発表場所: 福島県いわき市 小名浜オーシャンホテル
  • 年月日: 2015-08-20
• [学会発表] メチル化の医科学：小さな修復、大きな作用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 深水 昭吉
  • 学会等名: Research PlaNet2015
  • 発表場所: 大阪府大阪市 梅田スカイビルタワーウエスト
  • 年月日: 2015-06-20
  • 招待講演
• [学会発表] 線虫におけるSAM代謝制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 深水 昭吉
  • 学会等名: 平成27年度「転写代謝システム」領域班会議
  • 発表場所: 熊本県熊本市 ユウベルホテル
  • 年月日: 2015-06-14
• [学会発表] 転写代謝システム：遺伝子発現とｴﾈﾙｷﾞｰ分子のクロストーク (2015)
  • 著者名/発表者名: 深水 昭吉
  • 学会等名: 第88回日本内分泌学会学術総会
  • 発表場所: 東京都千代田区 ホテルニューオータニ東京
  • 年月日: 2015-04-25
• [学会発表] In vivo regulation of mammalian nucleotide excision repair (2015)
  • 著者名/発表者名: Kaoru Sugasawa
  • 学会等名: Gordon Research Conference on “Mammalian DNA Repair”
  • 発表場所: Four Points Sheraton, Ventura, CA, U.S.A.
  • 年月日: 2015-02-09
• [学会発表] Crosstalk between Transcription and Metabolism (2014)
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: THE 4D NUCLEOME 2014
  • 発表場所: 広島県廿日市市安芸 安芸グランドホテル
  • 年月日: 2014-12-17 – 2014-12-19
• [学会発表] メチル化の作用点と機能 (2014)
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 広島県廿日市市 安芸グランドホテル
  • 年月日: 2014-12-16
• [学会発表] 摂食によるMalic enzyme 1遺伝子の転写調節機構のin vivo Ad-lucとTFEL scan解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 志鎌明人, 武内謙憲, 西真貴子, 沢田義一, 朴賢英, 會田雄一, 戸谷直樹, 大屋友華 里, 升田紫, 久保田みどり, 泉田欣彦, 松坂賢, 中川嘉, 岩崎仁, 小林和人, 矢藤 繁, 鈴木浩明, 山田信博, 門脇孝, 島野仁, 矢作直也
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神奈川県横浜市 パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-27
• [学会発表] 線虫由来タンパク質アルギニンメチル基転移酵素7 の結晶構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 長谷川森雄,藤間‐深井祥子,金俊達,深水昭吉,清水敏之
  • 学会等名: 日本結晶学会
  • 発表場所: 東京都文京区 東京大学
  • 年月日: 2014-11-01 – 2014-11-03
• [学会発表] メチル化制御と遺伝子発現 (2014)
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: 第12回 RCGMフロンティア国際シンポジウム
  • 発表場所: 埼玉県日高市 埼玉医科大学ゲノム医学研究センター(RCGM)
  • 年月日: 2014-10-31
• [学会発表] The heme-Bach1 pathway regulates the adaptive erythropoiesis under iron deficiency. (2014)
  • 著者名/発表者名: 五十嵐和彦
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会シンポジウム「鉄生化学の新しい潮流」
  • 発表場所: 京都府京都市 国立京都国際会館
  • 年月日: 2014-10-16
• [学会発表] Keap1-Nrf2 system for redox regulation and metabolic reprogramming in cancers. (2014)
  • 著者名/発表者名: 本橋ほづみ
  • 学会等名: 第７３回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 神奈川県横浜市 パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-09-27
• [学会発表] Epigenetic cell regulation in energy metabolism and cancer (2014)
  • 著者名/発表者名: M. Nakao
  • 学会等名: 9th Asian Epigenomics Meeting (Epigenetics in development and diseases)
  • 発表場所: Singapore
  • 年月日: 2014-08-26
• [学会発表] Methylation related to transcription and metabolism (2014)
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: 第37回日本基礎老化学会大会
  • 発表場所: 愛知県知多郡東浦町 あいち健康プラザ
  • 年月日: 2014-06-26 – 2014-06-27
• [学会発表] ヒストン脱メチル化酵素LSD2による肝細胞内脂質バランスの制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 長岡克弥、日野信次朗、中尾光善
  • 学会等名: 第3回 発生過程におけるエネルギー代謝を考える会
  • 発表場所: 熊本大学発生医学研究所
• [学会発表] Crosstalk between redox regulation and cell proliferation (2014)
  • 著者名/発表者名: Hozumi Motohashi
  • 学会等名: International Symposium on Tumor Biology in Kanazawa & Symposium on Drug Discovery in Academics
  • 発表場所: 石川 金沢エクセルホテル東急
  • 招待講演
• [学会発表] Roles for post-translational protein modifications in regulation of DNA damage recognition for mammalian nucleotide excision repair (2014)
  • 著者名/発表者名: Masaki Akita, Syota Matsumoto, Wataru Sakai, Kaoru Sugasawa
  • 学会等名: International Symposium on Xeroderma Pigmentosum and Related Diseases
  • 発表場所: 兵庫 神戸国際会議場
• [学会発表] 創薬を指向した構造生物学の最前線 （オーガナイザー） (2013)
  • 著者名/発表者名: 清水敏之
  • 学会等名: 日本薬学会第１３３年会シンポジウム
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2013-03-28
• [学会発表] 生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 林良樹
  • 学会等名: 発生過程におけるエネルギー代謝を考える会
  • 発表場所: 基礎生物 学研究所
  • 年月日: 2013-02-21
• [学会発表] 生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: 若手ワークショップ＠鬼怒川
  • 発表場所: ホテル鬼怒川
  • 年月日: 2013-01-24
• [学会発表] Structural basis for vitamin D receptor antagonistic mechanism by 1α, 25-dihydroxyvitamin D3-26, 23-lactams (DLAMs) (2013)
  • 著者名/発表者名: 浅野理沙、伊藤一明、和久剛、長澤和夫、柳澤純、清水敏之
  • 学会等名: ICSG2013-SLS
  • 発表場所: 北海道 京王プラザホテル
• [学会発表] エピジェネティクス機構によるエネルギー代謝調節と病態 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中尾光善
  • 学会等名: 第56回日本糖尿病学会年次学術集会（シンポジウム：糖尿病とエピジェネティクス）
  • 発表場所: 熊本 ホテル日航熊本
• [学会発表] Contribution of Nrf2 pathway to metabolic reprogramming during cell proliferation (2013)
  • 著者名/発表者名: Hozumi Motohashi, Keiichi Shirasaki, Yoichiro Mitsuishi, Keiko Taguchi, Masayuki Yamamoto.
  • 学会等名: 第86回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神奈川 パシフィコ横浜
• [学会発表] 転写複合体解析から動脈硬化治療戦略へ (2013)
  • 著者名/発表者名: 矢作直也
  • 学会等名: 第45回日本動脈硬化学会総会・学術集会(ワークショップ1：高TG血 症と動脈硬化)
  • 発表場所: 東京 京王プラザホテル
• [学会発表] メチオニン代謝と細胞機能のネットワーク (2013)
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: 第３８３回東北医学会例会ｼﾝﾎﾟｼﾞｳﾑ
  • 発表場所: 宮城 東北大学医学部艮陵会館
• [学会発表] Heme as a signaling molecule for globin gene regulation and iron homeostasis (2013)
  • 著者名/発表者名: 五十嵐和彦
  • 学会等名: Cold Spring Harbor Laboratory Meeting Metabolic Sgnaling & Disease:From Cell to Ofganism“
  • 発表場所: 米国 Cold Spring Harbor Laboratory
• [学会発表] Networks of transcription and metabolism: physiology, diseases, and structural basis.（オーガナイザー） (2012)
  • 著者名/発表者名: 五十嵐和彦
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会シンポジウム
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] 生命活動における高次エピゲノム制御の分子基盤（オーガナイザー） (2012)
  • 著者名/発表者名: 中尾光善
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会シンポジウム
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] 転写因子による細胞運命の直接転換（オーガナイザー） (2012)
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会シンポジウム
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] Replication,recombination and repair meeting (2012)
  • 著者名/発表者名: 菅澤薫
  • 学会等名: The 8th 3R Symposium
  • 発表場所: 淡路 夢舞台国際会議場
  • 年月日: 2012-11-25
• [学会発表] 生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: 平成24年度班会議
  • 発表場所: つくばグランドホテル
  • 年月日: 2012-07-02
• [学会発表] 「生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御」 (2012)
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: 若手ワークショップ＠湯河原
  • 発表場所: 和光純薬湯河原研修所
• [学会発表] 「生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御」
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: キックオフミーティングおよび領域説明会
  • 発表場所: 大手町サン ケイプラザ
• [学会発表] 転写と代謝のクロストーク
  • 著者名/発表者名: 深水昭吉
  • 学会等名: 第３４回日本分子生物学会年会バイオテクノロジーセミナー
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 招待講演
• [学会発表] ピゲノムの静と動 - 維持、形成、リプログラミング（オーガナイザー）
  • 著者名/発表者名: 中尾光善
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会 シンポジウム
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [図書] 「あなたと私はどうして違う？ 体質と遺伝子のサイエンス－99.9％同じ設計図から個性と病気が生じる秘密」 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中尾 光善
  • 総ページ数: 222
  • 出版者: 羊土社
• [図書] series モデル動物利用マニュアル 疾患モデルの作製と利用：脂質代謝異常と関連疾患 下巻 (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢作 直也
  • 総ページ数: 416
  • 出版者: 株式会社 エル･アイ･シー
• [図書] series モデル動物利用マニュアル 疾患モデルの作製と利用：脂質代謝異常と関連疾患(上巻) (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢作直也
  • 総ページ数: 480
  • 出版者: 株式会社 エル･アイ･シー
• [図書] series モデル動物利用マニュアル 疾患モデルの作製と利用：脂質代謝異常と関連疾患(下巻) (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢作直也
  • 総ページ数: 400
  • 出版者: 株式会社 エル･アイ･シー
• [図書] 驚異のエピジェネティクス 遺伝子がすべてではない!? 生命のプログラムの秘密 (2014)
  • 著者名/発表者名: 中尾 光善
  • 総ページ数: 215
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 細胞工学 ストレス応答性転写因子 (2014)
  • 著者名/発表者名: 本橋ほづみ
  • 総ページ数: 100
  • 出版者: 学研メディカル秀潤社
• [図書] メディカルるるる 糖尿病編（CD－ROM付） (2014)
  • 著者名/発表者名: 矢作 直也
  • 総ページ数: 128
  • 出版者: SCICUS
• [図書] 筑波大学付属病院とクックバッドのおいしく治す「糖尿病食」 (2014)
  • 著者名/発表者名: 矢作直也
  • 総ページ数: 198
  • 出版者: 講談社プラスアルファ新書
• [図書] 秀潤社 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中尾光善
  • 総ページ数: 954
  • 出版者: 3D-エピゲノムが生む新たな生命情報
• [図書] 遺伝情報の発現制御-転写機構からエピジェネティクスまで- (2012)
  • 著者名/発表者名: 五十嵐和彦・監訳（Gene Control：David S. Latchman 著）
  • 総ページ数: 429
  • 出版者: メディカル・サイエンス・インターナショナル
• [図書] 世代を超えて伝わる代謝エピジェネティクス (2011)
  • 著者名/発表者名: 中尾光善 編集
  • 総ページ数: 131
  • 出版者: 羊土社
• [備考] 生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御
  • URL: http://tmsystem.tara.tsukuba.ac.jp/
• [備考] 生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御
  • URL: http://tmsystem.tara.tsukuba.ac.jp
• [備考] 生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御
  • URL: http://tmsystem.tara.tsukuba.ac.jp
• [備考] 生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御（転写代謝システム）
  • URL: http://tmsystem.tara.tsukuba.ac.jp/
• [備考] 生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御（転写代謝システム）
  • URL: http://tmsystem.tara.tsukuba.ac.jp/
• [学会・シンポジウム開催] International Symposium on Transcription and Metabolism (2016)
  • 発表場所: 東京大学薬学部講堂
  • 年月日: 2016-02-17