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新生鎖の生物学

総括班

研究領域新生鎖の生物学
研究課題/領域番号 26116001
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京工業大学

研究代表者

田口 英樹  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (40272710)

研究分担者 稲田 利文  東北大学, 薬学研究科, 教授 (40242812)
河野 憲二  奈良先端科学技術大学院大学, 研究推進機構, 特任教授 (50142005)
藤木 幸夫  九州大学, 生体防御医学研究所, 特任教授 (70261237)
稲葉 謙次  東北大学, 多元物質科学研究所, 教授 (10423039)
田中 元雅  国立研究開発法人理化学研究所, 脳神経科学研究センター, チームリーダー (40321781)
千葉 志信  京都産業大学, 総合生命科学部, 准教授 (20523517)
研究期間 (年度) 2014-07-10 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
52,130千円 (直接経費: 40,100千円、間接経費: 12,030千円)
2018年度: 10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
2017年度: 10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
2016年度: 10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
2015年度: 10,010千円 (直接経費: 7,700千円、間接経費: 2,310千円)
2014年度: 11,700千円 (直接経費: 9,000千円、間接経費: 2,700千円)
キーワード蛋白質科学 / RNA / 翻訳 / リボソーム / フォールディング / 新生ポリペプチド鎖 / シャペロン / リボソーム品質管理 / 新生鎖 / 品質管理 / 蛋白質
研究成果の概要

細胞内の全てのタンパク質は、生命のセントラルドグマにおける翻訳途上の新生ポリペプチド鎖(新生鎖)の状態を経由して産まれてくる。本新学術領域研究「新生鎖の生物学」は、近年さまざまな生命現象に積極的に関わることがわかってきた「新生鎖」を主役に据えた研究を推進するものである。本領域の総括班では、全体領域会議の開催、連携研究の推進、国際シンポジウム、国内関連学会などでのシンポジウム/ワークショップの開催、海外研究者との交流・共同研究支援、若手育成、広報活動を行った。

研究成果の学術的意義や社会的意義

全ての生命現象にタンパク質は関わるので、そのタンパク質ができてくる過程(翻訳過程)に未知の生物学があることを明確にして分野を確立した点が、本領域の最も重要な学術的意義と考える。実際、本領域の期間内に翻訳レベルでの遺伝情報の発現制御は従来想定されているよりずっと重要、かつ未開拓であることが認識されるようになった。本領域の基礎研究から有用タンパク質の生産などのバイオテクノロジー、創薬研究など、より応用性の高い研究への橋渡しが始まっており、今後さらなる展開が期待できる。

報告書

(6件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (49件)

すべて 2018 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (8件) 雑誌論文 (19件) (うち国際共著 1件、 査読あり 19件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 6件、 招待講演 9件) 図書 (3件) 学会・シンポジウム開催 (7件)

  • [国際共同研究] コロラド州立大学/UCSF/UCバークレー(米国)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] ハイデルベルク大/ミュンヘン大(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] シンガポール国立大学(シンガポール)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] King Faisal Specialist Center(サウジアラビア)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] 国立生命科学センター(NCBS)(インド)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] スタンフォード大学/UCSF/ペンシルベニア大学(米国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] ハイデルベルク大学/ルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘン(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] ヘルシンキ大学(フィンランド)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] A LEA model peptide protects the function of a red fluorescent protein in the dry state.2018

    • 著者名/発表者名
      Furuki T, Niwa T, Taguchi H, Hatanaka R, Kikawada T, *Sakurai M.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Rep

      巻: 17 ページ: 27-31

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Electrostatic interactions between middle domain motif-1 and the AAA1 module of the bacterial ClpB chaperone are essential for protein disaggregation2018

    • 著者名/発表者名
      Sugita S, Watanabe K, Hashimoto K, Niwa T, Uemura E, Taguchi H, *Watanabe YH.
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 293 ページ: 19228-19239

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The absence of thioredoxin m1 and thioredoxin C in Anabaena sp. PCC 7120 leads to oxidative stress2018

    • 著者名/発表者名
      Deschoenmaeker F, Mihara S, Niwa T, Taguchi H, Wakabayashi KI, *Hisabori T.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol

      巻: 59 ページ: 2432-2441

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Large-scale aggregation analysis of eukaryotic proteins reveals an involvement of intrinsically disordered regions in protein folding.2018

    • 著者名/発表者名
      Uemura E, Niwa T, Minami S, Takemoto K, Fukuchi S, Machida K, Imataka H, Ueda T, Ota M, Taguchi H.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 8 号: 1 ページ: 678-678

    • DOI

      10.1038/s41598-017-18977-5

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Heterogeneous interaction network of yeast prions and remodeling factors detected in live cells2017

    • 著者名/発表者名
      Pack CG, Inoue Y, Higurashi T, Kawai-Noma S, Hayashi D, Craig E, Taguchi H.
    • 雑誌名

      BMB Rep

      巻: 50 ページ: 478-483

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intrinsic ribosome destabilization underlies translation and provides an organism with a strategy of environmental sensing2017

    • 著者名/発表者名
      Chadani Y, Niwa T, Izumi T, Sugata N, Nagao A, Suzuki T, Chiba S, *Ito K, *Taguchi H.
    • 雑誌名

      Mol Cell

      巻: 68 ページ: 528-539

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] In vitro transcription-translation using bacterial genome as a template to reconstitute intracellular profile2017

    • 著者名/発表者名
      Fujiwara K, Sawamura T, Niwa T, Deyama T, Nomura MS, Taguchi H, Doi N
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 45 ページ: 11449-11458

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of novel in vivo obligate GroEL/ES substrates based on data from a cell-free proteomics approach.2016

    • 著者名/発表者名
      Niwa T, Fujiwara K, Taguchi H.
    • 雑誌名

      FEBS Lett.

      巻: 590 ページ: 251-7

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Integrated in vivo and in vitro nascent chain profiling reveals widespread translational pausing.2016

    • 著者名/発表者名
      Chadani Y, Niwa T, Chiba S, Taguchi, H., Ito K.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA.

      巻: 113 号: 7

    • DOI

      10.1073/pnas.1520560113

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Reaction Cycle of Chaperonin GroEL via Symmetric "Football" Intermediate.2015

    • 著者名/発表者名
      Taguchi H
    • 雑誌名

      J Mol Biol.

      巻: 427 号: 18 ページ: 2912-8

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2015.04.007

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tailoring Micrometer-Long High-Integrity ID Array of Superparamagnetic Nanoparticles in a Nanotubular Protein Jacket and Its Lateral Magnetic Assembling Behavior2015

    • 著者名/発表者名
      Seunghyun Sim, Daigo Miyajima, Tatsuya Niwa, Hideki Taguchi, Takuzo Aida
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.

      巻: 137 号: 14 ページ: 4658-4861

    • DOI

      10.1021/jacs.5b02144

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of C-terminal Truncation of Chaperonin GroEL on the Yield of In-cage Folding of the Green Fluorescent Protein.2015

    • 著者名/発表者名
      S. Ishino, Y. Kawata, H. Taguchi, N. Kajimura, K. Matsuzaki & M. Hoshino
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 290 号: 24 ページ: 15042-15051

    • DOI

      10.1074/jbc.m114.633636

    • NAID

      120005690196

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Large-scale analysis of macromolecular crowding effects on protein aggregation using a reconstituted cell-free translation system.2015

    • 著者名/発表者名
      Niwa T, Sugimoto R, Watanabe L, Nakamura S, Ueda T, Taguchi H
    • 雑誌名

      Front Microbiol.

      巻: 6 ページ: 1113-1113

    • DOI

      10.3389/fmicb.2015.01113

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comprehensive study of liposome-assisted synthesis of membrane proteins using a reconstituted cell-free translation system.2015

    • 著者名/発表者名
      Niwa T, Sasaki Y, Uemura E. Nakamura, S., Akiyama, M., Ando, M., Sawada, S., Mukai, S., Ueda, T., Taguchi, H.* and Akiyoshi, K.
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 5 号: 1 ページ: 18025-18025

    • DOI

      10.1038/srep18025

    • NAID

      120005820883

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single-molecule Analyses of the Dynamics of Heat Shock Protein 104 (Hsp104) and Protein Aggregates.2015

    • 著者名/発表者名
      Okuda M, Niwa T, Taguchi H
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 290 号: 12 ページ: 7833-7840

    • DOI

      10.1074/jbc.m114.620427

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of a symmetric football-shaped GroEL:GroES2-ATP14 complex determined at 3.8Å reveals rearrangement between two GroEL rings.2014

    • 著者名/発表者名
      Koike-Takeshita A, Arakawa T, Taguchi H, Shimamura T.
    • 雑誌名

      J Mol Biol.

      巻: 426 号: 21 ページ: 3634-41

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2014.08.017

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Asp52 in combination with Asp398 plays a critical role in ATP hydrolysis of chaperonin GroEL.2014

    • 著者名/発表者名
      Koike-Takeshita A, Mitsuoka K, Taguchi H
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 289(43) 号: 43 ページ: 30005-11

    • DOI

      10.1074/jbc.m114.593822

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conversion of a chaperonin GroEL-independent protein into an obligate substrate.2014

    • 著者名/発表者名
      Ishimoto T, Fujiwara K, Niwa T, Taguchi H
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 289 号: 46 ページ: 32073-80

    • DOI

      10.1074/jbc.m114.610444

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Peptide sequences converting polyglutamine into a prion in yeast.2014

    • 著者名/発表者名
      Odani W, Urata K, Okuda M, Okuma S, Koyama H, Pack CG, Fujiwara K, Nojima T, Kinjo M, Kawai-Noma S, Taguchi H
    • 雑誌名

      FEBS J

      巻: 282 号: 3 ページ: 477-90

    • DOI

      10.1111/febs.13152

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] “新生鎖によるリボソーム制御の分子機構から新規翻訳産物の生理機能へ”2018

    • 著者名/発表者名
      田口英樹
    • 学会等名
      第41回 日本分子生物学会年会 ワークショップ
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Nascent chain-induced ribosome dynamics regulation.2018

    • 著者名/発表者名
      Hideki Taguchi
    • 学会等名
      International Symposium on Proteins: From the Cradle to the Grave, August 26-29, 2018, Enryakuji, Japan”
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 翻訳途上の新生ポリペプチド鎖が引き起こす翻訳速度調節、翻訳の途中終了2018

    • 著者名/発表者名
      田口英樹
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「拡大する蛋白質の世界:Anfinsenのドグマを超えて」(オーガナイザー:田口英樹)(2018.6.26-28 新潟)
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] “Intrinsic ribosome destabilization underlies translation and provides an organism with a strategy of environmental sensing.2018

    • 著者名/発表者名
      Hideki Taguchi
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory meeting on Protein Homeostasis in Health and Diseases., April 17-21, 2018, Cold Spring Harbor, USA
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 新生鎖が拡張する蛋白質科学の世界2017

    • 著者名/発表者名
      田口 英樹
    • 学会等名
      生命科学系学会合同年次大会(ConBio)第40回 日本分子生物学会年会、第90回日本生化学会大会 シンポジウム “拡大する蛋白質科学のフロンティア”(オーガナイザー:田口英樹、遠藤斗志也)(2017.12.6-9 神戸)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] “Nascent-chain induced ribosome destabilization.”2017

    • 著者名/発表者名
      Hideki Taguchi
    • 学会等名
      International Symposium on Protein Quality Control, June 4, 2017, Nara, Japan,
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Global analysis of yeast protein aggregation using a reconstituted cell-free translation system2015

    • 著者名/発表者名
      Hideki Taguchi
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 新生鎖フォールディングの運命とシャペロンの分子機構2015

    • 著者名/発表者名
      田口 英樹
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A global analysis of proteome stability2015

    • 著者名/発表者名
      Hideki Taguchi
    • 学会等名
      EMBO Conference "Molecular chaperones: From molecules to cells and misfolding diseases"
    • 発表場所
      Aldemar Resort Knossos Royal, Family Resort (Heraklion, Greece)
    • 年月日
      2015-05-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Anfinsenフォールディングから新生鎖フォールディングへ2014

    • 著者名/発表者名
      田口 英樹
    • 学会等名
      第87回日本生化学会大会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都)
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 分泌タンパク質新生ポリペプチド鎖にジスルフィド結合を形成する仕組み2014

    • 著者名/発表者名
      門倉 広, 稲葉 謙次
    • 学会等名
      第87回日本生化学会大会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都)
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 翻訳伸長複合体の品質管理機構におけるユビキチン化の新規機能2014

    • 著者名/発表者名
      稲田 利文
    • 学会等名
      第87回日本生化学会大会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都)
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] 蛋白質代謝医学 医学のあゆみ別冊267 「新生鎖の生物学:翻訳途上の新生ポリペプチド鎖が積極的に関与する生命現象」2018

    • 著者名/発表者名
      田口英樹
    • 総ページ数
      280
    • 出版者
      医歯薬出版株式会社
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [図書] バイオサイエンスとインダストリー76:「終止コドンに依らず翻訳を途中終了させる酸性アミノ酸の連続配列」2018

    • 著者名/発表者名
      田口 英樹、茶谷 悠平、千葉 志信、伊藤 維昭
    • 総ページ数
      280
    • 出版者
      バイオインダストリー協会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [図書] 実験医学 36, 5月号  「翻訳途上の新生ポリペプチド鎖が引き起こすリボソームの不安定化とその生理的意義」2018

    • 著者名/発表者名
      茶谷 悠平、千葉 志信、伊藤 維昭、田口 英樹
    • 総ページ数
      143
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] IPR Seminar/RIKEN Symposium/MEXT Nascent Chain Biology "New Frontiers in Protein Misfolding and Aggregation"2017

    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所(吹田市)
    • 年月日
      2017-01-26
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] 新生鎖の生物学 国際シンポジウム Nascent Chain Biology2016

    • 発表場所
      富士レークホテル(河口湖)
    • 年月日
      2016-09-01
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] 第16回日本蛋白質科学会年会 ワークショップ「蛋白質科学の視点から迫る新生鎖生物学」2016

    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡市)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] RNA2016 satellite-symposium2016

    • 発表場所
      京都大学芝蘭会館稲盛ホール(京都市)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] Nascent-chain Biology Meeting 2015 in Tokyo2015

    • 発表場所
      東京大学弥生講堂 一条ホール(東京都文京区)
    • 年月日
      2015-10-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] 第53回日本生物物理学会年会 新学術領域研究「新生鎖の生物学」共催シンポジウム 新生鎖の合成と構造形成過程に潜む生物物理学2015

    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-14
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      2015 実績報告書
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    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
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公開日: 2014-11-20   更新日: 2022-01-28  

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