スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索

• 研究領域: がんシステムの新次元俯瞰と攻略
• 研究課題/領域番号: 15H05912
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 複合領域
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 宮野 悟 東京大学, 医科学研究所, 教授 (50128104)
• 研究分担者: 島村 徹平 名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (00623943) ; 白石 友一 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (70516880) ; PARK HEEWON 広島大学, 情報科学部, 准教授 (70756642) ; 山口 類 愛知県がんセンター(研究所), システム解析学分野, 分野長 (90380675) ; 新井田 厚司 東京大学, 医科学研究所, 講師 (00772493) ; 片山 琴絵 東京大学, 医科学研究所, 助教 (40581195) ; 張 耀中 東京大学, 医科学研究所, 助教 (60817138) ; 井元 清哉 東京大学, 医科学研究所, 教授 (10345027) ; 玉田 嘉紀 東京大学, 情報理工学(系)研究科, 助教 (80435495)
• 研究期間 (年度): 2015-06-29 – 2020-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2019年度)
• 配分額: 180,310千円 (直接経費: 138,700千円、間接経費: 41,610千円); 2019年度: 37,050千円 (直接経費: 28,500千円、間接経費: 8,550千円); 2018年度: 37,180千円 (直接経費: 28,600千円、間接経費: 8,580千円); 2017年度: 37,180千円 (直接経費: 28,600千円、間接経費: 8,580千円); 2016年度: 37,180千円 (直接経費: 28,600千円、間接経費: 8,580千円); 2015年度: 31,720千円 (直接経費: 24,400千円、間接経費: 7,320千円)
• キーワード: がん / システム生物学 / 統計的モデリング / バイオインフォマティクス / 人工知能

研究成果の概要

ゲノムの一次元地図から、時間軸・空間軸に広がるがんのシステム異常の複雑さの本態を捉え、それに基づいて、がんの発生、進展過程、診断、予防、治療戦略の探求を展開できるためのプラットフォームと方法論を構築した。スパコンを活用し、大規模ゲノムデータ解析パイプライン(Genomon）、がんシステムのネットワーク解析法、がんの進化モデルとシミュレーション、並びに人工知能技術(自然言語処理、知識処理、深層学習等）を開発した。これによりシステムがん研究が新たに直面していた挑戦的課題に解決法を与えた。この開発により、大規模ながんのシステム異常の俯瞰的解析情報から、局所へ自在にシャトルする方式が実現された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

人工知能技術を応用したIBM Watson for Genomicsのがんの臨書シークエンスシステムの研究は、ゲノムシークエンスコストの激減により、個々人のがんのゲノム変異の解釈・翻訳に大きな社会的インパクトを与えた。多数のメディアにとりあげられ、同時に、人工知能の健康医療分野のあり方についての課題を提示することになった。また、スーパーコンピュータを活用した大規模シークエンスデータ解析は、がんゲノミクス研究において共同研究として多大な成果につながった。また、大規模ネットワーク解析技術が説明可能な人工知能の応用と融合することにより、他の生命科学研究へも大きな波及効果を生み出すことが期待される。

研究成果

• [国際共同研究] CINSTAV(メキシコ)
• [国際共同研究] University Paris Diderot(フランス)
• [国際共同研究] Zhengzhou University(中国)
• [国際共同研究] University of Minnesota/Colombia University/University of Milwaukee(米国)
• [国際共同研究] Seoul National University(韓国)
• [国際共同研究]
• [国際共同研究] University of Pavia/University of Verona(イタリア)
• [国際共同研究] University of Groningen/Radboud University Medical Center(オランダ)
• [国際共同研究] Necker Hospital/INSERM/Paris Cite University(フランス)
• [国際共同研究] Chulalongkorn University(タイ)
• [国際共同研究] Australian National University/James Cook University(オーストラリア)
• [国際共同研究]
• [国際共同研究] University of Chicago/Cleaveland Clinic(米国)
• [国際共同研究] Radboud University Medical Cente(オランダ)
• [国際共同研究] MLL Munich Leukemia Laboratory(Germany)
• [国際共同研究] University of Chicago/Cleveland Clinic/Case Western Reserve University(米国)
• [国際共同研究] Chang Gung University(Taiwan)
• [国際共同研究] The University of Chicago(米国)
• [国際共同研究] Queen Mary University of London(英国)
• [雑誌論文] Pan-cancer analysis of whole genomes (2020)
  • 著者名/発表者名: The ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes Consortium
  • 雑誌名: Nature 巻: 578 号: 7793 ページ: 82-93
  • DOI: 10.1038/s41586-020-1969-6
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes (2020)
  • 著者名/発表者名: PCAWG Consortium
  • 雑誌名: Nature 巻: 578(7793) 号: 7793 ページ: 102-111
  • DOI: 10.1038/s41586-020-1965-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Patterns of somatic structural variation in human cancer genomes (2020)
  • 著者名/発表者名: PCAWG Consortium
  • 雑誌名: Nature 巻: 578(7793) 号: 7793 ページ: 112-121
  • DOI: 10.1038/s41586-019-1913-9
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing (2020)
  • 著者名/発表者名: PCAWG Consortium
  • 雑誌名: Nat Genet. 巻: 52(3) 号: 3 ページ: 331-341
  • DOI: 10.1038/s41588-019-0576-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Comprehensive Analysis of Indels in Whole-genome Microsatellite Regions and Microsatellite Instability across 21 Cancer Types (2020)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto A*, Fujita M, Hasegawa T, Wong JH, Maejima K, Oku-Sasaki A, Nakano K, Shiraishi Y, Miyano S, Yamamoto G, Akagi K, Imoto S, and Nakagawa H
  • 雑誌名: Genome Research 巻: 30 号: 3 ページ: 334-34
  • DOI: 10.1101/gr.255026.119
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Combined Cohesin-Runx1 Deficiency Synergistically Perturbs Chromatin Looping and Causes Myelodysplastic Syndromes (2020)
  • 著者名/発表者名: Ochi Y, Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Cancer Discov 巻: - 号: 6 ページ: 836-853
  • DOI: 10.1158/2159-8290.cd-19-0982
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A unified simulation model for understanding the diversity of cancer evolution. (2020)
  • 著者名/発表者名: Niida A, Hasegawa T, Innan H, Shibata T, Mimori K, Miyano S
  • 雑誌名: PeerJ 巻: 8 ページ: e8842-e8842
  • DOI: 10.7717/peerj.8842
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Variant analysis of prostate cancer in Japanese patients and a new attempt to predict related biological pathways (2020)
  • 著者名/発表者名: Kasajima R, Yamaguchi R, Shimizu E, Tamada Y, Niida A, Tremmel G, Kishida T,Aoki I, Imoto S, Miyano S, Uemura H, Miyagi Y
  • 雑誌名: Oncol Rep. 巻: 43(3) ページ: 943-952
  • DOI: 10.3892/or.2020.7481
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Nanopore base-calling from a perspective of instance segmentation (2020)
  • 著者名/発表者名: Zhang Y-Z, Akdemir A, Tremmel G, Imoto S, Miyano S, Shibuya T, Yamaguchi R.
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 23;21(Suppl 3) 号: S3 ページ: 136-136
  • DOI: 10.1186/s12859-020-3459-0
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Frequent mutations that converge on the NFKBIZ pathway in ulcerative colitis (2019)
  • 著者名/発表者名: Kakiuchi Nobuyuki et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: 577 号: 7789 ページ: 260-265
  • DOI: 10.1038/s41586-019-1856-1
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Integrated exome and RNA sequencing of dedifferentiated liposarcoma (2019)
  • 著者名/発表者名: Hirata Makoto、Matsubara Daisuke (21th) etc
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 10 号: 1 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1038/s41467-019-13286-z
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Virtual Grid Engine: a simulated grid engine environment for large-scale supercomputers (2019)
  • 著者名/発表者名: Ito S, Yadome M, Nishiki T, Ishiduki S, Inoue H, Yamaguchi R, Miyano S
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics. 巻: 20(Suppl 16) 号: S16 ページ: 591-591
  • DOI: 10.1186/s12859-019-3085-x
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Accurate and Flexible Bayesian Mutation Call from Multi-regional Tumor Samples (2019)
  • 著者名/発表者名: Moriyama T, Imoto s, Miyano S, Yamaguchi R
  • 雑誌名: Lecture Notes in Computer Science 巻: 11826 ページ: 47-61
  • 査読あり
• [雑誌論文] Invariant patterns of clonal succession determine specific clinical features of myelodysplastic syndromes (2019)
  • 著者名/発表者名: Nagata Yasunobu、Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 10 号: 1 ページ: 5386-5386
  • DOI: 10.1038/s41467-019-13001-y
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Phosphoethanolamine Accumulation Protects Cancer Cells under Glutamine Starvation through Downregulation of PCYT2 (2019)
  • 著者名/発表者名: Osawa T, Shimamura T, Saito K, Hasegawa Y, Ishii N, Nishida M, Ando R, Kondo A, Anwar M, Kato K, Endo K, Yamano S, Kanki Y, Matsumura Y, Minami T, Tanaka T, Anai M, Wada Y, Wanibuchi H, Hayashi M, Hamada A, Yoshida M, Yachida S, Nakao M, Sakai J, Aburatani H, Shibuya M, Hanada K, Miyano S, Soga T, Kodama T
  • 雑誌名: Cell Rep. 巻: 29(1) 号: 1 ページ: 89-103
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2019.08.087
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Replication stress triggers microsatellite destabilization and hypermutation leading to clonal expansion in vitro (2019)
  • 著者名/発表者名: Matsuno Yusuke、Atsumi Yuko、Shimizu Atsuhiro、Katayama Kotoe、Fujimori Haruka、Hyodo Mai、Minakawa Yusuke、Nakatsu Yoshimichi、Kaneko Syuzo、Hamamoto Ryuji、Shimamura Teppei、Miyano Satoru、Tsuzuki Teruhisa、Hanaoka Fumio、Yoshioka Ken-ichi
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 10 号: 1 ページ: 3925-3925
  • DOI: 10.1038/s41467-019-11760-2
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Divergent lncRNA MYMLR regulates MYC by eliciting DNA looping and promoter-enhancer interaction (2019)
  • 著者名/発表者名: Kajino T, Shimamura T, Gong S, Yanagisawa K, Ida L, Nakatochi M, Griesing S, Shimada Y, Kano K, Suzuki M, Miyano S
  • 雑誌名: EMBO J 巻: 38 号: 17 ページ: 1-13
  • DOI: 10.15252/embj.201798441
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• [雑誌論文] Massively parallel sequencing of tenosynovial giant cell tumors reveals novel CSF1 fusion transcripts and novel somatic CBL mutations (2019)
  • 著者名/発表者名: Tsuda Yusuke、Matsubara Daisuke (5th) etc
  • 雑誌名: International Journal of Cancer 巻: 145 号: 12 ページ: 3276
  • DOI: 10.1002/ijc.32421
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Molecular heterogeneity in peripheral T-cell lymphoma, not otherwise specified revealed by comprehensive genetic profiling (2019)
  • 著者名/発表者名: Watatani Yosaku,Ogawa Seishi., et al.
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 33 号: 12 ページ: 2867-2883
  • DOI: 10.1038/s41375-019-0473-1
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Development of an MSI-positive colon tumor with aberrant DNA methylation in a PPAP patient (2019)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi K, Shimizu E, Yamaguchi R, Imoto S, Komura M, Hatakeyama S, Noguchi R, Takane K, Ikenoue T, Gohda Y, Yano H, Miyano S, Furukawa Y
  • 雑誌名: J Hum Genet. 巻: 64(8) 号: 8 ページ: 729-740
  • DOI: 10.1038/s10038-019-0611-7
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• [雑誌論文] The first case of elderly TCF3-HLF-positive B-cell acute lymphoblastic leukemia. (2019)
  • 著者名/発表者名: Takeda R, Yokoyama K (corresponding author), Ogawa M, Kawamata T, Tomofusa F, Kondoh K, Tomomi T, Nakamura S, Ito M, Yusa N, Shimizu E, Ohno N, Uchimaru K, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, and Tojo A.
  • 雑誌名: Leuk lymphoma. 巻: 60 号: 11 ページ: 2821-2824
  • DOI: 10.1080/10428194.2019.1602267
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] ALPHLARD-NT: Bayesian Method for Human Leukocyte Antigen Genotyping and Mutation Calling through Simultaneous Analysis of Normal and Tumor Whole-Genome Sequence Data (2019)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S, Moriyama T, Yamaguchi R, Mizuno S, Komura M, Miyano S, Nakagawa H, Imoto S
  • 雑誌名: J Comput Biol. 巻: 26(9) 号: 9 ページ: 923-937
  • DOI: 10.1089/cmb.2018.0224
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Prognostic impact of circulating tumor DNA status post-allogeneic hematopoietic stem cell transplantation in AML and MDS. (2019)
  • 著者名/発表者名: Nakamura S, Yokoyama K (co-1st and co-corresponding author), Shimizu E, Yusa N, Kondoh K, Ogawa M, Takei T, Kobayashi A, Ito M, Isobe M, Konuma T, Kato S, Kasajima R, Wada Y, Inoue-Nagamura T, Yamaguchi R, Takahashi S, Imoto S, Miyano S, and Tojo A.
  • 雑誌名: Blood 巻: 133 号: 25 ページ: 2682-2695
  • DOI: 10.1182/blood-2018-10-880690
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A Bayesian model integration for mutation calling through data partitioning (2019)
  • 著者名/発表者名: Moriyama T, Imoto S, Hayashi S, Shiraishi Y, Miyano S, Yamaguchi R
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 35(21) 号: 21 ページ: 4247-4254
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btz233
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Robust sample-specific stability selection with effective reror control (2019)
  • 著者名/発表者名: Park H, Yamada M, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: J Comput Biol 巻: 26(3) 号: 3 ページ: 202-217
  • DOI: 10.1089/cmb.2018.0180
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] GIMLET: Identifying biological modulators in context-specific gene regulation using local energy statistics (2019)
  • 著者名/発表者名: Shimamura T, Matsui Y, Kajino T, Ito S, Takahashi T, Miyano S
  • 雑誌名: LNBI 巻: 10834 ページ: 124-137
  • DOI: 10.1007/978-3-030-14160-8_13
  • ISBN: 9783030141592, 9783030141608
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Virtual Grid Engine: Accelerating thousands of omics sample analyses using large-scale supercomputers (2019)
  • 著者名/発表者名: Ito S, Yadome M, Nishiki T, Ishiduki S, Inoue H, Yamaguchi R, Miyano S
  • 雑誌名: IEEE BIBM 2018 巻: 印刷中 ページ: 387-392
  • DOI: 10.1109/bibm.2018.8621285
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tumor subclonal progression model for cancer hallmark acquisition (2019)
  • 著者名/発表者名: Matsu Y, Miyano S, Shimamura T
  • 雑誌名: LNBI 巻: 10834 ページ: 115-123
  • DOI: 10.1007/978-3-030-14160-8_12
  • ISBN: 9783030141592, 9783030141608
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Sensitivity analysis of agent-based simulation utilizing massively parallel computation and interactive data visualization (2019)
  • 著者名/発表者名: Niida A, Hasegawa T, Miyano S
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 14(3) 号: 3 ページ: e0210678-e0210678
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0210678
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Age-related remodelling of oesophageal epithelia by mutated cancer drivers. (2019)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama A, Ogawa S., et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: 565 号: 7739 ページ: 312-317
  • DOI: 10.1038/s41586-018-0811-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Defective Epstein-Barr virus in chronic active infection and haematological malignancy. (2019)
  • 著者名/発表者名: Okuno Y, Murata T, Sato Y,Yoshida K, Sawada A, Inoue M, Kawa K, Seto M, Ohshima K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Nishida T, Kiyoi H, Kato S, Nakamura S, Morishima S, Yoshikawa T, Fujiwara S, Shimizu N, Isobe Y, Noguchi M, Kikuta A, Iwatsuki K, Takahashi Y, Kojima S, Ogawa S, Kimura H.
  • 雑誌名: Nat Microbiol. 巻: 4 号: 3 ページ: 404-413
  • DOI: 10.1038/s41564-018-0334-0
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Frequent structural variations involving programmed death ligands in Epstein-Barr virus-associated lymphomas (2019)
  • 著者名/発表者名: Kataoka Keisuke, Miyoshi Hiroaki, Sakata Seiji, Dobashi Akito, Couronne Lucile, Kogure Yasunori, Sato Yasuharu, Nishida Kenji, Gion Yuka, Shiraishi Yuichi, Tanaka Hiroko, et al
  • 雑誌名: Leukemia 巻: Epub ahead of print 号: 7 ページ: 1687-1699
  • DOI: 10.1038/s41375-019-0380-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Frequent germline mutations of HAVCR2 in sporadic subcutaneous panniculitis-like T-cell lymphoma (2019)
  • 著者名/発表者名: Polprasert C, Takeuchi Y, Kakiuchi N, Yoshida K, Assanasen T, Sitthi W, Bunworasate U, Pirunsarn A, Wudhikarn K, Lawasut P, Uaprasert N, Kongkiatkamon S, Moonla C, Sanada M, Akita N, Takeda J, Fujii Y, Suzuki H, Nannya Y, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Rojnuckarin P, Ogawa S, Makishima H
  • 雑誌名: Blood Advances 巻: 3 号: 4 ページ: 588-595
  • DOI: 10.1182/bloodadvances.2018028340
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A comprehensive characterization of cis-acting splicing-associated variants in human cancer. (2018)
  • 著者名/発表者名: Shiraishi Y, Kataoka K, Chiba K, Okada A, Kogure Y, Tanaka H, Ogawa S, Miyano S.
  • 雑誌名: Genome Res. 巻: 28 号: 8 ページ: 1111-1125
  • DOI: 10.1101/gr.231951.117
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Cancer evolution and heterogeneity (2018)
  • 著者名/発表者名: Mimori K, Saito T, Niida A, Miyano S
  • 雑誌名: Ann Gastroenterol Surg 巻: 2(5) 号: 5 ページ: 332-338
  • DOI: 10.1002/ags3.12182
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] ALPHLARD: a Bayesian method for analyzing HLA genes from whole genome sequence data (2018)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S, Yamaguchi R, Mizuno S, Komura M, Miyano S, Nakagawa H, Imoto S
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 19(1) 号: 1 ページ: 790-790
  • DOI: 10.1186/s12864-018-5169-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Understanding intratumor heterogeneity by combining genome analysis and mathematical modeling (2018)
  • 著者名/発表者名: Niida Atsushi、Nagayama Satoshi、Miyano Satoru、Mimori Koshi
  • 雑誌名: Cancer science 巻: 109 号: 4 ページ: 884-892
  • DOI: 10.1111/cas.13510
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A temporal shift of the evolutionary principle shaping intratumor heterogeneity in colorectal cancer (2018)
  • 著者名/発表者名: Saito T, Niida A, Uchi R, Hirata H, Kodama M, Okimoto T, Murakami K, Suzuki Y, Ogawa S, Miyano S, Mimori K, et al.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 9 号: 1 ページ: 2884-2884
  • DOI: 10.1038/s41467-018-05226-0
  • NAID: 120006551763
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Aberrant splicing and defective mRNA production induced by somatic spliceosome mutations in myelodysplasia. (2018)
  • 著者名/発表者名: Shiozawa Y, Malcovati L, Gall A, Sato-Otsubo A, Kataoka K, Sato Y, Watatani Y, Suzuki H, Yoshizato T, Yoshida K, Sanada M, Makishima H, Shiraishi Y, Chiba K, Hellstrom-Lindberg E, Miyano S, Ogawa S, Cazzola M
  • 雑誌名: Nat. Commun. 巻: 9 号: 1 ページ: 3649-3649
  • DOI: 10.1038/s41467-018-06063-x
  • NAID: 120006537149
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Early detection and evolution of preleukemic clones in therapy-related myeloid neoplasms following autologous SCT (2018)
  • 著者名/発表者名: Berger G,Ogawa S., et al.
  • 雑誌名: Blood 巻: 131 号: 16 ページ: 1846-1857
  • DOI: 10.1182/blood-2017-09-805879
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Gain-of-function IKBKB mutation causes human combined immune deficiency (2018)
  • 著者名/発表者名: Cardinez C, Miraghazadeh B, Tanita K, da Silva E, Hoshino A, Okada S, Chand R, Asano T, Tsumura M, Yoshida K, Ohnishi H, Kato Z, Yamazaki M, Okuno Y, Miyano S, Kojima S, Ogawa S, Andrews TD, Field MA, Burgio G,et al.
  • 雑誌名: J Exp Med 巻: 215 号: 11 ページ: 2715-2724
  • DOI: 10.1084/jem.20180639
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Cell-lineage level-targeted sequencing to identify acute myeloid leukemia with myelodysplasia-related changes (2018)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama K, Shimizu E, Yokoyama N, Nakamura S, Kasajima R, Ogawa M, Takei T,Ito M, Kobayashi A, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, Tojo A
  • 雑誌名: Blood Adv 巻: 2(19) 号: 19 ページ: 2513-2521
  • DOI: 10.1182/bloodadvances.2017010744
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Circulating tumor DNA dynamically predicts response and/or relapse in patients with hematological malignancies (2018)
  • 著者名/発表者名: Nakamura S, Yokoyama K, Yusa N, Ogawa M, Takei T, Kobayashi A, Ito M, Shimizu E, Kasajima R, Wada Y, Yamaguchi R, Imoto S, Nagamura-Inoue T, Miyano S, Tojo A
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 108(4) 号: 4 ページ: 402-410
  • DOI: 10.1007/s12185-018-2487-2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Azacitidine effectively reduces TP53-mutant leukemic cell burden in secondary acute myeloid leukemia after cord blood transplantation (2018)
  • 著者名/発表者名: Takei Tomomi、Yokoyama Kazuaki、Shimizu Eigo、Konuma Takaaki、Takahashi Satoshi、Yamaguchi Rui、Imoto Seiya、Miyano Satoru、Tojo Arinobu
  • 雑誌名: Leukemia & Lymphoma 巻: In press 号: 11 ページ: 1-2
  • DOI: 10.1080/10428194.2018.1443335
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic Characterization of Biliary Tract Cancers Identifies Driver Genes and Predisposing Mutations (2018)
  • 著者名/発表者名: Wardell CP, Fujita M, Yamada T, Simbolo M, Fassan M, Karlic R, Polak P, Kim J, Hatanaka Y, Maejima K, Lawlor RT, Nakanishi Y, Mitsuhashi T et al
  • 雑誌名: J Hepatol 巻: - 号: 5 ページ: 959-969
  • DOI: 10.1016/j.jhep.2018.01.009
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Targeting Tyro3 ameliorates a model of PGRN-mutant FTLD-TDP via tau-mediated synaptic pathology (2018)
  • 著者名/発表者名: Fujita Kyota、Chen Xigui、Homma Hidenori、Tagawa Kazuhiko、Amano Mutsuki、Saito Ayumu、Imoto Seiya、Akatsu Hiroyasu、Hashizume Yoshio、Kaibuchi Kozo、Miyano Satoru、Okazawa Hitoshi
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 9 号: 1 ページ: 433-433
  • DOI: 10.1038/s41467-018-02821-z
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Adaptive NetworkProfiler for Identifying Cancer Characteristic-Specific Gene Regulatory Networks (2018)
  • 著者名/発表者名: Park H, Shimamura T, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: J Comput Biol 巻: 25(2) 号: 2 ページ: 130-145
  • DOI: 10.1089/cmb.2017.0120
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Genomic Heterogeneity Within Individual Prostate Cancer Foci Impacts Predictive Biomarkers of Targeted Therapy (2018)
  • 著者名/発表者名: VanderWeele DJ, Finney R, Katayama K, Gillard M, Paner G, Imoto S, Yamaguchi R, Wheeler D, Lack J, Cam M, Pontier A, Nguyen YTM, Maejima K, Sasaki-Oku A, Nakano K, Tanaka H, Vander Griend D, Kubo M, Ratain MJ, Miyano S, Nakagawa H
  • 雑誌名: Eur Urol Focus 巻: pii: S2405-4569(18) 号: 3 ページ: 30007-5
  • DOI: 10.1016/j.euf.2018.01.006
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Integrated Molecular Characterization of the Lethal Pediatric Cancer Pancreatoblastoma (2018)
  • 著者名/発表者名: Isobe T, Seki M, Yoshida K, Sekiguchi M, Shiozawa Y, Shiraishi Y,..., Kataoka K, Sato Y, Kawai T, Chiba K, Tanaka H, Shimamura T, Kato M, Iguchi A, Hama A, Taguchi T, Akiyama M, Fujimura J, Inoue A, Ito T, Deguchi T, Kiyotani C, Iehara T, Hosoi H, Oka A, Sanada M, Tanaka Y, Hata K, Miyano S, Ogawa S, Takita J
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 78(4) 号: 4 ページ: 865-876
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-17-2581
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Characterization of the B-cell receptor repertoires in peanut allergic subjects undergoing oral immunotherapy (2018)
  • 著者名/発表者名: Kiyotani K, Mai TH, Yamaguchi R, Yew PY, Kulis M, Orgel K, Imoto S, Miyano S, Burks AW, Nakamura Y
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 63(2) 号: 2 ページ: 239-248
  • DOI: 10.1038/s10038-017-0364-0
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A novel genetic and morphologic phenotype of ARID2-mediated myelodysplasia (2018)
  • 著者名/発表者名: Sakai H, Hosono N, Nakazawa H, Przychodzen B, Polprasert C, Carraway HE, Sekeres MA, Radivoyevitch T, Yoshida K, Sanada M, Yoshizato T, Kataoka K, Nakagawa MM, Ueno H, Nannya Y, Kon A, Shiozawa Y, Takeda J, Shiraishi Y, Chiba K, Miyano S, Singh J, Padgett RA, Ogawa S, Maciejewski JP, Makishima H
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 32(3) 号: 3 ページ: 839-843
  • DOI: 10.1038/leu.2017.319
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Phenotype-Based Gene Analysis Allowed Successful Diagnosis of X-Linked Neutropenia Associated with a Novel Wasp Mutation. (2018)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi M, Yokoyama K, Shimizu E, Yusa N, Ito M, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, and Tojo A.
  • 雑誌名: Ann Hematol 巻: 97 号: 2 ページ: 367-369
  • DOI: 10.1007/s00277-017-3134-3
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Different Clonal Dynamics of Chronic Myeloid Leukaemia between Bone Marrow and the Central Nervous System. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ogawa M, Yokoyama K, Hirano M, Jimbo K, Ochi K, Kawamata T, Ohno N, Shimizu E, Yokoyama N, Yamaguchi R, Imoto S, Uchimaru K, Takahashi N, Miyano S, Imai Y, and Tojo A.
  • 雑誌名: Br J Haematol 巻: - 号: 5 ページ: 842-845
  • DOI: 10.1111/bjh.15065
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Clonal evolution in myelodysplastic syndromes. (2017)
  • 著者名/発表者名: da Silva-Coelho P, Kroeze LI, Yoshida K, Koorenhof-Scheele TN, Knops R, van de Locht LT, de Graaf AO, Massop M, Sandmann S, Dugas M, Stevens-Kroef MJ, Cermak J, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, de Witte T, Blijlevens NMA, Muus P, Huls G, van der Reijden BA, Ogawa S, Jansen JH.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 印刷中 号: 1 ページ: 15099-15099
  • DOI: 10.1038/ncomms15099
  • NAID: 130005163316
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Recurrent SPI1 (PU.1) fusions in high-risk pediatric T cell acute lymphoblastic leukemia. (2017)
  • 著者名/発表者名: Seki M, Kimura S, Isobe T, Yoshida K, (13 authors), Masuda K, Kawamoto H, Ohki K, Kato M, Arakawa Y, Koh K, Hanada R, Moritake H, Akiyama M, Kobayashi R, Deguchi T, Hashii Y, Imamura T, Sato A, Kiyokawa N, Oka A, Hayashi Y, Takagi M, Manabe A, Ohara A, Horibe K, Sanada M, Iwama A, Mano H, Miyano S, Ogawa S, Takita J
  • 雑誌名: Nature Genetics 巻: 49 号: 8 ページ: 1274-1281
  • DOI: 10.1038/ng.3900
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Prognostic relevance of genetic alterations in diffuse lower-grade gliomas (2017)
  • 著者名/発表者名: Aoki Kosuke、Nakamura Hideo、Suzuki Hiromichi et al.
  • 雑誌名: Neuro-Oncology 巻: 20 号: 1 ページ: 66-77
  • DOI: 10.1093/neuonc/nox132
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] phyC: Clustering cancer evolutionary trees. (2017)
  • 著者名/発表者名: Matsui Y, Niida A, Uchi R, Mimori K, Miyano S, Shimamura T:
  • 雑誌名: PLoS Comput Biol. 巻: 13(5) 号: 5 ページ: 1005509-1005509
  • DOI: 10.1371/journal.pcbi.1005509
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Large-scale DNA Barcode Library Generation for Biomolecule Identification in High-throughput Screens (2017)
  • 著者名/発表者名: Lyons E, Sheridan P, Tremmel G, Miyano S, Sugano S
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 7(1) 号: 1 ページ: 13899-13899
  • DOI: 10.1038/s41598-017-12825-2
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Circulating exosomal microRNA-203 is associated with metastasis possibly via inducing tumor-associated macrophages in colorectal cancer (2017)
  • 著者名/発表者名: Takano Y, Masuda T, Iinuma H, Yamaguchi R, Sato K, Tobo T, Hirata H, Kuroda Y, Nambara S, Hayashi N, Iguchi T, Ito S, Eguchi H, Ochiya T, Yanaga K, Miyano S, Mimori K
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 8(45) 号: 45 ページ: 78598-78613
  • DOI: 10.18632/oncotarget.20009
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Gene expression and risk of leukemic transformation in myelodysplasia (2017)
  • 著者名/発表者名: Shiozawa Y, Malcovati L, Galli A, Pellagatti A, Karimi M, Sato-Otsubo A, Sato Y, Suzuki H, Yoshizato T, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Makishima H, Boultwood J, Hellstroem-Lindberg E, Miyano S, Cazzola M, Ogawa S
  • 雑誌名: Blood 巻: 130(24) 号: 24 ページ: 2642-2653
  • DOI: 10.1182/blood-2017-05-783050
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Prognostic relevance of integrated genetic profiling in adult T-cell leukemia/lymphoma (2017)
  • 著者名/発表者名: Kataoka Keisuke、Iwanaga Masako、Yasunaga Jun-ichirou、et al.
  • 雑誌名: Blood 巻: 131 号: 2 ページ: 215-225
  • DOI: 10.1182/blood-2017-01-761874
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Identification of a p53-repressed gene module in breast cancer cells (2017)
  • 著者名/発表者名: Miyamoto T, Tanikawa C, Yodsurang V, Zhang YZ, Imoto S, Yamaguchi R, Miyano S, Nakagawa H, Matsuda K
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 8(34) 号: 34 ページ: 55821-55836
  • DOI: 10.18632/oncotarget.19608
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Identification of a p53 target, CD137L, that mediates growth suppression and immune response of osteosarcoma cells (2017)
  • 著者名/発表者名: Tsuda Y, Tanikawa C, Miyamoto T, Hirata M, Yodsurang V, Zhang YZ, Imoto S, Yamaguchi R, Miyano S, Takayanagi H, Kawano H, Nakagawa H, Tanaka S, Matsuda K
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 7 号: 1 ページ: 10739-10739
  • DOI: 10.1038/s41598-017-11208-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Japanese genome-wide association study identifies a significant colorectal cancer susceptibility locus at chromosome 10p14. (2017)
  • 著者名/発表者名: Takahashi Y, Sugimachi K, Yamamoto K, Niida A, Shimamura T, Sato T, Watanabe M, Tanaka J, Kudo S, Sugihara K, Hase K, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Moriya Y, Suzuki Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
  • 雑誌名: Cancer Sci. 巻: 108(11) 号: 11 ページ: 2239-2247
  • DOI: 10.1111/cas.13391
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The Transcriptional Landscape of p53 Signalling Pathway (2017)
  • 著者名/発表者名: Tanikawa C, Zhang YZ, Yamamoto R, Tsuda Y, Tanaka M, Funauchi Y, Mori J, Imoto S, Yamaguchi R, Nakamura Y, Miyano S, Nakagawa H, Matsuda K
  • 雑誌名: EBioMedicine 巻: 20 ページ: 109-119
  • DOI: 10.1016/j.ebiom.2017.05.017
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Abnormal hematopoiesis and autoimmunity in human subjects with germline IKZF1 mutations. (2017)
  • 著者名/発表者名: Hoshino A, Okada S, Yoshida K, Nishida N, Okuno Y, Ueno H, Yamashita M, Okano T, Tsumura M, Nishimura S, Sakata S, Kobayashi M, Nakamura H, Kamizono J, Mitsui-Sekinaka K, Ichimura T, Ohga S, Nakazawa Y, Takagi M, Imai K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Ogawa S, Kojima S, Nonoyama S, Morio T, Kanegane H.
  • 雑誌名: J Allergy Clin Immunol. 巻: - 号: 1 ページ: 390-400
  • DOI: 10.1016/j.jaci.2016.09.029
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genome-wide screening of DNA methylation associated with lymph node metastasis in esophageal squamous cell carcinoma (2017)
  • 著者名/発表者名: Nagata Hiroaki、Kozaki Ken-Ichi、Muramatsu Tomoki、Hiramoto Hidekazu、Tanimoto Kousuke、Fujiwara Naoto、Imoto Seiya、Ichikawa Daisuke、Otsuji Eigo、Miyano Satoru、Kawano Tatsuyuki、Inazawa Johji
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 8 号: 23 ページ: 37740-37750
  • DOI: 10.18632/oncotarget.17147
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Haploinsufficiency of TNFAIP3 (A20) by germline mutation is involved in autoimmune lymphoproliferative syndrome. (2017)
  • 著者名/発表者名: Takagi M, Ogata S, Ueno H, Yoshida K, Yeh T, Hoshino A, Piao J, Yamashita M, Nanya M, Okano T, Kajiwara M, Kanegane H, Muramatsu H, Okuno Y, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Bando Y, Kato M, Hayashi Y, Miyano S, Imai K, Ogawa S, Kojima S, Morio T.
  • 雑誌名: J Allergy Clin Immunol. 巻: - 号: 6 ページ: 31286-6
  • DOI: 10.1016/j.jaci.2016.09.038
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Hypoxic adaptation of leukemic cells infiltrating the CNS affords a therapeutic strategy targeting VEGFA (2017)
  • 著者名/発表者名: Kato Itaru、Nishinaka Yoko、Nakamura Masahiro、et al.
  • 雑誌名: Blood 巻: 129 号: 23 ページ: 3126-3129
  • DOI: 10.1182/blood-2016-06-721712
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Clinical significance of T cell clonality and expression levels of immune-related genes in endometrial cancer (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikeda Y, Kiyotani K, Yew PY, Sato S, Imai Y, Yamaguchi R, Miyano S, Fujiwara K, Hasegawa K, Nakamura Y
  • 雑誌名: Oncol Rep 巻: 37(5) 号: 5 ページ: 2603-2610
  • DOI: 10.3892/or.2017.5536
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Impact of genetic alterations in stem-cell transplantation for myelodysplasia and secondary acute myeloid leukemia. (2017)
  • 著者名/発表者名: Yoshizato T, et. al., Sanada M, et. al., Ogawa S.
  • 雑誌名: Blood 巻: 129 号: 17 ページ: 2347-2358
  • DOI: 10.1182/blood-2016-12-754796
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Whole genome sequencing discriminates hepatocellular carcinoma with intrahepatic metastasis from multi-centric tumors (2017)
  • 著者名/発表者名: Furuta M, Ueno M, Fujimoto A, Hayami S, Yasukawa S, Kojima F, Arihiro K, Kawakami Y, Wardell CP, Shiraishi Y, Tanaka H, Nakano K, Maejima K, Sasaki-Oku A, Tokunaga N, Boroevich KA, Abe T, Aikata H, Ohdan H, Gotoh K, Kubo M, Tsunoda T, Miyano S, Chayama K, Yamaue H, Nakagawa H
  • 雑誌名: J Hepatol 巻: 66(2) 号: 2 ページ: 363-373
  • DOI: 10.1016/j.jhep.2016.09.021
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] ynamics of clonal evolution in myelodysplastic syndromes. (2017)
  • 著者名/発表者名: Makishima H, et al.
  • 雑誌名: Nat Genet. 巻: 49 号: 2 ページ: 204-212
  • DOI: 10.1038/ng.3742
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A novel adaptive penalized logistic regression for uncovering biomarker associated with anti-cancer drug sensitivity (2017)
  • 著者名/発表者名: Park H, Shiraishi Y, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: EEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform 巻: - 号: 4 ページ: 771-782
  • DOI: 10.1109/tcbb.2016.2561937
  • 査読あり
• [雑誌論文] Interaction-based feature selection for uncovering cancer driver genes through copy number-driven expression level (2017)
  • 著者名/発表者名: Park H, Niida A, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: J Comput Biol 巻: 24(2) 号: 2 ページ: 138-152
  • DOI: 10.1089/cmb.2016.0140
  • 査読あり
• [雑誌論文] Addiction to the IGF2-ID1-IGF2 circuit for maintenance of the breast cancer stem-like cells (2017)
  • 著者名/発表者名: Tominaga K, Shimamura T, Kimura N, Murayama T, Matsubara D, Kanauchi H, Niida A, Shimizu S, Nishioka K, Tsuji EI, Yano M, Sugano S, Shimono Y, Ishii H, Saya H, Mori M, Akashi K, Tada KI, Ogawa T, Tojo A, Miyano S, Gotoh N
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 36(9) 号: 9 ページ: 1276-1286
  • DOI: 10.1038/onc.2016.293
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Sequence-specific bias correction for RNA-seq data using recurrent neural networks (2017)
  • 著者名/発表者名: Zhang Y-Z, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 18(Suppl 1) 号: S1 ページ: 1044-1044
  • DOI: 10.1186/s12864-016-3262-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Characterization of T-cell receptor repertoire in inflamed tissues of patients with crohn's disease through deep sequencing (2016)
  • 著者名/発表者名: Chapman CG, Yamaguchi R, Tamura K, Weidner J, Imoto S, Kwon J, Fang H, Yew PY, Marino SR, Miyano S, Nakamura Y, Kiyotani K
  • 雑誌名: Inflamm Bowel Dis 巻: 22(6) 号: 6 ページ: 1275-1285
  • DOI: 10.1097/mib.0000000000000752
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Whole genome mutational landscape and characterization of non-coding and structural mutations in liver cancer. (2016)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto A et al.
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 48 号: 5 ページ: 500-509
  • DOI: 10.1038/ng.3547
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Aberrant PD-L1 expression via 3’-UTR disruption in multiple cancers. (2016)
  • 著者名/発表者名: K.Kataoka, (27名) N. Minato, K.Kashiwase, K. Izutsu, A. Takaori-Kondo, Y. Miyazaki, S. Takahashi, T. Shibata, H. Kawamoto, Y. Akatsuka, K. Shimoda, K. Takeuchi, T. Seya, S. Miyano, S. Ogawa.
  • 雑誌名: Nature 巻: 534 号: 7607 ページ: 402-406
  • DOI: 10.1038/nature18294
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Identification of RNA-binding protein LARP4B as a tumor suppressor in glioma (2016)
  • 著者名/発表者名: Koso H, Yi H, Sheridan P, Miyano S, Ino Y, Todo T, Watanabe S.
  • 雑誌名: Cancer Research 巻: 76 号: 8 ページ: 2254
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-15-2308
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] OVarCall: bayesian mutation calling method utilizing overlapping paired-end reads (2016)
  • 著者名/発表者名: Moriyama T, Shiraishi Y, Chiba K, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: IEEE Trans Nanobioscience 巻: 14 号: 2 ページ: 1-6
  • DOI: 10.1109/tnb.2017.2670601
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The hypusine cascade promotes cancer progression and metastasis through the regulation of RhoA in squamous cell carcinoma. (2016)
  • 著者名/発表者名: Muramatsu T, Kozaki KI, Imoto S, Yamaguchi R, Tsuda H, Kawano T, Fujiwara N, Morishita M, Miyano S, Inazawa J.
  • 雑誌名: Oncogene 巻: - 号: 40 ページ: 5304-5316
  • DOI: 10.1038/onc.2016.71
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 8q24 Polymorphisms and Diabetes Mellitus Regulate Apolipoprotein A-IV in Colorectal Carcinogenesis (2016)
  • 著者名/発表者名: Sugimachi K, Yamaguchi R, Eguchi H, Ueda M, Niida A, Sakimura S, Hirata H, Uchi R, Shinden Y, Iguchi T, Morita K, Yamamoto K, Miyano S, Mori M, Maehara Y, Mimori K
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol 巻: 23(Suppl 4) 号: S4 ページ: 546-551
  • DOI: 10.1245/s10434-016-5374-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Somatic mutations in plasma cell-free DNA are diagnostic markers for esophageal squamous cell carcinoma recurrence (2016)
  • 著者名/発表者名: Ueda M, Iguchi T, Masuda T, Nakahara Y, Hirata H, Uchi R, Niida A, Momose K, Sakimura S, Chiba K, Eguchi H, Ito S, Sugimachi K, Yamasaki M, Suzuki Y, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 7(38) 号: 38 ページ: 62280-62291
  • DOI: 10.18632/oncotarget.11409
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Reduced expression of APC-1B but not APC-1A by the deletion of promoter 1B is responsible for familial adenomatous polyposis (2016)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi K, Nagayama S, Shimizu E, Komura M, Yamaguchi R, Shibuya T, Arai M, Hatakeyama S, Ikenoue T, Ueno M, Miyano S, Imoto S, Furukawa Y
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 6 号: 1 ページ: 26011-26011
  • DOI: 10.1038/srep26011
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Gene set differential analysis of time course expression profiles via sparse estimation in functional logistic model with application to time-dependent biomarker detection (2016)
  • 著者名/発表者名: Kayano M, Matsui H, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: Biostatistics 巻: 17 号: 2 ページ: 235-248
  • DOI: 10.1093/biostatistics/kxv037
  • 査読あり
• [雑誌論文] Integrated Molecular Profiling of Human Gastric Cancer Identifies DDR2 as a Potential Regulator of Peritoneal Dissemination (2016)
  • 著者名/発表者名: Kurashige J, Hasegawa T, Niida A, Sugimachi K, Deng N, Mima K, Uchi R, Sawada G, Takahashi Y, Eguchi H, Inomata M, Kitano S, Fukagawa T, Sasako M, Sasaki H, Sasaki S, Mori M, Yanagihara K, Baba H, Miyano S, Tan P, Mimori K.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 6 号: 1 ページ: 22371-22371
  • DOI: 10.1038/srep22371
  • NAID: 120006352400
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Detection of differential distributions of methylation patterns (2016)
  • 著者名/発表者名: Matsui Y, Mizuta M, Miyano S, Shimamura T
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 印刷中 号: 15 ページ: 1-8
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btw138
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genomic Landscape of Esophageal Squamous Cell Carcinoma in a Japanese Population. (2016)
  • 著者名/発表者名: G. Sawada (他43名, 山本21番目)
  • 雑誌名: Gastroenterology 巻: 150 号: 5 ページ: 1171-1182
  • DOI: 10.1053/j.gastro.2016.01.035
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Integrated Multiregional Analysis Proposing a New Model of Colorectal Cancer Evolution. (2016)
  • 著者名/発表者名: R. Uchi (他40名, 山本36番目)
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: 12 号: 2 ページ: 1-24
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1005778
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Variegated RHOA mutations in adult T-cell leukemia/lymphoma (2016)
  • 著者名/発表者名: Nagata Y, Kontani K, Enami T, Kataoka K, Ishii R, Totoki Y, Kataoka TR, Hirata M, Aoki K, Nakano K, Kitanaka A, Sakata-Yanagimoto M, Egami S, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Shiozawa Y, Yoshizato T, (9名), Miyano S, Nureki O, Shibata T, Haga H, Shimoda K, Katada T, Chiba S, Watanabe T, Ogawa S
  • 雑誌名: Blood 巻: 127 号: 5 ページ: 596-604
  • DOI: 10.1182/blood-2015-06-644948
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] A likelihood-free filtering method via approximate Bayesian computation in evaluating biological simulation models (2015)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa T, Niida A, Mori T, Shimamura T, Yamaguchi R, Miyano S, Akutsu T, Imoto S
  • 雑誌名: Computational Statistics & Data Analysis 巻: 94 ページ: 63-74
  • DOI: 10.1016/j.csda.2015.08.003
  • 査読あり
• [雑誌論文] High performance computing of a fusion gene detection pipeline on the K computer (2015)
  • 著者名/発表者名: Ito S, Shiraishi Y, Shimamura T, Chiba K, Miyano S
  • 雑誌名: BIBM 巻: 2015 ページ: 1441-1447
  • DOI: 10.1109/bibm.2015.7359888
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elevated β-catenin pathway as a novel target for patients with resistance to EGF receptor targeting drugs (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakata A, Yoshida R, Yamaguchi R, Yamauchi M, Tamada Y, Fujita A, Shimamura T, Imoto S, Higuchi T, Nomura M, Kimura T, Nokihara H, Higashiyama M, Kondoh K, Nishihara H, Tojo A, Yano S, Miyano S, Gotoh N
  • 雑誌名: Scientific Report 巻: 5 号: 1 ページ: 13076-13076
  • DOI: 10.1038/srep13076
  • NAID: 120005764206
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Recursive random lasso (RRLasso) for identifying anti-cancer drug targets (2015)
  • 著者名/発表者名: Park H, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 号: 11 ページ: 147-152
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0141869
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] An Integrative Analysis to Identify Driver Genes in Esophageal Squamous Cell Carcinoma (2015)
  • 著者名/発表者名: Sawada G, Niida A, Hirata H, Komatsu H, Uchi R, Shimamura T, Takahashi Y, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Takano Y, Ueda M, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Yamasaki M, Tanaka F, Tachimori Y, Kajiyama Y, Natsugoe S, Fujita H, Tanaka Y, Calin G, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10(10) 号: 10 ページ: e0139808-e0139808
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0139808
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A Simple Model-Based Approach to Inferring and Visualizing Cancer Mutation Signatures (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Shiraishi , Georg Tremmel, Satoru Miyano, Matthew Stephens
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: 11(12) 号: 12 ページ: e1005657-e1005657
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1005657
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Quantitative characterization of T-cell repertoire in allogeneic hematopoietic stem cell transplant recipients (2015)
  • 著者名/発表者名: Yew PY, Alachkar H, Yamaguchi R, Kiyotani K, Fang H, Yap KL, Liu HT, Wickrema A, Artz A, van Besien K, Imoto S, Miyano S, Bishop MR, Stock W, Nakamura Y
  • 雑誌名: Bone Marrow Transplantation 巻: 50 号: 9 ページ: 1227-1234
  • DOI: 10.1038/bmt.2015.133
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Integrated molecular analysis of adult T cell leukemia/lymphoma. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kataoka K, Nagata Y, Kitanaka A, Shiraishi Y, Shimamura T, Yasunaga J, Totoki Y, Chiba K, Sato-Otsubo A, Nagae G, et al.
  • 雑誌名: Nat Genet. 巻: 47(11) 号: 11 ページ: 1304-15
  • DOI: 10.1038/ng.3415
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Binary Contingency Table Method for Analyzing Gene Mutation in Cancer Genome (2015)
  • 著者名/発表者名: Ayada E, Niida A, Hasegawa T, Miyano S, Imoto S
  • 雑誌名: Lecture Notes in Computer Science 巻: 9096 ページ: 12-23
  • DOI: 10.1007/978-3-319-19048-8_2
  • ISBN: 9783319190471, 9783319190488
  • 査読あり
• [雑誌論文] Oncogenic roles of TOPK and MELK, and effective growth suppression by small molecular inhibitors in kidney cancer cells (2015)
  • 著者名/発表者名: T. Kato, H. Inoue, S. Imoto, Y. Tamada, T. Miyamoto, Y. Matsuo, Y. Nakamura and J.H. Park
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 7 号: 14 ページ: 17652-17664
  • DOI: 10.18632/oncotarget.7755
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [学会発表] スーパーコンピュータと人工知能で実現したがんゲノム医療 (2020)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 第３回神戸健康・医療戦略会議
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能とスーパーコンピュータで加速するがんゲノム研究と医療 (2020)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 医学会総会
  • 招待講演
• [学会発表] がんゲノム医療に人工知能のパワースーツを着た医師達がやって来た (2020)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 山梨工業会東京支部産学公技術交流会
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能パワースーツを装着した医師によるがんゲノム医療 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 第30回日本医学会総会 2019 中部
  • 招待講演
• [学会発表] サイバーフィジカル空間で進化する人工知能支援がんゲノム医療 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 第92回日本整形外科学会学術総会
  • 招待講演
• [学会発表] クラウドと人工知能で加速するがんの臨床シークエンス (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 埼玉AIキャンパス
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能とスーパーコンピュータによるがんの臨床シークエンスの現場 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: The 8th Mie Hematology Summit
  • 招待講演
• [学会発表] リウマチ医療と人工知能ーがんゲノム医療研究での経験から (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 2019年度リウマチ月間リウマチ講演会
  • 招待講演
• [学会発表] 世界トップの癌ゲノム研究をたたき出し続ける研究者とスーパーコンピュータ (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 汎オミクス計測・計算科学センター設立記念式典
  • 招待講演
• [学会発表] がんゲノム医療におけるAI技術活用の現状と課題 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: The Japan Liver Forum
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能とスーパーコンピューターによるがんの臨床のシークエンスの現場 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 第12回熊本血液コロキウム
  • 招待講演
• [学会発表] Accelerating Cancer Big Data Analysis by Artificial Intelligence and Supercomputer (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 自治医大国際シンポジウム
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 人工知能で支援するがん臨床シークエンス研究―「造血幹細胞移植しますか？私にはわかりません」と担当医に言われたらどうしますか (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 第55回日本移植学会総会
  • 招待講演
• [学会発表] がんゲノム医療における人工知能ーもうスパコンはいらない (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 第57回日本癌治療学会学術集会会長企画シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] Society 5.0時代のがんゲノム医療と病院の展望 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: IMPULSEコンソーシアム
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能とスーパーコンピュータによるがんの臨床シークエンスの現場 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 第73回国立病院総合医学会
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能支援がんゲノム医療の現状と課題 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 第115回九州大学第一内科開講記念会
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能に支援されたSociety 5.0時代のがんゲノム医療と病院システム (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 新学術領域研究「化学コミュニ」第6回公開シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] Cancer Big Data Challenges by Supercomputers and Artificial Intelligence (2019)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: International Conference at Sungkyunkwan University School of Medicine
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Cancer Big Data Analysis with Supercomputers (2019)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: II WORKSHOP “PRACTICES IN BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY”
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ゲノム医療におけるAI技術活用の課題 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第154回日本医学会シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] がんビッグデータ 解析の現状と未来 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第１回日本メディカルAI学会学術集会
  • 招待講演
• [学会発表] システム生物学による薬物標的遺伝子の探索 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 京都大学大学院医学研究科創薬医学講座
  • 招待講演
• [学会発表] 未来のがんゲノム研究を支えるコンピュータ資源と人工知能 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: West Japan Hematology Forum In Osaka
  • 招待講演
• [学会発表] 世界のトップのがんゲノム研究が生まれるスーパーコンピュータとその運用 (2019)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第11回トップセミナー
  • 招待講演
• [学会発表] Challenges to Cancer Big Data by Artificial Intelligence and Supercomputers (2019)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 8th Global Reverse Phase Protein Array Workshop
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 人工知能によるがんの臨床シークエンス支援研究の現場から (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 福島県立医大臨床腫瘍セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能とスパコンでがんのシステム異常を暴き出し患者さんへ (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第2回Co-stimulators’Assembly
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノム解析の最前線と次世代のゲノム診療 (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第28回がん臨床研究フォーラム
  • 招待講演
• [学会発表] Watsonを用いたがんゲノム医療支援最前線 (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: オミックス医療学会大会 ～AI創薬フォーラム～
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能のパワースーツを着たオンコロジストの登場 (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第25回外科フォーラム
  • 招待講演
• [学会発表] 『ＡIとスパコンによる最先端のがん治療』～がん患者は待てない～ (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: みどり会講演会
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能と医療・研究の現在・将来 (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 「21世紀を考える会」第30回天城合宿研究会
  • 招待講演
• [学会発表] AI がもたらすこれからの生命科学 (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第５８回 生命科学 夏の学校
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能とスパコンで拓くがん臨床シークエンス (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第28回 DM club meeting
  • 招待講演
• [学会発表] 統合計算生命科学のもたらす ゲノム医療の展望 (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第15回DIA日本年会
  • 招待講演
• [学会発表] Revolutionizing Cancer Genomic Medicine by AI (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 東大工学系電気系工学専攻融合情報学特別講義Ⅳ
  • 招待講演
• [学会発表] Arrival of Oncologists Armed with AI-Powered Exoskeletons (2018)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: ICBET2018
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Accelerating Cancer Clinical Sequence by Artificial Intelligence and Supercomputer (2018)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: Seminar Precision Medicine in the 21st Century in Mexico
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Accelerating Cancer Genomics by Supercomputer and AI (2018)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: AI and Precision Forum
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Revolutionizing Cancer Clinical Sequencing by IBM Watson and Supercomputer with Big Data (2018)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 1st Baodi Forum on Medical Innovations in Health and Disease
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Cancer Genomics and Clinical Sequencing (2018)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: Genesort Conference in Precision Medicine in Cancer Genomics
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Unraveling Cancer Systems Disorders from Big Data by Supercomputers (2018)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: 2018 8th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] AIによるがんの臨床シークエンス支援研究の現場から (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第41回日本眼科手術学会学術総会
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能とスパコンで実現するがんの全遺伝子臨床シークエンス (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 平成29年度広島大学医学部小児科学教室同門会総会
  • 招待講演
• [学会発表] Cancer Big Data Analysis with Supercomputers (2018)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: シカゴ大学合同フォーラム
• [学会発表] Watsonとスパコンで実現したがんOne-Week全ゲノム臨床シークエンス (2018)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第26回バイオフィジオロジー研究会シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] Why AI is indispensable for biomedical research? -From a viewpoint of cancer genomic medicine (2017)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The Inaugural Academia Sinica Data Science Frontiers Workshop in Taipei
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 先端ゲノミクスによる癌の分子基盤の解明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第226回生命科学フォーラム
  • 招待講演
• [学会発表] 人工知能で拓く未来の医療 (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第17回日本抗加齢医学会総会
  • 招待講演
• [学会発表] Supercomputer Challenges for Cancer Genomics and TCR Data Analysis (2017)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: Precision Cancer Biology: From Targeted to Immune Therapies
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] がんの医療と研究を進化させる人工知能とスパコン ～不可能に直面したとき人は進化する～ (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 読売テクノ・フォーラム
  • 招待講演
• [学会発表] Cancer Clinical Sequence with Genomon and Watson for Genomics Using Supercomputers (2017)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: International Conference on Precision Cancer Medicine
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 人知の増強（ＡＩ）とがんのゲノム医療 (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: ＴＭ研究会2017 年度第4 回研究交流会
  • 招待講演
• [学会発表] スパコンと人工知能でがんの臨床シークエンス支援を新ステージへ (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 京都大学大学院薬学研究科医薬創成情報科学専攻10周年記念シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノムデータ解析パイプラインGenomonとがん臨床シークエンス研究 (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第6回生命医薬情報学連合大会
  • 招待講演
• [学会発表] AIとスパコンでが拓く新生命科学 (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 京都バイオ計測センターシンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] スパコンとＡＩでがんのシステム異常を暴き出す -ゲノムからネットワークまで－ (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第21回 薬物動態談話会セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] Challenging Big Cancer Sequence Data by Supercomputer and Artificial Intelligence (2017)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: DNA sequencing technologies and their application in practice
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] CHALLENGES FOR COMPLEXIY OF CANCER BY SUPERCOMPUTER -FROM GENOME TO NETWORK (2017)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: 第48回高松宮妃癌研究基金国際シンポジウム
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] AIによるがんの臨床シークエンス支援研究 －できること、できないこと、できそうなこと－ (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第15回医療機器フォーラム
  • 招待講演
• [学会発表] Breaking Cancer Big Data with Supercomputer and Artificial Intelligence (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 創立125周年・改組50周年記念国際シンポジウム
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 人工知能がもたらす新時代の医療診断支援 (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第17回抗加齢医学の実際2017
  • 招待講演
• [学会発表] スーパーコンピュータと人工知能で加速するがんゲノミクスと臨床シークエンス研究 (2017)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 愛知県がんセンター特別招聘セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] Challenging Cancer Omics Big Data with Supercomputers (2017)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: 2017年度生命科学系学会合同年次大会
  • 招待講演
• [学会発表] Analyzing and Interpreting Cancer Big Data (2017)
  • 著者名/発表者名: Miyano S
  • 学会等名: NSF Big Data PI Meeting
  • 発表場所: Omni Shoreham Hotel, Washington DC, USA
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Challenging Cancer Omics Big Data with Supercomputers (2017)
  • 著者名/発表者名: Miyano S
  • 学会等名: Computational Biology for Big Data: New Opportunities and Challenges
  • 発表場所: Shanghai Information Center for Life Sciences, Shanghai, China
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Mining Gene Networks in Cancer by Supercomputers (2016)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: Symposium of Biodynamical Systems
  • 発表場所: South University of Science and Technology of China, Shenzhen, China
  • 年月日: 2016-03-06
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Cancer Big Data Challenges with Supercomputers (2016)
  • 著者名/発表者名: Miyano S
  • 学会等名: ISC 2016
  • 発表場所: Frankfurt am, Germany
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Cancer Clinical Sequence Research with IBM Watson (2016)
  • 著者名/発表者名: Miyano S
  • 学会等名: The 19th Annual Meeting of Korean Urogynecology Society
  • 発表場所: Seoul, Korea
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Next-Generation Cancer Research with Artificial Intelligence (2016)
  • 著者名/発表者名: Miyano S
  • 学会等名: The 3rd Meeting of the International Ovarian Cancer Consortium in conjunction with the International Symposium on Tumor Microenvironment and Therapeutic Resistance
  • 発表場所: Oklahoma City, USA
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Understanding and Interpreting Cancer Big Data by Supercomputer and Artificial Intelligence (2016)
  • 著者名/発表者名: Miyano S
  • 学会等名: The 16th IEEE International Conference on Bioinformatics and Bioengineering
  • 発表場所: Taichung, Taiwan
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Boosting Systems Understanding of Cancer in New Dimension by Supercomputers (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 2015 CSHA/AACR Joint Conference “Big Data, Computation and Systems Biology in Cancer”
  • 発表場所: Cold Spring Harbor Asia, Suzhou, China
  • 年月日: 2015-12-03
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Cancer Genomes and Clinical Sequence (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: Princess Al Jawhara Center for Molecular Medicine: The 9th Scientific Conference
  • 発表場所: The Arabic Gulf University, Manama, Bahrain
  • 年月日: 2015-11-28
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ゲノム個別化医療は医療費を削減できるか (2015)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 日本癌治療学会学術総会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府京都市)
  • 年月日: 2015-10-30
  • 招待講演
• [学会発表] 「京」、及びポスト「京」がブーストするがんビッグデータ解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 生命医薬情報学連合大会 2015 年大会
  • 発表場所: 京都大学宇治キャンパスおうばくプラザ(京都府宇治市)
  • 年月日: 2015-10-30
  • 招待講演
• [学会発表] スーパーコンピュータが暴き出したがんのシステム異常 (2015)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 日本癌治療学会学術総会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府京都市)
  • 年月日: 2015-10-29
  • 招待講演
• [学会発表] Unraveling cancer heterogeneity with supercomputer (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa University, Kanazawa, Ishikawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13
  • 招待講演
• [学会発表] Boosting Systems Understanding of Cancer into Another Dimension (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: QBiC Symposium 2015: High-Dimensional Data for the Design Principles of Life
  • 発表場所: RIKEN Quantitative Biology Center (QBiC), Osaka, Japan
  • 年月日: 2015-08-25
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Analyzing Cancer Gene Networks with Supercomputers (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 2nd Annual Meeting of the International Ovarian Cancer Consortium and the Symposium on Tumor Microenvironment and Therapy Resistance
  • 発表場所: Stephenson Cancer Center, Oklahoma City, USA
  • 年月日: 2015-08-17
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Supercomputers for Cancer Research and Cancer Big Data (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 4th IIAI International Congress on Advanced Applied Informatics
  • 発表場所: Okayama Convention Center, Okayama, Japan
  • 年月日: 2015-07-13
  • 国際学会 / 招待講演
• [備考] システム癌新次元ホームページ
  • URL: http://neosystemscancer.hgc.jp/home
• [備考]
  • URL: http://neosystemscancer.hgc.jp/
• [備考]
  • URL: http://genomon-project.github.io/GenomonPages/
• [備考]
  • URL: https://github.com/Genomon-Project/paplot/
• [備考]
  • URL: https://github.com/tshimam/gimlet/
• [備考]
  • URL: http://sign.hgc.jp/signbn/index_ja.html
• [備考] 新学術領域「システム癌新次元」
  • URL: http://neosystemscancer.hgc.jp/
• [備考] Genomon Project
  • URL: http://genomon-project.github.io/GenomonPages/
• [備考] PAPLOT
  • URL: https://github.com/Genomon-Project/paplot/
• [備考] GIMLET
  • URL: https://github.com/tshimam/gimlet/
• [備考] SiGN-BN
  • URL: http://sign.hgc.jp/signbn/index_ja.html
• [備考] Genomon
• [備考] D3M
  • URL: https://github.com/ymatts/D3M
• [備考] SiGN-L1
  • URL: http://sign.hgc.jp/signl1/
• [備考] GenomonPipeline
  • URL: https://github.com/Genomon-Project/GenomonPipeline
• [備考] Genomon
  • URL: http://genomon.hgc.jp/exome/index.html
• [備考] Genomon-fusion
  • URL: http://genomon.hgc.jp/rna/
• [備考] GenomonMutationFilter
  • URL: https://github.com/Genomon-Project/GenomonMutationFilter
• [備考] GenomonSV
  • URL: https://github.com/Genomon-Project/GenomonSV