リプログラミングによる植物幹細胞の新生機構の解明

• 研究領域: 植物の生命力を支える多能性幹細胞の基盤原理
• 研究課題/領域番号: 17H06472
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 林 誠 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (30291933)
• 研究分担者: 石崎 公庸 神戸大学, 理学研究科, 教授 (00452293)
• 研究期間 (年度): 2017-06-30 – 2022-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2021年度)
• 配分額: 127,660千円 (直接経費: 98,200千円、間接経費: 29,460千円); 2021年度: 28,080千円 (直接経費: 21,600千円、間接経費: 6,480千円); 2020年度: 28,080千円 (直接経費: 21,600千円、間接経費: 6,480千円); 2019年度: 28,080千円 (直接経費: 21,600千円、間接経費: 6,480千円); 2018年度: 28,080千円 (直接経費: 21,600千円、間接経費: 6,480千円); 2017年度: 15,340千円 (直接経費: 11,800千円、間接経費: 3,540千円)
• キーワード: ゲノム / 発現制御 / 発生・分化 / 植物

研究成果の概要

植物に特徴的な分化細胞のリプログラミングによる幹細胞新生に着目し、マメ科の根粒形成とコケ植物苔類の杯状体形成を対象にそれらの発生の鍵となる転写因子の機能を中心に研究を進めた。その結果、側根形成と根粒形成あるいは杯状体形成と腋芽形成という、異なる器官の発生に共通した転写因子が明らかとなり、進化的に新たな器官を獲得する際に重要な制御メカニズムを発見した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

マメ科植物は根粒菌と細胞内共生することで大気中の窒素を利用し、貧栄養土壌で生育できる。また、維管束植物は腋芽を発生させることで地上部のバイオマスを格段に増大させ、環境に適応した生態系の根幹を形作る。植物の生存戦略に重要な器官の発生を制御する鍵因子を分子遺伝学的に明らかにし、その進化メカニズムを紐解いたことにより、特定の因子をターゲットにしたデザイン育種が可能となり、持続可能な開発目標に貢献できる。

研究成果

• [国際共同研究] Monash University(オーストラリア)
• [国際共同研究] TEMASEK Laboratories(シンガポール)
• [国際共同研究] INRA(フランス)
• [国際共同研究] Monash University(オーストラリア)
• [国際共同研究] TEMASEK Laboratories(シンガポール)
• [国際共同研究] Upsala University(スウェーデン)
• [国際共同研究] Monash University(オーストラリア)
• [国際共同研究] TEMASEK Laboratories(シンガポール)
• [国際共同研究] Ludwig Maximilian University of Munich(ドイツ)
• [雑誌論文] Evolution of root nodule symbiosis: Focusing on the transcriptional regulation from the genomic point of view (2022)
  • 著者名/発表者名: Battenberg Kai、Hayashi Makoto
  • 雑誌名: Ｐｌａｎｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ 巻: 39 号: 1 ページ: 79-83
  • DOI: 10.5511/plantbiotechnology.22.0127a
  • ISSN: 1342-4580, 1347-6114
  • 年月日: 2022-03-25
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Migration of prospindle before the first asymmetric division in germinating spore of <i>Marchantia polymorpha</i> (2022)
  • 著者名/発表者名: Sakai Yuuki、Higaki Takumi、Ishizaki Kimitsune、Nishihama Ryuichi、Kohchi Takayuki、Hasezawa Seiichiro
  • 雑誌名: Ｐｌａｎｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ 巻: 39 号: 1 ページ: 5-12
  • DOI: 10.5511/plantbiotechnology.21.1217b
  • ISSN: 1342-4580, 1347-6114
  • 年月日: 2022-03-25
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Development and Molecular Genetics of Marchantia polymorpha. (2021)
  • 著者名/発表者名: Kohchi T, Yamato KY, Ishizaki K, Yamaoka S, Nishihama R.
  • 雑誌名: Annu. Rev. Plant Biol. 巻: 72 号: 1 ページ: 677-702
  • DOI: 10.1146/annurev-arplant-082520-094256
  • 査読あり
• [雑誌論文] Major components of the KARRIKIN INSENSITIVE2-dependent signaling pathway are conserved in the liverwort Marchantia polymorpha (2021)
  • 著者名/発表者名: Mizuno Y, Komatsu A, Shimazaki S, Naramoto S, Inoue K, Xie X, Ishizaki K, Kohchi T, Kyozuka J.
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: - 号: 7 ページ: 112-156
  • DOI: 10.1093/plcell/koab106
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Leguminous nodule symbiosis involves recruitment of factors contributing to lateral root development (2021)
  • 著者名/発表者名: Soyano Takashi、Liu Meng、Kawaguchi Masayoshi、Hayashi Makoto
  • 雑誌名: Current Opinion in Plant Biology 巻: 59 ページ: 102000-102000
  • DOI: 10.1016/j.pbi.2020.102000
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rhizobia use a pathogenic-like effector to hijack leguminous nodulation signalling (2021)
  • 著者名/発表者名: Ratu Safirah Tasa Nerves、Teulet Albin、Miwa Hiroki、Masuda Sachiko、Nguyen Hien P.、Yasuda Michiko、Sato Shusei、Kaneko Takakazu、Hayashi Makoto、Giraud Eric、Okazaki Shin
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 号: 1 ページ: 2034-2034
  • DOI: 10.1038/s41598-021-81598-6
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Multi-omics analysis on an agroecosystem reveals the significant role of organic nitrogen to increase agricultural crop yield (2020)
  • 著者名/発表者名: Ichihashi Y, Date Y, Shino A, Shimizu T, Shibata A, Kumaishi K, Funahashi F, Wakayama K, Yamazaki K, Umezawa A, Sato T, Kobayashi M, Kamimura M, Kusano M, Che FS, O Brien M, Tanoi K, Hayashi M, Nakamura R, Shirasu K, Kikuchi J, Nihei N
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 117 号: 25 ページ: 14552-14560
  • DOI: 10.1073/pnas.1917259117
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Common Mechanisms of Developmental Reprogramming in Plants-Lessons From Regeneration, Symbiosis, and Parasitism (2020)
  • 著者名/発表者名: Ichihashi Yasunori、Hakoyama Tsuneo、Iwase Akira、Shirasu Ken、Sugimoto Keiko、Hayashi Makoto
  • 雑誌名: Frontiers in Plant Science 巻: 11 ページ: 1084-1084
  • DOI: 10.3389/fpls.2020.01084
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Design principles of a minimal auxin response system (2020)
  • 著者名/発表者名: Kato Hirotaka、Mutte Sumanth K.、Suzuki Hidemasa、Crespo Isidro、Das Shubhajit、Radoeva Tatyana、Fontana Mattia、Yoshitake Yoshihiro、Hainiwa Emi、van den Berg Willy、Lindhoud Simon、Ishizaki Kimitsune、Hohlbein Johannes、Borst Jan Willem、Boer D. Roeland、Nishihama Ryuichi、Kohchi Takayuki、Weijers Dolf
  • 雑誌名: Nature Plants 巻: 6 号: 5 ページ: 473-482
  • DOI: 10.1038/s41477-020-0662-y
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] 庭の厄介者ゼニゴケがクローン個体をつくり繁殖する仕組み (2020)
  • 著者名/発表者名: 安居佑季子, 石崎公庸
  • 雑誌名: 化学と生物 巻: 58 ページ: 502-504
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gemma cup and gemma development in Marchantia polymorpha (2020)
  • 著者名/発表者名: Kato Hirotaka、Yasui Yukiko、Ishizaki Kimitsune
  • 雑誌名: New Phytologist 巻: 228 号: 2 ページ: 459-465
  • DOI: 10.1111/nph.16655
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Induction of Multichotomous Branching by CLAVATA Peptide in Marchantia polymorpha (2020)
  • 著者名/発表者名: Hirakawa Yuki、Fujimoto Toko、Ishida Sakiko、Uchida Naoyuki、Sawa Shinichiro、Kiyosue Tomohiro、Ishizaki Kimitsune、Nishihama Ryuichi、Kohchi Takayuki、Bowman John L.
  • 雑誌名: Current Biology 巻: 30 号: 19 ページ: 3833-3840
  • DOI: 10.1016/j.cub.2020.07.016
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The rhizobial autotransporter determines the symbiotic nitrogen fixation activity of Lotus japonicus in a host-specific manner (2020)
  • 著者名/発表者名: Shimoda Yoshikazu、Nishigaya Yuki、Yamaya-Ito Hiroko、Inagaki Noritoshi、Umehara Yosuke、Hirakawa Hideki、Sato Shusei、Yamazaki Toshimasa、Hayashi Makoto
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 117 号: 3 ページ: 1806-1815
  • DOI: 10.1073/pnas.1913349117
  • 査読あり
• [雑誌論文] A shared gene drives lateral root development and root nodule symbiosis pathways in Lotus (2019)
  • 著者名/発表者名: Soyano Takashi、Shimoda Yoshikazu、Kawaguchi Masayoshi、Hayashi Makoto
  • 雑誌名: Science 巻: 366 号: 6468 ページ: 1021-1023
  • DOI: 10.1126/science.aax2153
  • 査読あり
• [雑誌論文] Kinase activity-dependent stability of calcium/calmodulin-dependent protein kinase of Lotus japonicus (2019)
  • 著者名/発表者名: Shimoda Yoshikazu、Imaizumi-Anraku Haruko、Hayashi Makoto
  • 雑誌名: Planta 巻: 250 号: 5 ページ: 1773-1779
  • DOI: 10.1007/s00425-019-03264-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] ERN1 and CYCLOPS coordinately activate NIN signaling to promote infection thread formation in Lotus japonicus (2019)
  • 著者名/発表者名: Liu Meng、Soyano Takashi、Yano Koji、Hayashi Makoto、Kawaguchi Masayoshi
  • 雑誌名: Journal of Plant Research 巻: 132 号: 5 ページ: 641-653
  • DOI: 10.1007/s10265-019-01122-w
  • NAID: 40022011638
  • 査読あり
• [雑誌論文] A conserved regulatory mechanism mediates the convergent evolution of plant shoot lateral organs. (2019)
  • 著者名/発表者名: Naramoto S, Jones VAS, Nicola, N, Sato M,Toyooka K, Shimamura M, Ishida S, Nishitani K,Ishizaki K, Nishihama R, Kohchi T, Dolan L, Kyozuka J.
  • 雑誌名: PLoS Biology 巻: 17 号: 12 ページ: 12-12
  • DOI: 10.1371/journal.pbio.3000560
  • NAID: 120006813343
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] GEMMA CUP-ASSOCIATED MYB1, an ortholog of axillary meristem regulators, is essential in vegetative reproduction in Marchantia polymorpha. (2019)
  • 著者名/発表者名: Yasui Y, Tsukamoto S, Sugaya T, Nishihama R, Wang Q, Kato H, Yamato KT, Fukaki H, Mimura T, Kubo H, Theres K, Kohchi T, Ishizaki K.
  • 雑誌名: Curr Biol. 巻: 29 号: 23 ページ: 3987-3995
  • DOI: 10.1016/j.cub.2019.10.004
  • NAID: 120006773950
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] The RopGEF KARAPPO Is Essential for the Initiation of Vegetative Reproduction in Marchantia polymorpha (2019)
  • 著者名/発表者名: Hiwatashi T., Goh H., Yasui Y., Koh L.Q., Takami H., Kajikawa M., Kirita H., Kanazawa T., Minamino N., Togawa T., Sato M., Wakazaki M., Yamaguchi K., Shigenobu S., Fukaki H., Mimura T., Toyooka K., Sawa S., Yamato K.T.,Ueda T., Urano D., Kohchi T., Ishizaki K.
  • 雑誌名: Current Biology 巻: 29 号: 20 ページ: 3525-3531
  • DOI: 10.1016/j.cub.2019.08.071
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Cytokinin signaling is essential for organ formation in Marchantia polymorpha (2019)
  • 著者名/発表者名: Aki Shiori S、Mikami Tatsuya、Naramoto Satoshi、Nishihama Ryuichi、Ishizaki Kimitsune、Kojima Mikiko、Takebayashi Yumiko、Sakakibara Hitoshi、Kyozuka Junko、Kohchi Takayuki、Umeda Masaaki
  • 雑誌名: Plant and Cell Physiology 巻: 60 号: 8 ページ: 1842-1854
  • DOI: 10.1093/pcp/pcz100
  • NAID: 120006711216
  • 査読あり
• [雑誌論文] SNARE Proteins LjVAMP72a and LjVAMP72b Are Required for Root Symbiosis and Root Hair Formation in Lotus japonicus (2019)
  • 著者名/発表者名: Sogawa Aoi、Yamazaki Akihiro、Yamasaki Hiroki、Komi Misa、Manabe Tomomi、Tajima Shigeyuki、Hayashi Makoto、Nomura Mika
  • 雑誌名: Frontiers in Plant Science 巻: 9 ページ: 1992-1992
  • DOI: 10.3389/fpls.2018.01992
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Control of proliferation in the haploid meristem by CLE peptide signaling in Marchantia polymorpha. (2019)
  • 著者名/発表者名: Hirakawa Y, Uchida N, Yamaguchi YL, Tabata R, Ishida S, Ishizaki K, Nishihama R, Kohchi T, Sawa S, Bowman JL
  • 雑誌名: PLoS Genet. 巻: 7 号: 3 ページ: e1007997-e1007997
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1007997
  • NAID: 120006621164
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Transcription factor DUO1 generated by neo-functionalization is associated with evolution of sperm differentiation in plants (2018)
  • 著者名/発表者名: Higo, A., Kawashima, T., Borg, M., Zhao, M., Lopez-Vidriero, I., Sakayama, H., et al. (他18名)
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 9 号: 1 ページ: 5283-5283
  • DOI: 10.1038/s41467-018-07728-3
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] An Evolutionarily Conserved Abscisic Acid Signaling Pathway Regulates Dormancy in the Liverwort Marchantia polymorpha (2018)
  • 著者名/発表者名: Eklund D. Magnus、Kanei Masakazu、Flores-Sandoval Eduardo、Ishizaki Kimitsune、Nishihama Ryuichi、Kohchi Takayuki、Lagercrantz Ulf、Bhalerao Rishikesh P.、Sakata Yoichi、Bowman John L.
  • 雑誌名: Current Biology 巻: 28 号: 22 ページ: 3691-3699
  • DOI: 10.1016/j.cub.2018.10.018
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Biosynthesis of riccionidins and marchantins is regulated by R2R3-MYB transcription factors in Marchantia polymorpha (2018)
  • 著者名/発表者名: Kubo Hiroyoshi、Nozawa Shunsuke、Hiwatashi Takuma、Kondou Youichi、Nakabayashi Ryo、Mori Tetsuya、Saito Kazuki、Takanashi Kojiro、Kohchi Takayuki、Ishizaki Kimitsune
  • 雑誌名: Journal of Plant Research 巻: 131 号: 5 ページ: 849-864
  • DOI: 10.1007/s10265-018-1044-7
  • NAID: 40021652450
  • 査読あり
• [雑誌論文] An evolutionarily conserved NIMA-related kinase directs rhizoid tip growth in the basal land plant Marchantia polymorpha (2018)
  • 著者名/発表者名: Otani Kento、Ishizaki Kimitsune、Nishihama Ryuichi、Takatani Shogo、Kohchi Takayuki、Takahashi Taku、Motose Hiroyasu
  • 雑誌名: Development 巻: 145 号: 5 ページ: 154617-154617
  • DOI: 10.1242/dev.154617
  • 査読あり
• [雑誌論文] Generative Cell Specification Requires Transcription Factors Evolutionarily Conserved in Land Plants (2018)
  • 著者名/発表者名: Yamaoka, S., Nishihama, R., Yoshitake, Y., Ishida, S., Inoue, K., Saito, M., Okahashi, K., Bao, H., Nishida, H., Yamaguchi, K., Shigenobu, S., Ishizaki, K., Yamato, K.T., and Kohchi, T.
  • 雑誌名: Current Biology 巻: 28 号: 3 ページ: 479-486
  • DOI: 10.1016/j.cub.2017.12.053
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Loss-of-function of ASPARTIC PEPTIDASE NODULE-INDUCED 1 (APN1) in Lotus japonicus restricts efficient nitrogen-fixing symbiosis with specific Mesorhizobium loti strains (2017)
  • 著者名/発表者名: Yamaya-Ito Hiroko、Shimoda Yoshikazu、Hakoyama Tsuneo、Sato Shusei、Kaneko Takakazu、Hossain Md Shakhawat、Shibata Satoshi、Kawaguchi Masayoshi、Hayashi Makoto、Kouchi Hiroshi、Umehara Yosuke
  • 雑誌名: The Plant Journal 巻: 93 号: 1 ページ: 5-16
  • DOI: 10.1111/tpj.13759
  • 査読あり
• [雑誌論文] Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome. (2017)
  • 著者名/発表者名: Bowman J, Kouchi T,..(106名）..Yokoyama R, ..(4名)
  • 雑誌名: Cell 巻: 171 号: 2 ページ: 287-304
  • DOI: 10.1016/j.cell.2017.09.030
  • NAID: 120006353839
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The Roles of the Sole Activator-Type Auxin Response Factor in Pattern Formation of Marchantia polymorpha (2017)
  • 著者名/発表者名: Kato, H., Kouno, M., Takeda, M., Suzuki, H., Ishizaki, K., Nishihama, R., and Kohchi, T.
  • 雑誌名: Plant and Cell Physiology 巻: 58 号: 10 ページ: 1642-1651
  • DOI: 10.1093/pcp/pcx095
  • 査読あり
• [雑誌論文] DRP3 and ELM1 are required for mitochondrial fission in the liverwort Marchantia polymorpha (2017)
  • 著者名/発表者名: Nagaoka Nagisa、Yamashita Akihiro、Kurisu Rina、Watari Yuta、Ishizuna Fumiko、Tsutsumi Nobuhissro、Ishizaki Kimitsune、Kohchi Takayuki、Arimura Shin-ichi
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 7 号: 1 ページ: 4600-4600
  • DOI: 10.1038/s41598-017-04886-0
  • NAID: 120006366789
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Regulation of nodule initiation in legumes (2022)
  • 著者名/発表者名: Makoto Hayashi
  • 学会等名: 第63回 日本植物生理学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] 根粒形成における共生シグナルによる細胞周期再活性化機構の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 杉山輝樹、林誠
  • 学会等名: 第63回 日本植物生理学会年会
• [学会発表] Evolutionary conserved mechanisms of stem cell proliferation in land plants (2022)
  • 著者名/発表者名: Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: 第63回 日本植物生理学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] ゼニゴケ無性芽におけるMpHYPNOSを介した休眠制御 (2022)
  • 著者名/発表者名: 芳村 那美, 吉川 実樺子, 安田 有沙, 加藤 大貴, 酒井 友希, 三村 徹郎, 近藤 侑貴, 深城 英弘, 石崎 公庸
  • 学会等名: 第63回 日本植物生理学会年会
• [学会発表] 苔類ゼニゴケの杯状体形成におけるsingle-MYB遺伝子GROMの機能解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 加藤 大貴, 安居 佑季子, 近藤 侑貴, 深城 英弘, 三村 徹郎, 石崎 公庸
  • 学会等名: 第63回 日本植物生理学会年会
• [学会発表] ゼニゴケ胞子における非対称分裂メカニズム (2022)
  • 著者名/発表者名: 酒井 友希, 近藤 侑貴, 深城 英弘, 石崎 公庸
  • 学会等名: 第63回 日本植物生理学会年会
• [学会発表] Nodule initiation regulated by symbiotic signals (2021)
  • 著者名/発表者名: Makoto Hayashi
  • 学会等名: 14th European Nitrogen Fixation Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Gene expression patterns of Lotus japonicus root cortex through single cell RNAseq (2021)
  • 著者名/発表者名: Kai Battenberg, S. Thomas Kelly, Nicola Hetherington, Atsuko Hirota, Aki Minoda, Makoto Hayashi
  • 学会等名: 14th European Nitrogen Fixation Conference
  • 国際学会
• [学会発表] Sterol acyltransferase is involved in the regulation of nodulation (2021)
  • 著者名/発表者名: Akihiro Yamazaki, Yozo Okazaki, Yasuhiro Higashi, Kazuki Saito, Akira Akamatsu, Naoya Takeda, Akira Miyahara Miwa Nagae, Yosuke Umehara, Makoto Hayashi
  • 学会等名: 14th European Nitrogen Fixation Conference
  • 国際学会
• [学会発表] ゼニゴケ無性芽におけるMpHYPNOS を介した休眠制御 (2021)
  • 著者名/発表者名: 芳村那美, 吉川実樺子, 安田有沙, 加藤大貴, 酒井友希, 三村徹郎, 近藤侑貴, 深城英弘, 石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会 第85回大会
• [学会発表] ゼニゴケの葉状体再生におけるGCAM1 およびGC1L の機能 (2021)
  • 著者名/発表者名: 田中涼葉, 加藤大貴, 安居佑季子, 近藤侑貴, 深城英弘, 石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会 第85回大会
• [学会発表] ゼニゴケ葉状体の形態形成におけるMpREN の機能解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 米塚広樹, 上野亜紀, 樋渡琢真, 加藤大貴, 酒井友希, 三村徹郎, 近藤侑貴, 深城英弘, 石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会 第85回大会
• [学会発表] ゼニゴケ器官形成におけるR2R3-MYB 転写因子SHOTGLASS の機能 (2021)
  • 著者名/発表者名: 酒井友希, 高見英幸, 山岡尚平, 近藤侑貴, 深城英弘, 三村徹郎, 石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会 第85回大会
• [学会発表] 陸上植物に保存されたオーキシン応答遺伝子WIP のゼニゴケにおける機能解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 加藤大貴, 近藤侑貴, 深城英弘, Dolf Weijers, 石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会 第85回大会
• [学会発表] Application of single cell RNAseq to investigate the onset of root nodule development in Lotus japonicus (2021)
  • 著者名/発表者名: Kai Battenberg, S. Thomas Kelly, Nicola A. Hetherington, Aki Minoda, Makoto Hayashi
  • 学会等名: 第62回日本植物生理学会年会
• [学会発表] Regulation of cell cycle reactivation during nodule development (2021)
  • 著者名/発表者名: 杉山輝樹、林誠
  • 学会等名: 第62回日本植物生理学会年会
• [学会発表] Sterol acyltransferase is involved in the regulation of root nodule symbiosis (2021)
  • 著者名/発表者名: 山崎明広、岡咲洋三、東泰弘、斉藤和季、赤松明、武田直也、宮原章、永江美和、梅原洋佐、林誠
  • 学会等名: 第62回日本植物生理学会年会
• [学会発表] Exploring the common mechanisms for stem cell propagation from vegetative reproduction of Marchantia polymorpha (2021)
  • 著者名/発表者名: Hirotaka Kato, Yukiko Yasui, Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: 第62回日本植物生理学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] Functional analysis of a R2R3-MYB transcription factor SHOTGLASS in Marchantia polymorpha (2021)
  • 著者名/発表者名: Yuuki Sakai, Hideyuki Takami, Shigeyuki Tsukamoto, Shohei Yamaoka, Yuki Kondo, Hidehiro Fukaki, Tetsuro Mimura, Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: 第62回日本植物生理学会年会
• [学会発表] 苔類ゼニゴケの杯状体形成に重要なsingle-MYBタンパク質の同定 (2020)
  • 著者名/発表者名: 加藤大貴, 安居佑季子, 深城英弘, 三村徹郎, 石崎公庸
  • 学会等名: 第84回日本植物学会大会
• [学会発表] ゼニゴケ側生器官形成を制御するMYB転写因子GCAM2の機能解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 酒井友希, 高見英幸, 塚本成幸, 山岡尚平, 増田晃秀, 深城英弘, 三村徹郎, 河内孝之, 石崎公庸
  • 学会等名: 第84回日本植物学会大会
• [学会発表] 無性芽形成に重要なKAR/RopGEFを制御する上流因子の探索 (2020)
  • 著者名/発表者名: 樋渡琢真, 南野尚紀, 海老根一生, 深城英弘, 三村徹郎, 上田貴志, 石崎公庸
  • 学会等名: 第84回日本植物学会大会
• [学会発表] The legume-rhizobial gene-for-gene interaction based on the Lotus japonicus and Mesorhizobium loti co-expression network (2020)
  • 著者名/発表者名: Tsuneo Hakoyama, Atsuko Hirota, Yoshikazu Shimoda, Makoto Hayashi
  • 学会等名: 第61回日本植物生理学会年会
• [学会発表] Single-cell RNAseq analysis of Lotus japonicus roots to elucidate the genetic mechanisms of cell division reactivation in legume cortical cells (2020)
  • 著者名/発表者名: Kai Battenberg, S. Thomas Kelly, Nicola Hetherington, Aki Minoda, Makoto Hayashi
  • 学会等名: 第61回日本植物生理学会年会
• [学会発表] Sterol acyltransferase is involved in the regulation of root nodule symbiosis (2020)
  • 著者名/発表者名: Akihiro Yamazaki, Yozo Okazaki, Yasuhiro Higashi, Kazuki Saito, Akira Akamatsu, Naoya Takeda, Akira Miyahara, Miwa Nagae, Yosuke Umehara and Makoto Hayashi
  • 学会等名: 第61回日本植物生理学会年会
• [学会発表] Roles of Lotus japonicus PUCHI genes in root nodule formation (2020)
  • 著者名/発表者名: Takashi Soyano, Masayoshi Kawaguchi, Makoto Hayashi
  • 学会等名: 第61回日本植物生理学会年会
• [学会発表] ミヤコグサ根粒菌 Mesorhizobium lotiトランスポゾン挿入変異体の挿入位置決定 (2019)
  • 著者名/発表者名: 箱山雅生、廣田敦子、山崎祥子、久下修平、辻井快、下田宜司、山崎明広、林誠
  • 学会等名: 植物微生物研究会第29回研究交流会
• [学会発表] 根粒形成初期におけるミヤコグサの根の1細胞RNAseq解析に向けて (2019)
  • 著者名/発表者名: 辻井快、S. Thomas Kelly、Nicola Hetherington、Aki Minoda、林誠
  • 学会等名: 植物微生物研究会第29回研究交流会
• [学会発表] CAMTA1: a novel regulator of nodulation (2019)
  • 著者名/発表者名: Akihiro Yamazaki, Kiminori Toyooka, Akira Akamatsu, Naoya Takeda, Akira Miyahara, Miwa Nagae, Yosuke Umehara, and Makoto Hayashi
  • 学会等名: IS-MPMI XVIII Congress
  • 国際学会
• [学会発表] Marchantia as a model for evolutionary biology. (2019)
  • 著者名/発表者名: Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: The Vassilios Sarafis OzBryo Meeting
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] An evolutionary conserved mechanism for production of secondary meristems in land plants. (2019)
  • 著者名/発表者名: Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: Australian Society of Plant Scientists Conference: ASPS2019
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] GEMMA CUP-ASSOCIATED MYB1, an orthologue of axillary meristem regulator, is essential for vegetative reproduction in the liverwort Marchantia polymorpha (2019)
  • 著者名/発表者名: Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: Marchantia Workshop 2019
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ゼニゴケ形態形成におけるRopGAPの機能解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 上野亜紀, 樋渡琢真, 三村徹郎, 深城英弘, 石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会第83回大会
• [学会発表] ゼニゴケ無性芽形成に機能するRopおよびRopGEFの細胞内局在解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 樋渡琢真, 上野亜紀, 金澤建彦, 南野尚紀, 深城英弘, 三村徹郎, 上田貴志, 石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会第83回大会
• [学会発表] 重イオンビーム照射胞子を用いたゼニゴケ配偶体形態形成変異体のスクリーニングと解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 酒井嵩人, 平田千穂, 風間裕介, 阿部知子, 三村徹郎, 深城英弘, 石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会第83回大会
• [学会発表] A single-cell bioinformatics analysis pipeline for discovery of stem cells in plants (2019)
  • 著者名/発表者名: S Thomas Kelly, Nicola A Hetherington, Shiori Aki, Haruka Yabukami, Kai Battenberg, Makoto Hayashi, Masaaki Umeda, Aki Minoda
  • 学会等名: Keystone Symposium Single Cell Biology
  • 国際学会
• [学会発表] Gene regulatory networks in root nodule symbiosis (2019)
  • 著者名/発表者名: Makoto Hayashi
  • 学会等名: 第60回日本植物生理学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] ステロールの恒常性に寄与するAcyltransferaseによる根粒共生の制御 (2019)
  • 著者名/発表者名: 山崎明広、岡咲洋三、斉藤和季、橋本恵、豊岡公徳、宮原章、永江美和、梅原洋佐、林誠
  • 学会等名: 第60回日本植物生理学会年会
• [学会発表] ミヤコグサASL18/LBD16はNF-Yと結合して根粒の発達を正に制御する (2019)
  • 著者名/発表者名: 征矢野敬、林誠、川口正代司
  • 学会等名: 第60回日本植物生理学会年会
• [学会発表] ERN1 may function as an additional regulator of NIN to promote infection thread formation in Lotus japonicus (2019)
  • 著者名/発表者名: Meng Liu, Takashi Soyano, Koji Yano, Makoto Hayashi, Masayoshi Kawaguchi
  • 学会等名: 第60回日本植物生理学会年会
• [学会発表] 遺伝子共発現ネットワークに基づくミヤコグサとミヤコグサ根粒菌の共生成立過程における遺伝子間相互作用の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 箱山雅生、廣田敦子、下田宜司、林誠
  • 学会等名: 第60回日本植物生理学会年会
• [学会発表] ゼニゴケの２つのR2R3-MYB 型転写因子を介した異なる幹細胞性獲得制御機構 (2019)
  • 著者名/発表者名: 安居佑季子、塚本成幸、石田咲子、西浜竜一、深城英弘、三村徹郎、河内孝之、石崎公庸
  • 学会等名: 第60回日本植物生理学会年会
• [学会発表] ゼニゴケ腹鱗片の粘液細胞形成におけるRopシグナル伝達の役割 (2019)
  • 著者名/発表者名: 樋渡琢真、深城英弘、三村徹郎、石崎公庸
  • 学会等名: 第60回日本植物生理学会年会
• [学会発表] 植物・微生物共生における細胞リプログラミングとその進化 (2018)
  • 著者名/発表者名: 林誠
  • 学会等名: 細胞凝集研究会
  • 招待講演
• [学会発表] Gene regulatory networks co-opted into the root nodule symbiosis of legumes (2018)
  • 著者名/発表者名: Makoto Hayashi
  • 学会等名: 13th European Nitrogen Fixation Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] A Calmodulin-binding Transcriptional Activator controls nodule organogenesis (2018)
  • 著者名/発表者名: Akihiro Yamazaki, Akira Miyahara, Miwa Nagae, Yosuke Umehara, Makoto Hayashi
  • 学会等名: 13th European Nitrogen Fixation Conference
  • 国際学会
• [学会発表] Transcription factors involved in lateral root development may function downstream of Nodule Inception to regulate nodule development (2018)
  • 著者名/発表者名: Takashi Soyano, Makoto Hayashi, Masayoshi Kawaguchi
  • 学会等名: 13th European Nitrogen Fixation Conference
  • 国際学会
• [学会発表] マメ科植物の根粒と側根の形成に共通して係わる宿主因子 (2018)
  • 著者名/発表者名: 征矢野敬、林誠、川口正代司
  • 学会等名: 日本植物学会第82回大会
• [学会発表] 遺伝子共発現ネットワークを用いた ALB1 タンパク質のリガンドの探索 (2018)
  • 著者名/発表者名: 箱山雅生、下田宜司、林誠
  • 学会等名: 植物微生物研究会第28回研究交流会
• [学会発表] PH/BEACH/WDドメインを持つ CRINKLE タンパク質の根粒共生における機能解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 下村彩、横田圭祐、廣田敦子、征矢野敬、林誠
  • 学会等名: 植物微生物研究会第28回研究交流会
• [学会発表] 根粒共生における新奇制御因子 (2018)
  • 著者名/発表者名: 山崎明広、宮原章、永江美和、梅原洋佐、豊岡公徳、林誠
  • 学会等名: 植物微生物研究会第28回研究交流会
• [学会発表] Developing a single-cell bioinformatics analysis pipeline: Application of single-cell RNA-seq to plant tissues (2018)
  • 著者名/発表者名: S Thomas Kelly, Nicola A Hetherington, Shiori Aki, Haruka Yabukami, Kai Battenberg, Makoto Hayashi, Masaaki Umeda, Aki Minoda
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Molecular genetics of gemma dormancy in a basal land plant Marchantia polymorpha (2018)
  • 著者名/発表者名: Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: Plant Dormancy Symposium 2018
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ゼニゴケの無性芽形成におけるKAR/RopGEFの機能ドメイン解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 樋渡琢真、安居佑季子、上野亜紀、Li Quan Koh、深城英弘、三村徹郎、河内孝之、浦野大輔、石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会第82回大会
• [学会発表] ゼニゴケのMYB型転写因子GCAM1による幹細胞制御機構の解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 安居佑季子、塚本成幸、西浜竜一、深城英弘、三村徹郎、河内孝之、石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会第82回大会
• [学会発表] The critical role of MpbHLH40 as a positive regulator of dormancy in the liverwort Marchantia polymorpha (2018)
  • 著者名/発表者名: Kimitsune Ishizaki, Mikako Yoshikawa, Shigeyuki Tsukamoto, Hidehiro Fukaki, Tetsuro Mimura, Daisuke Takezawa, Yoichi Sakata, Takayuki Kohchi
  • 学会等名: EMBO Workshop ~New shores in land plant evolution~
  • 国際学会
• [学会発表] Blue light perception by roots inhibits root nodule formation in Lotus japonicus (2018)
  • 著者名/発表者名: Aya Shimomura, Ayumi Naka, Nobuyuki Miyazaki, Sayaka Moriuchi, Susumu Arima, Shusei Sato, Hideki Hirakawa, Makoto Hayashi, Maskit Maymon, Ann M. Hirsch, Akihiro Suzuki
  • 学会等名: International Symposium on Plant Photobiology 2018
  • 国際学会
• [学会発表] 根粒共生特異的NIN転写因子の下流で作用する側根形成関連因子 (2018)
  • 著者名/発表者名: 征矢野敬、林誠、川口正代司
  • 学会等名: 第59回日本植物生理学会年会
• [学会発表] カルモジュリン結合転写因子による根粒形成の新奇制御機構 (2018)
  • 著者名/発表者名: 山﨑明広、宮原章、永江美和、梅原洋佐、林誠
  • 学会等名: 第59回日本植物生理学会年会
• [学会発表] PH/BEACH/WDドメインを持つCRINKLEタンパク質の根粒共生における機能解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 下村彩、横田圭祐、廣田敦子、征矢野敬、林誠
  • 学会等名: 第59回日本植物生理学会年会
• [学会発表] ゼニゴケ無性芽の休眠を正に制御するMpbHLH40の機能解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 吉川 実樺子、塚本 成幸、深城 英弘、三村 徹郎、竹澤 大輔、坂田 洋一、河内 孝之、石崎 公庸
  • 学会等名: 第59回日本植物生理学会年会
• [学会発表] ゼニゴケ無性芽形成初期を制御するRopシグナル伝達経路の機能解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 樋渡琢真, Koh Li Quan, 深城英弘, 三村徹郎, 河内孝之, 浦野大輔, 石崎公庸
  • 学会等名: 第59回日本植物生理学会年会
• [学会発表] Evolution of root nodule symbiosis in legumes (2017)
  • 著者名/発表者名: Makoto Hayashi
  • 学会等名: Taiwan-Japan Plant Biology 2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 根粒共生特異的転写因子NINの下流で作用する側根形成関連因子 (2017)
  • 著者名/発表者名: 征矢野敬、林誠、川口正代司
  • 学会等名: 植物微生物研究会第27回研究交流会
• [学会発表] カルモジュリン結合転写因子による根粒形成の制御 (2017)
  • 著者名/発表者名: 山﨑明広、宮原章、永江美和、梅原洋佐、林誠
  • 学会等名: 植物微生物研究会第27回研究交流会
• [学会発表] 遺伝子共発現ネットワーク構造解析による共生窒素固定に重要な遺伝子の探索 (2017)
  • 著者名/発表者名: 箱山雅生、下田宜司、林誠
  • 学会等名: 植物微生物研究会第27回研究交流会
• [学会発表] Molecular genetics of the gametophytic body plan in a basal land plant Marchantia polymorpha (2017)
  • 著者名/発表者名: Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: editBio Mexico 2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ゼニゴケ無性芽発生を制御するKAR/RopGEFの生化学的解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 樋渡琢真, Koh Li Quan, 深城英弘, 三村徹郎, 河内孝之, 浦野大輔, 石崎公庸
  • 学会等名: 日本植物学会第81回大会
• [学会発表] Functional characterization of MpbHLH40 in gemma dormancy of a liverwort Marchantia polymorpha (2017)
  • 著者名/発表者名: Mikako Yoshikawa, Shigeyuki Tsukamoto, Hidehiro Fukaki, Tetsuro Mimura, Daisuke Takezawa, Yohichi Sakata, Kohchi Takayuki, Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: Taiwan-Japan Plant Biology 2017
  • 国際学会
• [学会発表] Molecular mechanism of vegetative reproduction in the liverwort Marchantia polymorpha (2017)
  • 著者名/発表者名: Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: Taiwan-Japan Plant Biology 2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] KARAPPO encoding RopGEF is critical for the gemma development in the liverwort Marchantia polymorpha (2017)
  • 著者名/発表者名: Takuma Hiwatashi, Koh Li Quan, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Shinichiro Sawa, Hiroyuki Kirita, Hidehiro Fukaki, Tetsuro Mimura, Takayuki Kohchi, Daisuke Urano, Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: Taiwan-Japan Plant Biology 2017
  • 国際学会
• [学会発表] Gemma and Gemma Cup Development in Marchantia polymorpha (2017)
  • 著者名/発表者名: Kimitsune Ishizaki
  • 学会等名: 65th NIBB Conference ~Marchantia Workshop 2017~
  • 国際学会 / 招待講演