ミトコンドリア・色素体以外の共生オルガネラ成立過程の解明

• 研究領域: マトリョーシカ型進化原理
• 研究課題/領域番号: 23117006
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 稲垣 祐司 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (50387958)
• 研究分担者: 小保方 潤一 京都府立大学, 大学院生命環境科学研究科, 教授 (50185667) ; 神川 龍馬 京都大学, 大学地球環境学堂, 助教 (40627634)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 112,580千円 (直接経費: 86,600千円、間接経費: 25,980千円); 2015年度: 21,320千円 (直接経費: 16,400千円、間接経費: 4,920千円); 2014年度: 21,320千円 (直接経費: 16,400千円、間接経費: 4,920千円); 2013年度: 22,490千円 (直接経費: 17,300千円、間接経費: 5,190千円); 2012年度: 22,230千円 (直接経費: 17,100千円、間接経費: 5,130千円); 2011年度: 25,220千円 (直接経費: 19,400千円、間接経費: 5,820千円)
• キーワード: オルガネラ進化 / ゲノム進化 / 共生 / 光合成 / 窒素固定

研究成果の概要

ロパロディア科珪藻細胞内にはシアノバクテリア共生体（楕円体）が存在する。我々は楕円体が宿主内でどう制御されているかの解明を目指した。楕円体ゲノムの解読と珪藻核からの遺伝子転写物を網羅的に解析し、珪藻による楕円体の維持・制御の一端を解明した。また楕円体の直近の起源となった自由生活性シアノバクテリアを探索した。
有殻アメーバ・ポーリネラの細胞内にはシアノバクテリアに由来する光合成オルガネラ（シアネレ）をもつ。シアネレ獲得にともなう宿主核ゲノム進化を解明するためMYN-1株について、ゲノム解析、遺伝子転写物の網羅的解析、転写開始点解析等を実施し、核ゲノムの概要を把握することに成功した。

研究成果

• [国際共同研究] Dalhousie University/University of British Columbia(Canada)
• [国際共同研究] Charles University in Prague(チェコ)
• [国際共同研究] Dalhousie University(Canada)
• [雑誌論文] Ungulate malaria parasites (2016)
  • 著者名/発表者名: Templeton TJ, Asada M, Jiratanh M, Ishikawa SA, Tiawsirisup S, Sivakumar T, Namangala B, Takeda M, Mohkaew K, Ngamjituea S, Inoue N, Sugimoto C, Inagaki Y, Suzuki Y, Yokoyama N, Kaewthamasorn M, Kaneko O
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 6 号: 1 ページ: 23230-23230
  • DOI: 10.1038/srep23230
  • NAID: 120007135596
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Group II intron-mediated trans-splicing in the gene-rich mitochondrial genome of an enigmatic eukaryote, Diphylleia rotans. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Shiratori T, Ishida K, Miyashita H, Roger AJ.
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 8 号: 2 ページ: 458-466
  • DOI: 10.1093/gbe/evw011
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 共生体由来オルガネラにまつわるエトセトラ (2016)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司
  • 雑誌名: 生物の科学 遺伝 巻: 70 ページ: 156-160
• [雑誌論文] シアノバクテリアと真核藻類の細胞統合―「窒素固定オルガネラ」へ続く道？ (2016)
  • 著者名/発表者名: 中山卓郎，稲垣祐司
  • 雑誌名: 生物の科学 遺伝 巻: 70 ページ: 176-180
• [雑誌論文] 光合成能力を失った種と葉緑体の進化・多様性 (2016)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬
  • 雑誌名: 生物の科学 遺伝 巻: 70 ページ: 115-120
• [雑誌論文] Multiple losses of photosynthesis in Nitzschia (Bachillariophyceae) (2015)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Yubuki N, Yoshida M, Taira M, Ishida K, Leander BS, Miyashita H, Hashimoto T, Mayama S, Inagaki Y
  • 雑誌名: Phycological Research 巻: 63 号: 1 ページ: 18-28
  • DOI: 10.1111/pre.12072
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Plastid genome-based phylogeny pinpointed the origin of the green-colored plastid in the dinoflagellate Lepidodinium chlorophorum (2015)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Tanifuji G, Kawachi M, Miyashita H, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 7 ページ: 1133-1140
  • NAID: 120007130154
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Morphological identities of two different marine stramenopile environmental sequence clades: Bicosoeca kenaiensis (Hilliard 1971) and Cantina marsupialis (Larsen and Patterson, 1990) gen. nov., comb. nov. (2015)
  • 著者名/発表者名: Naoji Yubuki, Tomas Panek, Akinori Yabuki, Ivan Cepicka, Kiyotaka Takishita, Yuji Inagaki, Brian S. Leander
  • 雑誌名: Journal of Eukaryotic Microbiology 巻: 62 号: 4 ページ: 532-542
  • DOI: 10.1111/jeu.12207
  • 査読あり
• [雑誌論文] The mitochondria genomes of Kudoa species are extremely diverged among Metazoa (2015)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi F, Sekizuka T, Ogasawara Y, Yokoyama H, Kamikawa R, Inagaki Y, Nozaki T, Sugita-Konish Y, Ohnishi T, Kuroda M
  • 雑誌名: PLOS One 巻: 10
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Multiple conversion between the genes encoding bacterial class-I release factors. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa SA, Kamikawa R, Inagaki Y.
  • 雑誌名: Scientific Resports 巻: 5 号: 1 ページ: 12406-12406
  • DOI: 10.1038/srep12406
  • NAID: 120005822775
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Proposal of a Twin Arginine Translocator system-mediated constraint against loss of ATP synthase genes from nonphotosynthetic plastid genomes (2015)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Tanifuji G, Ishikawa SA, Ishii K, Matsuno Y, Onodera NT, Ishida K, Hashimoto T, Miyashita H, Mayama S, Inagaki Y.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 巻: 32 号: 10 ページ: 2598-2604
  • DOI: 10.1093/molbev/msv134
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Metabolic capacity of mitochondrion-related organelles in the free-living anaerobic stramenopile Cantina marsupialis (2015)
  • 著者名/発表者名: Fumiya Noguchi, Shigeru Shimamura, Takuro Nakayama, Euki Yazaki, Akinori Yabuki, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki, Katsunori Fujikura, Kiyotaka Takishita
  • 雑誌名: Protist 巻: 166 号: 5 ページ: 534-550
  • DOI: 10.1016/j.protis.2015.08.002
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] High REDOX RESPONSIVE TRANSCRIPTION FACTOR1 levels result in accumulation of reactive oxygen species in Arabidopsis thaliana shoots and roots (2015)
  • 著者名/発表者名: Matsuo M, Johnson JM, Hieno A, Tokizawa M, Nomoto M, Tada Y, Godfry R, Obokata J, Sheramati I, Yamamoto YY, Bohmer FD, Oelmuller R
  • 雑誌名: Molecular Plant 巻: 8 ページ: 1253-1273
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Palpitomonas bilix presents a basal cryptist lineage : insight into the char acter evolution in Cryptista (2014)
  • 著者名/発表者名: Yabuki A, Kamikawa R, Sohta A. Ishikawa, Kolisko M, Kim E, Tanabe AS, Kume K, Ishida K, Inagaki Y
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 第4巻 号: 1 ページ: 1-6
  • DOI: 10.1038/srep04641
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] An intronic open reading frame was released from one of group II introns in the mitochondrial genome of the haptophyte Chrysochromulina sp. NIES-1333. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y, Kamikawa R, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: Mobile Genetic Elements 巻: 4 号: 3 ページ: e29384-e29384
  • DOI: 10.4161/mge.29384
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Secondary loss of a cis-spliced intron during the divergence of Giardia intestinalis assemblages (2014)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki and Tetsuo Hashimoto
  • 雑誌名: BMC Research Notes 巻: 7 号: 1 ページ: 413-413
  • DOI: 10.1186/1756-0500-7-413
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complete genome of a nonphotosynthetic cyanobacterium in a diatom reveals recent adaptations to an intracellular lifestyle (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakayama T, Kamikawa R, Tanifuji G, Kashiyama Y, Ohkouchi N, Archibald JM, Inagaki Y
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 巻: 111 号: 31 ページ: 11407-11412
  • DOI: 10.1073/pnas.1405222111
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Unique genome evolution in an intracellular N2-fixing symbiont of a rhopalodiacean diatom (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakayama T, Inagaki Y
  • 雑誌名: Acta Societatis Botanicorum Poloniae 巻: 83 号: 4 ページ: 409-413
  • DOI: 10.5586/asbp.2014.046
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Gene-content evolution in discobid mitochondria deduced from the phylogenetic position and complete mitochondrial genome of Tsukubamonas globosa. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Kolisko M, Nishimura Y, Yabuki A, rown MW, Sohta A. Ishikawa, Ishida K, Roger AJ, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 第6巻2号 号: 2 ページ: 306-315
  • DOI: 10.1093/gbe/evu015
  • 査読あり
• [雑誌論文] ppdb: Plant Promoter Database ver. 3.0 (2014)
  • 著者名/発表者名: Hieno A, Naznin A, Hyakumachi M, Sakurai T, Tokizawa M, Koyama H, Sato N, Nishiyama T, Hasebe H, Zimmer AD, Lang D, Resk R, Rensing S, Obokata J, Yamamoto YY
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 42 号: D1 ページ: D1188-D1192
  • DOI: 10.1093/nar/gkt1027
  • 査読あり
• [雑誌論文] Parallel re-modeling of EF-la function in eukaryotic evolution : Divergent, low-expressed EF-1α genes co-occur with EFL genes in diverse distantly related eukaryotes. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Brown MW, Nishimura Y, Sako Y, Heiss AA, Yubuki N, Gawryluk R, Simpson AGB, Roger AJ, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: BMC Evolutionary Biology 巻: 13 号: 1 ページ: 131-131
  • DOI: 10.1186/1471-2148-13-131
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of a bacteria-like ferrochelatase gene in Strongyloides venezuelensis, an animal parasitic nematode. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nagayasu E, Ishikawa S, Taketani S, Ooka T, Chakraborty G, Yoshida A, Inagaki Y, Hayashi T, Maruyama H.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 8 号: 3 ページ: 1-11
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0058458
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ardenticatena maritima gen. nov., sp. nov., a ferric iron- and nitrate-reducing bacterium of the phylum Chloroflexi isolated from an iron-rich coastal hydrothermal field, and description of Ardenticateniaclassis nov. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kawaichi,S., Ito,N., Kamikawa,R., Sugawara,T., Yoshida,T. and Sako,Y.
  • 雑誌名: Int. J. Syst. Evol. Microbiol 巻: 63 号: Pt_8 ページ: 1-1
  • DOI: 10.1099/ijs.0.046532-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pentatricopeptide repeat proteins involved in plant organellar RNA editing. (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Yagi., M. Tachikawa., H. Noguchi., S. Satoh., J. Obokata., T. Nakamura
  • 雑誌名: RNA biology 巻: 10 号: 9 ページ: 1419-1425
  • DOI: 10.4161/rna.24908
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multigene phylogenies of diverse Carpediemonas-like organisms identify the closest relatives of 'amitochndriate' diplomonads and retortamonads (2012)
  • 著者名/発表者名: Takishita K, Kolisko M, Komatsuzaki H, Yabuki A, Inagaki Y, Cepicka I, Smejkalova P, Silberman JD, Hashimoto T, Roger AJ, Simpson AGB.
  • 雑誌名: Protist 巻: 163 号: 3 ページ: 344-355
  • DOI: 10.1016/j.protis.2011.12.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Separate origins of group I introns in two mitochondrial genes of the katablepharid Leucocryptos marina. (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y, Kamikawa R, Hashimoto T, Inagaki Y.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7 号: 5 ページ: e37307-e37307
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0037307
  • 査読あり
• [雑誌論文] RY-coding and non-homogeneous models ameliorate the maximum-likelihood inferences from nucleotide sequence data with parallel compositional heterogeneity. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa SA, Inagaki Y, Hashimoto T.
  • 雑誌名: Evolutionary Bioinformatics 巻: 8 ページ: 357-371
  • DOI: 10.4137/ebo.s9017
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolution of elongation factor-like (EFL) protein in Rhizaria is revised by radiolarian EFL gene Sequences. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishitani Y., Kamikawa R., Yabuki A., Tsutiya M., Inagaki Y. Takihita K.
  • 雑誌名: Journal of Eukaryotic Microbiology 巻: 59 号: 4 ページ: 367-373
  • DOI: 10.1111/j.1550-7408.2012.00626.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prasinoxanthin is absent in the green-colored dinoflagellate Lepidodinium chlorophorum strain NIES-1868 : pigment composition and 18S rRNA phylogeny (2012)
  • 著者名/発表者名: Takuya Matsumoto, Masanobu Kawachi, Hideaki Miyashita, Yuji Inagaki
  • 雑誌名: Journal of Plant Research 巻: (印刷中) 号: 6 ページ: 705-711
  • DOI: 10.1007/s10265-012-0486-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characteristics of core promoter types with respect to gene structure and expression in Arabidopsis thaliana (2012)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto YY., Yoshioka Y., Hyakumachi M., Obokata J.
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 18 号: 5 ページ: 3634-35636
  • DOI: 10.1093/dnares/dsr020
  • 査読あり
• [雑誌論文] Green-colored plastids in the dinoflagellate genus Lepidodinium are of core chlorophyte origin. (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto T, 他5名, Nakayama T, Inouye I, HashimotoT & Inagaki Y.
  • 雑誌名: Protist 巻: 162 号: 2 ページ: 268-276
  • DOI: 10.1016/j.protis.2010.07.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tsukubamonas globosa n.gen., n.sp., a novel excavate flagellate possibily holding a key for the early evolution in "Discoba" (2011)
  • 著者名/発表者名: Yabuki A., Nakayama N., Yubuki N., Hashimoto T., Ishida K., Inagaki Y
  • 雑誌名: Journal of Eukaryotic Microbiology 巻: 58 号: 4 ページ: 319-331
  • DOI: 10.1111/j.1550-7408.2011.00552.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] A deviant genetic code in the green alga-derived plastid in the dinoflagellate Lepidodinium chlorophorum (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto T, Ishikawa SA, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: Molecular Phylogenetics and Evolution 巻: 60 号: 1 ページ: 68-72
  • DOI: 10.1016/j.ympev.2011.04.010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multigene phylogenetic analyses including diverse radiolarian species support the "Retaria" hypothesis-the sister relationship of Radiolaria and foraminifera (2011)
  • 著者名/発表者名: Ishitani, Y.
  • 雑誌名: Marine Micropaleontology 巻: 81 号: 1-2 ページ: 32-42
  • DOI: 10.1016/j.marmicro.2011.06.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel spliceosome-mediated trans-splicing can change our view on genome complexity of the divergent eukaryote Giardia intestinalis (2011)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa, Inagaki Y, Hashimoto T
  • 雑誌名: Biophysical Reviews 巻: 3 号: 4 ページ: 193-197
  • DOI: 10.1007/s12551-011-0058-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Splintrons in Giardia intestinalis : Spliceosomal introns in a split form (2011)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Inagaki Y, Roger AJ, Hashimoto T
  • 雑誌名: Communicative & Integrative Biology 巻: 4 ページ: 1-3
• [学会発表] フォルニカータ生物群の基部から分岐する新奇嫌気性生物PAP020株のミトコンドリア様オルガネラの代謝機能の推測 (2016)
  • 著者名/発表者名: 矢崎裕規，白鳥峻志，久米慶太郎，橋本哲男，石田健一郎，稲垣 祐司
  • 学会等名: 第85回日本寄生虫学会
  • 発表場所: 宮崎市民プラザ（宮崎県宮崎市）
  • 年月日: 2016-03-19
• [学会発表] 非光合成性珪藻類葉緑体における機能 (2016)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬，Stefan Zauner，Uwe Maier，Daniel Moog，John M Archibald，Andrew J Roger，真山茂樹，石田健一郎，宮下英明，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本藻類学会第40回大会
  • 発表場所: 日本歯科大学生命歯科部（東京都千代田区）
  • 年月日: 2016-03-19
• [学会発表] Rhopalodia科珪藻細胞内共生体の比較ゲノム解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 中山卓郎，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本藻類学会第40回大会
  • 発表場所: 日本歯科大学生命歯科部（東京都千代田区）
  • 年月日: 2016-03-19
• [学会発表] 葉緑体を置換した渦鞭毛藻の葉緑体関連代謝系におけるEGTの傾向 (2016)
  • 著者名/発表者名: 松尾恵梨子，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本藻類学会第40回大会
  • 発表場所: 日本歯科大学生命歯科部（東京都千代田区）
  • 年月日: 2016-03-19
• [学会発表] 新奇ケルコゾア生物Brevimastigomonas sp. KY003株の持つ新たなミトコンドリア様オルガネラ (2015)
  • 著者名/発表者名: 松野佑成，石井健一郎，宮下英明，神川龍馬
  • 学会等名: 第30回日本微生物生態学会
  • 発表場所: 土浦亀城プラザ（茨城県土浦市）
  • 年月日: 2015-10-17
• [学会発表] Green alga-derived nucleomorphs in dinoflagellate cells (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuji Inagaki
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-09-30
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] The dynamics of mitochondrial metabolism in a cercozoan capable of growth in aerobic and low-oxygen conditions (2015)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-09-30
  • 国際学会
• [学会発表] Phylogenetic analysis of a myxozoan genus Kudoa mitochondrial genomes, and the modulation of host innate immunity by Kudoa infection (2015)
  • 著者名/発表者名: Fumihiko Takeuchi, Tsuyoshi Sekizuka, Yumiko Ogasawara, Hiroshi Yokoyama, Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki, Tomoyoshi Nozaki, Yoshiko Sugita-Konishi, Takahiro Ohnishi, Makoto Kuroda
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-09-30
  • 国際学会
• [学会発表] Convergent evolution of carbon metabolisms after loss of photosynthesis (2015)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-09-30
  • 国際学会
• [学会発表] Plastid genome reduction in two separate dinoflagellate lineages bearing pedinophyte-derived plastids (2015)
  • 著者名/発表者名: Kounosuke Morita, Goro Tanifuji, Takuro Nakayama, Ryoma Kamikawa, Chihiro Sarai, Kazuya Takahashi, Mitsunori Iwataki, Yuji Inagaki
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-09-30
  • 国際学会
• [学会発表] Prediction and comparison of the metabolism of mitochondrion-related organelles in free-living fornicate organisms (2015)
  • 著者名/発表者名: Keitaro Kume, Shun Takabayashi, Ryoma Kamikawa, Goro Tanifuji, Yuji Inagaki, Tetsuo Hashimoto
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-09-30
  • 国際学会
• [学会発表] Impact of endosymbiotic gene transfer on plastid metabolic pathways in dinoflagellates with haptophyte-derived plastids (2015)
  • 著者名/発表者名: Eriko Matsuo, Yuki Nishimura, Yuji Inagaki
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-09-30
  • 国際学会
• [学会発表] フォルニカータ＋パラバサリア生物群内でのミトコンドリア縮退進化 (2015)
  • 著者名/発表者名: 髙林舜，久米慶太郎，神川龍馬，谷藤吾朗，稲垣祐司，橋本哲男
  • 学会等名: 第75回日本寄生虫学会東日本支部大会
  • 発表場所: 順天堂大学（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-09-26
• [学会発表] Rhopalodia科珪藻における細胞内共生シアノバクテリアのゲノム縮小進化 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中山卓郎，神川龍馬，谷藤吾朗，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本植物学会第79回大会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ・新潟コンベンションセンター（新潟県新潟市）
  • 年月日: 2015-09-06
• [学会発表] Comparative genome analysis of pedinophyte plastids and the pedinophyte-derived plastids in two dinoflagellates Lepidodinium chlorophorum and strain MRD-151 (2015)
  • 著者名/発表者名: Kounosuke Morita, Goro Tanifuji, Takuro Nakayama, Ryoma Kamikawa, Chihiro Sarai, Kazuya Takahashi, Mitsunori Iwataki, Yuji Inagaki
  • 学会等名: VII ECOP-ISOP Joint Meeting 2015
  • 発表場所: Hotel-Conterence Center Sylken Al-Andalus Palace & the "Reina Mercedes" Scientific Campus of the University of Seville, Seville, Spain
  • 年月日: 2015-09-05
  • 国際学会
• [学会発表] Strain PAP020, a novel anaerobic microeukaryote branching at the base of Fornicata (2015)
  • 著者名/発表者名: Euki Yazaki，Takashi Shiratori，Keitaro Kume，Tetsuo Hashimoto，Ken-Ichiro Ishida，Yuji Inagaki
  • 学会等名: VII ECOP-ISOP Joint Meeting 2015
  • 発表場所: Hotel-Conterence Center Sylken Al-Andalus Palace & the "Reina Mercedes" Scientific Campus of the University of Seville, Seville, Spain
  • 年月日: 2015-09-05
  • 国際学会
• [学会発表] The dynamics of mitochondrial metabolism .in a cercozoan capable of growth in aerobic and low-oxygen conditions (2015)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa
  • 学会等名: VII ECOP-ISOP Joint Meeting 2015
  • 発表場所: Hotel-Conterence Center Sylken Al-Andalus Palace & the "Reina Mercedes" Scientific Campus of the University of Seville, Seville, Spain
  • 年月日: 2015-09-05
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ヌクレオモルフをもつ2種の未記載渦鞭毛藻：「真核－真核型」細胞内共生を介した葉緑体成立過程を解き明かす新たなモデルとして (2015)
  • 著者名/発表者名: 皿井千裕，谷藤吾朗，中山卓郎，神川龍馬，高橋和也，石田健一郎，岩滝光儀，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本進化学会第17回大会
  • 発表場所: 中央大学後楽園キャンパス（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-08-20
  • 招待講演
• [学会発表] トランスクリプトームデータを基盤とした大規模分子系統解析による新奇嫌気性真核微生物PAP020株の系統的位置の解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢﨑裕規，白鳥隆志，久米慶太郎，橋本 哲男，石田健一郎，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本進化学会第17回大会
  • 発表場所: 中央大学後楽園キャンパス（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-08-20
• [学会発表] Is a microaerophilic flagellate strain PAP020 is the most basal member of the Fornicata? (2015)
  • 著者名/発表者名: Euki Yazaki, Takashi Shiratori, Keitaro Kume, Sohta Ishikawa, Ken-Ichiro Ishida, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki
  • 学会等名: Integrated Microbial Biodiversity Program meeting, Canadian Institute for Advanced Research
  • 発表場所: Westin Moutain Bear Resort, Victoria, Canada
  • 年月日: 2015-05-27
  • 国際学会
• [学会発表] Two cercozoans from low-oxygen environments reveal the early stages of mitochondrial adaptation to anaerobiosis (2015)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa
  • 学会等名: Integrated Microbial Biodiversity Program meeting, Canadian Institute for Advanced Research
  • 発表場所: Westin Moutain Bear Resort, Victoria, Canada
  • 年月日: 2015-05-27
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Metobolic capacity of mitochondrion-derived organelles in the free-living anaerobic stramenopile Cantina marsupialis (2015)
  • 著者名/発表者名: Fumiya Noguchi, Shigeru Shimamura, Takuro Nakayama, Yuki Yazaki, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki, Katsunori Fujikura, Kiyotaka Takishita
  • 学会等名: Society of General Microbiology，Annual Conference 2015
  • 発表場所: The International Convention Centre, Birmingham, UK
  • 年月日: 2015-03-30
  • 国際学会
• [学会発表] 失われた中央代謝系ハブ酵素の発掘―「新規」PEP carboxykinaseの同定とその生物間分布 (2015)
  • 著者名/発表者名: 千葉洋子，神川龍馬，野崎 智義
  • 学会等名: 日本農芸化学会2015年岡山大会
  • 発表場所: 岡山大学津島キャンパス（岡山県岡山市）
  • 年月日: 2015-03-26
• [学会発表] フォルニカータ生物Kipferlia bialataの二者培養系の確立とゲノム・トランスクリプトーム解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 髙林舜，谷藤吾朗，久米慶太郎，稲垣祐司，橋本哲男
  • 学会等名: 第84回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 杏林大学三鷹キャンパス（東京都三鷹市）
  • 年月日: 2015-03-21
• [学会発表] 赤痢アメーバ原虫における新規PEP carboxykinaseの同定と性状解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 千葉洋子，神川龍馬，津久井久美子，中野由美子，野崎 智義
  • 学会等名: 第84回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 杏林大学三鷹キャンパス（東京都三鷹市）
  • 年月日: 2015-03-21
• [学会発表] 新奇緑色渦鞭毛藻鶴岡株・室蘭株の葉緑体ゲノム比較解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 森田幸之介，谷藤吾朗，中山卓郎，神川龍馬，皿井千裕，高橋和也，岩滝光儀，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本藻類学会第39回大会
  • 発表場所: 九州大学箱崎キャンパス（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2015-03-20
• [学会発表] 日本沿岸域における珪藻類Chaetoceros属の形態及び分子系統解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 石井健一郎，神川龍馬，山口峰生，山口晴生，石川輝，今井一郎，宮下英明
  • 学会等名: 日本藻類学会第39回大会
  • 発表場所: 九州大学箱崎キャンパス（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2015-03-20
• [学会発表] 山形県鶴岡産緑色渦鞭毛藻TRD132株の細胞内微細構造 (2015)
  • 著者名/発表者名: 皿井千裕，高橋和也，谷藤吾朗，中山卓郎，神川龍馬，稲垣祐司，石田健一郎，岩滝光儀
  • 学会等名: 日本藻類学会第39回大会
  • 発表場所: 九州大学箱崎キャンパス（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2015-03-20
• [学会発表] 新奇緑色渦鞭毛藻類における緑藻遺伝子の網羅的探索 ― 新たなヌクレオモルフゲノムへの示唆 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中山卓郎，谷藤吾朗，神川龍馬，皿井千裕，松尾恵梨子，高橋和也，岩滝光儀，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本藻類学会第39回大会
  • 発表場所: 九州大学箱崎キャンパス（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2015-03-20
• [学会発表] 嫌気性ストラメノパイル生物Cantina marsupialisが有するミトコンドリア関連オルガネラの代謝能推定 (2015)
  • 著者名/発表者名: 野口文哉，島村繁，中山卓郎，矢崎裕規，橋本哲男，稲垣祐司，藤倉克則，瀧下清貴
  • 学会等名: 日本藻類学会第39回大会
  • 発表場所: 九州大学箱崎キャンパス（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2015-03-20
• [学会発表] 57遺伝子系統解析により解明されたキネトプラスチダ類における寄生性形質獲得プロセス (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢崎裕規，石川奏太，久米慶太郎，谷藤吾朗，釜石隆，橋本哲男，稲垣祐司
  • 学会等名: 第84回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 杏林大学三鷹キャンパス（東京都三鷹市）
  • 年月日: 2015-02-21
• [学会発表] The plastid genome in a nonphotosynthetic diatom (2015)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa
  • 学会等名: CGEB meeting
  • 発表場所: Dalhousie University, Halifax, Canada
  • 年月日: 2015-02-12
  • 国際学会
• [学会発表] 海産珪藻類が形成する休眠期細胞の分類 (2015)
  • 著者名/発表者名: 石井健一郎，神川龍馬，宮下英明
  • 学会等名: 第14回 日本分類学会連合 総会・公開シンポジウム
  • 発表場所: 国立科学博物館 上野本館（東京都台東区）
  • 年月日: 2015-01-10
  • 招待講演
• [学会発表] 珪藻類休眠期細胞研究の現状と分子研究への応用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 石井健一郎，神川龍馬，宮下英明
  • 学会等名: 第１回分子珪藻研究集会
  • 発表場所: 関西学院大学（兵庫県西宮市）
  • 年月日: 2014-12-15
• [学会発表] 有殻アメーバPaulinella chromatophoraのゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松尾充啓，潟端篤，水口洋平，野口英樹，豊田敦，藤山秋佐夫，鈴木穣，佐藤壮一郎，松崎素道，中山卓郎，神川龍馬，野村真未，壁谷如洋，宮城島進也，稲垣 祐司，石田健一郎，小保方潤一
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] 有殻アメーバPaulinella chromatophoraのトランスクリプトーム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 潟端篤，松尾充啓，鈴木穣，水口洋平，野口英樹，豊田敦，藤山秋佐夫，佐藤壮一郎，松崎素道，中山卓郎，神川龍馬，野村真未，壁谷如洋，宮城島進也，稲垣 祐司，石田健一郎，小保方潤一
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] 珪藻類休眠期細胞研究の現状と展望 (2014)
  • 著者名/発表者名: 石井健一郎，大塚泰介，神川龍馬，石川 輝，今井一郎，宮下英明
  • 学会等名: 日本珪藻学会第 34 回研究集会
  • 発表場所: 滋賀県立琵琶湖博物館（滋賀県草津市）
  • 年月日: 2014-11-08
• [学会発表] 珪藻細胞内の非光合成性シアノバクテリア共生体の起源と進化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司
  • 学会等名: 環境微生物系学会合同大会2014 サテライト研究集会「植物を住処とする微生物の生態」
  • 発表場所: ホテルクラウンパレス浜松（静岡県浜松市）
  • 年月日: 2014-10-25
  • 招待講演
• [学会発表] Chlorophyll-based adaptation of cyanobacterial photosynthesis to niche light quality (2014)
  • 著者名/発表者名: Hideaki Miyashita, Satoshi Ohkubo, Shogo Matsumoto, Ryoma Kamikawa, Masami Kobayashi
  • 学会等名: Humboldt Kolleg & The International Conference on Natural Science 2014
  • 発表場所: Jambuluwuk Resort, Batu, Indonesia
  • 年月日: 2014-09-25
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 新たな細胞内共生体獲得に伴うゲノムの進化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司
  • 学会等名: 日本遺伝学会第86回大会
  • 発表場所: 長浜バイオ大学（滋賀県長浜市）
  • 年月日: 2014-09-17
  • 招待講演
• [学会発表] 大規模配列データで解明される新奇真核微生物系統とそのオルガネラゲノム (2014)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司，西村祐貴，神川龍馬，谷藤吾朗，中山卓郎，橋本哲男
  • 学会等名: 日本植物学会第78回大会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス（神奈川県川崎市）
  • 年月日: 2014-09-12
  • 招待講演
• [学会発表] 新奇緑色渦鞭毛藻共生体の微細構造観察：とくに共生体核に注目して (2014)
  • 著者名/発表者名: 皿井千裕，谷藤吾朗，森田幸之助，中山卓郎，高橋和也，岩滝光儀，石田健一郎，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本植物学会第78回大会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス（神奈川県川崎市）
  • 年月日: 2014-09-12
• [学会発表] 伊勢湾海底泥中における珪藻類Chaeotoceros属休眠胞子の形態及び分子系統解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 石井健一郎，神川龍馬，石川輝，今井一郎，宮下英明
  • 学会等名: 2014年度日本プランクトン学会・日本ベントス学会合同大会
  • 発表場所: 広島大学（広島県東広島市）
  • 年月日: 2014-09-04
• [学会発表] キネトプラスチダ類における寄生性鞭毛虫の系統的位置と寄生性形質獲得プロセスの解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 矢﨑裕規，石川奏太，久米慶太郎，谷藤吾朗，釜石隆，橋本哲男，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本進化学会第16回大会
  • 発表場所: 高槻現代劇場（大阪府高槻市）
  • 年月日: 2014-08-21
• [学会発表] 渦鞭毛藻の葉緑体置換に伴うクロロフィルa生合成系遺伝子の進化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松尾恵梨子，高橋和也，中山卓郎，谷藤吾朗，岩滝光儀，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本進化学会第16回大会
  • 発表場所: 高槻現代劇場（大阪府高槻市）
  • 年月日: 2014-08-21
• [学会発表] 真核微生物Palpitomonas bilixにおけるミトコンドリアゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴，神川龍馬，谷藤吾朗，橋本哲男，稲垣祐司
  • 学会等名: 日本進化学会第16回大会
  • 発表場所: 高槻現代劇場（大阪府高槻市）
  • 年月日: 2014-08-21
• [学会発表] 寄生性アメーバに細胞内共生するキネトプラスチダ類のゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 谷藤吾朗，Bruce A Curtis，中山卓郎，稲垣祐司，橋本哲男，Julius Lukes，John M Archibald
  • 学会等名: 日本進化学会第16回大会
  • 発表場所: 高槻現代劇場（大阪府高槻市）
  • 年月日: 2014-08-21
• [学会発表] Paulinella chromatophora retains two evolutionarily distinct pathways for tetraphyrrole biosynthesis (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuki Nishimura, Mami Nomura, Takuro Nakayama, Ken-ichiro Ishida, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki
  • 学会等名: Protist 2014
  • 発表場所: Banff Center, Banff, Canada
  • 年月日: 2014-08-03
  • 国際学会
• [学会発表] Mitochondrial genome of Palpitomonas bilix: unique genome structure and ancestral characteristics in gene content (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuki Nishimura, Ryoma Kamikawa, Goro Tanifuji, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki
  • 学会等名: Protist 2014
  • 発表場所: Banff Center, Banff, Canada
  • 年月日: 2014-08-03
  • 国際学会
• [学会発表] Complex evolution of plastid GAPDHs in the dinoflagellate species with green alga-derived plastids. (2014)
  • 著者名/発表者名: Eriko Matsuo, Takuro Nakayama, Ryoma Kamikawa, Goro Tanifuji, Chihiro Sarai, Kazuya Takahashi, Mitsunori iwataki, Yuji Inagaki
  • 学会等名: Protist 201
  • 発表場所: Banff Center, Banff, Canada
  • 年月日: 2014-08-03
  • 国際学会
• [学会発表] "Green genes" in novel green colored dinoflagellates: signs of the nucleomorph genomes (2014)
  • 著者名/発表者名: Takuro Nakayama, Goro Tanifuji, Ryoma Kamikawa, Eriko Matsuo, Chihiro Sarai, Kazuya Takahashi, Ken-ichiro Ishida, Mitsunori Iwataki, Yuji Inagaki
  • 学会等名: Protist 201
  • 発表場所: Banff Center, Banff, Canada
  • 年月日: 2014-08-03
  • 国際学会
• [学会発表] The discovery of novel nucleomorph-bearing algae (2014)
  • 著者名/発表者名: Goro Tanifuji, Chihiro Sarai, Ryoma Kamikawa, Kazuya Takahashi, Takuro Nakayama, Konosuke Morita, Tetsuo Hashimoto, Mitsunori Iwataki, Yuji Inagaki
  • 学会等名: Protist 201
  • 発表場所: Banff Center, Banff, Canada
  • 年月日: 2014-08-03
  • 国際学会
• [学会発表] A snap shot of the gene replacement after endosymbiotic gene transfer: plastid GAPDH genes in the dinoflagellete Karenia brevis as a case study (2014)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa, Eriko Matsuo, Euki Yazaki, Michiru Tahara, Takaya Sakura, Kisaburo Nagamune, Yuji Inagaki
  • 学会等名: Protist 201
  • 発表場所: Banff Center, Banff, Canada
  • 年月日: 2014-08-03
  • 国際学会
• [学会発表] Phylogenemic placement of the orphaned amorphean protists; ancyromonads, mantamonads, collodictyonids, and rigifilids (2014)
  • 著者名/発表者名: Matthew W Brown, Aaron A Heiss, Ryoma Kamikawa, Akinori Yabuki, Takashi Shiratori, Ken-ichiro Ishida, Yuji Inagaki, Alastair GB Simpson, Andrew J Roger
  • 学会等名: Protist 201
  • 発表場所: Banff Center, Banff, Canada
  • 年月日: 2014-08-03
  • 国際学会
• [学会発表] Cellular localization of evolutionarily distinctive 'plastid-targeted' GAPDHs in Karenia brevis and K. mikimotoi (2014)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Kamikawa, Eriko Matsuo, Euki Yazaki, Michiru Tahara, Takaya Sakura, Kisaburo Nagamune, Yuji Inagaki
  • 学会等名: Integrated Microbial Biodiversity Program meeting, Canadian Institute for Advanced Research
  • 発表場所: Liblice Castle, Liblice, Czech Republic
  • 年月日: 2014-06-25
  • 国際学会
• [学会発表] Green dinoflagellates: their origins and implications from transcriptome analyses (2014)
  • 著者名/発表者名: Takuro Nakayama, Yuji Inagaki
  • 学会等名: Integrated Microbial Biodiversity Program meeting, Canadian Institute for Advanced Research
  • 発表場所: Liblice Castle, Liblice, Czech Republic
  • 年月日: 2014-06-25
  • 国際学会
• [学会発表] Inter- or intra-genomic gene conversions between peptide-chain release factor paralogs in Bacteriodetes (2014)
  • 著者名/発表者名: Sohta Ishikawa, Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki
  • 学会等名: Evolution 2014
  • 発表場所: Raleigh Convention Center, North Carolina, USA
  • 年月日: 2014-06-20
  • 国際学会
• [学会発表] non-homogeneous置換モデルを搭載した系統解析プログラムのMPI/OpenMPハイブリッド並列化：大規模遺伝子配列データセットへの適用に向けて (2014)
  • 著者名/発表者名: 石川奏太、中尾昌広、稲垣祐司、橋本哲男、佐藤三久
  • 学会等名: HPC2014
  • 発表場所: 一橋大学(東京都国立市）
• [学会発表] 緑藻由来葉緑体をもつ渦鞭毛藻における葉緑体型gapdh遺伝子の進化． (2014)
  • 著者名/発表者名: 松尾恵梨子、中山卓郎、神川龍馬、谷藤吾朗、皿井千裕、高橋和也、岩滝光儀、稲垣祐司
  • 学会等名: 第38回日本藻類学会
  • 発表場所: 東邦大学習志野キャンパス（千葉県船橋市）
• [学会発表] Rhopalodia科珪藻における細胞内共生シアノバクテリアのゲノム縮小進化． (2014)
  • 著者名/発表者名: 中山卓郎、神川龍馬、谷藤吾朗、Archibald JM、稲垣祐司
  • 学会等名: 第38回日本藻類学会
  • 発表場所: 東邦大学習志野キャンパス（千葉県船橋市）
• [学会発表] フォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラ標的シグナルの分子進化． (2014)
  • 著者名/発表者名: 久米慶太郎、高林舜、森田幸之介、神川龍馬、稲垣祐司、橋本哲男
  • 学会等名: 第83回日本寄生虫学会
  • 発表場所: 愛媛大学（愛媛県松山市）
• [学会発表] In vitro RNA 編集におけるRNA 結合タンパク質の経時変化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 立川誠，長谷川綾香，八木祐介，高林厚史，種村尚典，溝田香織，諏佐瑞穂，野村明子，阪本康司，石浦正寛，若杉達也、中村崇裕，小保方潤一
  • 学会等名: 第55回日本植物生理学会
  • 発表場所: 富山大学五福キャンパス（富山県富山市）
• [学会発表] 有殻アメーバPaulinella chromatophoraにおけるシアネレから核に転移した遺伝子群の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松尾充啓、潟端篤、佐藤壮一郎、松崎素道、松本拓也、鶴岡愛、野村真未、壁谷如洋、中山卓郎、宮城島進也、石田健一郎、小保方潤一
  • 学会等名: 第55回日本植物生理学会
  • 発表場所: 富山大学五福キャンパス（富山県富山市）
• [学会発表] The enigmatic discobid Tsukubamonas globosa: phylogenomic analysis and mitochondrial genome sequence. (2013)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y
  • 学会等名: Integrated Microbial Biodiversity Program meeting, Canadian Institute for Advanced Research
  • 発表場所: Four Seasons Hotel，Whistler，Canada
• [学会発表] The genes encoding elongation factor 1α and elongation factor-like protein co-exist in distantly related eukaryotic genomes. (2013)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y
  • 学会等名: Integrated Microbial Biodiversity Program meeting, Canadian Institute for Advanced Research
  • 発表場所: Four Seasons Hotel，Whistler，Canada
• [学会発表] Pedinophytes are easy: Origin and diversity of green-colored plastids in dinoflagellates. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R
  • 学会等名: Integrated Microbial Biodiversity Program meeting, Canadian Institute for Advanced Research
  • 発表場所: Four Seasons Hotel，Whistler，Canada
  • 招待講演
• [学会発表] Efficient parallelization of the maximum-likelihood phylogenetic inference with the non-homogeneous substitution model. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa S, Inagaki Y, Hashimoto T, Sato M
  • 学会等名: Evolution 2013
  • 発表場所: Meeting and Conference Center，Snowbird，Utah，USA
• [学会発表] 新奇生物種の単離と大規模分子系統解析が解明（？）する真核生物の多様性と系統関係. (2013)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司
  • 学会等名: お茶の水大学大学院生命情報学副専攻公開セミナー・第39回バイオインフォマティックスへの招待
  • 発表場所: お茶の水女子大学（東京都文京区）
  • 招待講演
• [学会発表] 葉緑体のC-to-U RNA編集活性はRNaseによって失活する (2013)
  • 著者名/発表者名: 立川誠、長谷川綾香、高林厚史、種村尚典、溝田香織、諏佐瑞穂、野村明子、若杉達也、小保方潤一
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 県民文化会館・ひめぎんホール（愛媛県松山市）
• [学会発表] Reductive evolution of mitochondrion-related organelles in a monophyletic lineage (2013)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R
  • 学会等名: International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells
  • 発表場所: ホテル京都ガーデンパレス（京都市上京区）
  • 招待講演
• [学会発表] Morphologies and phylogenetic characteristics of two novel dinoflagellates with green-colored chloroplasts. (2013)
  • 著者名/発表者名: Sarai C, Takahasi K, Kamikawa R, Inagaki Y, Iwataki M
  • 学会等名: 10th International Congress of Phycology
  • 発表場所: Oland, Florida, USA
• [学会発表] An intron-rich mitochondrial cox1 gene of the katablepharid Roombia sp. NY0200. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y, Kamikawa R, Hirasawa T, Yubuki N, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 学会等名: International Congress of Protistology (ICOP) XIV
  • 発表場所: Westin Bayshore Hotel, Vancouver, Canada
• [学会発表] The genes encoding EF-1α and EFL genes co-exist in diverse distantly related eukaryotes. (2013)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y, Kamikawa R, Brown M, Nishimura Y, Sako Y, Heiss AA, Yubuki N, Gawryluk R, Simpson AGB, Roger AJ, Hashimoto T
  • 学会等名: International Congress of Protistology (ICOP) XIV
  • 発表場所: Westin Bayshore Hotel, Vancouver, Canada
• [学会発表] Pedinophyte-origin of the non-canonical plastids in the dinoflagellate genus Lepidodinium. (2013)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y, Kamikawa R, Matsumoto T
  • 学会等名: International Congress of Protistology (ICOP) XIV
  • 発表場所: Westin Bayshore Hotel, Vancouver, Canada
• [学会発表] Morphological identities of two MAST-13 (marine stramenopile) environmental sequence clades. (2013)
  • 著者名/発表者名: Yubuki N, Panek T, Yabuki A, Cepicka I, Takishita K, Inagaki Y, Leander BS
  • 学会等名: International Congress of Protistology (ICOP) XIV
  • 発表場所: Westin Bayshore Hotel, Vancouver, Canada
• [学会発表] Progress in placing newly discovered protist lineages in the deep tree of eukaryotes: Tskuubamonas globosa and Palpitomonas bilix. (2013)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y
  • 学会等名: International Congress of Protistology (ICOP) XIV
  • 発表場所: Westin Bayshore Hotel, Vancouver, Canada
  • 招待講演
• [学会発表] The origin of the Giardia mitosome demystified: comparative analyses of predicted organellar proteomes across free-living and parasitic metamonads. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kolisko M, Kamikawa R, Andersson JO, Hashimoto T, Inagaki Y, Simpson AGB, Roger AJ
  • 学会等名: International Congress of Protistology (ICOP) XIV
  • 発表場所: Westin Bayshore Hotel, Vancouver, Canada
• [学会発表] 窒素固定オルガネラ？ - 珪藻細胞内共生シアノバクテリアに見るゲノム縮小進化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中山卓郎、神川龍馬、谷藤吾朗、Archibald JM、稲垣祐司
  • 学会等名: 第15回日本進化学会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 招待講演
• [学会発表] 独自の光合成シアノバクテリア共生体を持つ有殻アメーバPaulinella chromatophoraにおけるテトラピロール合成系の進化. (2013)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、野村真未、中山卓郎、石田健一郎、小保方潤一、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 第15回日本進化学会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
• [学会発表] 紅（アカ）からミドリへのお色直し―渦鞭毛藻類における緑藻類由来葉緑体の獲得― (2013)
  • 著者名/発表者名: 皿井千裕、神川龍馬、高橋和也、稲垣祐司、岩滝光儀
  • 学会等名: 第15回日本進化学会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 招待講演
• [学会発表] 真正細菌由来翻訳終結因子パラログにおける相同組換えの検出 (2013)
  • 著者名/発表者名: 石川奏太、神川龍馬、稲垣祐司
  • 学会等名: 第15回日本進化学会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
• [学会発表] Karenia属渦鞭毛藻における進化的起源の異なる葉緑体型GAPDHの進化と細胞内局在 (2013)
  • 著者名/発表者名: 松尾恵梨子、神川龍馬、矢崎裕規、田原 美智留、佐倉孝哉、永宗喜三郎、稲垣祐司
  • 学会等名: 第15回日本進化学会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
  • 招待講演
• [学会発表] Fornicata生物のミトコンドリア関連オルガネラタンパク質におけるmatrix targeting signal. (2013)
  • 著者名/発表者名: 久米慶太郎、高林舜、森田幸之介、神川龍馬、稲垣祐司、橋本哲男
  • 学会等名: 第15回日本進化学会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
• [学会発表] Possible roles of ATG initiation codon in the maintenance and alteration of the transcriptome in the plant genome: hints for elucidating the molecular basis of EGT. (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoh S, Matsuo M, Kudo H, Yamamoto YY, Obokata J
  • 学会等名: 12th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis
  • 発表場所: Dalhousie University, Halifax, Canada
• [学会発表] 独自の光合成シアノバクテリア共生体を持つ有殻アメーバPaulinella chromatophoraにおけるテトラピロール合成系の進化. (2013)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、野村真未、石田健一郎、小保方潤一、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 日本植物学会第77回大会
  • 発表場所: 北海道大学（北海道札幌市）
• [学会発表] "王道"から外れた葉緑体進化：渦鞭毛藻類や珪藻類を例に (2013)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬
  • 学会等名: 藻類懇話会
  • 発表場所: 奈良女子大学（奈良県奈良市）
  • 招待講演
• [学会発表] 嫌気環境下におけるミトコンドリアの縮退進化：フォルニカータ生物群を例に (2013)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市中央区）
  • 招待講演
• [学会発表] ATG開始コドン欠損型の偽遺伝子化はゲノム上で転写領域の消失を引き起こす (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐藤壮一郎、松尾充啓、松崎素道、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市中央区）
• [学会発表] 葉緑体のC-to-U RNA編集活性はRNaseによって失活する (2013)
  • 著者名/発表者名: 立川誠、長谷川綾香、八木裕輔、高林厚、種村尚典、溝田香織、諏佐瑞穂、野村明子、中村崇裕、若杉達也、 小保方潤一
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市中央区）
• [学会発表] 渦鞭毛藻類における緑色葉緑体の起源と多様性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司、皿井千裕、神川龍馬、高橋和也、岩滝光儀
  • 学会等名: 第15回植物オルガネラワークショップ
  • 発表場所: オルガホール（岡山県岡山市）
• [学会発表] ハプト藻類Chrysochromulina sp.ミトコンドリアゲノムと転移性イントロンの進化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、神川龍馬、稲垣祐司、橋本哲男
  • 学会等名: 日本藻類学会第37回大会
  • 発表場所: 山梨大学西甲府キャンパス（山梨県甲府市）
• [学会発表] 嫌気性寄生原虫におけるエネルギー代謝関連酵素の分子進化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 橋本哲男、神川龍馬、林奈々子、稲垣祐司
  • 学会等名: 第82回日本寄生虫学会
  • 発表場所: 日本医科歯科大学（東京都文京区）
• [学会発表] 遺伝子重複型偽遺伝子の転写状態の維持におけるATG配列の役割． (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐藤壮一郎、松尾充啓、工藤久幸、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 第54回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 岡山大学津島キャンパス（岡山県岡山市）
• [学会発表] 緑藻ハネモ(Bryopsis plumosa)の形質転換系の確立と光合成ウミウシの盗葉緑体研究への応用． (2013)
  • 著者名/発表者名: 石井寿季、安井孝彰、佐藤壮一郎、松尾充啓、平野弥生、本村泰三、小保方潤一
  • 学会等名: 第54回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 岡山大学津島キャンパス（岡山県岡山市）
• [学会発表] Genome evolution of the nitrogen-fixing cyanobacterial endosymbiont in the diatom Epithemia turgida. (2012)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y
  • 学会等名: Integrated Microbial Biodiversity Program Meeting, Canadian Institute for Advanced Research
  • 発表場所: Hilton Hotel, Quebec City, Quebec, Canada
  • 招待講演
• [学会発表] 放散虫と有孔虫が互いに姉妹群とする「レタリア仮説」に基づいたアクチン、チューブリンおよびペプチド伸長因子の複雑な進化シナリオ (2012)
  • 著者名/発表者名: 石谷佳之、石川奏太、神川龍馬、矢吹彬憲、土屋正史、稲垣祐司、瀧下清貴
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2012年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ国際会議場（千葉県千葉市）
• [学会発表] メタゲノミクスで探る東京湾沿岸の藻類・プロティスト相 (2012)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子 守屋繁春、稲垣祐司、橋本哲男、白鳥峻志、中山剛、石田健一郎、井上勲
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2012年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ国際会議場（千葉県千葉市）
• [学会発表] ローリングサークル型複製法に基づく原生生物ミトコンドリアゲノムのシーケンス解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、神川龍馬、稲垣祐司、橋本哲男
  • 学会等名: 日本藻類学会第36回大会
  • 発表場所: 北海道大学（北海道札幌市）
• [学会発表] Karenia属渦鞭毛藻類の三次葉緑体獲得に伴う葉緑体型GAPDHの進化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 矢崎裕規、神川龍馬、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 日本藻類学会第36回大会
  • 発表場所: 北海道大学（北海道札幌市）
• [学会発表] 塩基配列情報で探る東京湾沿岸の真核微生物相とその季節変動 (2012)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子、守屋繁春、稲垣祐司、橋本哲男、井上勲
  • 学会等名: 日本藻類学会第36回大会
  • 発表場所: 北海道大学（北海道札幌市）
• [学会発表] 光合成能進化研究のモデルとしての無色珪藻類Nitzschia spp. (2012)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、吉田昌樹、平美砂歌、石田健一郎、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 日本藻類学会第36回大会
  • 発表場所: 北海道大学（北海道札幌市）
• [学会発表] 渦鞭毛藻Lepidodinium EST解析によるヌクレオモルフ関連遺伝子の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松本拓也、神川龍馬、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 日本藻類学会第36回大会
  • 発表場所: 北海道大学（北海道札幌市）
• [学会発表] A model for endosymbiotic genome reduction: rhopalodiacecan diatoms and their nitrogen-fixing organelle, spheroid body. (2012)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y
  • 学会等名: Protist2012
  • 発表場所: University of Oslo, Oslo, Norway
  • 招待講演
• [学会発表] RY-coding and non-homogeneous models can ameliorate the maximum-likelihood inferences from nucleotide sequence data with parallel compositional heterogeneity. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa SA, Inagaki Y, Hashimoto T
  • 学会等名: Protist2012
  • 発表場所: University of Oslo, Oslo, Norway
• [学会発表] A new strategy of organellar genome sequencing incorporating rolling circle amplification: protist mitochondria genomes. (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y, Kamikawa R, Inagaki Y, Hashimoto T
  • 学会等名: Protist2012
  • 発表場所: University of Oslo, Oslo, Norway
• [学会発表] Is the replacement of a gene encoding plastid-targeted GAPDH on-going in the dinoflagellate genus in Karenia? (2012)
  • 著者名/発表者名: Yazaki Y, Kamikawa R, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 学会等名: Protist2012
  • 発表場所: University of Oslo, Oslo, Norway
• [学会発表] The phylogenetic position and mitochondrial genome sequence of the enigmatic discobid Tsukubamonas globosa. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Nishimura Y, Yabuki A, Kolisko M, Simpsono AGB, Roger AJ, Ishida K, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 学会等名: Protist2012
  • 発表場所: University of Oslo, Oslo, Norway
• [学会発表] Seasonal succession of eukaryotic community detected by environmental sequences in Tokyo Bay, Japan. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama A< Moriya S, Inagaki Y, Hashimoto T, Inouye I
  • 学会等名: Protist2012
  • 発表場所: University of Oslo, Oslo, Norway
• [学会発表] Evolutionary analysis of mitochondrial ancestry of diplomonads: Phylogenomics of mitochondrial-related organelles in Carpediemonas-like organisms. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kolisko M, Kamikawa R, Takishita K, Cepicka I, Zhang Q, Hashimoto T, Yabuki A, Inagaki Y, Roger AJ, Simpson AGB
  • 学会等名: Protist2012
  • 発表場所: University of Oslo, Oslo, Norway
• [学会発表] 細胞共生体由来オルガネラ進化に関する新たな展開 (2012)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司、神川龍馬、中山卓郎、谷藤吾朗、橋本哲男
  • 学会等名: 第28回日本微生物生態学会
  • 発表場所: 豊橋技術科学大学（愛知県豊橋市）
  • 招待講演
• [学会発表] 新奇真核微生物がもたらす新しい真核生物大系統像 (2012)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、矢吹彬憲、橋本哲男、西村祐貴、稲垣祐司
  • 学会等名: 第28回日本微生物生態学会
  • 発表場所: 豊橋技術科学大学（愛知県豊橋市）
  • 招待講演
• [学会発表] フォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラの縮退進化―ハイドロジェノソームからマイトソームへ (2012)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、Kolisko M、Andersson J、Simpson AGB、Roger AJ、稲垣祐司、橋本哲男
  • 学会等名: 第72回日本寄生虫学会東日本支部会・第10回分子寄生虫マラリアフォーラム合同大会
  • 発表場所: 群馬大学（群馬県前橋市）
• [学会発表] 新奇単細胞真核生物Tsukubamonas globosaの系統的位置とミトコンドリアゲノム (2012)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、西村祐貴、矢吹彬憲、Kolisko M、Simpson AGB、Roger AJ、石田健一郎、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡県福岡市）
• [学会発表] 真核生物における翻訳伸長因子EF-1αとEFLを両有するゲノムの分布 (2012)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、西村祐貴、左子芳彦、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡県福岡市）
• [学会発表] 嫌気環境に適応したフォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラのトランスクリプトーム比較解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、Kolisko M、Andersson J、 Simpson AGB、Roger AJ、 稲垣祐司、橋本哲男.
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡県福岡市）
• [学会発表] ミトコンドリア関連オルガネラの縮退進化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、Kolisko M、Andersson J、Simpson AGB、Roger AJ、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 日本ミトコンドリア学会第12回年会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
• [学会発表] A new driving force for the functional gene transfer during endosymbiotic evolution: pol II promoter de novo origination, (2012)
  • 著者名/発表者名: Obokata J
  • 学会等名: Protist2012
  • 発表場所: University of Oslo, Oslo, Norway
  • 招待講演
• [学会発表] 緑藻ハネモ (Bryopsis plumosa) のオルガネラの蛍光標識と盗葉緑体研究への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 石井寿季、安井孝彰、中塚直樹、佐藤壮一郎、松尾充啓 、平野弥生、本村泰三、小保方潤一
  • 学会等名: 日本藻類学会第36回大会
  • 発表場所: 北海道大学（北海道札幌市）
• [学会発表] シロイヌナズナTFIIF変異体のゲノムワイド転写開始点解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐藤壮一郎、Elena B、松尾充啓、坂本智昭、倉田哲也、Sergei K、小保方潤一
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡県福岡市）
• [学会発表] 光合成ウミウシ卵における緑藻由来DNA配列の存在様式について (2012)
  • 著者名/発表者名: 松尾充啓、片山裕樹、安井孝彰、中塚直樹、佐藤壮一郎、石井寿季、多和田佳織、平野弥生、本村泰三、小保方潤一
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡県福岡市）
• [学会発表] 緑藻ハネモ(Bryopsis plumosa)のオルガネラの蛍光標識と盗葉緑体研究への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 石井寿季、安井孝彰、佐藤壮一郎、松尾充啓、平野弥生、本村泰三、小保方潤一
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡県福岡市）
• [学会発表] 糞線虫の持つ細菌様フェロケラターゼ遺伝子の同定 (2012)
  • 著者名/発表者名: 長安英治、石川奏太、竹谷茂、稲垣祐司、吉田彩子、丸山治彦
  • 学会等名: 第81回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 兵庫・西宮・兵庫県立大学
• [学会発表] 高等植物において遺伝子コード領域の存在は転写型ジーンサイレンシングを抑制する (2012)
  • 著者名/発表者名: 松尾充啓、佐藤壮一郎、工藤久幸、安井孝彰、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 第53回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都・京都・京都産業大学
• [学会発表] 遺伝子重複領域内のATG開始コドンが転写状態に与える影響について (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐藤壮一郎、松尾充啓、工藤久幸、安井孝彰、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 第53回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都・京都・京都産業大学
• [学会発表] 緑藻ハネモのオルガネラの蛍光標識と盗葉緑体研究への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 石井寿季、安井孝彰、中塚直樹、佐藤壮一郎、松尾充啓、平野弥生、本村泰三、小保方潤一
  • 学会等名: 第53回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都・京都・京都産業大学
• [学会発表] 新奇真核微生物からの大規模配列データで変貌し続ける、我々の真核生物大系統像 (2011)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司、矢吹彬憲、神川龍馬
  • 学会等名: 第31回微生物系統分類研究会
  • 発表場所: 埼玉・和光・理化学研究所(招待講演)
  • 年月日: 2011-11-25
• [学会発表] Recent progress in placing newly-discovered lineages of protists in the deep tree of eukaryotes (2011)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y
  • 学会等名: CGEB meeting
  • 発表場所: カナダ・ハリファックス・Dalhousie大学(招待講演)
  • 年月日: 2011-08-06
• [学会発表] 渦鞭毛藻Lepidodinium「葉緑体型」GAPDH遺伝子の転写活性比較 (2011)
  • 著者名/発表者名: 矢崎裕規、神川龍馬、松本拓也、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] ミトコンドリア7遺伝子に基づくカタブレファリス類Leucocryptos marinaの系統的位置 (2011)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、神川龍馬、稲垣祐司、橋本哲男
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] 159遺伝子データに基づく従属栄養性真核微生物Palpitomonas bilixの系統的位置 (2011)
  • 著者名/発表者名: 矢吹彬憲、神川龍馬、Martin Kolisko、石田健一郎、田辺晶史、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] Tsukubamonas globosaのPhylogenomic解析と部分的ミトコンドリアゲノム配列 (2011)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、矢吹彬憲、Martin Kolisko、西村祐貴、石川奏太、石田健一郎、橋本哲男、Andrew J Roger、Alastair GB Simpson、稲垣祐司
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大(Poster)
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] 複数遺伝子解析により得られた放散虫と有孔虫の姉妹関係 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石谷佳之、石川奏太、稲垣祐司、土屋正史、瀧下清貴
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] 寄生性真核微生物Giardiaの縮退ゲノムにおける複雑な遺伝子発現 (2011)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、稲垣祐司、Andrew J Roger、橋本哲男
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] 真核生物における翻訳伸長因子EF-1alphaおよび翻訳伸長因子様タンパク質EFLの進化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 神川龍馬、稲垣祐司
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] 緑色渦鞭毛藻類Lepidodinium chlorophorumが持つ共生体退化核遺伝子について (2011)
  • 著者名/発表者名: 松本拓也, 神川龍馬, 橋本哲男, 稲垣祐司
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] ミトコンドリアをもたないプロティスト分類群'Fornicata'の分子系統:複数遺伝子に基づく解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小松崎洋志、瀧下清貴、Marin Kolisko、矢吹彬憲、雪吹直史、稲垣祐司、橋本哲男、Andrew J Roger、Alastair GB Simpson
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] Red vs.Green : Apicomplexa類における退化型葉緑体apicoplastの起源に関する分子系統学的研究 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石川奏太、稲垣祐司、橋本哲男
  • 学会等名: 第5回日本進化原生生物学研究会
  • 発表場所: 富山・富山・富山大
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] 真核生物ゲノムの可塑性:渦鞭毛藻類葉緑体関連遺伝子の起源を例に (2011)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2011年大会
  • 発表場所: 千葉・幕張メッセ国際会議場
• [学会発表] Rhopalodia科珪藻に見られる細胞内共生シアノバクテリアの起源と分子進化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中山卓郎、池上裕子、中山剛、井上勲、稲垣祐司、笠井文絵
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2011年大会
  • 発表場所: 千葉・幕張メッセ国際会議場
• [学会発表] Spliceosomal introns in a split form : Another aspect of intron evolution in eukaryotes (2011)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Inagaki Y, Roger AJ, Hashimoto T
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: 京都・京都・京都大学
• [学会発表] Molecular evidence for the residual nuclear genome of the green algal endosymbiont in the dinoflagellate Lepidodinium chlorophorum (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto T, Kamikawa R, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: 京都・京都・京都大学
• [学会発表] The phylogenetic position of the katablepharid Leucocryptos marina based on seven mitochondrial gene sequences (2011)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y, Kamikawa R, Inagaki Y, Hashimoto T
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: 京都・京都・京都大学
• [学会発表] Difference in transcriptional regulation between two genes encoding plastid-targeted GAPDH in the dinoflagellate Karenia mikimotoi (2011)
  • 著者名/発表者名: Yazaki Y, Kamikawa R, Matsumoto T, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: 京都・京都・京都大学
• [学会発表] Intragenomic gene conversion in the evolution of bacterial peptide-chain release factors (2011)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa S, Kamikawa R, Inagaki Y
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: 京都・京都・京都大学
• [学会発表] Effective bootstrapping : A new method for estimating accurate credibilities of splits on a phylogenetic tree (2011)
  • 著者名/発表者名: Tanabe AS, Inagaki Y, Hashimoto T, Tsuji M, Sato M
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: 京都・京都・京都大学
• [学会発表] Molecular phylogeny of the amitochondriate lineage, Fornicata, based on multi-gene analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: Komatsuzaki H, Takishita K, Kolisko M, Yabuki A, Roger AJ, Simpson AGB, Inagaki Y, Hashimoto T
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: 京都・京都・京都大学
• [学会発表] Tsukubamonas globosa is a deep-branching member in the Discoba clade : Morphology, phylogenomics, and mitochondrial genome (2011)
  • 著者名/発表者名: Yabuki A, Kamikawa R, Kolisko M, Ishikawa SA, Ishida K, Simpson AGB, Roger AJ, Inagaki Y
  • 学会等名: IUMS2011
  • 発表場所: 北海道・札幌・札幌コンベンションセンター(招待講演)
• [学会発表] Trans-splicing of split introns is required for the expressions-of indispen sable genes in Giardia intestinalis (2011)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R., Inagaki Y, Roger AJ, Hashimoto T
  • 学会等名: IUMS2011
  • 発表場所: 北海道・札幌・札幌コンベンションセンター(招待講演)
• [学会発表] 複数遺伝子解析により明らかとなった放散虫と有孔虫の姉妹関係 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石谷佳之、石川奏太、稲垣祐司、土屋正史、瀧下清貴
  • 学会等名: 第11回放散虫研究集会
  • 発表場所: 愛媛・松山・愛媛大学
• [学会発表] 珪藻細胞中の窒素固定に特化したオルガネラ「楕円体」:オルガネラ獲得過程理解にむけた新たなモデル (2011)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司、中山卓郎、笠井文絵、大河内直彦
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神奈川・横浜・パシフィコ横浜(招待講演)
• [学会発表] 植物ゲノム上でのプロモーター機能領域の出現に対するATG開始コドンの役割 (2011)
  • 著者名/発表者名: 佐藤壮一郎、松尾充啓、工藤久幸、安井孝彰、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 日本植物学会第75回大会
  • 発表場所: 東京・東京・東京大学(駒場)
• [学会発表] 植物の核ゲノムにはATG開始コドンを介したプロモーター機能領域の出現メカニズムがある (2011)
  • 著者名/発表者名: 松尾充啓、佐藤壮一郎、工藤久幸、安井孝彰、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 日本遺伝学会第83回大会
  • 発表場所: 京都・京都・京都大学
• [学会発表] 遺伝子重複領域内のATG開始コドンの保存性が転写状態の持続性に及ぼす影響について (2011)
  • 著者名/発表者名: 佐藤壮一郎、松尾充啓、工藤久幸、安井孝彰、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神奈川・横浜・パシフィコ横浜
• [学会・シンポジウム開催] 2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells (2015)
  • 発表場所: 筑波大学大学会館国際会議場（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-09-30