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立体構造解明のための種々のレクチンの結晶化

研究課題

研究課題/領域番号 02680047
研究種目

一般研究(C)

配分区分補助金
研究分野 結晶学
研究機関大阪大学

研究代表者

松浦 良樹  大阪大学, たんぱく質研究所, 助教授 (90029968)

研究分担者 勝部 幸輝  大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (20032013)
研究期間 (年度) 1990 – 1991
研究課題ステータス 完了 (1991年度)
配分額 *注記
1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
1991年度: 400千円 (直接経費: 400千円)
1990年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードたんぱく質結晶化 / レクチン / X線結晶解析 / エノキタケレクチン / ベ-タバレル / 免疫グロブリンフォ-ルド / 分子進化 / ベ-タバレル構造 / 結晶構造 / 結晶化
研究概要

1、エノキタケレクチン(FVA)の精密構造解析を分解能2AでプログラムXPLORとPROLSQを用いて行った結果R値18.7%を得た。その構造を調べることにより、FVAは主として7本のベ-タシ-トからなる逆平行バレル構造からなることがわかった。さらに、ベ-タバレルのアミノ末端側には3タ-ンのアルファヘリックスと、それに続く結晶内で隣あう分子間のベ-タシ-トが付加されている。このベ-タバレルノ主鎖の折れたたみの様子は免疫グロブリンの1つのドメインと類似している。7本鎖のベ-タバレルは免疫グロブリンのCドメインと同一であり、4番目のベ-タ鎖が3番目のベ-タ鎖と水素結合するのはVドメインと同一である。このように、FVAは今まで構造の得られているレクチンとは異なる構造をもち、免疫グロブリンとの構造的な類似が見られる。これはFVAと免疫グロブリンの間のなんらかの分子進化的関連性を示すものであろう。
2、ニワトリのβガラクトシド結合性レクチンの結晶化
ニワトリの皮ふから抽出精製された分子量14000のレクチンはβガラクトシドに特異的な結合性を示すことから、脊椎動物由来のレクチンとして世界で初めてであるので結晶化を試みた。その結果、5mMリン酸バッファpH7、硫酸アンモニウム1.6Mの溶液からハンギングドロップ法で結晶が得られた。結晶は小さいめであったがプリセッション写真をとることができ、格子定数はa=106.3,b=67.3,c=44.8Aの空間群P2_12_12_1のもので2分子が非対称単位中に含まれることが予想された。皮ふからの抽出では量的に微量であるので大腸菌で発現させた分子量16000の類似のレクチンの結晶化も試みたが、これについては結晶は現在のところ得られていない。
3、日本ニワトコレクチンの結晶化
Neu5Ac(2ー6)Gal/GalNacに強い特異性を有するレクチンで、A_2B_2タイプのサブユニット構造を有している。各種の条件下で結晶化を試みたが、これまでのところ結晶は得られていない。本レクチンはかなりの量の糖を結合した糖蛋白質であり、糖鎖部分の立体的ゆらぎが大きいため、結晶が生成しないと考えられる。今後このような糖蛋白質をいかにして結晶化するかが問題点となる。

報告書

(3件)
  • 1991 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1990 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (16件)

  • [文献書誌] 山本,北川,松浦,勝部: "エノキタケ由来のレクチンの結晶構造解析" 日本結晶学会講演要旨集. OA2 (1989)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 山本,松浦,北川,伊藤,勝部: "エノキタケレクチンの結晶構造解析と抗体との構造比較" 生化学. 62. 0867 (1990)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 山本 雅貴: "A New Approach to Protein Structure Determination by Xーray Diffraction Methods:Structure Analysis of Flammulina velripes Aggltinin" Doctoral Thesis(Osaka University). (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 山本 雅貴: "エノキタケレクチンの結晶構造解析" 蛋白質工学基礎研究センタ-だより. 12. 33-39 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 山本,北川,松浦,勝部: "The ThreeーDimensional Structure of F.veltipes Agglutinir" J.Biol.Chem. (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masaki Yamamoto: "A New Approach to Protein Structure Determination by X-ray Diffraction Methods : Structure Analysis of Flammulina veltipes Agglutinin" Doctoral Thesis. Osaka Universuty. (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masaki Yamamoto: "Crystal Structure Analysis of F. veltipes Agglutinin" J. Res. Center Prot. Eng. 12. 33-39 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamamoto, Kitagawa, Matsuura, Katsube: "The Three-Dimesional Structure of F. veltipes Agglutinin" (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 山本,北川,松浦,勝部: "エノキタケ由来のレクチンの結晶構造解析" 日本結晶学会講演要旨集. OA2 (1989)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 山本,松浦,北川,伊藤,勝部: "エノキタケレクチンの結晶構造解析と抗体との構造比較" 生化学. 62. O867 (1990)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 山本 雅貴: "A New Approach to Protein Structure Determination by Xーray Diffraction Methods:Structure Analysis of Flammulina Veltipes Agglutinin" Doctoral Thesis (Osaka University). (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 山本 雅貴: "エノキタケレクチンの結晶構造解析" 蛋白質工学基礎研究センタ-だより. 12. 33-39 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 山本,北川,松浦,勝部: "The Three Dimensional Structure of F.veltipes Agglutinin" J.Biol.Chem.(1992)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 山本、北川、松浦、勝部: "エノキタケ由来のレクチンの結晶構造解析" 日本結晶学会講演要旨集. OA2 (1989)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] 山本、松浦、北川、伊藤、勝部: "エノキタケレクチンの結晶構造解析と抗体との構造比較" 生化学. 62. 0867 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Yamamoto,Kitagawa,Matsuura,Katsube,Hashimoto: "Three Dimensional Structure of Flammulina veltipes Aggilutinin contains an Immunoglobulin Fold"

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書

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公開日: 1990-04-01   更新日: 2016-04-21  

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