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mRNA分子内構造の動的変化によるシュードノットの形成とその機能に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 04272202
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関電気通信大学

研究代表者

清渕 潔  電気通信大学, 電気通信学部, 教授 (00092346)

研究分担者 森脇 博子  東京大学, 理学部, 助手
研究期間 (年度) 1992
研究課題ステータス 完了 (1992年度)
配分額 *注記
2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
1992年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
キーワードRNAシュードノット構造 / アンチセンスRNA / ColIb-P9プラスミド / 遺伝子内現の調節 / 分子生物学
研究概要

ColIb-P9プラスミドの複製開始蛋白質をコードするrepz遺伝子の翻訳開始はmRNA分子内で一過的なRNAシュードノットと呼ばれる構造の形成に依存している。一方、シュードノットの形成はアンチセンスRNA(IncRNA)の作用により阻害される。これら二つのRNA-RNA相互作用には特異なGGCG配列が関与しており、それ故、この配列を含むRNAの高次構造を明らかにすることはシュードノット形成を理解するために要重である。本研究ではGGCGを含む6塩基のUUGGCG配列によって構成させるRNAの二次構造を解析し、それがRNA-RNA相互作用のためのユニークな機能構造モチーフであることを見いだした。UUGGCG配列は構造-Iと名付けたステム・ループ構造内に存在するが、塩基置換によりシュードノット形成能、IncRNA活性能、あるいは両者の活性が低下した様々な突然変異を分離し、その二次構造をRNaseの切断パターンの変化を指標として解析した。その結果、6塩基のうち、UGGCの4塩基は構造-Iのループ部分に対応していることが明らかとなった。次いで、IncRNA-mRNAハイブリッドの動態から構造-Iを構成する塩基には、G:C>A:U>G:U>A:Cのルールに従って安定な複合体を形成するものと、このルールに従わないものとに区分できることを見いだし、前者にはシュードノッフ形成に関与するGGCGの各塩基が属することも明かとなった。これらの事実はシュードノットの形成とIncRNA-mRNA分子間互作用が互いに共通なRNA構造モチーフを介して行われていることを強く示唆しており、極めて興味深い。

報告書

(1件)
  • 1992 実績報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (1件)

  • [文献書誌] 山田 秀明,別府 輝彦,深沢 俊夫編: "微生物の機能開発" 学会出版センター, 330 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書

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公開日: 1992-04-01   更新日: 2016-04-21  

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