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潜在性果樹ウイルスのゲノム不均一性と宿主パッセージ効果に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 08660047
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 植物保護
研究機関岩手大学

研究代表者

吉川 信幸  岩手大学, 農学部, 助教授 (40191556)

研究期間 (年度) 1996 – 1997
研究課題ステータス 完了 (1997年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
1997年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
1996年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
キーワードカピロウイルス / リンゴステムグルービングウイルス / 塩基配列変異株 / ゲノム状不均一性 / 宿主パッセージ効果 / SSCP / ASGV
研究概要

本研究の概要は以下のようにまとめられる。
1)リンゴ,ニホンナシ,セイヨウナシから得られたすべてのASGV分離株には2-4種類の塩基配列変異株が存在することが明らかになった。2)外被タンパク質(CP)(237アミノ酸),ORF2タンパク質(320アミノ酸)およびORF1タンパク質の一部である可変(variable,V)領域タンパク質(284アミノ酸)の3領域のアミノ酸配列の各分離株および塩基配列変異株間の相同性はCPで92.4%-100%,ORF2で92.8%-100%であった.これに対してV領域の相同性は53.2%-99.3%で,すべての株に保存されているアミノ酸はわずか20.4%であった.3)上記の3領域のアミノ酸配列から系統樹を作成し,各分離株および塩基配列変異株の進化的類縁関係を調べた.V領域による系統樹では,各種果樹類から分離したカピロウイルスは4つの明瞭なクラスター(I,II,III,IV)に分かれた.系統樹の各クラスターと宿主植物の種類との間に関連性は認められなかった。4)IC-RT-PCRによってASGV感染果樹の微量な(0.1g以下)葉組織からASGVゲノムを増幅可能であった.5)ASGVの分離株および塩基配列変異株のDNAクローンを供試してSSCP分析したところ,大部分の株を移動度の異なる一体のバンドとして検出することができた.6)リンゴ,ニホンナシおよびセイヨウナシ2樹の計4樹の葉をSSCP分析したところ,すべての供試樹から2-4種類の塩基配列変異株が検出され,葉によってその構成および量比に違いが認められた.7)ASGV分離株(AAKおよびJP3)をC.quinoaで15代継代を繰り返した後,SSCP分析したところ,継代の繰り返しによって,含まれる塩基配列変異株の構成および量比に変化が生じ,一部の塩基配列変異株が優占することが明らかになった.

報告書

(3件)
  • 1997 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1996 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (6件)

  • [文献書誌] Yoshikawa, N.et.al.: "Apple stem grooving and citrus tatter leaf capillovirus obtained from a single shoot of Japanese pear (Pyrus serotina)" Annals of the Phytopathological Society of japan. 62・2. 103-108 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Magome, H., Yoshikawa et al.: "Molecular Variability of the genome of capilloviruses from apple,Japanese pear,European pear, and citrus trees" Phytopathology. 87・4. 389-396 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ysihikawa, N., Sasamoto, K., Sakurada, M., Takahashi, T.and Yanase, H.: "Apple stem grooving and cotrus tatter leaf capilloviruses obtained from a single shoot of Japanese pear (Pyrus serotina)." Annals of the Phytopathological Society of Japan. vol.62, N0.2. 119-124 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Magome, H.Yoshikawa, N., Takahashi, T., Ito, T., Miyakawa, T.: "Molecular variability of the genomes of capilloviruses from apple, Japanese Pear, European pear, and citrus trees." Phytopathology. vol.87, N0.4. 389-396 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Magome,H., Yoshikawa,N.et al: "Molecular variability of the genome of capilloviruses from apple,Japanese pear,European pear,and citrus trees" Phytopathology. 87・4. 389-396 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] H.Magome,N.Yoshikawa,et al.: "Molecular ariability of the genome of capilloviruses from apple,Japanese pear,European pear and citrus frees" Phytopathology. 87(印刷中). (1997)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書

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公開日: 1996-04-01   更新日: 2016-04-21  

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