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実験室内での多世代進化によるテルペン酵素活性の組織的創出

研究課題

研究課題/領域番号 11J06590
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生物分子科学
研究機関千葉大学

研究代表者

古林 真衣子  千葉大学, 大学院工学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2011 – 2013
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
2013年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2012年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2011年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワードテルペノイド / カロテノイド / 代謝工学 / 進化工学 / 二次代謝 / 生合成 / 合成生物学
研究概要

自然界には何万もの生理活性テルペノイドが存在する。これらの生産活性がいかにして生まれたかを知ること, そして多様なテルペン骨格の合成活性を開発することが, 本研究の目的である。テルペン群のすべての分子骨格は, イソプレニル二リン酸の環化によって一段階で形成される。その生合成を行うテルペン環化酵素は, 基質から二リン酸を脱離させ, そこで生じるカルボカチオンに分子内のどの二重結合を求電子攻撃させるかを規定する「反応シャペロン」の役割を担う。この特異な機構から, 少ないアミノ酸変異によっても, 大きくその生産物の構造を変化し得ることが予言されてきた。申請者はこれまで, テルペン酵素の細胞活性を, 共通するイソプレニル二リン酸を基質とするカロテノイド色素経路の生産量低下によって可視化する手法を開発してきた。本研究では, この手法を用いて, ひとつのテルペン酵素から多様なテルペン活性をつくり出すことを目指した。
採用期間の初年度では, スクリーニング手法を完成させ, 論文として発表した。その後, 二, 三年次においては本手法を用いて, バジル由来ゲラニオール合成酵素, タバコ由来5-エピアリストロケン合成酵素およびマツ由来ビサボレン合成酵素を対象として, 数世代の進化工学を行った。そこで得られた変異体から, 生産物特異性を変更させるものを単離した。その変異体解析によって, テルペンの反応特異性を改変し得るアミノ酸部位を複数特定することができた。これらの結果は, テルペン合成酵素が数アミノ酸変異による小さな構造変化によって反応特異性が大きく変わり得ることを, そしてその変化が大きな活性低下を伴うことなく起こり得ることを示すものである。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

計画通りに研究が進展した。

今後の研究の推進方策

(抄録なし)

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2014 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (14件) (うち招待講演 1件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Evolutionary analysis of the functional plasticity of Staphylococcus aure us C_<30> carotenoid synthase2014

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M, Saito K, Umeno D
    • 雑誌名

      J Biosci Bioeng

      巻: 117 ページ: 431-436

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Construction of carotenoid biosynthetic pathways using squalene synthase2014

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M, Li L, Katabami A, Saito K, Umeno D
    • 雑誌名

      FEBS Lett

      巻: 588 号: 3 ページ: 436-442

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.12.003

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A high-throughput colorimetric screening assay for terpene synthase activity based on substrate consumption2014

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M, Ikezumi M, Kajiwara J, Iwasaki M, Fujii A, Li L, Saito K, Umeno D
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 号: 3 ページ: e93317-e93317

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0093317

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 代謝経路と制御ネットワークの組織的な進化工学技術2013

    • 著者名/発表者名
      梅野太輔, 冨永将大, 古林真衣子, 池紘平
    • 雑誌名

      生物工学会誌

      巻: 91 ページ: 333-336

    • NAID

      110009616009

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] 代謝ネットワーク建設のための進化分子工学-進化的デザインによる非天然代謝経路の創出-2012

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 梅野太輔
    • 雑誌名

      植田充美(監修)合成生物工学の隆起-有用物質の新たな生産法構築をめざして-

      ページ: 67-72

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Directed Evolution of Carotenoid Synthases for the Production of Unnatural Carotenoids2012

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M, Umeno D
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 892 ページ: 879-5

    • DOI

      10.1007/978-1-61779-879-5_14

    • ISBN
      9781617798788, 9781617798795
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] A highly specific synthetic metabolic pathway assembled from promiscuous enzymes2013

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M
    • 学会等名
      Synthetic Biology 6.0 Conference (SB6.0)
    • 発表場所
      Imperial Collage London, United Kingdom
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 改良型酵素を用いたゲラニオール関連物質の微生物生産2013

    • 著者名/発表者名
      岩嵜美希, 藤井爽, 梶原順, 古林真衣子, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年度大会
    • 発表場所
      東北大学川内北キャンパス
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 基質消費スクリーニングを用いたゲラニオール合成酵素の活性進化2012

    • 著者名/発表者名
      梶原順, 岩嵜美希, 古林真衣子, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      第22回ドリコールおよびイソプレノイド研究会
    • 発表場所
      新潟大学
    • 年月日
      2012-09-29
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 非天然カロテノイド経路における不飽和化酵素の進化分子工学2012

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 李伶, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学
    • 年月日
      2012-03-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 基質消費活性スクリーニングを用いたゲラニオール合成酵素の進化工学2012

    • 著者名/発表者名
      岩崎美希, 梶原順, 生悦住茉友, 古林真衣子, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学
    • 年月日
      2012-03-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Evolutionary engineering of biosynthetic pathways for non-natural C50 carotenoids.2012

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M, Ling L, Takaichi S, Saito K & Umeno D
    • 学会等名
      International Conference of Natural Products Bios ynthesis (ICNPB)
    • 発表場所
      Awaji Shima, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 人工代謝経路による非天然C_<50>-β-caroteneの生合成2011

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      第10回微生物研究会
    • 発表場所
      千葉大学松戸キャンパス
    • 年月日
      2011-11-12
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 人工代謝経路による非天然C50-β-Caroteneの生合成2011

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部2011年度大会
    • 発表場所
      東洋大学板倉キャンパス
    • 年月日
      2011-10-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 基質消費スクリーニングを用いたゲラニオール合成酵素の細胞活性進化2011

    • 著者名/発表者名
      梶原順, 生悦住茉友, 岩崎美希, 古林真衣子, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部2011年度大会
    • 発表場所
      東洋大学板倉キャンパス
    • 年月日
      2011-10-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 非天然カロテノイド合成経路の選択性と多様性の進化工学2011

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本生物工学会2011年度大会
    • 発表場所
      東京農工大学小金井キャンパス
    • 年月日
      2011-09-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 基質消費スクリーニングを用いたテルペン酵素の細胞活性進化2011

    • 著者名/発表者名
      梶原順, 生悦住茉友, 古林真衣子, 岩崎美希, 斎藤恭一, 青木考, 梅野太輔
    • 学会等名
      日本生物工学会2011年度大会
    • 発表場所
      東京農工大学小金井キャンパス
    • 年月日
      2011-09-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 人工代謝経路を用いたC50-β-Caroteneの全合成2011

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • 学会等名
      第25回カロテノイド研究談話会
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2011-09-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Specific non-natural C_<50> carotenoid pathways constructed by the combinatorial expression of laboratory-evolved enzymes2011

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M, Takaichi S, Misawa N, Umeno D
    • 学会等名
      The 16th International Symposium on Carotenoids
    • 発表場所
      Krakow, Poland
    • 年月日
      2011-07-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Efficient and selective production of non-natural carotenoids by combinatorial expression of laboratory-evolved enzymes2011

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi M, Ikezumi M, Saito K, Umeno D
    • 学会等名
      Synthetic Biology 5.0 Conference (SB5.0)
    • 発表場所
      Stanford, CA
    • 年月日
      2011-06-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [図書] 「人工代謝経路構築のための進化分子工学」, 伏見譲(監修)『進化分子工学~高速分子進化によるタンパク質・核酸の開発~』2013

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子, 梅野太輔
    • 総ページ数
      466
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [産業財産権] 炭素数50のカロテノイドの製造方法2011

    • 発明者名
      梅野太輔, 古林真衣子, 三沢典彦, 高市真一
    • 権利者名
      国立大学法人千葉大学
    • 産業財産権番号
      2011-130326
    • 出願年月日
      2011-06-10
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-12-12   更新日: 2024-03-26  

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