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葉緑体のRNAプロセス・翻訳系に関与するRNA結合性蛋白質の研究

研究課題

研究課題/領域番号 12440226
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 植物生理
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

杉浦 昌弘  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 教授 (80027044)

研究分担者 櫻井 宣彦  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 講師 (00255233)
森山 昭彦  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 教授 (50145744)
谷本 英一  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 教授 (90080283)
小保方 潤一  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教授 (50185667)
續 伯彦  愛知学院大学, 情報社会政策学部, 教授 (60064896)
杉田 護  名古屋大学, 人間情報学研究科, 教授 (70154474)
研究期間 (年度) 2000 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
12,000千円 (直接経費: 12,000千円)
2002年度: 2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
2001年度: 2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
2000年度: 6,200千円 (直接経費: 6,200千円)
キーワード葉緑体 / タバコ / シス配列 / 翻訳 / RNAエディティング / mRNA / Sine-Dalgarno配列 / in vitro系 / Shine-Dalgarno配列 / エンドウ / 遺伝子 / RNAプロセス
研究概要

(1)葉緑体単離条件の検討
エンドウが生化学研究に適しているので、エンドウの栽培条件、葉の採取条件および葉緑体の単離法を組織的に再検討し、満足すべき結果を得た。次いで、エンドウ葉緑体転写物のRNAエディティング部位を探索した。
(2)翻訳シス配列とトランス因子の解析
タバコ葉緑体の30種のmRNAは、Shine-Dalgarno配列が無く、代わりに特異的な蛋白因子が翻訳開始に必要である。我々の開発したin vitro翻訳系を用いてATP合成酵素サブユニットβのmRNAのシス配列を同定した。ついで、Shine-Dalgarno様の配列を持つリボソームタンパクS2のmRNAのシス配列を調べたところ、Shine-Dalgarno様配列が阻害的に働くことを見出した。.
(3)RNAエディティング因子の単離と解析
葉緑体でのRNAエディティングの分子機構を解析するため、世界に先がけて単離タバコ葉緑体よりin vitro系を開発した。この系を用いてタバコ葉緑体のpsbL mRNAとpsbE mRNAの部位決定因子を同定し、25kDaと56kDaのタンパク質であることを示した。この単離を進めているが、すぐ活性が無くなり、困難を極めている。
(4)エンドウ葉緑体でのRNAエディティングの解析
エンドウをタバコに次ぐモデル系として、その単離葉緑体よりin vitro RNAエディティング系を開発した。エンドウのpsbE mRNAはエディティング部位が無い。タバコのpsbE mRNAを基質に用いてもエディトされない。従って、エディティング部位をエディティング活性は共進化すると考えられる。

報告書

(4件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (31件)

  • [文献書誌] Miyamoto, T.: "Recognition of RNA editing sites is directed by unique proteins in chloroplasts"Mol.Cell.Biol.. 22. 6726-6734 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, K.: "Organization and transcription of the gene family encoding chlorophyll a/b-binding proteins in Nicotiana sylvestris"Gene. 289. 161-168 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mathiew, O.: "5S rRNA genes expression is not inhibited by DNA methylation in Arabidopsis"Plant Journal. 29. 313-323 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, K.: "In vitro analysis of transcription initiation and termination from the Lhcb1 gene family In Nicotiana sylvestris"Plant Journal. 33. 1063-1072 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sasaki, T.: "Identification of RNA editing sites in chloroplasts transcripts from the maternal and paternal progenitors of tobacco (Nicotiana tabacum)"Mol.Biol.Evol.. 20. 1028-1035 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 杉浦昌弘: "生体の科学第53巻(2号)P.124-130「RNAエディティングに関与するタンパク-クロロプラストの例」"医学書院. (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Miyamoto, T.et al.: "Recognition of RNA editing sites is directed by unique proteins in chloroplasts"Mol.Cell.Biol.. 22. 6726-6734 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, K.et al.: "Organization and transcription of the gene family encoding chlorophyll a/b-binding proteins in Nicotiana sylvestris"Plant Journal. 289. 161-168 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mathiew, O.et al.: "5S rRNA genes expression is not inhibited by DNA methylation in Arabidopsis"Plant Journal. 29. 313-323 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, K.et al.: "In vitro analysis of transcription initiation and termination from the Lhcb1 gene family in Nicotiana sylvestris"Plant Journal. 33. 1063-1072 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sasaki, T.et al.: "Identification of RNA editing sites in chloroplasts transcripts from the maternal and paternal progenitors of tobacco (Nicotiana tabacum)"Mol.Biol.Evol.. 20. 1028-1035 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sugiura, M.: "Proteins involved in RNA editing-In chloroplasts (in Japanese)"Seitai-no-Kagaku (Life Science). 53. 124-130 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Miyamoto, T.: "Recognition of RNA editing sites is directed by unique proteins in chloroplasts"Mol. Cell. Biol.. 22. 6726-6734 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Hasegawa, K.: "Organization and transcription of the gene family encoding chlorophyll a/b-binding proteins in Nicotiana sylvestris"Gene. 289. 161-168 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Mathieu, O.: "5S rRNA genes expression is not inhibited by DNA methylation in Arabidopsis"Plant Journal. 29. 313-323 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Hasegawa, K.: "In vitro analysis of transcription initiation and termination from the Lhcbl gene family in Nicotiana sylvestris"Plant Journal. 33. 1063-1072 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Sasaki, T.: "Identification of RNA editing sites in chloroplasts transcripts from the maternal and paternal progenitors of tobacco (Nicotiana tabacum)"Mol. Biol. Evol.. (未定). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Plader, W.: "The Shine-Dalgarno-like sequence is a negative regulatory element for translation of tobacco chloroplast rps2 mRNA"Plant Journal. (未定). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 杉浦昌弘: "生体の科学 第53巻(2号)「RNAエディティングに関与するタンパク-クロロプラストの例」"医学書院. 124-130 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Hirose, T.: "Involvement of a site-specific trans-acting factor and a common RNA-binding protein in the editing of chloroplast mRNAs"EMBOJ.. 20. 1144-1152 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Arnaud, P.: "Analysis of the SINE S1 Pol III promoter from Brassica"Plant Journal. 26. 295-305 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Tsudzuki, T.: "Comparative analysis of RNA editing sites in higher plant chioroplasts"J. Mol. Evol.. 53. 327-332 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Wakasugi, T.: "The genomics of land plant chioroplasts: Gene content and alteniation of genomic information by RNA editing"Photosynthesis Res.. 70. 107-118 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yukawa, Y.: "A tobacco nuclear extract supporting transcription, processing, splicing and modification from plant intron-containing tRNA precursors"Plant Journal. 28. 583-594 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Nakamura T.: "Chioroplast ribonucleoproteins function as a stabilizing factor of ribosome-free mRNAs in the stroma"J. Biol. Chem.. 276. 147-152 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yukawa,Y.: "The TATA motif, the CAA motif and the Poly (T) transcription termination motif are all important for transcription re-initiation on plant tRNA genes."Plant Journal. 22. 439-447 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Akama,K.: "Splicing of Arabidopsis tRNA^<Met> precursors in tobacco cell and wheat germ extracts."Plant Molecular Biology. 44. 155-165 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Sugita,C.: "A novel nucleic acid-binding protein in the cyanobacterium Synechococcus sp.PCC6301."Mol.Gen.Genet.. 263. 655-663 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Nakamura T.: "Chloroplast ribonucleoproteins function as a stabilizing factor of ribosome-free mRNAs in the stroma."J.Biol.Chem.. 276. 147-152 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Sugiura,M.: "Nucleic Acids.In "Biochemistry & Molecular Biology of Plans""American Society of Plant Physiologists. 50 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Sugiura,M.: "Phytogene sequence : From cyanobacteia to plastids.In "From Symbiosis to Eukaryotism-Endocytobioligy VII""Univ Geneva Press. 16 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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