• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

複雑な認識機構を有する生体分子間相互作用の解析手法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 15K00406
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 生命・健康・医療情報学
研究機関北里大学

研究代表者

能登 香  北里大学, 一般教育部, 講師 (20361818)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2017年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2016年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2015年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
キーワード生体分子シミュレーション / 抗体 / 糖鎖 / 分子間相互作用 / ヒト免疫不全ウィルス
研究成果の概要

複数箇所でリガンドを認識するような複雑な認識機能を有する生体分子機能を標的に創薬開発ができる手法の開発と応用を目的に,ヒト免疫不全ウィルス(HIV-1)表面の糖タンパク質に糖鎖を介して結合し,標的細胞への侵入を防ぐ一連の中和抗体を対象に計算化学の手法に基づいて研究を行った.中和抗体PGTの結合において重要な役割を担う糖鎖を特定し,糖鎖―糖鎖相互作用も抗体の結合に協同的に関与することや,PGT抗体間の糖鎖親和性の違いの要因を明らかにした.また,本研究で開発した生体内水分子を考慮したモデルによって,糖が関与する生体分子間相互作用を適切に再現できることを示した.

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2018 2017 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 3件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Water Molecules Inside Protein Structure Affect Binding of Monosaccharides with HIV-1 Antibody 2G122016

    • 著者名/発表者名
      K. Ueno-Noto, K. Takano
    • 雑誌名

      J. Comp. Chem.

      巻: 37 号: 26 ページ: 2431-2438

    • DOI

      10.1002/jcc.24447

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] An application of an explicit water model to a glycoprotein-antibody complex2018

    • 著者名/発表者名
      Kaori Ueno-Noto
    • 学会等名
      日本化学会第98春季年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Theoretical study of the interaction between a neutralizing antibody and glycan ligands on the HIV-1 Envelope glycoprotein2017

    • 著者名/発表者名
      K. Ueno-Noto
    • 学会等名
      日本化学会第97春季年会
    • 発表場所
      慶応大学(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Interaction Analysis between HIV-1 and PGT antibodies2017

    • 著者名/発表者名
      M. Kusumoto, K. Noto, K. Takano
    • 学会等名
      日本化学会第97春季年会
    • 発表場所
      慶応大学(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] A theoretical study of the recognition of a neutralizing antibody to the HIV-1 envelope glycoprotein2017

    • 著者名/発表者名
      Kaori Ueno-Noto
    • 学会等名
      World Association of Theoretical and Computational Chemists (WATOC) 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] HIV-1 外被糖タンパク質における糖鎖―中和抗体間相互作用に関する理論的研究2017

    • 著者名/発表者名
      能登 香
    • 学会等名
      第36回日本糖質学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] フラグメント分子軌道法によるHIV-1認識PGT抗体と抗原糖鎖との間の相互作用解析2017

    • 著者名/発表者名
      楠本美侑,能登香,鷹野景子
    • 学会等名
      第11回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] The effect of water molecules on the binding affinity of the ligands to the HIV-1 antibody 2G122016

    • 著者名/発表者名
      K. Ueno-Noto, K. Takano
    • 学会等名
      heory and Applications of Computational Chemistry (TACC-2016)
    • 発表場所
      ワシントン大学(シアトル,米国)
    • 年月日
      2016-08-29
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 大規模量子化学計算によるHIV-1表面糖タン パク質と中和抗体間の相互作用解析2016

    • 著者名/発表者名
      能登 香
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      同志社大学(京都府京田辺市)
    • 年月日
      2016-03-25
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Affinity of HIV-1 antibody 2G12 with monosaccharides: a theoretical study based on explicit and implicit water models2015

    • 著者名/発表者名
      ○Kaori Ueno-Noto, Yuka Koyama,Keiko Takano
    • 学会等名
      PACIFICHEM 2015
    • 発表場所
      Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-19
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 複数箇所で抗原を認識する抗体における分子間相互作用に関する理論研究2015

    • 著者名/発表者名
      能登 香
    • 学会等名
      第9回分子科学討論会
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都目黒区)
    • 年月日
      2015-09-19
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] HIV-1中和抗体PGTと糖タンパク質gp120複合体における分子間相互作用の電子論的考察2015

    • 著者名/発表者名
      能登 香
    • 学会等名
      第34回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      東京大学(東京都文京区)
    • 年月日
      2015-08-01
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [備考]

    • URL

      https://www.kitasato-u.ac.jp/ippan/kagaku/noto.html

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 北里大学研究者情報データベース

    • URL

      http://kerid-web.kitasato-u.ac.jp/Profiles/45/0004485/profile.html

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [備考] 北里大学一般教育部自然科学教育センター化学

    • URL

      https://www.kitasato-u.ac.jp/ippan/kagaku/noto.html

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi