コアプロモーター認識因子の選択によるmRNA運命決定機構の解明

• 研究課題/領域番号: 15K06953
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 古久保 哲朗 横浜市立大学, 生命医科学研究科, 教授 (10271587)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2017年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2016年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: transcription / TFIID / SAGA / mRNA / RNA-binding protein / gene regulation / cell morphogenesis / GTF / 転写調節 / 転写因子 / 局所翻訳制御 / 出芽酵母 / TAF / TBP

研究成果の概要

TFIIDはTBPと14種類のTAFから構成される巨大な複合体であり、SAGAとともにコアプロモーター（CP）上で働き、TBP-DNA相互作用を制御することによって転写の活性化を行う。最近我々は、同一のプロモーターからTFIIDまたはSAGAによって転写されるCLN2 mRNAが機能の異なる二種類のCln2に翻訳される可能性を示した。本研究では、さらに解析を進め、①転写が「上流配列によるコア因子の選択→CP領域による被選択コア因子の活性制御」という二段階を経て進むこと、②CLN2 mRNAの局所翻訳制御には二種類のRNA結合タンパク質が関与することを強く示唆する結果を得たので、以下に報告する。

研究成果

• [雑誌論文] SAGA mediates transcription from the TATA-like element independently of Taf1p/TFIID but dependent on core promoter structures in Saccharomyces cerevisiae (2017)
  • 著者名/発表者名: Watanabe Kiyoshi、Kokubo Tetsuro
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 12 号: 11 ページ: e0188435-e0188435
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0188435
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Oligomerization of Hmo1 mediated by box A is essential for DNA binding in vitro and in vivo. (2016)
  • 著者名/発表者名: K. Kasahara, A. Higashino, S. Unzai, H. Yoshikawa, T. Kokubo
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 21(12) 号: 12 ページ: 1333-1352
  • DOI: 10.1111/gtc.12449
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A random screen using a novel reporter assay system reveals a set of sequences that are preferred as the TATA or TATA-like elements in the CYC1 Promoter of Saccharomyces cerevisiae. (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Watanabe, M. Yabe, K. Kasahara, T. Kokubo
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10(6) 号: 6 ページ: e0129357-e0129357
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0129357
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Novel Quantitative Hemolytic Assay Coupled with Restriction Fragment Length Polymorphisms Analysis Enabled Early Diagnosis of Atypical Hemolytic Uremic Syndrome and Identified Unique Predisposing Mutations in Japan. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Y, Miyata T, Matsumoto M, Shirotani-Ikejima H, Uchida Y, Ohyama Y, Kokubo T, Fujimura Y.
  • 雑誌名: PLos One. 巻: 10 号: 5 ページ: e0124655-e0124655
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0124655
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] 基本転写因子TFIIDの構成因子TAF8の天然変性領域の機能解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 高井直樹, Ehmed Ekrem, 櫻井堅介, 大山良文, 古久保哲朗
  • 学会等名: 2017年度生命科学系学会合同年次大会（ConBio2017）
• [学会発表] ATP/ADP結合型RecAによるE. coli /T4 DNA LigaseのDNA末端結合活性促進の生化学的特性 (2016)
  • 著者名/発表者名: 此村直人, 新井直人, 古久保哲朗, 柴田武彦
  • 学会等名: 日本分子生物学会第39回年会
  • 発表場所: 横浜（パシフィコ横浜）
• [学会発表] 基本転写因子TFIIDのサブユニットであるTAF8における天然変性領域の機能解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 高井直樹, Ehmed Ekrem, 櫻井堅介, 大山良文, 古久保哲朗
  • 学会等名: 日本分子生物学会第39回年会
  • 発表場所: 横浜（パシフィコ横浜）
• [学会発表] 出芽酵母のRNAポリメラーゼII系遺伝子における新規コアプロモーターエレメントの同定ならびにその機能解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 渡邉清, 矢部誠, 古久保哲朗
  • 学会等名: 日本分子生物学会第38回年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-12-01