タンパク質とゲノムの相互作用を組織特異的に検出する方法の開発と応用

• 研究課題/領域番号: 15K14527
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 発生生物学
• 研究機関: 高知工科大学
• 研究代表者: 蒲池 雄介 高知工科大学, 環境理工学群, 教授 (90263334)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2016年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円); 2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: 転写因子 / クロマチン免疫沈降 / エピトープタグ / クロマチン免疫沈降法

研究成果の概要

細胞内におけるタンパク質とゲノムDNAとの相互作用の解析は、遺伝子発現の制御機構の理解に重要である。これには、クロマチン免疫沈降法と呼ばれる手法が用いられるが、これに適した高品質の抗体が必要であるなど、現在はさまざまな技術的な制約がある。本研究は、目的タンパク質にビオチンタグなどの特定の短いアミノ酸配列を導入することで、タンパク質－DNAの相互作用を動物胚の特定の組織で高感度に検出する、汎用性がきわめて高い方法の開発を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Cooperation of Sall4 and Sox8 transcription factors in the regulation of the chicken Sox3 gene during otic placode development (2018)
  • 著者名/発表者名: Okamoto Yu、Nishimura Naoko、Matsuda Kazunari、Ranawakage Deshani C.、Kamachi Yusuke、Kondoh Hisato、Uchikawa Masanori
  • 雑誌名: Development, Growth & Differentiation 巻: 60 号: 3 ページ: 133-145
  • DOI: 10.1111/dgd.12427
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Regulation of trunk neural crest delamination by δEF1 and Sip1 in the chicken embryo (2016)
  • 著者名/発表者名: Yasumi, T., Inoue, M., Maruhashi, M., Kamachi, Y., Higashi, Y., Kondoh, H., Uchikawa, M.
  • 雑誌名: Dev. Growth. Differ. 巻: 58 号: 2 ページ: 205-214
  • DOI: 10.1111/dgd.12256
  • 査読あり
• [学会発表] Optimization of epitope tagging for robust chromatin immunoprecipitation (2017)
  • 著者名/発表者名: Deshani C. Ranawakage, Yusuke Kamachi
  • 学会等名: The 6th International Symposium on Frontier Technology
  • 国際学会
• [図書] Sox2: Biology and Role in Development and Disease (Editors : Kondoh & Lovell-Badge) (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Kamachi (Chapter 6: Evolution of Sox2 and Functional Redundancy in Relation to Other SoxB1 Genes)
  • 総ページ数: 344
  • 出版者: Elsevier
• [図書] Sox2: Biology and Role in Development and Disease (Editors : Kondoh & Lovell-Badge) (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kondoh and Y. Kamachi (Chapter 8: SOX2-Partner Factor Interactions and Enhancer Regulation)
  • 総ページ数: 344
  • 出版者: Elsevier