研究課題
若手研究(B)
多くの文字列処理ではビッグデータが用いられ，データアクセスが処理のボトルネックになることが多い．本研究ではデータアクセスに着目し，圧縮したまま演算できるような簡潔データ構造とその演算回路構成を提案した．ウェーブレット木を用いた階層的なデータ構造を用いられることにより，データ量が２７％まで削減した．その結果メモリアクセスを７３％まで削減できた．本研究では，データアクセス削減のための簡潔データ表現に基づいたスマートストレージ構造を提案した．それを用い，遺伝子配列位置推定や文字列検索処理を高速化するアクセラレータを再構成可能な集積回路（FPGA）上で実装し，従来のCPUの２１倍の高速処理を実現した．
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すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 3件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 6件)
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