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DNA相同組換えにおけるDNAクランプの酵素反応制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K16128
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 放射線・化学物質影響科学
研究機関藤田医科大学 (2018)
崇城大学 (2015-2017)

研究代表者

河合 聡人  藤田医科大学, 医学部, 助教 (20435150)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2018年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2017年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2016年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
キーワードタンパク質の結晶化 / X線結晶構造解析 / DNA相同組換え / DNAクランプ
研究成果の概要

本研究では、構造生物学的な手法を用いて、四量体型DNAクランプによってstoHjmやstoHjcの酵素活性が制御される仕組みを明らかにすることを目的に研究を行った。stoHjc、stoHjm、四量体型DNAクランプの大量調製系を確立し、stoHjcー四量体型DNAクランプ複合体、stoHjcー四量体型DNAクランプーホリデイ構造複合体およびstoHjmの結晶化条件を検討した。また得られた結晶はX線回折実験を行った。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究ではこれまで不明であった四量体型DNAクランプの機能を解明するため研究を進め、立体構造が未知であるstoHjcー四量体型DNAクランプーホリデイ構造複合体の構造解析へとつながる結晶化条件の発見に至った。今後、さらに研究を進めることで四量体型DNAクランプの機能解明を行い、この四量体型DNAクランプの機能を利用してDNA修復の正確性、効率を向上につながるアイデアを生み出したい。

報告書

(5件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2018 2017 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (10件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Analysis of the binding of aripiprazole to human serum albumin: The importance of a chloro-group in the chemical structure.2018

    • 著者名/発表者名
      Sakurama K, Kawai A, Tuan Giam Chuang V, Kanamori Y, Osa M, Taguchi K, Seo H, Maruyama T, Imoto S, Yamasaki K, Otagiri M
    • 雑誌名

      ACS Omega

      巻: 3 号: 10 ページ: 13790-13797

    • DOI

      10.1021/acsomega.8b02057

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Crystal structure analysis of human serum albumin complexed with sodium 4-phenylbutyrate.2018

    • 著者名/発表者名
      Kawai A, Yamasaki K, Enokida T, Miyamoto S, Otagiri M.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Rep

      巻: 13 ページ: 78-82

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2018.01.006

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Crystallographic analysis of the ternary complex of octanoate and N-acetyl-l-methionine with human serum albumin reveals the mode of their stabilizing interactions.2017

    • 著者名/発表者名
      Kawai A, Chuang VTG, Kouno Y, Yamasaki K, Miyamoto S, Anraku M, Otagiri M.
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta

      巻: 1865 号: 8 ページ: 979-984

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2017.04.004

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Species Differences in the Binding of Sodium 4-Phenylbutyrate to Serum Albumin.2017

    • 著者名/発表者名
      Yamasaki K, Enokida T, Taguchi K, Miyamura S, Kawai A, Miyamoto S, Maruyama T, Seo H, Otagiri M.
    • 雑誌名

      J Pharm Sci

      巻: 106 号: 9 ページ: 2860-2867

    • DOI

      10.1016/j.xphs.2017.04.025

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of family 4 uracil-DNA glycosylase from Sulfolobus tokodaii and a function of tyrosine 170 in DNA binding2015

    • 著者名/発表者名
      Kawai A., Higuchi S., Tsunoda M., Nakamura K.T., Yamagata Y., Miyamoto S.
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 589 号: 19PartB ページ: 2675-2682

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2015.08.019

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ヒト血清アルブミンを安定化する低分子化合物の構造化学研究2018

    • 著者名/発表者名
      河合 聡人、安楽 誠、河野 陽介、宮本 秀一、山崎 啓之、小田切 優樹
    • 学会等名
      第16回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム(PPF2018)
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] ファミリー4 ウラシルDNAグリコシラーゼによる酵素触媒機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      河合 聡人, 吉田 紀生, 中村 照也, 下野 和実, 山縣 ゆり子, 宮本 秀一
    • 学会等名
      第18回 日本蛋白質科学会 年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] ファミリー4 ウラシルDNAグリコシラーゼ-DNA複合体の立体構造に基づく酵素反応機構の解明2017

    • 著者名/発表者名
      河合 聡人, 中村 照也, 山縣 ゆり子, 宮本 秀一
    • 学会等名
      2016年度量子ビームサイエンスフェスタ
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2017-03-14
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 立体構造に基づくオクタン酸ナトリウム及びN-アセチル-L-メチオニンのヒト血清アルブミン安定化効果に関する考察2017

    • 著者名/発表者名
      河合 聡人, 安楽 誠, 河野 陽介, 宮本 秀一, 山崎 啓之, 小田切 優樹
    • 学会等名
      第34回日本薬学会九州支部大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] ファミリー4 ウラシルDNAグリコシラーゼ-DNA複合体の結晶構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      河合 聡人, 中村 照也, 下野 和実, 山縣 ゆり子, 宮本 秀一
    • 学会等名
      第55回 日本生物物理学会 年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 立体構造に基づくヒト血清アルブミンに対するN-アセチル-L-メチオニンの抗酸化効果に関する考察2017

    • 著者名/発表者名
      河合 聡人, 安楽 誠, 河野 陽介, 宮本 秀一, 山崎 啓之, 小田切 優樹
    • 学会等名
      第17回 日本蛋白質科学会 年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 立体構造に基づくアルブミン製剤に添加する安定化剤の有用性に関する考察2016

    • 著者名/発表者名
      河合 聡人, 安楽 誠, 河野 陽介, 宮本 秀一, 小田切 優樹
    • 学会等名
      第16回 日本蛋白質科学会 年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒト血清アルブミン-オクタン酸ナトリウム-N-アセチル-L-メチオニン三元複合体のX線結晶構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      小田切 優樹, 河合 聡人, 河野 陽介, 宮本 秀一, 山崎 啓之, 安楽 誠
    • 学会等名
      日本薬剤学会 第31年会
    • 発表場所
      長良川国際会議場(岐阜県岐阜市)
    • 年月日
      2016-05-19
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] ファミリー4 ウラシルDNAグリコシラーゼとDNAの複合体構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      河合 聡人, 中村 照也, 山縣 ゆり子, 宮本 秀一
    • 学会等名
      2015年度量子ビームサイエンスフェスタ
    • 発表場所
      つくば国際会議場 (茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-03-15
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] ファミリー4 ウラシルDNAグリコシラーゼによるDNA認識機構の解明2015

    • 著者名/発表者名
      河合 聡人, 中村 照也, 山縣 ゆり子, 宮本 秀一
    • 学会等名
      第15回 日本蛋白質科学会 年会
    • 発表場所
      あわぎんホール (徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [備考] 藤田医科大学 医学部 微生物学講座・感染症科ホームページ

    • URL

      http://www.fujita-hu.ac.jp/~microb/

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [備考] 崇城大学薬学部物理化学研究室

    • URL

      http://www.ph.sojo-u.ac.jp/~akawai/

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2020-03-30  

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