クロマチン構造変換複合体によるRNAポリメラーゼII転写開始複合体の制御機構

• 研究課題/領域番号: 15K18861
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 生物系薬学
• 研究機関: 富山大学
• 研究代表者: 田中 亜紀 富山大学, 大学院医学薬学研究部(薬学), 助教 (50432109)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2015年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: 遺伝子発現 / 転写 / 基本転写因子 / 遺伝子発現制御 / 生化学 / 転写開始 / 基本転写因子TFIIE / RNAポリメラーゼII clamp領域 / TFIIE / RNAポリメラーゼ clamp

研究成果の概要

基本転写因子TFIIEと相互作用する因子としてクロマチン構造変換複合体であるSWI/SNF複合体を同定した。細胞内でTFIIEはSWI/SNF複合体と相互作用し、TFIIHが関わる可能性が示された。SWI/SNF複合体は構成サブユニットによりBAF複合体とPBAF複合体に分けられる。TFIIEは主にPABF複合体と相互作用することが示された。TFIIE は転写開始および開始から伸長への移行段階で TFIIH と協調的に機能する。このことからもTFIIE－TFIIH と SWI/SNF 複合体の相互作用は、転写初期の2つの段階で協調的に機能して転写開始の活性化に寄与すると考えられる。

研究成果

• [雑誌論文] Mediator cyclin-dependent kinases upregulate transcription of inflammatory genes in cooperation with NF-κB and C/EBPβ on stimulation of Toll-like receptor 9. (2017)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, S., Hagihara, T., Horiuchi, Y., Okui, A., Wani, S., Yoshida, T., Inoue, T., Tanaka, A., Ito, T., Hirose, Y., and Ohkuma, Y.
  • 雑誌名: GENES TO CELLS 巻: 22 号: 3 ページ: 265-276
  • DOI: 10.1111/gtc.12475
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Association of the Winged Helix Motif of the TFIIEα Subunit of TFIIE with Either the TFIIEβ Subunit or TFIIB Distinguishes Its Functions in Transcription. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, A., Akimoto, Y., Kobayashi, S., Hisatake, K., Hanaoka, F., and Ohkuma, Y.
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 20 号: 3 ページ: 203-216
  • DOI: 10.1111/gtc.12212
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Human mediator MED17 subunit plays essential roles in gene regulation by associating with the transcription and DNA repair machineries. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kikuchi, Y., Umemura, H., Nishitani, S., Iida, S., Fukasawa, R., Hayashi, H., Hirose, Y., Tanaka, A., Sugasawa, K. and Ohkuma, Y.
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 20 号: 3 ページ: 191-202
  • DOI: 10.1111/gtc.12210
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 基本転写因子TFIIE とクロマチン構造変換複合体による転写制御機構 (2018)
  • 著者名/発表者名: 田中 亜紀, 山田 佑里香, 小林 聡子, 廣瀬 豊, 大熊 芳明
  • 学会等名: 日本薬学会第138年会
• [学会発表] 基本転写因子による転写開始から伸長への移行の制御機構解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 平山 翼, 福岡 瑞希, 田中 亜紀, 廣瀬 豊, 大熊 芳明
  • 学会等名: 日本薬学会第138年会
• [学会発表] 基本転写因子による転写開始から伸長への移行の制御機構解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 福岡瑞希、田中亜紀、平山翼、廣瀬豊、大熊芳明
  • 学会等名: RNAミーティング2017
• [学会発表] 真核生物RNAポリメラーゼIIは転写初期段階に外側と内側からダイナミックな構造と機能の変化を誘起される (2017)
  • 著者名/発表者名: 大熊 芳明、中村 考秀、加藤 大騎、鈴木 吾大、松本 靖彦、田中 亜紀、大矢 禎一、関水 和久
  • 学会等名: ConBio2017(第40回日本分子生物学会年会、第90回日本生化学会大会)
• [学会発表] 基本転写因子TFIIEの転写開始から伸長への移行段階における役割の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 田中 亜紀、福岡 瑞希、平山 翼、廣瀬 豊、大熊 芳明
  • 学会等名: ConBio2017(第40回日本分子生物学会年会、第90回日本生化学会大会)
• [学会発表] TLR9活性化の際のメディエーターキナーゼによる転写制御の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 山本誠司，萩原衆子，堀内祥行，奥井文, 吉田徳幸， 井上貴雄, 田中亜紀, 松久明生，廣瀬豊, 大熊芳明.
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2016-11-30
• [学会発表] 基本転写因子TFIIEによる転写開始から伸長への移行の制御機構解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 中村考秀, 田中亜紀, 福岡瑞希,廣瀬豊,大熊芳明.
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2016-11-30
• [学会発表] Dynamic Switch Mechanism of RNA polymerase II by General Transcription Factor TFIIE from Transcription Initiation to the Transition Step from Intiation to Elongation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ohkuma Y, Nakamura T, Akimoto Y, Fukuoka M, Hirose Y, Tanaka A
  • 学会等名: The 39th Annual Meeting of the Molecular Biology Scociety of Japan
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 2016-11-30
• [学会発表] 転写メディエーター複合体と神経細胞分化の関係 (2016)
  • 著者名/発表者名: 林裕人, 田中亜紀, 廣瀬豊, 大熊芳明.
  • 学会等名: 第89回日本生化学会大会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2016-09-25
• [学会発表] Functional analysis of archaeal DNA-binding protein Sso7d (2016)
  • 著者名/発表者名: Nakamura T, Nomura N, Mitsumizu H, Hirose Y, Tanaka A, Ohkuma Y.
  • 学会等名: The First International Symposium on Toyama-Asia-Africa Pharmaceutical Network
  • 発表場所: Toyama
  • 年月日: 2016-09-12
• [学会発表] CpGオリゴ核酸によるTLR9を介した転写制御機構の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山本誠司，萩原衆子，堀内祥行，奥井文，和仁翔太郎, 吉田徳幸， 井上貴雄, 田中亜紀, 松久明生，廣瀬豊, 大熊芳明
  • 学会等名: BMB2015 第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] 基本転写因子TFIIBとTFIIEによる転写開始の制御機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中村考秀、田中亜紀、秋元勇亮、郭丹恵、大熊芳明
  • 学会等名: BMB2015 第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] 基本転写因子TFIIEα winged helix領域の機能解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 田中亜紀、福岡瑞希、小林聡子、大熊芳明
  • 学会等名: BMB2015 第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] ヒトメディエーター複合体hMED17サブユニットによる転写制御とDNA損傷修復機能の解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 菊地祐子, 西谷紗織, 梅村啓靖, 田中亜紀, 廣瀬豊, 菅澤薫, 大熊芳明
  • 学会等名: BMB2015 第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] 転写コファクターPC4と基本転写因子TFIIEのβサブユニットとの協調的な働き (2015)
  • 著者名/発表者名: 秋元勇亮, 山本誠司, 飯田智, 田中亜紀, 廣瀬豊, 大熊芳明
  • 学会等名: BMB2015 第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] 基本転写因子TFIIEによる転写開始から伸長への移行の制御機構解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中村考秀, 田中亜紀, 廣瀬豊,大熊芳明
  • 学会等名: 日本薬学会北陸支部第127回例会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2015-11-15
• [学会発表] メディエーター複合体と転写因子BRD4との機能的関連性の検討 (2015)
  • 著者名/発表者名: 林裕人、田中亜紀、廣瀬豊、田渕明子、大熊芳明.
  • 学会等名: 第33回日本生化学会北陸支部例会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] 基本転写因子TFIIEによる転写開始と伸長の制御機構の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 郭丹慧、保田幸子、廣瀬豊、田中亜紀、今中常雄、大熊芳明.
  • 学会等名: 第33回日本生化学会北陸支部例会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2015-05-23