• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

P型ATPaseによる能動輸送機構の構造的解明

研究課題

研究課題/領域番号 16H02499
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関東京大学

研究代表者

豊島 近  東京大学, 定量生命科学研究所, 教授 (70172210)

研究分担者 椛島 佳樹  東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (00580573)
小川 治夫  東京大学, 定量生命科学研究所, 准教授 (40292726)
金井 隆太  東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (50598472)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
43,030千円 (直接経費: 33,100千円、間接経費: 9,930千円)
2018年度: 14,430千円 (直接経費: 11,100千円、間接経費: 3,330千円)
2017年度: 13,520千円 (直接経費: 10,400千円、間接経費: 3,120千円)
2016年度: 15,080千円 (直接経費: 11,600千円、間接経費: 3,480千円)
キーワードイオンポンプ / 膜蛋白質 / 結晶解析 / エネルギー変換 / 構造生物学 / 蛋白質 / 生物物理
研究成果の概要

本研究は、イオン能動輸送機構の完全な理解を第一の目標とし、特に、既に10の中間状態の構造決定に成功しているCa2+ポンプを対象に、イオンポンプは「どうしてそういう構造をとる必要があるのか」を追求した。イオン通路のゲート残基の変異体の結晶構造からプロトンの対向輸送の意義を解明し、Ca2+非存在下でATPを結合した状態の結晶から、ATPのみで起こる構造変化を明らかにした。さらに、4状態のCa2+ポンプ結晶中の脂質二重膜の可視化によって構造変化における燐脂質との相互作用の詳細を初めて明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

イオンポンプは生体の恒常性の維持に極めて重要な役割を持つ膜蛋白質であり、心臓病や癌、神経疾患の治療などの観点からも注目されている。Ca2+ポンプに関しては11の中間状態の構造決定に成功しているのみならず、本研究によって構造変化におけるプロトンの役割や脂質二重膜との相互作用の詳細の解明にまで成功した唯一の膜蛋白質である。原子構造に基づく蛋白質の作動機構の理解がここまで進んだ蛋白質は他に無く、学術的価値は極めて高い。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2019 2018 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 9件、 招待講演 16件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Aarhus University(デンマーク)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [雑誌論文] Mechanism of the E2 to E1 transition in Ca2+ pump revealed by crystal structures of gating residue mutants.2018

    • 著者名/発表者名
      Naoki Tsunekawa, Haruo Ogawa, Junko Tsueda, Toshihiko Akiba, and Chikashi Toyoshima
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 115 号: 50 ページ: 12722-12727

    • DOI

      10.1073/pnas.1815472115

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] X線コントラスト変調法によって明らかになった膜蛋白質と燐脂質の相互作用のダイナミクス2018

    • 著者名/発表者名
      豊島 近、乗松 良行
    • 雑誌名

      放射光

      巻: 31 ページ: 212-218

    • NAID

      40021599683

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Suppressor mutation analysis combined with 3D modeling explains cohesin’s capacity to hold and release DNA2018

    • 著者名/発表者名
      Xu Xingya、Kanai Ryuta、Nakazawa Norihiko、Wang Li、Toyoshima Chikashi、Yanagida Mitsuhiro
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 115 号: 21

    • DOI

      10.1073/pnas.1803564115

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Protein-lipid interplay revealed with crystals of a Calcium pump2017

    • 著者名/発表者名
      Norimatsu, Y and Toyoshima, C
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 545 号: 7653 ページ: 193-198

    • DOI

      10.1038/nature22357

    • 説明
      掲載確定
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distinct pH dependencies of Na+/K+selectivity at the two faces of Na,K-ATPase2017

    • 著者名/発表者名
      Cornelius Flemming、Tsunekawa Naoki、Toyoshima Chikashi
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 293 号: 6 ページ: 2195-2205

    • DOI

      10.1074/jbc.ra117.000700

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The road to understanding an ion pump2016

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima, C
    • 雑誌名

      PHYSICA SCRIPTA

      巻: 91 号: 4 ページ: 042501-042501

    • DOI

      10.1088/0031-8949/91/4/042501

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mn^<2+> transport by Ca^<2+>-ATPase of sarcoplasmic reticulum2016

    • 著者名/発表者名
      Yonekura, SI and Toyoshima, C
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 590 号: 14 ページ: 2086-2095

    • DOI

      10.1002/1873-3468.12244

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] P 型 ATPase によるイオン輸送とその制御機構2019

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      日本薬学会 第139年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Role of phospholipids in ion pumping2018

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      5th ShanghaiTech-SIAIS BioForum
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 原子構造に基づく筋小胞体カルシウムポンプの制御機構2018

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      日本筋学会第4会学術集会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] カルシウムポンプの結晶構造解析の現状2018

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      第2回SPring-8における蛋白質構造生物学研究の現状と将来
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural Biology of the Calcium Pump2018

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      第18回国際薬理学・臨床薬理学会議
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural Biology of Ion Pumps2018

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      Post Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural Biology of Ion Pumps2018

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Chemical Communication
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] イオンポンプの構造生物学:膜の可視化から量子化学計算まで2018

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      生理研プロジェクト「機能タンパク質の構造と機能のダイナミクスと、それに基づく細胞・生体シス テム 作動機構の研究拠点の形成」平成29年度成果報告会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] イオンポンプの構造的理解の長い道2017

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      第35回先端医療センター Monthly Lecture
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural Basis of Ion Pumping by Ca2+-ATPase2017

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      第20回カルシウム結合蛋白質とカルシウム機構の生理と病態に関する国際シンポジウム(CaBP20)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Crystal structure analysis of Ca2+- and Na+,K+-ATPases” The 15th International Conference on Na,K-ATPase and Related Transport ATPases2017

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      The 15th International Conference on Na,K-ATPase and Related Transport ATPases
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural biology of Na+,K+-ATPase: towards understanding of mutations in ATP1A32017

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      第6回ATP1A3遺伝子関連疾患国際シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Protein-lipid interplay revealed by X-ray solvent contrast modulation with calcium pump crystals2017

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      19th IUPAB and 11th EBSA congress
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] カルシウムポンプの構造生物学 - 燐脂質との相互作用2017

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      第2回生物構造学研究会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Protein-Lipid Interplay as Revealed by X-ray Solvent Contrast Modulation with the crystals of Ca2+-ATPases in four different States2017

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      IGER International Symposium on Physics of Life
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Crystal structure analysis of Ca2+- and Na+,K+-ATPases2017

    • 著者名/発表者名
      豊島 近
    • 学会等名
      The 15th International Conference on Na,K-ATPase and Related Transport ATPases
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 豊島研究室ホームページ

    • URL

      http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/StrBiol/index.html

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書 2016 実績報告書

URL: 

公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi