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ツシマヤマネコ保全に向けた食物連鎖の解明及び腸内細菌叢と個体特性との関連解析

研究課題

研究課題/領域番号 16H06892
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 生物資源保全学
研究機関京都大学

研究代表者

伊藤 英之  京都大学, 野生動物研究センター, 特任研究員 (10779648)

連携研究者 村山 美穂  京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60293552)
研究協力者 佐藤 大樹  環境省・九州地方環境事務所, 対馬自然保護官事務所(対馬野生生物保護センター), 首席自然保護官
箕浦 千咲  環境省・九州地方環境事務所, 対馬自然保護官事務所(対馬野生生物保護センター), 獣医師
高木 直子  京都市動物園, 種の保存展示課, 飼育員
安井 早紀  京都市動物園, 種の保存展示課, 飼育員
研究期間 (年度) 2016-08-26 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードツシマヤマネコ / 食性解析 / 腸内細菌叢 / 次世代シークエンス / 遺伝的多様性 / 食性 / マイクロサテライト / メタゲノム / 細菌叢解析
研究成果の概要

ツシマヤマネコは長崎県対馬にのみ生息している。生息地の破壊等により、生息数が減少している。
非侵襲的な手法である糞を用いた解析は、野生個体の解析に非常に有用である。食性の正確な情報は、域内保全や飼育個体の飼育管理に極めて有用である。また、免疫等に関連する腸内細菌叢の解析は種の保全に有用な情報となりうる。本研究では、次世代シークエンサーを用い、食性解析及び腸内細菌叢のメタゲノム解析を実施した。
飼育下個体及び野生下の糞便からDNAを抽出し、次世代シークエンス用ライブラリー作成を目的にPCR、タグ標識を実施したが、最終ライブラリー濃度が低く、条件の再検討が必要であった。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2017

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Contrasting results from molecular and pedigree-based population diversity measures in captive zebra highlight challenges facing genetic management of zoo populations.2017

    • 著者名/発表者名
      Ito H, Ogden R, Langenhorst T, Inoue-Murayama M
    • 雑誌名

      Zoo Biology

      巻: 36 号: 1 ページ: 87-94

    • DOI

      10.1002/zoo.21342

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 京都大学野生動物研究センターにおけるGenetic resource bankの概要及び応用例2017

    • 著者名/発表者名
      伊藤英之, 佐藤悠, 小林宏美, 森村成樹, 大沼学, 村山美穂
    • 学会等名
      第23回日本野生動物医学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Genetic diversities in the two captive grevy’s zebra populations2017

    • 著者名/発表者名
      Hideyuki ITO
    • 学会等名
      The 6th International Seminar on Biodiversity and Evolution
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genetic polymorphisms of candidate genes related to behavior traits in zebra species2017

    • 著者名/発表者名
      Hideyuki Ito, Rob Ogden, Tanya Langenhorst, Miho Murayama-Inoue
    • 学会等名
      11th International Conference on Behaviour, Physiology and Genetics of Wildlife
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 京都大学野生動物研究センター(WRC)の性判別研修会について2017

    • 著者名/発表者名
      村山美穂・伊藤英之・森村成樹
    • 学会等名
      動物園大学7
    • 発表場所
      愛媛県立とべ動物園(愛媛県伊予郡砥部町)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2016-09-02   更新日: 2019-03-29  

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