ミトコンドリアイントロンの解析によるスプライソソーマルイントロン進化の解明

• 研究課題/領域番号: 16H07451
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 進化生物学
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 西村 祐貴 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソースセンター, 特別研究員 (20783012)
• 研究期間 (年度): 2016-08-26 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円); 2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: ミトコンドリアゲノム / グループIIイントロン / スプライソソーマルイントロン / カタブレファリス類 / 有中心粒太陽虫類 / グループIイントロン / ミトコンドリア / スプライソソーム / eukaryogenesis / 転移性イントロン

研究成果の概要

真核生物の核ゲノムに見られるスプライソソーマル(sp)イントロンは、ミトコンドリアゲノム(mtDNA)に存在するグループII(gII)イントロンから進化したと考えられている。そこで、本研究は真核生物mtDNAにおけるgIIイントロンの多様性を探ることでspイントロンへの進化を解明する手がかりを得ることを目的とし、カタブレファリス類と有中心粒太陽虫類に属する生物のmtDNAを解読した。決定したmtDNAに含まれていたgIIイントロンは少数であったが、別タイプのイントロンの水平伝播やC-to-U型RNAエディングの発見など、派生的ではあるが興味深い成果を得ることができた。

研究成果

• [雑誌論文] Lactococcus reticulitermitis sp. nov., isolated from the gut of the subterranean termite Reticulitermes speratus (2018)
  • 著者名/発表者名: Yuki Masahiro、Sakamoto Mitsuo、Nishimura Yuki、Ohkuma Moriya
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 68 号: 2 ページ: 596-601
  • DOI: 10.1099/ijsem.0.002549
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondrial genome of Palpitomonas bilix: derived genome structure and ancestral system for cytochrome c maturation (2016)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Y, Tanifuji G, Kamikawa R, Yabuki A, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 8 号: 10 ページ: 3090-3098
  • DOI: 10.1093/gbe/evw217
  • NAID: 120007129285
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] 有中心粒太陽虫類におけるミトコンドリアゲノムの解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、白鳥峻志、石田健一郎、橋本哲男、稲垣祐司
  • 学会等名: 第12回日本ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] ゲノムデータに基づくTrichosporonales目の系統解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 高島昌子、Sira Sriswasdi、西村祐貴、眞鍋理一郎、杉田隆、遠藤力也、岩崎渉、大熊盛也
  • 学会等名: 第11回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 慶応大学
  • 年月日: 2017-03-02
• [学会発表] Single cell transcriptomes of the symbiotic protists in the wood-feeding termites gut suggest that chitin degradation is assigned to a symbiotic species (2017)
  • 著者名/発表者名: Yuki Nishimura, Masato Otagiri, Yuki Masahiro, Jun-ichi Inoue, Shigeharu Moriya, Moriya Ohkuma
  • 学会等名: 15 th International Congress of Protistology
  • 国際学会
• [学会発表] Molecular tinkering in the evolution of the membrane attachment mechanisms of the Rheg GTPase (2017)
  • 著者名/発表者名: Kristina Zahonova, Romana Petrzelkova , Euki Yazaki, Yuki Nishimura, Matus Valach, Stepanka Hrda, Vladimir Klimes, Yuji Inagaki, Gertraud Burger, Vladimir Hampl, Vyacheslav Yurchenko, Marek Elias
  • 学会等名: 15 th International Congress of Protistology
  • 国際学会
• [学会発表] シングルセルトランスクリプトームに基づくイエシロアリ共生原生生物の機能解明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、小田切正人、雪真弘、井上潤一、守屋繁春、大熊盛也
  • 学会等名: 環境生物系合同大会2017
• [学会発表] ハイブリッドゲノムも包含する真菌のゲノム分類: 多様な表現型を有するTrichosporonales目の特性解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 高島昌子、Sira Sriwasdi、杉田隆、西村祐貴、遠藤力也、大熊盛也、岩崎渉、眞鍋理一郎
  • 学会等名: 環境微生物系合同大会2017
• [学会発表] シングルセルトランスクリプトームによりシロアリ腸内原生生物の一種がキチン分解を通して効率的な窒素の利用に資することが示された (2017)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、小田切正人、雪真弘、井上潤一、守屋繁春、大熊盛也
  • 学会等名: 第50回日本原生生物学会大会&第1回日本共生生物学会大会合同大会
• [学会発表] シングルセルトランスクリプトームに基づくイエシロアリ共生原生生物の機能解明 (2016)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴、小田切正人、雪真弘、守屋繁春、大熊盛也
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第31回横須賀大会
  • 発表場所: 横須賀市文化会館
  • 年月日: 2016-10-23
• [学会発表] 真核生物における光合成生物の多様性とオルガネラ進化 (2016)
  • 著者名/発表者名: 西村祐貴
  • 学会等名: 第12回新産業酵母研究会講演会
  • 発表場所: 産業技術研究所臨海副都心センター
  • 招待講演