超解像ライブイメージングによるRNA動態解析法の開発

• 研究課題/領域番号: 16K14773
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 形態・構造
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 増井 修 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 研究員 (30579305)
• 研究協力者: Kepten Eldad Curie Institute
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2017年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2016年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: エピジェネティクス / non-coding RNA / X染色体不活性化 / Xist / 超解像顕微鏡 / ライブイメージング / Super-resolution / SIM / live-imaging / Xist RNA / Polycomb group / RNA / 遺伝子 / 核酸 / 生体分子

研究成果の概要

本研究課題では、超解像顕微鏡とライブイメージングを組み合わせた超解像ライブイメージング解析法の実現を目指した。超解像ライブイメージング解析法の実現に繋がる基礎的なデータの取得を終え、また関連する研究として以下の成果を得た。
(1) RNA 分子を蛍光シグナルとして検出する新しい手法を開発した (Methods Mol Biol, 印刷中)。
(2) この手法と超解像顕微鏡による解析を組み合わせて、Xist RNA とポリコーム蛋白質複合体の空間位置関係を明らかにした (Science, 2017, 356, 1081-1084)。

研究成果

• [国際共同研究] Curie Institute(France)
• [国際共同研究] University of Oxford(United Kingdom)
• [国際共同研究] Curie Institute(France)
• [雑誌論文] Live imaging of Xist RNA (2018)
  • 著者名/発表者名: Masui O, Heard E, Koseki H
  • 雑誌名: Methods in Molecular Biology 巻: 印刷中
  • 国際共著
• [雑誌論文] PCGF3/5-PRC1 initiates Polycomb recruitment in X chromosome inactivation. (2017)
  • 著者名/発表者名: Almeida M, Pintacuda G, Masui O, Koseki Y, Gdula M, Cerase A, Brown D, Mould A, Innocent C, Nakayama M, Schermelleh L, Nesterova TB, Koseki H, Brockdorff N.
  • 雑誌名: Science 巻: 356 号: 6342 ページ: 1081-1084
  • DOI: 10.1126/science.aal2512
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] PCGF6-PRC1 suppresses premature differentiation of mouse embryonic stem cells by regulating germ cell-related genes (2017)
  • 著者名/発表者名: Endoh M, Endo TA, Shinga J, Hayashi K, Farcas A, Ma KW, Ito S, Sharif J, Endoh T, Onaga N, Nakayama M, Ishikura T, Masui O, Kessler BM, Suda T, Ohara O, Okuda A, Klose RJ, Koseki H
  • 雑誌名: Elife 巻: 6
  • DOI: 10.7554/elife.27970
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] PCGF6-PRC1 suppresses premature differentiation of mouse embryonic stem cells by regulating germ cell-related genes. (2017)
  • 著者名/発表者名: Endoh M, Endo TA, Shinga J, Hayashi K, Farcas A, Ma KW, Ito S, Sharif J, Endoh T, Onaga N, Nakayama M, Ishikura T, Masui O, Kessler BM, Suda T, Ohara O, Okuda A, Klose RJ, Koseki H.
  • 雑誌名: Elife 巻: 6 ページ: 27970-27970
  • DOI: 10.7554/elife.21064
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [図書] 実験医学別冊「初めてでもできる！ 超解像イメージング」 (2016)
  • 著者名/発表者名: 増井修
  • 総ページ数: 11
  • 出版者: 羊土社