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酸化ストレスにより活性化されるポリA付加酵素の構造機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 16K18510
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 構造生物化学
研究機関東京大学

研究代表者

山下 征輔  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任助教 (30769576)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2018年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2017年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2016年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
キーワードヌクレオチド転移酵素 / X線結晶構造解析 / TUTase / ヌクレオチド付加 / RNA修飾 / Star-PAP / TUT1 / U6 snRNA / X線結晶構造解析 / 生体分子
研究成果の概要

本研究は、非古典的ヌクレオチド転移酵素による特異的な反応メカニズムの解明を目的として行われた。特にヒトのヌクレオチド転移酵素Star-PAPとTUT4をターゲットとしてX線結晶構造解析および生化学解析に取り組み、Star-PAPについてはU6 snRNAに対する特異的なウリジン付加反応の分子基盤を、TUT4についてはlet-7 miRNAの抑制に必要な複合体形成の分子基盤をそれぞれ明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

生命の設計図と呼ばれるDNAはそれ自身が部品として働くのではなく、RNAに転写されたのちにさらにタンパクに翻訳されて、あるいはRNAそのものとして機能的な役割を果たす。RNAは転写された後にさらに様々なプロセシングを受けていることが近年明らかになり、プロセシングが適切な機能発現や活性制御に不可欠であることがわかってきた。本研究では転写後プロセシングの一つであるヌクレオチド転移反応を担う酵素を標的とし、その立体構造を明らかにすることで高次生命現象の制御機構の解明につなげることができた。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2019 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Crystal structure of the enterohemorrhagic Escherichia coli AtaT-AtaR toxin-antitoxin complex.2019

    • 著者名/発表者名
      Yashiro Y, Yamashita S, Tomita K.
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 27 号: 3 ページ: 476-484

    • DOI

      10.1016/j.str.2018.11.005

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the Lin28-interacting module of human terminal uridylyltransferase that regulates let-7 expression2019

    • 著者名/発表者名
      Yamashita Seisuke、Nagaike Takashi、Tomita Kozo
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 1960-1960

    • DOI

      10.1038/s41467-019-09966-5

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Acetate-dependent tRNA acetylation required for decoding fidelity in protein synthesis2018

    • 著者名/発表者名
      Taniguchi T, Miyauchi K, Sakaguchi Y, Yamashita S, Soma A, Tomita K, Suzuki T
    • 雑誌名

      Nature Chemical Biology

      巻: 14 号: 11 ページ: 1010-1020

    • DOI

      10.1038/s41589-018-0119-z

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structures of U6 snRNA-specific terminal uridylyltransferase2017

    • 著者名/発表者名
      Yamashita Seisuke、Takagi Yuko、Nagaike Takashi、Tomita Kozo
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 8 号: 1 ページ: 15788-15788

    • DOI

      10.1038/ncomms15788

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Human BCDIN3D Monomethylates Cytoplasmic Histidine Transfer RNA.2017

    • 著者名/発表者名
      Martinez A, Yamashita S, Nagaike T, Sakaguchi Y, Suzuki T, Tomita K
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: - ページ: 5423-5436

    • DOI

      10.1093/nar/gkx051

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Crystal structures of U6 snRNA-specific terminal uridylyltransferase2017

    • 著者名/発表者名
      Seisuke Yamashita, Kozo Tomita
    • 学会等名
      第43回内藤コンファレンス
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Mechanism of 3'-matured tRNA discrimination from 3'-immature tRNA by class-II CCA-adding enzyme2016

    • 著者名/発表者名
      Seisuke Yamashita
    • 学会等名
      The 26th tRNA conference
    • 発表場所
      韓国、済州
    • 年月日
      2016-09-04
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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