アブラナ科野菜における遺伝子重複とゲノムインプリント遺伝子の出現機構の解明

• 研究課題/領域番号: 16K18636
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 遺伝育種科学
• 研究機関: 京都産業大学
• 研究代表者: 川邊 隆大 京都産業大学, 総合生命科学部, 研究助教 (40544507)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円); 2017年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2016年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: エピゲノム / 遺伝子発現制御 / ゲノムインプリンティング / アブラナ科 / アブラナ科野菜 / エピジェネティクス / トランスクリプトーム

研究成果の概要

ゲノムインプリンティングとは、ある対立遺伝子が父親から由来したか母親から由来したかに応じて遺伝子発現の有無が決定される現象のことであり、おもに哺乳動物と被子植物において見つかっている。本研究では、Brassica rapaを用いて、網羅的なインプリント遺伝子の同定と胚乳におけるゲノム全体のDNAメチル化状態を明らかとすることを目的として研究を行った。B. rapaにおけるインプリント遺伝子の数は、これまで報告されている近縁種よりも多いことが明らかとなった。

研究成果

• [雑誌論文] Assessment of DNA markers for seed contamination testing and selection of disease resistance in cabbage. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kazutaka Kawamura, Motoki Shimizu, Takahiro Kawanabe, Zujing Pu, Taro Kodama, Makoto Kaji, Kenji Osabe, Ryo Fujimoto, Keiichi Okazaki
  • 雑誌名: Euphytica 巻: 213 号: 1 ページ: 28-28
  • DOI: 10.1007/s10681-016-1821-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of DNA methylation in hybrid vigor in Arabidopsis thaliana (2016)
  • 著者名/発表者名: Kawanabe, T., Ishikura, S., Miyaji, N., Sasaki, T., Wu, L., Itabash, E., Takada, S., Shimizu, M., Takasaki-Yasuda, T., Osabe, K., Peacock, W.J., Dennis, E.S., and Fujimoto, R.
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 巻: 113 号: 43
  • DOI: 10.1073/pnas.1613372113
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Molecular and cellular characteristics of hybrid vigour in a commercial hybrid of Chinese cabbage (2016)
  • 著者名/発表者名: Saeki N, Kawanabe T, Ying H, Shimizu M, Kojima M, Abe H, Okazaki K, Kaji M, Taylor JM, Sakakibara H, Peacock WJ, Dennis ES, Fujimoto R.
  • 雑誌名: BMC Plant Biology 巻: 16 号: 1 ページ: 45-45
  • DOI: 10.1186/s12870-016-0734-3
  • NAID: 120005714785
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Development of primer sets that can verify the enrichment of histone modifications, and their application to examining vernalization-mediated chromatin changes in <i>Brassica rapa</i> L. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kawanabe, T., Osabe, K., Itabash, E., Okazaki, K., Dennis, E.S., and Fujimoto, R.
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 91 号: 1 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1266/ggs.15-00058
  • NAID: 130005165461
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The importance of reproductive barriers and the effect of allopolyploidization on crop breeding (2016)
  • 著者名/発表者名: Tonosaki, K., Osabe, K., Kawanabe, T., and Fujimoto, R.
  • 雑誌名: Ｂｒｅｅｄｉｎｇ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 66 号: 3 ページ: 333-349
  • DOI: 10.1270/jsbbs.15114
  • NAID: 130005160897
  • ISSN: 1344-7610, 1347-3735
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Gene duplication, silencing and expression alteration govern the molecular evolution of PRC2 genes in plants (2016)
  • 著者名/発表者名: Furihata, H.Y., Suenaga, K., Kawanabe, T., Yoshida, T., Kawabe, A.
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 91 号: 2 ページ: 85-95
  • DOI: 10.1266/ggs.15-00055
  • NAID: 130005421236
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Brassica rapaにおけるゲノムインプリント候補遺伝子の探索 (2017)
  • 著者名/発表者名: 川邊隆大、田中翔、吉田貴徳、河邊昭
  • 学会等名: 日本育種学会第131回講演会