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1細胞がんー間質相互作用解析による抗癌剤耐性克服ターゲットの探索

研究課題

研究課題/領域番号 17H04992
研究種目

若手研究(A)

配分区分補助金
研究分野 ゲノム医科学
研究機関東京大学 (2018-2019)
東京医科歯科大学 (2017)

研究代表者

河村 大輔  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 助教 (10776082)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
23,010千円 (直接経費: 17,700千円、間接経費: 5,310千円)
2019年度: 11,440千円 (直接経費: 8,800千円、間接経費: 2,640千円)
2018年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
2017年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
キーワードがん / 治療標的 / ゲノム / がん-間質細胞間相互作用 / シングルセルトランスクリプトーム / がん間質相互作用 / 癌
研究成果の概要

腫瘍組織のシングルセルトランスクリプトームシークエンスのデータから、癌細胞や線維芽細胞、免疫細胞、血管内皮細胞といった各種細胞との間における細胞間相互作用全体(インタラクトーム)を解析・可視化する手法を開発した。この方法を用いてびまん型胃がんモデルマウスおよび利用可能なヒトの正常胃粘膜と胃癌組織のシングルセルシーケンスデータのインタラクトーム解析を行った。その結果、線維芽細胞を始めとして様々な細胞からのシグナルががんの進展に寄与している可能性が示唆された。また、これらの中には抗癌剤の効果減弱に関係するとの報告がある分子も含まれていた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

がん細胞は通常それ単独では生存できず、周囲のさまざまな細胞と相互作用することによって生存に有利な状況を作り出している。近年組織における遺伝子発現量を一細胞レベルで定量化する技術が開発された。本研究ではこのデータを用いてがん細胞と周囲の非がん細胞との間の相互作用を定量化・可視化する技術を開発した。本手法をマウスのがん組織やヒトの正常組織、がん組織に適用したところ、正常組織からがん組織に至る過程で重要な相互作用を明らかにした。また、その中には抗がん剤の効果を弱める可能性のある分子も含まれていた。本研究成果をさらに進めることでがんの本体解明や抗癌剤耐性獲得の機序解明などにつながることが期待される。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2020 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 4件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Novel targets identified by integrated cancer-stromal interactome analysis of pancreatic adenocarcinoma.2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroshima Y, Kasajima R, Kimura Y, Komura D, Ishikawa S, Ichikawa Y, Bouvet M, Yamamoto N, Oshima T, Morinaga S, Singh SR, Hoffman RM, Endo I, Miyagi Y.
    • 雑誌名

      Cancer Lett.

      巻: 469 ページ: 217-227

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2019.10.031

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] High expression of olfactomedin-4 is correlated with chemoresistance and poor prognosis in pancreatic cancer.2020

    • 著者名/発表者名
      Ohkuma R, Yada E, Ishikawa S, Komura D, Ishizaki H, Tamada K, Kubota Y, Hamada K, Ishida H, Hirasawa Y, Ariizumi H, Satoh E, Shida M, Watanabe M, Onoue R, Ando K, Tsurutani J, Yoshimura K, Yokobori T, Sasada T, Aoki T, Murakami M, Norose T, Ohike N, Takimoto M, Izumizaki M, Kobayashi S, Tsunoda T, Wada S.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10 号: 1 ページ: e0226707-e0226707

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0226707

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] The genomic profile of metastatic diffuse-type gastric cancer in Cdh1loxP/loxP; Trp53loxP/loxP double conditional knockout mice2020

    • 著者名/発表者名
      Menghua Zhang, Itsuki Sugita, Daisuke Komura, Shunpei Ishikawa
    • 学会等名
      第90回 日本衛生学会学術総会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell transcriptomics of a model mouse for diffuse-type gastric cancer reveal ligand-receptor interactions potentially important for the cancer development2020

    • 著者名/発表者名
      古久保宙希、河村大輔、加藤洋人、石川俊平
    • 学会等名
      第20回 東京大学生命科学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] The genomic profile of metastatic diffuse-type gastric cancer in Cdh1loxP/loxP; Trp53loxP/loxP double conditional knockout mice2019

    • 著者名/発表者名
      Menghua Zhang, Itsuki Sugita, Daisuke Komura, Shunpei Ishikawa
    • 学会等名
      第42回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 膵癌における包括的癌-間質インタラクトーム解析2019

    • 著者名/発表者名
      廣島, 幸彦; 笠島, 理加; 木村, 弥生; 河村, 大輔; 石川, 俊平; 市川, 靖史; 遠藤, 格; 宮城, 洋平
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Visualizing ligand-receptor-mediated interactome in single cell transcriptome data2019

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Komura, Ryohei Suzuki, Shumpei Ishikawa
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting, Systems Immunology
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Interactome analysis of gastric cancer microenvironment by single-cell transcriptome sequencing2019

    • 著者名/発表者名
      Shumpei Ishikawa, Daisuke Komura, Ryohei Suzuki, Hiroto Katoh
    • 学会等名
      Cell Symbosia. Single Cells: Technology to Biology
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Single cell analysis for the human gastric cancer environments2017

    • 著者名/発表者名
      Hiroto Katoh, Daisuke Komura, Shumpei Ishikawa.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting, Single Cell Analyses
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 治療標的探索のためのがんー間質細胞間相互作用の網羅的解析2017

    • 著者名/発表者名
      河村大輔, 鈴木良平, 加藤洋人, 山本尚吾, 油谷浩幸, 石川俊平
    • 学会等名
      第76回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] CASTIN: a system for comprehensive analysis of cancer-stromal interactome.2017

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Komura, Takayuki Isagawa, Ryohei Suzuki, Reiko Sato, Mariko Tanaka, Shogo Yamamoto, Masashi Fukayama, Hiroyuki Aburatani, Shumpei Ishikawa.
    • 学会等名
      The 12th International Workshop on Advanced Genomics
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 治療標的探索のためのがん-間質細胞間相互作用解析システム2017

    • 著者名/発表者名
      河村大輔, 砂河孝行, 鈴木良平, 佐藤玲子, 加藤洋人, 田中麻理子, 山本尚吾, 深山正久, 油谷浩幸, 石川俊平
    • 学会等名
      第106回 日本病理学会総会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [図書] 遺伝統計学と疾患ゲノムデータ解析 : 病態解明から個別化医療, ゲノム創薬まで2018

    • 著者名/発表者名
      岡田 随象(編集)、河村大輔ら
    • 総ページ数
      264
    • 出版者
      メディカルドゥ
    • ISBN
      9784944157631
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [図書] 遺伝統計学と疾患ゲノムデータ解析2018

    • 著者名/発表者名
      岡田随象(編集)、河村大輔、石川俊平ら
    • 総ページ数
      272
    • 出版者
      メディカルドゥ
    • ISBN
      4944157630
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2021-02-19  

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