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HIVのVifタンパク質による宿主細胞を利用したヒト抗ウイルス因子排斥機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K15434
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 物理系薬学
研究機関京都大学

研究代表者

神庭 圭佑  京都大学, エネルギー理工学研究所, 研究員 (00795049)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2018年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2017年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード生体分子 / NMR / 相互作用 / APOBEC3G / HIV / Vif / 阻害 / タンパク質複合体 / 選択的標識
研究成果の概要

ヒトのAPOBEC3Gタンパク質 (A3G) は、ウイルスのマイナス鎖DNA中のシトシンをウラシルに脱アミノ化することで、HIV等のレトロウイルスに対する生体防御として機能する。HIVのVifタンパク質 (Vif) はA3Gを無力化する。ヒト細胞内では、Vifは4種類のヒトタンパク質と結合し、分子量100 kDa程度からなる五者複合体 (Vif複合体) を形成する。本研究では、Vif複合体中の単一のタンパク質のみを安定同位体標識し、そのNMRスペクトルを得た。次いで、Vif複合体とA3GのC端ドメインの相互作用することにより、Vif複合体は、A3Gによる脱アミノ化反応を阻害することを示した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

複合体タンパク質の単独の分子を標識する手法を提供することで、NMRを用いて高分子量のタンパク質を標識することが可能になり、ドラッグスクリーニング等に応用できることが期待される。宿主分子を巧みに利用するウイルス分子の作用機序を明らかにすることで、創薬研究のみならず、生命の進化の本質にかかわる知見が得られることが期待される。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2019 2018 2017 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 3件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] An insight into the dependence of the deamination rate of human APOBEC3F on the length of single-stranded DNA, which is affected by the concentrations of APOBEC3F and single-stranded DNA2019

    • 著者名/発表者名
      Wan Li、Kamba Keisuke、Nagata Takashi、Katahira Masato
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      巻: In Press 号: 2 ページ: 129346-129346

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2019.04.011

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The C-terminal cytidine deaminase domain of APOBEC3G itself undergoes intersegmental transfer for a target search, as revealed by real-time NMR monitoring2018

    • 著者名/発表者名
      Kamba Keisuke、Nagata Takashi、Katahira Masato
    • 雑誌名

      Phys Chem Chem Phys

      巻: 20 号: 5 ページ: 2976-2981

    • DOI

      10.1039/c7cp05171a

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Development of RNAs that bind to the Vif - CBFβ - CUL 5 - ELOB - ELOC complex2019

    • 著者名/発表者名
      Kumagai K., Suzuki T., Sekikawa Y., Kamba K., Wan L., Nagata K., Takaori-Kondo A., Katahira M., Nagata T. and Sakamoto T.
    • 学会等名
      The 10th International Symposium of Advanced Energy Science
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] An insight into the target search and HIV Vif-dependent inactivation of APOBEC3F and APOBEC3G elucidated by tracking the deamination events2019

    • 著者名/発表者名
      Kamba K., Wan L., Unzai S., Morishita R. Nagata T. and Katahira M
    • 学会等名
      8th Asia-Pacific NMR Symposium
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] HIV Vifによるユビキチン化を介さないヒトAOBEC3G活性の阻害2019

    • 著者名/発表者名
      神庭 圭佑、万 里、雲財 悟、森下 了、永田 崇、片平 正人
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] The effect of the distance between the RNA sequences recognized by two RNA-binding domains on the affinity of the MSI1-RNA interaction2019

    • 著者名/発表者名
      Tu. W. H., Kamba K., Nagata T. and Katahira M.
    • 学会等名
      第57回日本生物物理会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] HIV Vif-ヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体によるヒト抗ウイルス因子APOBEC3Gの脱アミノ化阻害の分子メカニズム2019

    • 著者名/発表者名
      神庭 圭佑、万 里、雲財 悟、森下 了、永田 崇、片平 正人
    • 学会等名
      第57回日本生物物理会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] APOBEC3Fと APOBEC3Gの脱アミノ化速度は、それら及びDNAの濃度、さらにDNAの長さに影響を受ける2019

    • 著者名/発表者名
      神庭 圭佑、万 里、永田 崇、片平 正人
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Vif - CBFβ - CUL5 - ELOB - ELOC 複合体に結合するアプタマーの解析2019

    • 著者名/発表者名
      熊谷紀志, 鈴木拓也, 関川湧斗, 神庭圭佑, 万里, 永田佳代子, 高折晃史, 片平正人, 永田崇, 坂本泰一
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Characteristics of the C-terminal domain of anti-viral factor APOBEC3G: mechanism behind a target search and inhibition by HIV-1 Vif protein2018

    • 著者名/発表者名
      Kamba K., Nagata T. and Katahira M.
    • 学会等名
      The XXVIIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems (ICMRBS)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヒト抗ウイルス因子APOBEC3Gの標的配列探索と、HIV-VifによるAPOBEC3G阻害メカニズムの研究2018

    • 著者名/発表者名
      神庭圭佑
    • 学会等名
      定量生物学の会・第九回年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] HIV Vif-ヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体はAPOBEC3Gの脱アミノ化を直接阻害する2018

    • 著者名/発表者名
      神庭 圭佑、汪 寧馨、雲財 悟、森下 了、永田 崇、片平 正人
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Vif-CBFβ-CUL5-ELOB-ELOC複合体に対するアプタマーの取得と解析2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木 拓也、万 里、関川 湧斗、田中 陽一郎、神庭 圭佑、片平 正人、永田 崇、坂本 泰一
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Vif-CBFβ-CUL5-ELOB-ELOC複合体に結合する2'F化したaptamerの取得2018

    • 著者名/発表者名
      関川 湧斗、水澤 果那、神庭 圭佑、鈴木 拓也、万 里、片平 正人、永田 崇、坂本 泰一
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] HIV Vif-ヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体によるAPOBEC3タンパク質の脱アミノ化阻害と核酸を含む3者間の分子間相互作用の解析2018

    • 著者名/発表者名
      神庭 圭佑、万 里、雲財 悟、森下 了、高折 晃史、永田 崇、片平 正人
    • 学会等名
      核酸化学 若手フォーラム 2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Vif-CBFβ-CUL5-ELOB-ELOC複合体に対するアプタマーの取得と解析2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木 拓也、万 里、関川 湧斗、田中 陽一郎、神庭 圭佑、片平 正人、永田 崇、坂本 泰一
    • 学会等名
      平成30年度日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] HIV Vif-E3-ユビキチンリガーゼ複合体と核酸の相互作用2018

    • 著者名/発表者名
      神庭 圭佑、永田 崇、片平 正人
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年回
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] ストランド間移動に依存するヒト抗ウイルス因子APOBEC3Gの酵素活性の促進と阻害2017

    • 著者名/発表者名
      神庭圭佑、永田崇、片平正人
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 脱アミノ化反応の実時間NMR解析で検出するヒト抗HIV因子APOBEC3Gと核酸及び阻害因子間の相互作用2017

    • 著者名/発表者名
      神庭圭佑、永田崇、片平正人
    • 学会等名
      第18回若手NMR研究会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] APOBEC3Gのストランド間移動の実時間NMR法検出2017

    • 著者名/発表者名
      神庭圭佑、永田崇、片平正人
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [備考]

    • URL

      https://sites.google.com/view/keisukekambapersonalwebsite2/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] Keisuke Kamba Personal Website/ Achievements

    • URL

      https://sites.google.com/view/keisukekambapersonalwebsite2/%E3%83%9B%E3%83%BC%E3%83%A0/achievements-%E6%A5%AD%E7%B8%BE%E4%B8%80%E8%A6%A7?authuser=0

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] Keisuke Kamba Personal Website/ Presentation

    • URL

      https://sites.google.com/view/keisukekambapersonalwebsite2/%E3%83%9B%E3%83%BC%E3%83%A0/presentation-%E5%AD%A6%E4%BC%9A%E7%99%BA%E8%A1%A8?authuser=0

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] 片平研究室ホームページ/ Achievements/ 原著論文

    • URL

      http://www.iae.kyoto-u.ac.jp/bio/papers.html

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2021-02-19  

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