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エンハンサー解析による腎臓BMP7分泌サイトの機能的意義の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K16072
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 腎臓内科学
研究機関京都大学 (2019)
慶應義塾大学 (2017-2018)

研究代表者

辻村 太郎  京都大学, 高等研究院, 特定講師 (90741893)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2019年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2018年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2017年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードエンハンサー / BMP7 / 腎臓 / CTCF / Bmp7 / シングルセルRNA-seq / クロマチン高次構造 / 腎機能 / 遺伝子 / クロマチン / マウス / ゲノム編集
研究成果の概要

Bmp7の腎臓エンハンサーの制御について、(1)通常の腎臓機能に重要なエンハンサーは、おそらくBmp7下流領域には存在しないこと、(2)成体腎臓でのBmp7発現は通常状態では限定的であること、(3)エンハンサー制御においてはCTCF結合サイトが重要な役割を果たすことが確かであること、(4)しかし、腎臓細胞で実際にどのように機能しているのかについては、エンハンサーの場所やエピジェネティクス状態に依存するのでそれらを総合的に検討していく必要があること、を示すことができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

Bmp7の制御という観点からは、より理解を深めていくために、シングルセルレベルでの詳細な解析が必要になってくることを示唆した。エンハンサー制御に関連して得たCTCFの機能およびその調節動態についての知見は、他の遺伝子座においても同様であるはずで、腎臓のみならず広く生体機能をゲノムから探る上での大きな指針となる研究になったと考えている。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2020 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 1件) 産業財産権 (2件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Controlling gene activation by enhancers through a drug-inducible topological insulator2020

    • 著者名/発表者名
      Taro Tsujimura, Osamu Takase, Masahiro Yoshikawa, Etsuko Sano, Matsuhiko Hayashi, Kazuto Hoshi, Tsuyoshi Takato, Atsushi Toyoda, Hideyuki Okano, Keiichi Hishikawa
    • 雑誌名

      eLife

      巻: -

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Controlling gene activation by enhancers through a drug-inducible topological insulator.2019

    • 著者名/発表者名
      Tsujimura T, Takase O, Yoshikawa M, Sano E, Hayashi M, Hoshi K, Takato T, Toyoda A, Okano H, Hishikawa K
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/534073

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Control of Directionality of Chromatin Folding for the Inter- and Intra-Domain Contacts at the Tfap2c-Bmp7 Locus2018

    • 著者名/発表者名
      Tsujimura T, Takase O, Yoshikawa M, Sano E, Hayashi M, Takato T, Toyoda A, Okano H, Hishikawa K.
    • 雑誌名

      Epigenetic & Chromatin

      巻: 11 号: 1 ページ: 51-51

    • DOI

      10.1186/s13072-018-0221-1

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] クロマチン高次構造から考える遺伝子制御の制約と可塑性2018

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎
    • 学会等名
      第20回日本進化学会大会シンポジウム『表現型の可塑性~ホモ・サピエンスの環境適応のヒントを探る』
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クロマチン高次ドメイン構造分断機構の解明とiPS細胞におけるその応用2018

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎、高瀬敦、吉川真弘、佐野悦子、高戸毅、林松彦、豊田敦、岡野栄之、菱川慶一
    • 学会等名
      第17回日本再生医療学会総会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Tfap2c-Bmp7遺伝子座で互いに反目方向に並ぶ2つのCTCF結合クラスターは、クロマチンの隣接コンタクトドメインを分断し、かつ内部コンタクトパターンに関与する、2017

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎、高瀬敦、吉川真弘、佐野悦子、高戸毅、豊田敦、岡野栄之、菱川慶一
    • 学会等名
      第40回日本分子生物学会年会(ConBio2017)
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [産業財産権] エンハンサーブロッカー及びその使用2019

    • 発明者名
      辻村太郎、岡野栄之、菱川慶一
    • 権利者名
      慶應義塾大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 外国
  • [産業財産権] エンハンサーブロッカー及びその使用2018

    • 発明者名
      辻村太郎、岡野栄之、菱川慶一
    • 権利者名
      慶應義塾大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2021-02-19  

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