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日本列島のアワビ類における種分化遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 17K19280
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
研究分野 森林圏科学、水圏応用科学およびその関連分野
研究機関東京大学

研究代表者

平瀬 祥太朗  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 (90635559)

研究分担者 關野 正志  国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)
研究期間 (年度) 2017-06-30 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2019年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2018年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2017年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
キーワードアワビ / 種分化 / 集団ゲノミクス / ゲノムシーケンス / GRAS-Di / 保全 / 生殖隔離 / 大型アワビ類 / 交雑 / 集団動態モデリング / 集団遺伝 / コピー数多型 / 日本列島 / SNP / GRAD-Di / 全ゲノム解析 / 集団ゲノミクス解析 / 次世代シーケンサー / 近縁種群 / 交雑帯
研究成果の概要

日本の水産重要種であるエゾアワビ(エゾ)、クロアワビ(クロ)、マダカアワビ(マダカ)、メガイアワビ(メガイ)は近縁な関係にあり、分布域が重複するものの、それぞれが独自の表現型を示す。これらのアワビ類の進化的関係と種分化プロセス、種分化に関与するゲノム基盤の解明に挑戦することを目的とし、ゲノムワイドSNPマーカーを用いた集団ゲノミクス解析を行った。エゾ・クロとマダカ、メガイ間では明確な遺伝的分化が生じており、基本的に生殖隔離が成立していると考えられた。一方、集団動態モデリングは、アワビ類が交雑を伴いながら種分化してきたことを示唆した。また、種分化に関与した可能性のあるゲノム領域も抽出した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

近縁であるにも関わらず、種の独自性を生みだしている遺伝基盤を明らかにすることは、対象となる生物種の増養殖及び保全戦略を考える上で重要であり、種分化のプロセスを考える上でも興味深い。本研究の成果は、日本の水産重要種であるエゾアワビ、クロアワビ、マダカアワビ、メガイアワビの保全方策を立案するための重要な遺伝情報を提供する。また、本研究をさらに深化させることで、海洋における種分化プロセスのモデルケースを提示できると考えている。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2020 2019 2018

すべて 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件)

  • [学会発表] 日本産大型アワビ類3種の種分化プロセスの推定と遺伝子コピー数多型の検出2020

    • 著者名/発表者名
      平瀬祥太朗, 山崎 曜, 關野正志, 池田 実, 原 素之, 菊池 潔
    • 学会等名
      令和2年度 日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Population genomics of Pacific abalone species complex in early phase of marine speciation2019

    • 著者名/発表者名
      Shotaro Hirase, Masashi Sekino, Minoru Ikeda, Motoyuki Hara, Kiyoshi Kikuchi
    • 学会等名
      Evolution2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ゲノムワイドSNP解析による日本産大型アワビ類3種の遺伝的類縁関係2019

    • 著者名/発表者名
      平瀬祥太朗・關野正志・池田 実・原 素之・菊池 潔
    • 学会等名
      平成31年度 日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 主成分分析による地域適応遺伝子の探索2018

    • 著者名/発表者名
      平瀬祥太朗, 手塚 あゆみ, 永野 惇, 菊池 潔, 岩崎 渉
    • 学会等名
      平成30年日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書

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公開日: 2017-07-21   更新日: 2021-02-19  

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